为了深入研究豆瓣菜(Nasturtium officinale R. Br.)对锌和铁的吸收和转运,我们采用RACE方法克隆了一种豆瓣菜根部锌铁转运蛋白NoZIP2 (N. officinale zinc iron transporter protein 2)的全长cDNA,并采用生物信息学方法对序列进行分析...为了深入研究豆瓣菜(Nasturtium officinale R. Br.)对锌和铁的吸收和转运,我们采用RACE方法克隆了一种豆瓣菜根部锌铁转运蛋白NoZIP2 (N. officinale zinc iron transporter protein 2)的全长cDNA,并采用生物信息学方法对序列进行分析。结果表明,NoZIP2包含1 446 bp,编码一个357个氨基酸残基的多肽,包含了9个跨膜结构域,存在植物锌铁转运蛋白的保守结构域,可能参与了豆瓣菜锌铁转运的过程。NoZIP2氨基酸序列与其它物种ZIP的氨基酸序列相似性较高,其中与荠菜的相似性最高,氨基酸相似性高达92%。分子进化分析表明,NoZIP2与十字花科植物荠菜、荠蓝和小花蓝芥的ZIP能够聚到一起。从豆瓣菜根部克隆的NoZIP2具有其它植物锌铁转运蛋白相似的高度保守的ZIP家族成员序列特征,因此推测NoZIP2属于ZIP家族成员。豆瓣菜No ZIP2的克隆和序列分析能够为进一步研究其功能及表达提供理论基础。展开更多
文摘为了深入研究豆瓣菜(Nasturtium officinale R. Br.)对锌和铁的吸收和转运,我们采用RACE方法克隆了一种豆瓣菜根部锌铁转运蛋白NoZIP2 (N. officinale zinc iron transporter protein 2)的全长cDNA,并采用生物信息学方法对序列进行分析。结果表明,NoZIP2包含1 446 bp,编码一个357个氨基酸残基的多肽,包含了9个跨膜结构域,存在植物锌铁转运蛋白的保守结构域,可能参与了豆瓣菜锌铁转运的过程。NoZIP2氨基酸序列与其它物种ZIP的氨基酸序列相似性较高,其中与荠菜的相似性最高,氨基酸相似性高达92%。分子进化分析表明,NoZIP2与十字花科植物荠菜、荠蓝和小花蓝芥的ZIP能够聚到一起。从豆瓣菜根部克隆的NoZIP2具有其它植物锌铁转运蛋白相似的高度保守的ZIP家族成员序列特征,因此推测NoZIP2属于ZIP家族成员。豆瓣菜No ZIP2的克隆和序列分析能够为进一步研究其功能及表达提供理论基础。
