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埃及伊蚊yellow基因家族的鉴别和表达谱分析
被引量:
1
1
作者
颜凤
吕清巧
+5 位作者
程金芝
牟小会
翟慧
杨迅
商正玲
吴家红
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期1-8,共8页
目的筛选并鉴定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因组中的yellow基因,分析其基因结构、基因进化以及在不同发育时期和不同组织的表达谱。方法运用模式昆虫黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)Dm-yellow基因(GenBank登录号为AAF45497)...
目的筛选并鉴定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因组中的yellow基因,分析其基因结构、基因进化以及在不同发育时期和不同组织的表达谱。方法运用模式昆虫黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)Dm-yellow基因(GenBank登录号为AAF45497)王浆主蛋白(MRJP)结构域氨基酸序列,在埃及伊蚊全基因组数据库中筛选并鉴定埃及伊蚊yell0叫基因家族.采用ExPASy在线相关工具包分析其理化性质和结构域,运用SignalP4.1预测信号肽.结合使用DNAstar、MAGA6.0和GeneDoc软件包进行同源性比对、保守性分析和系统进化树构建。提取埃及伊蚊总RNA,合成cDNA,利用实时荧光定量PCR(qRT—PCR)法对埃及伊蚊不同发育时期(卵、I~Ⅳ龄幼虫、蛹以及未吸血雌蚊和雄蚊)和未吸血雌蚊不同组织(唾液腺、中肠、脂肪体和卵巢)的yellow基因表达谱进行相对定量分析。结果 从埃及伊蚊全基因组中筛选出12条yellow基因(Aa-一yellow、Aa一yellow—b、Aa一yellow—c、Aa一yellow—d、Aa-yellow—e、Aa一yellow-f2、Aa—yellow-fb、Aa一yellow-fc、Aa—yellow—g、Aa—yellow—g2、Aa—yellow—h和Aa一fellow—x)。生物信息学分析结果显示,12条yellow基因均具有MRJP结构域和信号肽序列。同源性比对结果显示.埃及伊蚊yellow基因家族成员间同源性较低,为15%~49%:但其保守域间同源性较高,可达60%。系统进化树分析结果显示.12个yellow蛋白分为5个亚家族,其中11个在黑腹果蝇中均有直系同源蛋白存在。ⅡRT.PCR结果显示,An—yellow-d和Aa-yelloW一Ⅳ在雄蚊中高表达(P〈0.01或P〈O.05),相对表达量分别为0.0189和0.0235;Aa一yelloW一尼在雌蚊和唾液腺中特异高表达(P〈0.01),相对表达量分别为0.0248和0.0349;Aa一yellow-f2在Ⅱ龄幼虫中特异高表达(P〈0.01),相对表达量为0.0934;Aa一yellow、Aa—yellow—e和Aa—yellow一�
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关键词
埃及伊蚊
yellow
基因
家族
qRT—PCR
表达谱
原文传递
题名
埃及伊蚊yellow基因家族的鉴别和表达谱分析
被引量:
1
1
作者
颜凤
吕清巧
程金芝
牟小会
翟慧
杨迅
商正玲
吴家红
机构
贵州医科大学基础医学院人体寄生虫学教研室
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期1-8,共8页
基金
国家自然科学基金(No.81260260)~~
文摘
目的筛选并鉴定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因组中的yellow基因,分析其基因结构、基因进化以及在不同发育时期和不同组织的表达谱。方法运用模式昆虫黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)Dm-yellow基因(GenBank登录号为AAF45497)王浆主蛋白(MRJP)结构域氨基酸序列,在埃及伊蚊全基因组数据库中筛选并鉴定埃及伊蚊yell0叫基因家族.采用ExPASy在线相关工具包分析其理化性质和结构域,运用SignalP4.1预测信号肽.结合使用DNAstar、MAGA6.0和GeneDoc软件包进行同源性比对、保守性分析和系统进化树构建。提取埃及伊蚊总RNA,合成cDNA,利用实时荧光定量PCR(qRT—PCR)法对埃及伊蚊不同发育时期(卵、I~Ⅳ龄幼虫、蛹以及未吸血雌蚊和雄蚊)和未吸血雌蚊不同组织(唾液腺、中肠、脂肪体和卵巢)的yellow基因表达谱进行相对定量分析。结果 从埃及伊蚊全基因组中筛选出12条yellow基因(Aa-一yellow、Aa一yellow—b、Aa一yellow—c、Aa一yellow—d、Aa-yellow—e、Aa一yellow-f2、Aa—yellow-fb、Aa一yellow-fc、Aa—yellow—g、Aa—yellow—g2、Aa—yellow—h和Aa一fellow—x)。生物信息学分析结果显示,12条yellow基因均具有MRJP结构域和信号肽序列。同源性比对结果显示.埃及伊蚊yellow基因家族成员间同源性较低,为15%~49%:但其保守域间同源性较高,可达60%。系统进化树分析结果显示.12个yellow蛋白分为5个亚家族,其中11个在黑腹果蝇中均有直系同源蛋白存在。ⅡRT.PCR结果显示,An—yellow-d和Aa-yelloW一Ⅳ在雄蚊中高表达(P〈0.01或P〈O.05),相对表达量分别为0.0189和0.0235;Aa一yelloW一尼在雌蚊和唾液腺中特异高表达(P〈0.01),相对表达量分别为0.0248和0.0349;Aa一yellow-f2在Ⅱ龄幼虫中特异高表达(P〈0.01),相对表达量为0.0934;Aa一yellow、Aa—yellow—e和Aa—yellow一�
关键词
埃及伊蚊
yellow
基因
家族
qRT—PCR
表达谱
Keywords
Aedes aegypti
yellow
gene family
qRT-PCR
Expression profile
分类号
R384.113 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
埃及伊蚊yellow基因家族的鉴别和表达谱分析
颜凤
吕清巧
程金芝
牟小会
翟慧
杨迅
商正玲
吴家红
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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