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基于统计相关性与K-means的区分基因子集选择算法
被引量：
56
1
作者
谢娟英
高红超
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2014年第9期2050-2075,共26页
针对高维小样本癌症基因数据集的有效区分基因子集选择难题,提出基于统计相关性和K-means的新颖混合基因选择算法实现有效区分基因子集选择.算法首先采用Pearson相关系数和Wilcoxon秩和检验计算各基因与类标的相关性,根据统计相关性原...
针对高维小样本癌症基因数据集的有效区分基因子集选择难题,提出基于统计相关性和K-means的新颖混合基因选择算法实现有效区分基因子集选择.算法首先采用Pearson相关系数和Wilcoxon秩和检验计算各基因与类标的相关性,根据统计相关性原则选取与类标相关性较大的若干基因构成预选择基因子集;然后,采用K-means算法将预选择基因子集中高度相关的基因聚集到同一类簇,训练SVM分类模型,计算每一个基因的权重,从每一类簇选择一个权重最大或者采用轮盘赌思想从每一类簇选择一个得票数最多的基因作为本类簇的代表基因,各类簇的代表基因构成有效区分基因子集.将该算法与采用随机策略选择各类簇代表基因的随机基因选择算法Random,Guyon的经典基因选择算法SVM-RFE、采用顺序前向搜索策略的基因选择算法SVM-SFS进行实验比较,几个经典基因数据集上的200次重复实验的平均实验结果表明:所提出的混合基因选择算法能够选择到区分性能非常好的基因子集,建立在该区分基因子集上的分类器具有非常好的分类性能.
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关键词
区分基因子集选择
Pearson
相关系数
Wilcoxon
秩和检验
K-MEANS
聚类
统计相关性
FILTER
算法
wrapper
算法
下载PDF
职称材料
最小二乘支持向量回归机在发动机推力估计中的应用
被引量：
18
2
作者
赵永平
孙健国
《航空动力学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期1420-1425,共6页
实现直接推力控制的首要问题就是要估计出推力.基于最小二乘支持向量回归机提出了一种Wrapper算法进行特征选择,此算法不仅能降低计算的复杂度,而且能增强模型的泛化能力.另外,在对最小二乘支持向量回归机进行稀疏性建模的时候,用QR分...
实现直接推力控制的首要问题就是要估计出推力.基于最小二乘支持向量回归机提出了一种Wrapper算法进行特征选择,此算法不仅能降低计算的复杂度,而且能增强模型的泛化能力.另外,在对最小二乘支持向量回归机进行稀疏性建模的时候,用QR分解法代替传统的协方差法,增强了数值的稳定性.最后,推力估计器设计的应用实例,验证了本文提出的特征选择法和QR分解法进行稀疏性建模的可行性和实用性.
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关键词
推力估计
最小二乘支持向量回归机
特征选择
wrapper
算法
QR分解
原文传递
题名
基于统计相关性与K-means的区分基因子集选择算法
被引量：
56
1
作者
谢娟英
高红超
机构
陕西师范大学计算机科学学院
出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2014年第9期2050-2075,共26页
基金
国家自然科学基金(31372250)
中央高校基本科研业务费专项基金(GK201102007)
陕西省科技攻关项目(2013K12-03-24)
文摘
针对高维小样本癌症基因数据集的有效区分基因子集选择难题,提出基于统计相关性和K-means的新颖混合基因选择算法实现有效区分基因子集选择.算法首先采用Pearson相关系数和Wilcoxon秩和检验计算各基因与类标的相关性,根据统计相关性原则选取与类标相关性较大的若干基因构成预选择基因子集;然后,采用K-means算法将预选择基因子集中高度相关的基因聚集到同一类簇,训练SVM分类模型,计算每一个基因的权重,从每一类簇选择一个权重最大或者采用轮盘赌思想从每一类簇选择一个得票数最多的基因作为本类簇的代表基因,各类簇的代表基因构成有效区分基因子集.将该算法与采用随机策略选择各类簇代表基因的随机基因选择算法Random,Guyon的经典基因选择算法SVM-RFE、采用顺序前向搜索策略的基因选择算法SVM-SFS进行实验比较,几个经典基因数据集上的200次重复实验的平均实验结果表明:所提出的混合基因选择算法能够选择到区分性能非常好的基因子集,建立在该区分基因子集上的分类器具有非常好的分类性能.
关键词
区分基因子集选择
Pearson
相关系数
Wilcoxon
秩和检验
K-MEANS
聚类
统计相关性
FILTER
算法
wrapper
算法
Keywords
distinguishable gene subset selection
Pearson correlation coefficient
Wilcxon singed-rank test
K-means clustering
statistical correlation
Filter algorithms
wrapper
algorithms
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
下载PDF
职称材料
题名
最小二乘支持向量回归机在发动机推力估计中的应用
被引量：
18
2
作者
赵永平
孙健国
机构
南京航空航天大学能源与动力学院
出处
《航空动力学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期1420-1425,共6页
基金
国家自然科学基金(50576033)
航空科学基金(04C52019)
文摘
实现直接推力控制的首要问题就是要估计出推力.基于最小二乘支持向量回归机提出了一种Wrapper算法进行特征选择,此算法不仅能降低计算的复杂度,而且能增强模型的泛化能力.另外,在对最小二乘支持向量回归机进行稀疏性建模的时候,用QR分解法代替传统的协方差法,增强了数值的稳定性.最后,推力估计器设计的应用实例,验证了本文提出的特征选择法和QR分解法进行稀疏性建模的可行性和实用性.
关键词
推力估计
最小二乘支持向量回归机
特征选择
wrapper
算法
QR分解
Keywords
thrust estimation
least squares support vector regression machine
feature selection
wrapper
algorithm
QR decomposition
分类号
V233.7 [航空宇航科学与技术—航空宇航推进理论与工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于统计相关性与K-means的区分基因子集选择算法
谢娟英
高红超
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2014
56
下载PDF
职称材料
2
最小二乘支持向量回归机在发动机推力估计中的应用
赵永平
孙健国
《航空动力学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009
18
原文传递
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