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基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
1
作者
郭晖
陈鹏
+3 位作者
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
《中国生漆》
2023年第3期51-54,共4页
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(S...
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。
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关键词
漆树(Toxicodendron
vernicifluum
(
stokes
)
f
.A.
barkl
.)
基因组大小
流式细胞术
K-mer分析
下载PDF
职称材料
漆树木材中漆黄素的分离及其抑制酪氨酸酶活性的研究
被引量:
2
2
作者
陈虹霞
王成章
+2 位作者
叶建中
周昊
陶冉
《林产化学与工业》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期101-107,共7页
采用体积分数70%乙醇水溶液对漆树木材进行减压回流提取,经过乙酸乙酯萃取和中低压色谱快速分离得到纯度70%以上的化合物,并进一步采用高效液相色谱纯化,分离得到单体化合物。经过IR、MS和NMR鉴定,化合物为漆黄素。进一步研究了漆黄素...
采用体积分数70%乙醇水溶液对漆树木材进行减压回流提取,经过乙酸乙酯萃取和中低压色谱快速分离得到纯度70%以上的化合物,并进一步采用高效液相色谱纯化,分离得到单体化合物。经过IR、MS和NMR鉴定,化合物为漆黄素。进一步研究了漆黄素对酪氨酸酶活性的抑制作用。结果表明,漆黄素对多巴色素的形成有较强的抑制作用,对酪氨酸酶单酚酶的半数抑制浓度(IC50)为69.46 mg/L。对酪氨酸酶单酚酶的抑制表现出迟滞效应,0.524 mmol/L的漆黄素能将迟滞效应由1 min延长至11.2 min。通过Lineweaver-Burk图显示漆黄素对二酚酶的抑制作用表现为竞争性抑制。
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关键词
漆树
漆黄素
中低压色谱
酪氨酸酶
抑制
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职称材料
题名
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
1
作者
郭晖
陈鹏
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
机构
陕西省林业科学院
陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心
出处
《中国生漆》
2023年第3期51-54,共4页
文摘
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。
关键词
漆树(Toxicodendron
vernicifluum
(
stokes
)
f
.A.
barkl
.)
基因组大小
流式细胞术
K-mer分析
Keywords
Toxicodendron
vernicifluum
(
stokes
)
f
.A.
barkl
.
genome size
f
low cytometry
K-mer analysis
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
漆树木材中漆黄素的分离及其抑制酪氨酸酶活性的研究
被引量:
2
2
作者
陈虹霞
王成章
叶建中
周昊
陶冉
机构
中国林业科学研究院林产化学工业研究所
生物质化学利用国家工程实验室
国家林业局林产化学工程重点开放性实验室
江苏省生物质能源与材料重点实验室
中国林业科学研究院林业新技术研究所
出处
《林产化学与工业》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期101-107,共7页
基金
国家国际科技合作专项(2014DFR31300)
中国林科院林业新技术所基本科研业务费专项资金(CAFINT2013C03)
文摘
采用体积分数70%乙醇水溶液对漆树木材进行减压回流提取,经过乙酸乙酯萃取和中低压色谱快速分离得到纯度70%以上的化合物,并进一步采用高效液相色谱纯化,分离得到单体化合物。经过IR、MS和NMR鉴定,化合物为漆黄素。进一步研究了漆黄素对酪氨酸酶活性的抑制作用。结果表明,漆黄素对多巴色素的形成有较强的抑制作用,对酪氨酸酶单酚酶的半数抑制浓度(IC50)为69.46 mg/L。对酪氨酸酶单酚酶的抑制表现出迟滞效应,0.524 mmol/L的漆黄素能将迟滞效应由1 min延长至11.2 min。通过Lineweaver-Burk图显示漆黄素对二酚酶的抑制作用表现为竞争性抑制。
关键词
漆树
漆黄素
中低压色谱
酪氨酸酶
抑制
Keywords
Toxicodendron
vernicifluum
(
stokes
)
f
. A.
barkl
.
f
isetin
middle pressure chromatography
tyrosinase
inhibition
分类号
TQ351 [化学工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
郭晖
陈鹏
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
《中国生漆》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
漆树木材中漆黄素的分离及其抑制酪氨酸酶活性的研究
陈虹霞
王成章
叶建中
周昊
陶冉
《林产化学与工业》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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