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基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
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作者 郭晖 陈鹏 +3 位作者 郭欣怡 任俊澎 商慧颖 柏国清 《中国生漆》 2023年第3期51-54,共4页
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(S... 漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。 展开更多
关键词 漆树(Toxicodendron vernicifluum(stokes)f.A.barkl.) 基因组大小 流式细胞术 K-mer分析
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漆树木材中漆黄素的分离及其抑制酪氨酸酶活性的研究 被引量:2
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作者 陈虹霞 王成章 +2 位作者 叶建中 周昊 陶冉 《林产化学与工业》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第6期101-107,共7页
采用体积分数70%乙醇水溶液对漆树木材进行减压回流提取,经过乙酸乙酯萃取和中低压色谱快速分离得到纯度70%以上的化合物,并进一步采用高效液相色谱纯化,分离得到单体化合物。经过IR、MS和NMR鉴定,化合物为漆黄素。进一步研究了漆黄素... 采用体积分数70%乙醇水溶液对漆树木材进行减压回流提取,经过乙酸乙酯萃取和中低压色谱快速分离得到纯度70%以上的化合物,并进一步采用高效液相色谱纯化,分离得到单体化合物。经过IR、MS和NMR鉴定,化合物为漆黄素。进一步研究了漆黄素对酪氨酸酶活性的抑制作用。结果表明,漆黄素对多巴色素的形成有较强的抑制作用,对酪氨酸酶单酚酶的半数抑制浓度(IC50)为69.46 mg/L。对酪氨酸酶单酚酶的抑制表现出迟滞效应,0.524 mmol/L的漆黄素能将迟滞效应由1 min延长至11.2 min。通过Lineweaver-Burk图显示漆黄素对二酚酶的抑制作用表现为竞争性抑制。 展开更多
关键词 漆树 漆黄素 中低压色谱 酪氨酸酶 抑制
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