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花生花斑种皮花青素生物合成相关miRNA及其靶基因鉴定与分析 被引量:2
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作者 胡梦蝶 李佳伟 +8 位作者 王梅 刘彬 马钰聪 赵雨露 杨鑫雷 崔顺立 侯名语 蒋晓霞 穆国俊 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期226-239,共14页
花生在世界粮油食品中占有重要地位,其种皮颜色有白色、红色、紫色、粉红色及花斑等多种颜色,花斑种皮花生是其独特的成员之一,具有便于区分的优良性状。本研究以花斑种皮花生VG-02为研究材料,结果表明与花斑种皮颜色合成相关差异表达的... 花生在世界粮油食品中占有重要地位,其种皮颜色有白色、红色、紫色、粉红色及花斑等多种颜色,花斑种皮花生是其独特的成员之一,具有便于区分的优良性状。本研究以花斑种皮花生VG-02为研究材料,结果表明与花斑种皮颜色合成相关差异表达的miRNA富集的代谢途径有苯丙烷生物合成、类黄酮生物合成、异黄酮的生物合成、昼夜节律植物。miRNA测序结果中共筛选出86个差异表达miRNA,其中20个差异表达的miRNA与花生花斑种皮颜色合成相关。其中包括4个共同靶向花青素、类花青素和IFS2靶基因的miRNA,即miR_8、miR_50、miR_51和miR_239;5个靶向花青素生物合成中结构基因的miRNA,即调控CHS靶基因的miR_398-x,调控4CL靶基因的miR_482-z,调控F3′H靶基因的miR_266和miR_182以及调控花青素3-O-葡萄糖苷-6靶基因的miR_5;1个靶向花青素生物合成调节基因的miRNA,即miR858-y靶向调控MYB2和MYB3;10个靶向CYP450靶基因的miRNA,即miR_10、miR_15、miR_61、miR_72、miR_102、miR_116、miR_123、miR_193、miR_256和miR_862-z。miRNA测序与转录组联合分析KEGG代谢通路表明类黄酮生物合成为花生种皮花斑形成最直接的代谢途径。本研究对于全面揭示花斑花生种皮花青素合成的分子机制有重要意义。 展开更多
关键词 花生 花斑种皮 花青素生物合成 MIRNA 靶基因
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花生花斑种皮花青素合成的转录组-代谢组联合分析 被引量:3
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作者 胡梦蝶 李佳伟 +5 位作者 崔顺立 侯名语 杨鑫雷 刘立峰 蒋晓霞 穆国俊 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1732-1745,共14页
花生是重要的油料和经济作物,花生种皮色泽存在较大差异,具有白色、红色、紫色、粉色及花斑类型,花斑种皮花生是其中的独特成员。有关花斑花生种皮花青素合成的分子机制存在深入研究的必要性。本研究以花斑种皮花生VG-02为研究材料,采... 花生是重要的油料和经济作物,花生种皮色泽存在较大差异,具有白色、红色、紫色、粉色及花斑类型,花斑种皮花生是其中的独特成员。有关花斑花生种皮花青素合成的分子机制存在深入研究的必要性。本研究以花斑种皮花生VG-02为研究材料,采用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)法检测不同发育阶段种皮中花青素的相对含量变化,共检测到12种与种皮颜色相关的代谢物质。在花生种皮着色区(F)与非着色区(B)开花下针(DAF)45 d的F2-B2比较组中差异代谢产物最多,结果表明矢车菊素3-O-半乳糖苷和矢车菊素O-丁香酸含量着色区低于非着色区,差异倍数分别为0.63和2.35;松香花青素O-己糖苷,原花青素A1、A2、B2、B3,矢车菊素,花翠素,花翠素3-O-葡萄糖苷,矢车菊素3-O-半乳糖苷含量着色区高于非着色区,差异倍数1.05~11.55。花翠素和矢车菊素是导致着色区与非着色区颜色差异的主要代谢物。RNA-seq分析表明,1050个差异基因中筛选出与花斑种皮颜色形成高度相关的差异表达基因共27个,包括3个PAL、1个C4H、2个CHS、1个F3H、1个F3′H、2个DFR、2个LAR、2个IAA、4个bHLH和9个MYB,其中上调13个、下调14个。KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析表明,与种皮颜色合成相关所富集的代谢通路有苯丙氨酸代谢、苯丙醇生物合成、黄酮和黄酮醇生物合成、类黄酮生物合成、植物激素信号转导以及昼夜节律植物,其中类黄酮生物合成代谢途径是花生种皮花斑形成最直接的代谢途径。对20个差异基因进行qPCR验证,结果表明差异基因qPCR表达趋势与转录组测序结果显著一致。本研究结果对进一步揭示花生花斑种皮花青素合成调控机制具有一定的参考意义。 展开更多
关键词 花生 种皮 花青素 黄酮生物合成代谢途径 RNA-SEQ qPCR
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