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陆地棉UDPGP基因家族的鉴定及抗旱性分析
被引量:
1
1
作者
陈琴
李多露
+3 位作者
赵杰银
高文举
陈全家
曲延英
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2022年第1期12-22,共11页
【目的】尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(Uridine diphosphate glucose pyrophosphorylase,UDPGP)是植物碳水化合物代谢和细胞壁生物合成中的关键酶,但关于棉花UDPGP基因研究较少。对陆地棉UDPGP基因进行全基因组分析,为深入研究UDPGP基因...
【目的】尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(Uridine diphosphate glucose pyrophosphorylase,UDPGP)是植物碳水化合物代谢和细胞壁生物合成中的关键酶,但关于棉花UDPGP基因研究较少。对陆地棉UDPGP基因进行全基因组分析,为深入研究UDPGP基因在棉花抗逆中的作用提供参考。【方法】利用已公布的陆地棉标准系TM-1基因组数据,通过生物信息学分析方法对陆地棉UDPGP基因进行全基因组鉴定,分析该家族成员的理化性质、系统进化关系、基因结构、染色体定位、启动子区顺式作用元件、组织表达特异性和干旱胁迫下的表达模式。【结果】陆地棉UDPGP基因家族包含31个成员,不均等地分布在18条染色体上,可分为5个亚族。顺式作用元件分析发现,大部分UDPGP基因的启动子区域含有响应脱落酸、赤霉素、水杨酸、茉莉酸甲酯的顺式作用元件以及响应干旱的MYB结合位点。转录组分析表明,Gh UDPGP10和GhUDPGP26基因响应干旱胁迫,且在棉花多个器官中较高水平表达;实时荧光定量聚合酶链式反应结果显示,干旱胁迫下,GhUDPGP10和GhUDPGP26在抗旱材料的根中表达量普遍较高;而在干旱敏感材料中,主要在叶中高表达,推测这两个基因在不同的遗传材料中抗逆作用机制不同。【结论】明确了陆地棉UDPGP基因家族成员的分布特征、结构特征以及系统进化特征,通过表达分析初步揭示了该家族Gh UDPGP10和GhUDPGP26基因可能在棉花生长发育和抗旱响应中发挥功能,为解析Gh UDPGP基因的抗旱分子机理奠定基础。
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关键词
陆地棉
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶
抗旱性
表达模式
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职称材料
UGP2基因与肿瘤关系的研究进展
2
作者
杨月娥(综述)
周宇(审校)
《海南医学》
CAS
2023年第1期145-148,共4页
UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)在糖代谢特别是糖原生物合成过程中起重要作用,其将葡萄糖部分从1磷酸葡萄糖转移到MgUTP,生成UDP葡萄糖并释放焦磷酸盐PPi。研究表明,UGP2基因与多种肿瘤关系密切。本文对UGP2基因与肿瘤的关系研究进展做一...
UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)在糖代谢特别是糖原生物合成过程中起重要作用,其将葡萄糖部分从1磷酸葡萄糖转移到MgUTP,生成UDP葡萄糖并释放焦磷酸盐PPi。研究表明,UGP2基因与多种肿瘤关系密切。本文对UGP2基因与肿瘤的关系研究进展做一综述。
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关键词
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2
消化道肿瘤
乳腺癌
白血病
甲状腺乳头状癌
肿瘤的靶向治疗
下载PDF
职称材料
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)基因调控不同地源灵芝孢子粉次生代谢产物的差异
3
作者
李明成
李亚晗
+4 位作者
刘佳琳
兰春阳
孙晓红
赵万涛
王立霞
《北华大学学报(自然科学版)》
CAS
2021年第4期484-489,共6页
目的探讨不同地源灵芝孢子粉携带尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因在转录水平上的差异表达,以及对灵芝多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)含量的影响.方法采集不同地源灵芝孢子粉共7批18...
目的探讨不同地源灵芝孢子粉携带尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因在转录水平上的差异表达,以及对灵芝多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)含量的影响.方法采集不同地源灵芝孢子粉共7批18份,通过水浸煮-醇沉法提取GLP,应用苯酚-硫酸法计算GLP含量.克隆、测序UGPase基因,荧光定量PCR检测UGPase-mRNA.结果灵芝孢子粉GLP检测结果显示:吉林产含量为(3.3610±0.0046)%,云南产含量为(2.8870±0.0059)%,××堂孢子粉含量为(2.3990±0.0053)%,差异具有统计学意义(P<0.05);克隆UGPase基因测序结果显示:不同地域灵芝孢子粉携带UGPase基因序列相同,与Genbank中UGPase基因序列(Sequence:KM260167.1)核苷酸同源性达100%.UGPase-mRNA检测结果显示:吉林产灵芝孢子粉为表达量最高.结论不同地源灵芝孢子粉GLP与UGPase-mRNA相对表达量存在差异.UGPase基因在高多糖灵芝菌株中存在明显的表达优势,与GLP的生物合成呈正相关,该机制为深入研究GLP的生物合成提供了理论依据.
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关键词
灵芝多糖
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶
实时荧光定量PCR
基因表达量
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职称材料
题名
陆地棉UDPGP基因家族的鉴定及抗旱性分析
被引量:
1
1
作者
陈琴
李多露
赵杰银
高文举
陈全家
曲延英
机构
新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心/新疆作物遗传改良与种质创新重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2022年第1期12-22,共11页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A92)
中国博士后科学基金面上项目(地区专项支持计划)第69批(2021M693901)
新疆维吾尔自治区重大科技专项(2020A01001-2)。
文摘
【目的】尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(Uridine diphosphate glucose pyrophosphorylase,UDPGP)是植物碳水化合物代谢和细胞壁生物合成中的关键酶,但关于棉花UDPGP基因研究较少。对陆地棉UDPGP基因进行全基因组分析,为深入研究UDPGP基因在棉花抗逆中的作用提供参考。【方法】利用已公布的陆地棉标准系TM-1基因组数据,通过生物信息学分析方法对陆地棉UDPGP基因进行全基因组鉴定,分析该家族成员的理化性质、系统进化关系、基因结构、染色体定位、启动子区顺式作用元件、组织表达特异性和干旱胁迫下的表达模式。【结果】陆地棉UDPGP基因家族包含31个成员,不均等地分布在18条染色体上,可分为5个亚族。顺式作用元件分析发现,大部分UDPGP基因的启动子区域含有响应脱落酸、赤霉素、水杨酸、茉莉酸甲酯的顺式作用元件以及响应干旱的MYB结合位点。转录组分析表明,Gh UDPGP10和GhUDPGP26基因响应干旱胁迫,且在棉花多个器官中较高水平表达;实时荧光定量聚合酶链式反应结果显示,干旱胁迫下,GhUDPGP10和GhUDPGP26在抗旱材料的根中表达量普遍较高;而在干旱敏感材料中,主要在叶中高表达,推测这两个基因在不同的遗传材料中抗逆作用机制不同。【结论】明确了陆地棉UDPGP基因家族成员的分布特征、结构特征以及系统进化特征,通过表达分析初步揭示了该家族Gh UDPGP10和GhUDPGP26基因可能在棉花生长发育和抗旱响应中发挥功能,为解析Gh UDPGP基因的抗旱分子机理奠定基础。
关键词
陆地棉
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶
抗旱性
表达模式
Keywords
Gossypium
hirsutum
L.
uridine
diphosphate
-
glucose
pyrophosphorylase
drought
resistance
expression
profile
分类号
S562 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
UGP2基因与肿瘤关系的研究进展
2
作者
杨月娥(综述)
周宇(审校)
机构
广东医科大学附属医院消化内科
出处
《海南医学》
CAS
2023年第1期145-148,共4页
文摘
UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)在糖代谢特别是糖原生物合成过程中起重要作用,其将葡萄糖部分从1磷酸葡萄糖转移到MgUTP,生成UDP葡萄糖并释放焦磷酸盐PPi。研究表明,UGP2基因与多种肿瘤关系密切。本文对UGP2基因与肿瘤的关系研究进展做一综述。
关键词
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2
消化道肿瘤
乳腺癌
白血病
甲状腺乳头状癌
肿瘤的靶向治疗
Keywords
uridine
diphosphate
-
glucose
pyrophosphorylase
2
Digestive
tract
tumor
Breast
Cancer
Leukaemia
Papillary
thyroid
carcinoma
Targeted
therapy
for
tumor
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)基因调控不同地源灵芝孢子粉次生代谢产物的差异
3
作者
李明成
李亚晗
刘佳琳
兰春阳
孙晓红
赵万涛
王立霞
机构
北华大学医学技术学院
吉林省中药DNA指纹检测技术科技创新中心
北华大学附属医院
出处
《北华大学学报(自然科学版)》
CAS
2021年第4期484-489,共6页
基金
吉林省科技创新中心建设项目(20190902018TC)
吉林省科技创新项目(20190304101YY)
吉林市医疗卫生指导性计划项目(20200404021).
文摘
目的探讨不同地源灵芝孢子粉携带尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose pyrophosphorylase,UGPase)基因在转录水平上的差异表达,以及对灵芝多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)含量的影响.方法采集不同地源灵芝孢子粉共7批18份,通过水浸煮-醇沉法提取GLP,应用苯酚-硫酸法计算GLP含量.克隆、测序UGPase基因,荧光定量PCR检测UGPase-mRNA.结果灵芝孢子粉GLP检测结果显示:吉林产含量为(3.3610±0.0046)%,云南产含量为(2.8870±0.0059)%,××堂孢子粉含量为(2.3990±0.0053)%,差异具有统计学意义(P<0.05);克隆UGPase基因测序结果显示:不同地域灵芝孢子粉携带UGPase基因序列相同,与Genbank中UGPase基因序列(Sequence:KM260167.1)核苷酸同源性达100%.UGPase-mRNA检测结果显示:吉林产灵芝孢子粉为表达量最高.结论不同地源灵芝孢子粉GLP与UGPase-mRNA相对表达量存在差异.UGPase基因在高多糖灵芝菌株中存在明显的表达优势,与GLP的生物合成呈正相关,该机制为深入研究GLP的生物合成提供了理论依据.
关键词
灵芝多糖
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶
实时荧光定量PCR
基因表达量
Keywords
Ganoderma
lucidum
polysaccharides
uridine
diphosphate
glucose
pyrophosphorylase
quantitative
real-time
PCR
amount
of
gene
expression
分类号
R932 [医药卫生—生药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆地棉UDPGP基因家族的鉴定及抗旱性分析
陈琴
李多露
赵杰银
高文举
陈全家
曲延英
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
2
UGP2基因与肿瘤关系的研究进展
杨月娥(综述)
周宇(审校)
《海南医学》
CAS
2023
0
下载PDF
职称材料
3
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)基因调控不同地源灵芝孢子粉次生代谢产物的差异
李明成
李亚晗
刘佳琳
兰春阳
孙晓红
赵万涛
王立霞
《北华大学学报(自然科学版)》
CAS
2021
0
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职称材料
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