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吸虱亚目trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间独立进化和协同进化的研究
被引量:
1
1
作者
张艳芳
董文鸽
陈婷
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期920-930,共11页
【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa...
【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较分析,探讨trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间的独立进化和协同进化。【方法】对云南采集到的3科3属4种吸虱(弯多板虱Polyplax reclinata、锯多板虱Polyplax serrata、太平洋甲胁虱Hoplopleura pacifica和麝鼩钩板虱Ancistroplax crocidurae),用IlluminaMiSeq PE250平台高通量测序后与GenBank中查找的其它13种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较,采用最大简约法(Maximumparsimony,MP)分析17种吸虱trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因的进化关系。【结果】17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因均形成典型的三叶草结构,trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因在虱属、阴虱属和猴虱属中有较长的等同序列;在甲胁虱属和钩板虱属中有很短的等同序列;在多板虱属、微胸虱属和血虱属中的等同序列介于二者之间。常见典型单一环状线粒体基因组物种的trnL_(1)(tag)和trn L_(2)(taa)基因等同序列的长度在6-10 bp之间。对17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行同源性比较分析,发现不同属吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较大,同属内吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较小。基于17种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因构建系统进化树,结果表明trnL_(1)(tag)、trnL_(2)(taa)及trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间既有协同进化又有独立进化。【结论】trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因等同序列较长的吸虱易发生协同进化,等同序列较短的吸虱易发生独立进化。吸虱亚目的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因协同进化是长期的或发生在远缘物种间,而独�
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关键词
吸虱
trnl
_
(1)(
tag
)
trnl
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)
裂化线粒体基因组
协同进化
独立进化
原文传递
题名
吸虱亚目trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间独立进化和协同进化的研究
被引量:
1
1
作者
张艳芳
董文鸽
陈婷
机构
大理大学病原与媒介生物研究所
出处
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期920-930,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31660314,32060143)
云南省自然科学基金项目(No.2016FB135)
大理大学媒介生物学创新团队项目(ZKLK2019104)。
文摘
【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较分析,探讨trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间的独立进化和协同进化。【方法】对云南采集到的3科3属4种吸虱(弯多板虱Polyplax reclinata、锯多板虱Polyplax serrata、太平洋甲胁虱Hoplopleura pacifica和麝鼩钩板虱Ancistroplax crocidurae),用IlluminaMiSeq PE250平台高通量测序后与GenBank中查找的其它13种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较,采用最大简约法(Maximumparsimony,MP)分析17种吸虱trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因的进化关系。【结果】17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因均形成典型的三叶草结构,trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因在虱属、阴虱属和猴虱属中有较长的等同序列;在甲胁虱属和钩板虱属中有很短的等同序列;在多板虱属、微胸虱属和血虱属中的等同序列介于二者之间。常见典型单一环状线粒体基因组物种的trnL_(1)(tag)和trn L_(2)(taa)基因等同序列的长度在6-10 bp之间。对17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行同源性比较分析,发现不同属吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较大,同属内吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较小。基于17种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因构建系统进化树,结果表明trnL_(1)(tag)、trnL_(2)(taa)及trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间既有协同进化又有独立进化。【结论】trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因等同序列较长的吸虱易发生协同进化,等同序列较短的吸虱易发生独立进化。吸虱亚目的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因协同进化是长期的或发生在远缘物种间,而独�
关键词
吸虱
trnl
_
(1)(
tag
)
trnl
_
(2)(
tag
)
裂化线粒体基因组
协同进化
独立进化
Keywords
Anoplura
trnl
_
(1)(
tag
)
trnl
_
(
2
)(taa)
fragmented mitochondrial genome
concerted evolution
independent evolution
分类号
S852.744 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
吸虱亚目trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间独立进化和协同进化的研究
张艳芳
董文鸽
陈婷
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
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