为了挖掘与荷花花器官性状显著相关的分子标记,对60份荷花种质资源的18个花器官性状进行鉴定描述,用筛选得到的16个具有多态性的SSR标记进行遗传多样性分析,并使用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode,GLM)和混合线性模型(...为了挖掘与荷花花器官性状显著相关的分子标记,对60份荷花种质资源的18个花器官性状进行鉴定描述,用筛选得到的16个具有多态性的SSR标记进行遗传多样性分析,并使用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode,GLM)和混合线性模型(mixed linear mode,MLM)对18个花器官性状进行关联分析。研究结果显示,16个SSR标记以二核苷酸重复和三核苷酸重复类型为主,两者占比均为43.75%;在60份荷花种质中扩增出105个多态性位点,平均多态性位点为6.5625;引物多态性含量(PIC)为0.2898~0.7029,平均值为0.5242;Shannon’s信息指数(I)平均值为1.1548;观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.4308和0.5819。60份荷花品种的遗传相似系数(GS)为0.38~0.92,平均值为0.67;在GS为0.60处将60份荷花种质分为3大种群。GLM模型分析共检测到31个SSR位点,表型解释率为15.72%~76.76%;MLM模型分析共检测到13个SSR位点,表型解释率为20.25%~78.40%;其中有10个位点被二者同时检测到。此外有9个SSR标记的位点在2~5个花器官性状中被检测到,表现出显著的“一因多效”现象。展开更多
本研究利用51对SSR标记对148份马铃薯种质材料进行多态性扫描,群体遗传结构分析,在此基础上采用Tassel 2.1的MLM(mixed linear model)分析策略进行标记与马铃薯6个主要农艺性状的关联分析。分析检测到11个标记与6个农艺性状相关联且达...本研究利用51对SSR标记对148份马铃薯种质材料进行多态性扫描,群体遗传结构分析,在此基础上采用Tassel 2.1的MLM(mixed linear model)分析策略进行标记与马铃薯6个主要农艺性状的关联分析。分析检测到11个标记与6个农艺性状相关联且达到极显著水平(p<0.01),各标记对表型变异的解释率范围为0.082 9~0.498 8,部分标记与两个性状相关联。检测到与商品薯率相关联的标记共7个,分别为:Sti13、Ac58、Sti01、Stm1041、Sti19、Stm2012、Sti51;Sti06和Stm2007标记与株高相关联;与开花时间、分枝、单株薯重和单株茎叶鲜重相关的标记各1个,分别为:Ac58、Stm5136、Sti53、Sti53。研究进一步解析了各等位变异的表型效应,并对相应的载体材料进行挖掘。研究分析所得到的与农艺性状显著关联的SSR标记位点及其表型效应分析可在等位基因发掘、亲本组配、以及分子标记辅助选择等方面为育种工作提供参考。展开更多
文摘为了挖掘与荷花花器官性状显著相关的分子标记,对60份荷花种质资源的18个花器官性状进行鉴定描述,用筛选得到的16个具有多态性的SSR标记进行遗传多样性分析,并使用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode,GLM)和混合线性模型(mixed linear mode,MLM)对18个花器官性状进行关联分析。研究结果显示,16个SSR标记以二核苷酸重复和三核苷酸重复类型为主,两者占比均为43.75%;在60份荷花种质中扩增出105个多态性位点,平均多态性位点为6.5625;引物多态性含量(PIC)为0.2898~0.7029,平均值为0.5242;Shannon’s信息指数(I)平均值为1.1548;观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.4308和0.5819。60份荷花品种的遗传相似系数(GS)为0.38~0.92,平均值为0.67;在GS为0.60处将60份荷花种质分为3大种群。GLM模型分析共检测到31个SSR位点,表型解释率为15.72%~76.76%;MLM模型分析共检测到13个SSR位点,表型解释率为20.25%~78.40%;其中有10个位点被二者同时检测到。此外有9个SSR标记的位点在2~5个花器官性状中被检测到,表现出显著的“一因多效”现象。
