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家蚕Bm Tpi基因Z染色体定位 被引量：2
1
作者 牛宝龙 吕顺霖 +2 位作者 翁宏飚 沈卫锋 孟智启 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期622-626,共5页
采用实时定量PCR技术,以家蚕Bombyxmori第11号染色体上的DH-PBAN基因为参照基因,检测家蚕不同个体间BmTpi基因与常染色体上DH-PBAN基因的拷贝数之比,雄体BmTpi∶DH-PBAN=1.0,雌体BmTpi∶DH-PBAN=0.5;并用已经定位于Z染色体上的BmKettin... 采用实时定量PCR技术,以家蚕Bombyxmori第11号染色体上的DH-PBAN基因为参照基因,检测家蚕不同个体间BmTpi基因与常染色体上DH-PBAN基因的拷贝数之比,雄体BmTpi∶DH-PBAN=1.0,雌体BmTpi∶DH-PBAN=0.5;并用已经定位于Z染色体上的BmKettin基因为参照,检测BmTpi基因的拷贝数与BmKettin基因的拷贝数之比,雄体BmTpi∶BmKettin=1.0,雌体BmTpi∶BmKettin=1.0,证明BmTpi基因在家蚕基因组中的拷贝数与BmKettin基因相同,说明BmTpi基因位于Z染色体上。 展开更多
关键词 家蚕Bm tpi基因 DH-PBAN基因 BM Kettin基因 Z染色体 实时定量PCR
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腹泻患者艰难梭菌的检测及分析 被引量：3
2
作者 唐海先 肖洪广 +2 位作者 杨玉静 陈定强 吴爱武 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第17期3328-3331,共4页
目的了解广州地区腹泻病人中艰难梭菌(CD)及其毒素基因的分布情况并进行相关分析。方法收集261例住院及门诊腹泻病人粪便标本并提取宏基因组DNA,用PCR方法检测CD的种特异性基因tpi和毒素基因,包括毒素A基因(tcdA)、毒素B基因(tcdB)及二... 目的了解广州地区腹泻病人中艰难梭菌(CD)及其毒素基因的分布情况并进行相关分析。方法收集261例住院及门诊腹泻病人粪便标本并提取宏基因组DNA,用PCR方法检测CD的种特异性基因tpi和毒素基因,包括毒素A基因(tcdA)、毒素B基因(tcdB)及二元毒素基因,并对检测患者的临床资料与CD携带的关联性进行分析。结果 261例腹泻病人粪便标本中,tpi基因阳性的有14例(5.4%),毒素阳性的6例(2.3%),均为A、B毒素同时阳性,未发现产二元毒素菌株。在14例tpi阳性标本中,71.4%(10/14)为住院病人,28.6%(4/14)为门诊病人;57.1%(8/14)为大于60岁患者,35.7%(5/14)为儿童。基因序列分析发现tpi基因有2种基因型,tcdA有2个基因型,tcdB有4个基因型,未发现明显优势基因型。结论目前在广州,CD的感染为散发;不能忽视儿童及社区获得性CD相关性腹泻的监测。 展开更多
关键词 腹泻 艰难梭菌 PCR tpi基因 毒素 基因型
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山西省草地贪夜蛾的生物型鉴定 被引量：2
3
作者 李大琪 任美凤 +4 位作者 王升琛 蒋晓玲 龙佳敏 张东霞 陆俊姣 《中国植保导刊》 北大核心 2022年第10期5-8,19,共5页
2019年7月山西首次发现草地贪夜蛾入侵,当地农业生产受到严重影响。采用细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)和磷酸甘油醛异构酶(Tpi)的两个分子标记对山西草地贪夜蛾样本进行遗传特征分析。基于母系遗传特征COⅠ基因片段的序列分析表明,样本... 2019年7月山西首次发现草地贪夜蛾入侵,当地农业生产受到严重影响。采用细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)和磷酸甘油醛异构酶(Tpi)的两个分子标记对山西草地贪夜蛾样本进行遗传特征分析。基于母系遗传特征COⅠ基因片段的序列分析表明,样本中水稻型所占比例为97.6%,玉米型所占比例为2.4%;基于父系遗传特征Tpi基因片段的序列分析则表明所有样本均为玉米型,并在174、175位点存在3种碱基特征:87.80%的样本为玉米型碱基特征(AT),9.76%为水稻型碱基特征(GA),2.43%为杂合型特征(AA)。由此可见,入侵山西的草地贪夜蛾主要是母系水稻型和父系玉米型的杂合型。研究结果可为研究草地贪夜蛾迁飞过程中的种群遗传特征变化提供理论依据,为农业部门监测及制定防控策略提供参考。 展开更多
关键词 草地贪夜蛾 遗传特征 生物型 COⅠ基因 tpi基因
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两株犬源贾第虫tpi基因的基因型分析 被引量：2
4
作者 张萍 朱海波 +5 位作者 李结 李金平 刘远佳 郭建超 孟祥龙 李国清 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第10期59-63,共5页
采用巢式PCR鉴定广东两株犬源贾第虫(GD1和GD2)的基因型。运用碘液染色对犬粪便中贾第虫进行鉴定,提取DNA后经巢式PCR扩增tpi基因,扩增产物测序后用BLAST和DNAStar软件进行同源性和系统发育分析。结果表明,通过tpi基因分析,GD1与L02120... 采用巢式PCR鉴定广东两株犬源贾第虫(GD1和GD2)的基因型。运用碘液染色对犬粪便中贾第虫进行鉴定,提取DNA后经巢式PCR扩增tpi基因,扩增产物测序后用BLAST和DNAStar软件进行同源性和系统发育分析。结果表明,通过tpi基因分析,GD1与L02120的同源性为100%,种系发育树上位于同一分支;GD2与DQ220289的同源性为99.1%,种系发育树上两者在同一分支。广东犬源贾第虫GD1为人畜共患的A1型,GD2为犬的D型。 展开更多
关键词 犬 贾第虫 tpi基因 巢式PCR
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稻属单拷贝核基因TPI序列分析及其在疣粒野生稻鉴定中的应用 被引量：1
5
作者 宋云 陈岩 +2 位作者 徐晗 李明福 刘仕琴 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期76-81,共6页
通过对稻属(Oryza L.)及其近缘属等18个禾本科植物单拷贝核基因TPI序列进行扩增和测序,分析其系统进化关系及序列差异,并设计鉴定疣粒野生稻(O.granulata)特异的分子标记。序列分析表明,栽培稻间TPI基因序列碱基变异少,野生稻相对变异丰... 通过对稻属(Oryza L.)及其近缘属等18个禾本科植物单拷贝核基因TPI序列进行扩增和测序,分析其系统进化关系及序列差异,并设计鉴定疣粒野生稻(O.granulata)特异的分子标记。序列分析表明,栽培稻间TPI基因序列碱基变异少,野生稻相对变异丰富,其中疣粒野生稻变异尤为明显,根据疣粒野生稻的TPI基因序列特异位点设计引物,利用这一分子标记对疣粒野生稻进行准确鉴定。 展开更多
关键词 tpi基因 疣粒野生稻 分子标记 物种鉴定
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基于TPI基因的城市污水中蓝氏贾第鞭毛虫的分子鉴定 被引量：1
6
作者 张唯哲 凌虹 +5 位作者 张晓丽 李懿宏 姬红 杨凤坤 沈玉娟 刘爱芹 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2012年第5期347-348,379,共3页
目的对哈尔滨市污水处理厂原水中的蓝氏贾第鞭毛虫进行分子鉴定。方法收集哈尔滨市污水处理厂原水样,提取基因组DNA,巢式PCR扩增蓝氏贾第鞭毛虫TPI基因,通过序列分析确定蓝氏贾第鞭毛虫的集聚体类型和亚型,并进行同源性分析。结果从哈... 目的对哈尔滨市污水处理厂原水中的蓝氏贾第鞭毛虫进行分子鉴定。方法收集哈尔滨市污水处理厂原水样,提取基因组DNA,巢式PCR扩增蓝氏贾第鞭毛虫TPI基因,通过序列分析确定蓝氏贾第鞭毛虫的集聚体类型和亚型,并进行同源性分析。结果从哈尔滨市污水处理厂原水DNA提取物中扩增出蓝氏贾第鞭毛虫TPI基因,经分子鉴定为蓝氏贾第鞭毛虫集聚体AII,其序列与文献报道人源蓝氏贾第鞭毛虫集聚体AII序列(AB516351,FJ560570,EF688021)的同源性为100%。结论哈尔滨市污水处理厂原水中存在蓝氏贾第鞭毛虫集聚体AII,威胁当地居民健康。 展开更多
关键词 蓝氏贾第鞭毛虫 集聚体 污水 tpi基因 分子鉴定
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阴道毛滴虫TPI基因克隆及原核表达 被引量：1
7
作者 丁鹤 刘畅 +6 位作者 宫鹏涛 李建华 李赫 张国才 杨举 李淑红 张西臣 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2012年第7期516-518,共3页
目的构建阴道毛滴虫TPI基因原核表达载体,并在大肠埃希菌BL21(DE3)中表达。方法根据阴道毛滴虫TPI基因开放阅读框设计并合成特异性引物,以阴道毛滴虫总cDNA为模板PCR扩增目的片段,与pMD-18-T连接构建克隆载体pMD-TPI,经双酶切回收目的片... 目的构建阴道毛滴虫TPI基因原核表达载体,并在大肠埃希菌BL21(DE3)中表达。方法根据阴道毛滴虫TPI基因开放阅读框设计并合成特异性引物,以阴道毛滴虫总cDNA为模板PCR扩增目的片段,与pMD-18-T连接构建克隆载体pMD-TPI,经双酶切回收目的片段,与表达载体pGEX-T连接,构建原核表达载体pGEX-TPI,经IPTG诱导后通过SDS-PAGE及Western blot鉴定表达产物。结果成功构建了阴道毛滴虫TPI基因原核表达载体pGEX-TPI;SDS-PAGE电泳显示,在IPTG诱导下重组质粒转化菌高效表达分子质量单位为27.5ku的蛋白质;Western blot显示表达产物可被抗阴道毛滴虫的多克隆血清识别。结论成功构建了TPI基因原核表达载体,并在大肠埃希菌BL21(DE3)中高效表达,为进一步研究阴道毛滴虫TPI基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 阴道毛滴虫 tpi基因 克隆 原核表达
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成都动物园野生动物源贾第虫的多位点基因分型鉴定
8
作者 李威 屈羽 +7 位作者 钟志军 杨平 李云娇 王吴优 刘学涵 谢娜 邓家波 彭广能 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期185-190,共6页
为了解四川省成都市动物园野生动物贾第虫的流行及基因型,本研究采集了146份不同野生动物的新鲜粪便并提取基因组DNA.通过巢式PCR扩增β-giardin、tpi和gdh基因,扩增产物测序后进行种系发育分析.结果表明,CDZOO1黇鹿源和CDZOO3龟源贾第... 为了解四川省成都市动物园野生动物贾第虫的流行及基因型,本研究采集了146份不同野生动物的新鲜粪便并提取基因组DNA.通过巢式PCR扩增β-giardin、tpi和gdh基因,扩增产物测序后进行种系发育分析.结果表明,CDZOO1黇鹿源和CDZOO3龟源贾第虫通过多位点基因分型(MLG)鉴定为AI-1亚型;CDZOO2鹿源贾第虫为E型(β-giardin基因位点);CDZOO4黇鹿源贾第虫为A型(β-giardin和tpi基因位点);CDZOO5浣熊源和CDZOO6细尾獴源贾第虫在β-giardin位点为D型而在tpi位点为A型. 展开更多
关键词 贾第虫 β-giardin基因 tpi基因 gdh基因 MLG 种系发育 人畜共患
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猴源贾第虫新亚型B11的基因鉴定
9
作者 李威 钟志军 +7 位作者 屈羽 刘学涵 谢娜 邓家波 周紫峣 刘俊卿 程云 彭广能 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期156-160,共5页
运用饱和蔗糖溶液漂浮法收集了26份雅安市碧峰峡野生动物园不同野生动物的粪便寄生虫卵囊,提取DNA,经巢式PCR扩增β-giardin和tpi基因,扩增产物经测序后进行同源性和系统发育分析。结果显示,环尾狐猴(YARTL01)和猕猴(YARM01)感染贾第虫... 运用饱和蔗糖溶液漂浮法收集了26份雅安市碧峰峡野生动物园不同野生动物的粪便寄生虫卵囊,提取DNA,经巢式PCR扩增β-giardin和tpi基因,扩增产物经测序后进行同源性和系统发育分析。结果显示,环尾狐猴(YARTL01)和猕猴(YARM01)感染贾第虫,其中YARTL01分离株为一个新基因亚型,被命名为B11;YARM01分离株为蓝氏贾第虫B1亚型。YARTL01分离株的β-giardin基因序列与环尾狐猴分离株6LC(GenBank登录号HQ616629)的相似率为99.4%,tpi基因序列与猕猴分离株34538(GenBank登录号JX000563)的相似率为98.6%。种系发育分析显示,YARTL01在β-giardin基因位点与聚集体B处于同一分支,而在tpi基因位点,此分离株单独成一分支。YARM01的β-giardin基因序列和tpi基因序列分别与河狸分离株Be1(GenBank登录号EU014382)、猕猴分离株36395(GenBank登录号KC441076)的相似率达到100%;在进化树中,YARM01分离株在β-giardin基因位点与聚集体B处于同一分支,在tpi基因位点此分离株与聚集体B1处于同一个进化分支。本研究是首次报道四川省猴感染贾第虫,其中YARTL01分离株为一个新基因亚型。 展开更多
关键词 贾第虫 巢式PCR β-giardin基因 tpi基因 种系发育分析 亚型 猴
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复齿鼯鼠源贾第虫新亚型B15的基因鉴定
10
作者 弓超 屈羽 +12 位作者 钟志军 刘学涵 谢娜 李威 曹雪峰 邓家波 李奇 廖莉 杨平 杨俊 陈英 谭和林 彭广能 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期879-883,共5页
为了对复齿鼯鼠粪便中分离的贾第虫滋养体进行基因型鉴定,采用饱和蔗糖溶液漂浮法进行卵囊收集,然后提取虫卵的DNA,采用巢式PCR对贾第虫的β-giardin和tpi基因位点进行扩增、测序,建立了系统进化树并进行分析。结果显示,共检测到3株贾... 为了对复齿鼯鼠粪便中分离的贾第虫滋养体进行基因型鉴定,采用饱和蔗糖溶液漂浮法进行卵囊收集,然后提取虫卵的DNA,采用巢式PCR对贾第虫的β-giardin和tpi基因位点进行扩增、测序,建立了系统进化树并进行分析。结果显示,共检测到3株贾第虫分离株,其中HNSMX03分离株为新亚型,被命名为B15,HNSMX20分离株为蓝氏贾第虫的B14亚型和E型混合感染。HNSMX49分离株为蓝氏贾第虫A型。本研究是我国首次报道复齿鼯鼠感染贾第虫,新基因亚型B15的发现为进一步研究我国野生啮齿类动物的流行病学提供了一定的资料。 展开更多
关键词 蓝氏贾第虫 巢式PCR β-giardin基因 tpi基因 复齿鼯鼠
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