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红树植物秋茄中液泡膜内在蛋白(TIP)全长cDNA的克隆和表达分析(英文) 被引量:9
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作者 黄薇 方孝东 +2 位作者 林栖凤 李冠一 赵文明 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期147-152,共6页
利用cDNA快速末端扩增 (RACE )技术获得红树植物秋茄液泡膜内在蛋白 (TIP)的全长cDNA (GenBank登录号 :AF5 2 1135 )。该cDNA全长为 1 1kb ,含有一个 75 6个核苷酸的完整开放阅读框 ,编码 2 5 2个氨基酸 ,等电点为5 77,分子量为 2 6 ... 利用cDNA快速末端扩增 (RACE )技术获得红树植物秋茄液泡膜内在蛋白 (TIP)的全长cDNA (GenBank登录号 :AF5 2 1135 )。该cDNA全长为 1 1kb ,含有一个 75 6个核苷酸的完整开放阅读框 ,编码 2 5 2个氨基酸 ,等电点为5 77,分子量为 2 6 3kD。该氨基酸序列含有 6个跨膜区和两个高度保守的Asparagine proline alanine (NPA)基序。与冬葡萄、花椰菜、拟南芥的TIP相比 ,氨基酸的一致性达到 77%~ 79%。Northern分析表明盐分抑制该基因在红树 3个种中的表达 ,这种下调表达可能降低液泡膜水分渗透 ,有利于盐胁迫下细胞的保水。 展开更多
关键词 红树 秋茄 液泡膜内在蛋白 耐盐性 CDNA 克隆 表达
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油莎豆水通道蛋白基因CeTIP2;1的克隆与分析
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作者 邹智 郑玉皎 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1552-1559,共8页
油莎豆起源于非洲和地中海沿岸,是一种在块茎中高水平积累油脂的新型草本油料作物。水分平衡对于块茎的发育与代谢至关重要。液泡膜内在蛋白(TIP)是一类液泡膜定位并具有高效水分转运活性的水通道蛋白,包含TIP1~5等5个亚类。本研究基于... 油莎豆起源于非洲和地中海沿岸,是一种在块茎中高水平积累油脂的新型草本油料作物。水分平衡对于块茎的发育与代谢至关重要。液泡膜内在蛋白(TIP)是一类液泡膜定位并具有高效水分转运活性的水通道蛋白,包含TIP1~5等5个亚类。本研究基于油莎豆的基因组和转录组数据,采用RT-PCR技术对1个块茎高水平表达的TIP基因CeTIP2;1进行克隆。序列分析表明:CeTIP2;1的基因全长3323 bp,含有2个内含子,编码区长747 bp,编码248个氨基酸,理论分子量为24.73 kDa,等电点为5.09,总平均疏水指数为0.948,脂肪族指数为114.60,不稳定系数为21.76,属于稳定的酸性疏水型蛋白,与其液泡膜定位一致;该蛋白含有保守的MIP结构域,其中包括6个跨膜螺旋、2个半螺旋以及2个典型的NPA基序。CeTIP2;1与AtTIP2;1的序列相似性高达87.20%,远高于与SoPIP2;1的46.23%。进化分析进一步证实,CeTIP2;1隶属于TIP2亚类,是AtTIP2;1的直系同源基因。进化分析同时显示TIP2亚类早在单、双子叶植物分化之前就已经进化出2个小组。表达分析显示:CeTIP2;1在叶片、叶鞘、根、芽尖、匍匐茎、块茎等主要组织中均有较高水平的表达,丰度最高的是块茎和匍匐茎,最低的为芽尖;在块茎的发育过程中,呈现先升后降的钟形趋势,峰值出现在膨大中期,最低的为成熟期。此外,CeTIP2;1还在块茎的蛋白组中被检测到,表明其功能的重要性。这些结果为进一步揭示油莎豆的块茎水分平衡机制奠定坚实的基础。 展开更多
关键词 油料作物 块茎 液泡膜内在蛋白 进化分析 表达模式
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Expressions of Two Rice Mip Genes under Water Stress, Salt Stress and Exogenous ABA
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作者 周志琦 刘强 《Tsinghua Science and Technology》 SCIE EI CAS 1997年第1期22-29,共8页
Two rice cDNAs (rTip1 and rMip1) homologous to soybean nodulin 26 and Arabidopsis γ Tip, encoding major intrinsic protein (Mip) were isolated. The rTip1 was expressed in shoots and roots of rice seedlings and induc... Two rice cDNAs (rTip1 and rMip1) homologous to soybean nodulin 26 and Arabidopsis γ Tip, encoding major intrinsic protein (Mip) were isolated. The rTip1 was expressed in shoots and roots of rice seedlings and induced by water stress, salt stress and exogenous ABA. The rMip1 was expressed only in rice shoots. Although the mRNA level of rMip1 in the shoots was induced to a small extent by exogenous ABA, it did not show any increase under water or salt stress within the course of 12 h . On the basis of the different expression patterns and evolutionary distinctions of the above Mips, it is suggested that the possible Mip channel proteins encoded by the rTip1 and rMip1 genes may function in different transport systems. 展开更多
关键词 major intrinsic protein tonoplast intrinsic protein channel protein EXPRESSION RICE
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NaCl胁迫对菊芋悬浮细胞中TIP家族基因表达的影响 被引量:2
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作者 安慧 赵彤 +2 位作者 宋跃 庞秋颖 阎秀峰 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2373-2382,共10页
液泡膜内在蛋白(TIP)是一类定位于液泡膜或液泡形成体上的水通道蛋白,参与调节并维持胞质与液泡间水分平衡,对植物抵御非生物胁迫至关重要。本研究对菊芋(Helianthus tuberosus) TIP家族基因(HtTIP)进行了生物信息学分析,并以菊芋块茎... 液泡膜内在蛋白(TIP)是一类定位于液泡膜或液泡形成体上的水通道蛋白,参与调节并维持胞质与液泡间水分平衡,对植物抵御非生物胁迫至关重要。本研究对菊芋(Helianthus tuberosus) TIP家族基因(HtTIP)进行了生物信息学分析,并以菊芋块茎诱导获得的悬浮细胞为材料,测定了NaCl处理后HtTIP基因的表达量变化。结果表明,菊芋14个TIP蛋白分别归属于TIP1及TIP2两个亚族, HtTIP家族的蛋白结构特征保守性较强。实时荧光定量PCR分析结果显示,盐胁迫下HtTIP基因家族的表达发生明显变化。在适当浓度(100 mmol·L^-1) NaCl胁迫下,除HtTIP1-4的表达显著下调外,大部分HtTIP在短时间内作出响应,表达明显上调;高盐浓度(150mmol·L^-1 NaCl)处理下,所有HtTIP基因的表达均下调或接近未处理水平。这些结果表明HtTIP对盐胁迫应答迅速,且对不同程度的胁迫存在应答机制差异,不同家族成员的表现也不尽相同。 展开更多
关键词 菊芋 悬浮细胞 液泡膜内在蛋白 盐胁迫 基因表达
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液泡膜内在蛋白基因OsTIP1;1异位表达对油菜根皮层细胞水分关系参数的影响 被引量:2
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作者 张帆 李玉萍 +2 位作者 孙卫宁 殷俐娜 张岁岐 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1863-1870,共8页
在水培条件下,以水稻Os TIP1;1转基因油菜、空载体p HB转基因油菜以及野生型‘沪油15号’油菜为实验材料,用细胞压力探针技术研究正常水分条件和PEG-6000模拟–0.2 MPa水分胁迫条件下,液泡膜内在蛋白基因Os TIP1;1异位表达对油菜根皮层... 在水培条件下,以水稻Os TIP1;1转基因油菜、空载体p HB转基因油菜以及野生型‘沪油15号’油菜为实验材料,用细胞压力探针技术研究正常水分条件和PEG-6000模拟–0.2 MPa水分胁迫条件下,液泡膜内在蛋白基因Os TIP1;1异位表达对油菜根皮层细胞水分关系参数的影响。结果表明,与正常水分条件相比,水分胁迫显著降低了细胞膨压(P)以及细胞水导(Lp),而使细胞壁体积弹性模量(ε)和水分跨膜转运半时间(TW1/2)增加。在两种水分条件下,细胞膨压(P)和细胞水导(Lp)都表现为Os TIP1;1转基因油菜>空载体p HB转基因油菜以及野生型油菜,而Os TIP1;1转基因油菜的TW1/2显著小于其他两种油菜,ε值在正常水分条件下明显小于其他两种油菜,水分胁迫后不同材料间差异不显著。说明水稻液泡膜内在蛋白基因Os TIP1;1在转基因油菜中异位表达可提高油菜根系的水分运输效率。 展开更多
关键词 油菜 液泡膜内在蛋白 细胞压力探针 水分胁迫 水力学参数
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桃果实水孔蛋白cDNA的分离 被引量:2
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作者 Sumiko Sugaya Hiroshi Gemma +1 位作者 Shuichi Iwahori 刘广树 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第z1期560-562,共3页
使用逆转录聚合酶链失反应(RT-PCR)技术从桃果实的果皮组织中分离出来2个编码水孔蛋白部分cDNA克隆。比较结果表明,其推导的氨基酸序列与从其他一些植物体中分离出来的液泡膜内在蛋白有很高的同源性。数量PCR分析表明,编码水孔蛋白基因p... 使用逆转录聚合酶链失反应(RT-PCR)技术从桃果实的果皮组织中分离出来2个编码水孔蛋白部分cDNA克隆。比较结果表明,其推导的氨基酸序列与从其他一些植物体中分离出来的液泡膜内在蛋白有很高的同源性。数量PCR分析表明,编码水孔蛋白基因pWC1在果实发育早期表达,而pWC2在果实发育期间全过程均有表达。 展开更多
关键词 水孔蛋白 液泡膜内在蛋白 果实
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菠萝液泡膜水通道蛋白基因AcTIP1-1的克隆、重组载体构建
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作者 董乐 李小琴 +5 位作者 王芳 陈明贤 麻彤辉 陈洪彬 邱吕萍 陈月钗 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2020年第1期61-68,共8页
以菠萝(Ananas comosus(Linn.)Merr.)果实为材料,通过RT-PCR分别扩增液泡膜水通道蛋白基因(AcTIP1-1)(GenBank登录号:XM_020238793.1)的开放阅读框(ORF)和编码区(CDS)序列,序列长度分别为753 bp和750 bp.将ORF序列亚克隆到载体pET32a(+)... 以菠萝(Ananas comosus(Linn.)Merr.)果实为材料,通过RT-PCR分别扩增液泡膜水通道蛋白基因(AcTIP1-1)(GenBank登录号:XM_020238793.1)的开放阅读框(ORF)和编码区(CDS)序列,序列长度分别为753 bp和750 bp.将ORF序列亚克隆到载体pET32a(+)上,CDS序列被亚克隆到载体pSP64 Poly(A)上,构建成重组载体pET32a(+)-AcTIP1-1和pSP64 Poly(A)-AcTIP1-1.pET32a(+)-AcTIP1-1可为诱导表达并纯化融合蛋白制备抗体,pSP64 Poly(A)-AcTIP1-1可为制备含有Poly(A)+的AcTIP1-1转录子奠定基础. 展开更多
关键词 菠萝 液泡膜水通道蛋白 基因克隆 载体构建 体外转录
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基于Perl脚本的大豆核苷酸序列高通量提取 被引量:3
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作者 张大勇 王长彪 +2 位作者 易金鑫 何晓兰 马鸿翔 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期7-13,共7页
自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量... 自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量分析,还可用于某个基因在全基因组中的所有序列分析。本研究分别对大豆第4染色体Glyma04g00930.1~Glyma04g01740.1区间的基因序列和水通道蛋白基因家族成员TIP(液泡膜水通道蛋白)序列进行提取。结果发现:Glyma04g00930.1~Glyma04g01740.1区间共含有112个基因序列;大豆全基因组共有91个TIP基因,在20条染色体上均有分布,且在第12染色体上分布最多,多达10个,暗示该染色体可能对大豆的水分利用效率起着重要作用,基因所含内含子数为1~8个。序列提取所用的2个脚本程序可以从http://www.zlhyd.com/sxbi/soybean_strict.rar下载。 展开更多
关键词 大豆全基因组 序列提取 序列分析 液泡膜水通道蛋白 Perl程序
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毛竹TIP基因成员鉴定及其响应胁迫的表达分析
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作者 朱成磊 杨克彬 高志民 《世界竹藤通讯》 2021年第1期1-11,共11页
液泡膜内在水通道蛋白(TIPs)在调节植物细胞膨压适应逆境胁迫环境过程中发挥着重要作用。研究毛竹TIP基因成员的分子特征及其在不同逆境胁迫条件下的表达模式,对揭示其在毛竹应答胁迫中的功能具有重要意义。利用生物信息学方法在毛竹基... 液泡膜内在水通道蛋白(TIPs)在调节植物细胞膨压适应逆境胁迫环境过程中发挥着重要作用。研究毛竹TIP基因成员的分子特征及其在不同逆境胁迫条件下的表达模式,对揭示其在毛竹应答胁迫中的功能具有重要意义。利用生物信息学方法在毛竹基因组中共鉴定19个编码完整TIP蛋白的基因(PeTIP1-1~PeTIP1-3、PeTIP2-1~PeTIP2-4、PeTIP3-1~PeTIP3-2、PeTIP4-1~PeTIP4-7和PeTIP5-1~PeTIP5-3);PeTIPs编码氨基酸的长度为238~434 aa,相对分子量为25.06~44.03 kDa;亚细胞位置预测显示,所有PeTIPs均定位于液泡膜上。PeTIPs包含7个保守基序,其中有4个为共有基序,不同成员的Ar/R选择性过滤器具有一定的差异,而Froger's残基均较为保守。系统进化分析显示,来自毛竹、水稻等6个物种的71条TIP氨基酸序列可分为5个分支,各分支中PeTIPs成员依次为3、4、2、7和3个。共线性分析结果表明,PeTIPs成员间共存在10对片段重复,在12个PeTIPs与水稻8个TIP基因间发现18对片段重复,这些重复基因多半发生在PeTIP4s和PeTIP5s中,且基因对的非同义对同义取代比(Ka/Ks)均小于1.0,表明PeTIPs经复制后的功能差异不大。在PeTIPs启动子区域中,发现多种与胁迫、激素响应相关的调控元件。基于叶片RNA-seq数据分析表明,不同PeTIPs响应低温、干旱和强光胁迫的表达模式均存在一定差异,既有显著性变化的成员(如PeTIP1-1和PeTIP1-2),也有几乎无变化的成员(如PeTIP5的成员)。qPCR结果显示,在不同胁迫条件下毛竹叶片和根中的PeTIPs的表达模式不同,多数呈现不同程度的显著上调,亦有在某一处理下基因表达变化不明显(如强光下叶片中的PeTIP1-1、PeTIP1-3和PeTIP4-2;干旱下根中的PeTIP1-1和PeTIP1-2),个别基因呈现下调(如低温下叶片中的PeTIP1-1)。毛竹叶片和根中PeTIPs的表达变化模式差异,说明它们在响应不同环境胁迫中可能发挥着不同的作用。 展开更多
关键词 毛竹 液泡膜内在水通道蛋白 分子特征 逆境胁迫 基因表达
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