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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
1
作者
尹明华
曾淑琴
+3 位作者
曾荧
张彩霞
张慧博
张丽佳
《种子》
北大核心
2022年第3期45-51,共7页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和...
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77%)、β-片层(16.14%)、无规则卷曲(55.09%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。
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关键词
怀玉山三叶青
烟草病毒增殖蛋白
2
A
基因克隆
亚细胞定位
表达分析
下载PDF
职称材料
怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因克隆和功能分析
被引量：
1
2
作者
尹明华
胡嘉琦
+7 位作者
胡明艳
胡蓉
胡燕荣
黄舒绮
江梦芝
姜梦真
陈荣华
蔡红
《山东农业科学》
北大核心
2021年第8期1-10,共10页
为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,...
为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,并采用生物信息学、转基因瞬时表达和实时定量PCR方法对其进行序列分析、亚细胞定位、组织表达分析和功能分析。结果表明,怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因cDNA总长度为432bp,G+C含量为50.46%;编码143个氨基酸,分子量15392.36Da,等电点7.87,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(50.35%)、β-片层(2.10%)、无规则卷曲(47.55%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青TOM2BisoformX1主要存在于细胞核中;怀玉山三叶青TOM2BisoformX1与葡萄(Vitis vinifera)TOM2BisoformX1(GenBank:XP_010664025.1)的同源性最高,达到83.92%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,TOM2BisoformX1定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,TOM2BisoformX1基因在怀玉山三叶青两个栽培种中的表达存在器官特异性,‘怀玉2号’和‘怀玉1号’均在叶中表达量最高;TOM2BisoformX1转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于TOM2BisoformX1转基因阴性烟草;与转基因阴性烟草相比,转基因阳性烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青TOM2BisoformX1具有典型TOM2BisoformX1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。
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关键词
怀玉山三叶青
TOM
2
BisoformX1
基因克隆
功能分析
下载PDF
职称材料
题名
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
1
作者
尹明华
曾淑琴
曾荧
张彩霞
张慧博
张丽佳
机构
上饶师范学院生命科学学院
上饶农业技术创新研究院
上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室
上饶市三叶青保育与利用技术创新中心
出处
《种子》
北大核心
2022年第3期45-51,共7页
基金
国家自然科学基金(31960079)
江西省科技厅重点研发计划一般项目(20192 BBGL 70050
+4 种基金
20202 BBG 73010)
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ 201704)
上饶市科技局重点研发计划一般项目(2020 C 002)
上饶市科技局平台载体建设项目(2020 J 001)
上饶市科技局平台载体建设项目(2019 I 017)。
文摘
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77%)、β-片层(16.14%)、无规则卷曲(55.09%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。
关键词
怀玉山三叶青
烟草病毒增殖蛋白
2
A
基因克隆
亚细胞定位
表达分析
Keywords
Tetrastigma
hemsleyanum
Diels
et
Gilg
in
Huaiyushan
tobamovirus
multiplication
protein
2
A
gene
cloning
subcellular
localization
expression
analysis
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因克隆和功能分析
被引量：
1
2
作者
尹明华
胡嘉琦
胡明艳
胡蓉
胡燕荣
黄舒绮
江梦芝
姜梦真
陈荣华
蔡红
机构
上饶师范学院生命科学学院
上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室
上饶市三叶青保育与利用技术创新中心
上饶农业技术创新研究院
上饶市红日农业开发有限公司
出处
《山东农业科学》
北大核心
2021年第8期1-10,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31960079)
江西省科技厅重点研发计划一般项目(20192BBGL70050
+3 种基金
20202BBG73010)
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ201704)
上饶市科技局重点研发计划一般项目(2020C002)
上饶市科技局平台载体建设项目(2020J001,2019I017)。
文摘
为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,并采用生物信息学、转基因瞬时表达和实时定量PCR方法对其进行序列分析、亚细胞定位、组织表达分析和功能分析。结果表明,怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因cDNA总长度为432bp,G+C含量为50.46%;编码143个氨基酸,分子量15392.36Da,等电点7.87,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(50.35%)、β-片层(2.10%)、无规则卷曲(47.55%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青TOM2BisoformX1主要存在于细胞核中;怀玉山三叶青TOM2BisoformX1与葡萄(Vitis vinifera)TOM2BisoformX1(GenBank:XP_010664025.1)的同源性最高,达到83.92%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,TOM2BisoformX1定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,TOM2BisoformX1基因在怀玉山三叶青两个栽培种中的表达存在器官特异性,‘怀玉2号’和‘怀玉1号’均在叶中表达量最高;TOM2BisoformX1转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于TOM2BisoformX1转基因阴性烟草;与转基因阴性烟草相比,转基因阳性烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青TOM2BisoformX1具有典型TOM2BisoformX1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。
关键词
怀玉山三叶青
TOM
2
BisoformX1
基因克隆
功能分析
Keywords
Tetrastigma
hemsleyanum
Diels
et
Gilg
in
Huaiyushan
tobamovirus
multiplication
protein
2B(TOM2B)isoform
X1
Gene
cloning
Functional
analysis
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
Q781 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
尹明华
曾淑琴
曾荧
张彩霞
张慧博
张丽佳
《种子》
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
2
怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因克隆和功能分析
尹明华
胡嘉琦
胡明艳
胡蓉
胡燕荣
黄舒绮
江梦芝
姜梦真
陈荣华
蔡红
《山东农业科学》
北大核心
2021
1
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职称材料
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