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黄瓜绿斑驳花叶病毒辽宁分离物全基因组序列测定 被引量:22
1
作者 陈红运 林石明 +4 位作者 陈青 赵文军 廖富荣 陈洪俊 朱水芳 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期68-72,共5页
以感病组织总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增并测定黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)辽宁分离物(CGMMV-LN)的基因组全序列。CGMMV-LN基因组全长6 422 nt,5'非编码区(noncoding region,NCR)和3'NCR... 以感病组织总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增并测定黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)辽宁分离物(CGMMV-LN)的基因组全序列。CGMMV-LN基因组全长6 422 nt,5'非编码区(noncoding region,NCR)和3'NCR分别为59 nt和175 nt。CGMMV-LN编码的4个蛋白依次是186 kD和129kD的复制酶,29 kD的移动蛋白和17.4 kD的外壳蛋白。CGMMV-LN与其他4个CGMMV分离物基因组核苷酸序列同源性为97.6%~99.3%,与同属其他3种病毒基因组核苷酸序列同源性仅为61.7%~62.8%。基于186kD复制酶和外壳蛋白氨基酸序列的同源树显示:侵染葫芦科作物的烟草花叶病毒属病毒可分为2个亚组,亚组I包括所有CGMMV分离物,亚组II包括Kyuri绿斑驳花叶病毒(Kyuri green mottle mosaic virus,KGMMV)、黄瓜果实斑驳花叶病毒(Cucumber fruit mottle mosaic virus,CFMMV)和小西葫芦绿斑驳花叶病毒(Zucchini greenmottle mosaic virus,ZGMMV)。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 烟草花叶病毒属 序列分析
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烟草花叶病毒属研究新进展 被引量:14
2
作者 侯红琴 谭志琼 张振臣 《中国农学通报》 CSCD 2008年第5期304-307,共4页
烟草花叶病毒属(Tobamovirus)病毒在世界各地均有分布,能侵染茄科、葫芦科、十字花科等重要作物并引起严重危害。Tobamovirus病毒基因组为单链正义RNA。从该属病毒种类、分类依据、基因组学以及进化关系等方面,对近年来的国内外研究进... 烟草花叶病毒属(Tobamovirus)病毒在世界各地均有分布,能侵染茄科、葫芦科、十字花科等重要作物并引起严重危害。Tobamovirus病毒基因组为单链正义RNA。从该属病毒种类、分类依据、基因组学以及进化关系等方面,对近年来的国内外研究进展进行了简要总结。 展开更多
关键词 烟草花叶病毒属 种类 基因组学 进化关系
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Detection and characterization of an isolate of Tomato mottle mosaic virus infecting tomato in China 被引量:9
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作者 ZHAN Bin-hui CAO Ning +1 位作者 WANG Kai-na ZHOU Xue-ping 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期1207-1212,共6页
Tomato(Solanum lycopersicum) plants exhibiting severe leaf distortion, mottle and systemic crinkling symptoms were identified in Hainan province in China in 2016. To survey and control the disease, it is necessary t... Tomato(Solanum lycopersicum) plants exhibiting severe leaf distortion, mottle and systemic crinkling symptoms were identified in Hainan province in China in 2016. To survey and control the disease, it is necessary to identify and characterize the pathogen causing the disease. Dot enzyme-linked immunosorbent assay showed that the crude saps of the infected tomato samples reacted positively with the monoclonal antibody against Tobacco mosaic virus which indicated that one or more tobamoviruses are likely associated with the disease. RT-p CR and DNA sequence analysis results further elucidated that Tomato mottle mosaic virus(To MMV) in Tobamovirus was the pathogen causing the mottle disease in tomato. We amplified and sequenced the full-length sequence of the genome which showed the highest nucleotide identity with To MMV YYMLJ and To MMV Ti Lha LJ isolates. The putative virus isolate was named To MMV Hainan. Biological indexing studies showed that To MMV Hainan can infect Nicotiana benthamiana, Capsicum annuum and Solanum lycopersicum showing serious symptoms. This was the first identification and characterization of To MMV infecting tomato in Hainan of China. 展开更多
关键词 Tomato mottle mosaic virus tomato tobamovirus dot-ELISA biological characterization
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番茄褐色皱纹果病毒的发生分布及防控对策 被引量:11
4
作者 张宇 张松柏 +4 位作者 张德咏 刘慧 张战泓 张友军 刘勇 《中国蔬菜》 北大核心 2020年第5期12-17,共6页
番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的新成员,主要危害番茄、辣椒等茄科作物。2014年在以色列番茄上首次发现该病毒,随后快速扩展至欧洲、美洲的茄科作物主产区。2019年我国山... 番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的新成员,主要危害番茄、辣椒等茄科作物。2014年在以色列番茄上首次发现该病毒,随后快速扩展至欧洲、美洲的茄科作物主产区。2019年我国山东发现ToBRFV侵染番茄,要警惕该病毒在我国暴发危害。本文综述了国内外ToBRFV的分布、为害症状、传播途径、鉴定方法以及致病性等方面的研究进展,并结合烟草花叶病毒属病毒的侵染循环特征,提出防控对策;此外,对未来的研究重点、防控技术研发等进行了展望。 展开更多
关键词 番茄褐色皱纹果病毒 烟草花叶病毒属 茄科作物 发生分布 防控对策 综述
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Biological and molecular characterization of tomato brown rugose fruit virus and development of quadruplex RT-PCR detection 被引量:7
5
作者 YAN Zhi-yong ZHAO Mei-sheng +5 位作者 MA Hua-yu LIU Ling-zhi YANG Guang-ling GENG Chao TIAN Yan-ping LI Xiang-dong 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2021年第7期1871-1879,共9页
Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV) is a novel tobamovirus firstly reported in 2015 and poses a severe threat to the tomato industry. So far, it has spread to 10 countries in America, Asia, and Europe. In 2019, To... Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV) is a novel tobamovirus firstly reported in 2015 and poses a severe threat to the tomato industry. So far, it has spread to 10 countries in America, Asia, and Europe. In 2019, ToBRFV was identified in Shandong Province(ToBRFV-SD), China. In this study, it was shown that ToBRFV-SD induced mild to severe mosaic and blistering on leaves, necrosis on sepals and pedicles, and deformation, yellow spots, and brown rugose necrotic lesions on fruits. ToBRFV-SD induced distinct symptoms on plants of tomato, Capsicum annumm, and Nicotiana benthamiana, and caused latent infection on plants of Solanum tuberosum, Solanum melongena, and N. tabacum cv. Zhongyan 102. All the 50 tomato cultivars tested were highly sensitive to ToBRFV-SD. The complete genomic sequence of ToBRFV-SD shared the highest nucleotide and amino acid identities with isolate IL from Israel. In the phylogenetic tree constructed with the complete genomic sequence, all the ToBRFV isolates were clustered together and formed a sister branch with tobacco mosaic virus(TMV). Furthermore, a quadruplex RT-PCR system was developed that could differentiate ToBRFV from other economically important viruses affecting tomatoes, such as TMV, tomato mosaic virus, and tomato spotted wilt virus. The findings of this study enhance our understanding of the biological and molecular characteristics of ToBRFV and provide an efficient and effective detection method for multiple infections, which is helpful in the management of ToBRFV. 展开更多
关键词 host range identity quadruplex RT-PCR detection phylogenetic tree SYMPTOM tobamovirus tomato brown rugose fruit virus
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油菜花叶病毒Wh株系的鉴定 被引量:6
6
作者 蔡丽 许泽永 +2 位作者 陈坤荣 晏立英 侯明生 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期367-372,共6页
依据病毒的寄主植物反应、血清学性质和 RNA 3′末端含 cp 和 mp 基因1554 bp cDNA 片段序列分析,明确一个侵染油菜的烟草花叶病毒属 Tobamovirus 病毒分离物是油菜花叶病毒(Oilseedrape mosaic virus,ORMV)的一个株系,定名为 Wh 株系。... 依据病毒的寄主植物反应、血清学性质和 RNA 3′末端含 cp 和 mp 基因1554 bp cDNA 片段序列分析,明确一个侵染油菜的烟草花叶病毒属 Tobamovirus 病毒分离物是油菜花叶病毒(Oilseedrape mosaic virus,ORMV)的一个株系,定名为 Wh 株系。ORMV-Wh 侵染油菜、白菜和大白菜等十字花科的作物,初期产生典型明脉症状,对辣椒、番茄和烟草等茄科植物致病性弱;血清学与烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)有明显差异。ORMV-Wh mp、cp 基因和3′UTR 区段大小分别为798、474和235个核苷酸,mp 和 cp 基因有77个核苷酸重叠;与 TMV 序列同源性在60%以下,与侵染十字花科 Tobamovirus 属病毒株系序列同源性在80%以上;其中与 ORMV 的不同株系 RMV-CAB、RMV-Sh、YoMV、YoMV-Cg 和 CTMV-W 的同源性在90%以上。 展开更多
关键词 油菜花叶病毒 鉴定 烟草花叶病毒属
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北京、山东、陕西部分地区番茄褐色皱纹果病毒的检测及同源性分析 被引量:5
7
作者 高文征 范丽娜 +9 位作者 李晓东 陈一帆 邱卓瑶 黄泽军 李君明 舒金帅 刘磊 国艳梅 杜永臣 王孝宣 《中国蔬菜》 北大核心 2021年第4期48-52,共5页
番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)于2015年在约旦被首次报道,随即迅速在全世界蔓延。本试验对北京南口、山东寿光及陕西白水出现的疑似ToBRFV典型症状的感病植株的保守结构域进行RT-PCR扩增检测,结果表明ToB... 番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)于2015年在约旦被首次报道,随即迅速在全世界蔓延。本试验对北京南口、山东寿光及陕西白水出现的疑似ToBRFV典型症状的感病植株的保守结构域进行RT-PCR扩增检测,结果表明ToBRFV已经在北京、山东和陕西发生。对ToBRFV保守基因RdRP测序发现,北京、山东、陕西感病材料的ToBRFV RdRP基因遗传距离较近,与其他国家的ToBRFV RdRP基因遗传距离较远。 展开更多
关键词 番茄褐色皱纹果病毒 烟草花叶病毒属 RT-PCR RdRP基因
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Robust molecular detection of the new Tomato brown rugose fruit virus in infected tomato and pepper plants from Turkey 被引量:4
8
作者 Hakan FIDAN Pelin SARIKAYA +3 位作者 Kubra YILDIZ Bengi TOPKAYA Gozde ERKIS Ozer CALIS 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2021年第8期2170-2179,共10页
Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV)causes severe fruit loss in tomato(Solanum lycopersicum)and pepper(Capsicum annuum)plants.It is an emerging Tobamovirus that is spreading globally.The major challenge is to devel... Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV)causes severe fruit loss in tomato(Solanum lycopersicum)and pepper(Capsicum annuum)plants.It is an emerging Tobamovirus that is spreading globally.The major challenge is to develop a reliable method for the detection of the virus,and to better characterize the symptoms it causes.The aims of this study,therefore,were to characterize the symptom development on tomato and pepper plants,and to establish a reliable detection method for the virus.Following infection of the tomato and pepper plants with ToBRFV,the leaves turned chlorotic,mosaic or mottled,while the fruit became rugose,necrotic and marbled,and showed discoloration with yellow or brown spots.Transmission electron microscopy(TEM)revealed single rod-like virus particles characteristic of the Tobamoviruses.Classical reverse transcription PCR(RT-PCR)and quantitative PCR(qPCR)with specific primers and probes confirmed that the virus is ToBRFV.We found that the resistance genes from tomato,Tm-2^(2),and pepper,L1,L2,L3 and L4,did not confer resistance to ToBRFV.Here,we present a PCR-based method as a diagnostic test for detecting ToBRFV in infected seeds.This method will help to prevent further spread of the virus in commercial seeds. 展开更多
关键词 TOMATO PEPPER tobamovirus ToBRFV resistance
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An Attenuated Strain of Cucumber Green Mottle Mosaic Virus as a Biological Control Agent against Pathogenic Viral Strains
9
作者 Anna A. Slavokhotova Ekaterina A. Istomina +4 位作者 Emma N. Andreeva Tatyana V. Korostyleva Vitalij A. Pukhalskij Alexander N. Shijan Tatyana I. Odintsova 《American Journal of Plant Sciences》 2016年第5期724-732,共9页
Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), a member of the Tobamovirus genus, causes a severe disease of cucurbits. In the Moscow region of Russian Federation, the incidence of infection on cucumber plants in greenho... Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), a member of the Tobamovirus genus, causes a severe disease of cucurbits. In the Moscow region of Russian Federation, the incidence of infection on cucumber plants in greenhouses is high;however, the virus is poorly studied. In this work, the full-length genomes of two pathogenic MC-1 and MC-2 strains of CGMMV isolated from cucumber plants grown in greenhouses in the Moscow region and the attenuated VIROG-43M strain were sequenced. Comparison of VIROG-43M nucleotide sequence with those of the pathogenic strains revealed three missense mutations. Their role in attenuation is discussed. For the first time, in a number of trials conducted under laboratory conditions and in commercial greenhouses, the efficiency of the attenuated VIROG-43M strain as a biocontrol agent for cucumber plant protection resulting in significant yield gain was demonstrated. Phylogenetic analysis with 83 full-length CGMMV coat protein genes isolated in 16 different countries showed that Russian strains are related to isolates from Spain, Greece, USA and Israel. 展开更多
关键词 Cucumber Green Mottle Mosaic Virus tobamovirus Attenuated Virus Strain CROSS-PROTECTION Biological Control
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Tomato mottle mosaic virus: Characterization, resistance gene effectiveness, and quintuplex RT-PCR detection system
10
作者 Carlos Kwesi TETTEY YAN Zhi-yong +4 位作者 MA Hua-yu ZHAO Mei-sheng GENG Chao TIAN Yan-ping LI Xiang-dong 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第9期2641-2651,共11页
Tomato mottle mosaic virus(ToMMV), an economically important species of the genus Tobamovirus, causes significant loss in yield and quality of tomato fruits. Here, we identified the Shandong isolate of ToMMV(ToMMV-SD)... Tomato mottle mosaic virus(ToMMV), an economically important species of the genus Tobamovirus, causes significant loss in yield and quality of tomato fruits. Here, we identified the Shandong isolate of ToMMV(ToMMV-SD) collected from symptomatic tomato fruits in Weifang, Shandong Province of China. ToMMV-SD caused symptoms such as severe mosaic, mottling, and necrosis of tomato leaves, yellow spot and necrotic lesions on tomato fruits. The obtained full genome of ToMMV-SD was 6 399 nucleotides(accession number MW373515) and had the highest identity of 99.5% with that of isolate SC13-051 from the United States of America at the genomic level. The infectious clone of ToMMV-SD was constructed and induced clear mosaic and necrotic symptoms onto Nicotiana benthamiana leaves. Several commercial tomato cultivars, harboring Tm-2~2 resistance gene, and pepper cultivars, containing L resistance gene, were susceptible to ToMMV-SD. Plants of Solanum melongena(eggplant) and Brassica pekinensis(napa cabbage) showed mottling symptoms, while N. tabacum cv. Zhongyan 100 displayed latent infection. ToMMV-SD did not infect plants of N. tabacum cv. Xanthi NN, Brassica rapa ssp. chinensis(bok choy), Raphanus sativus(radish), Vigna unguiculata cv. Yuanzhong 28-2(cowpea), or Tm-2~2 transgenic N. benthamiana. A quintuplex RT-PCR system differentiated ToMMV from tomato mosaic virus, tomato brown rugose fruit virus, tobacco mosaic virus, and tomato spotted wilt virus, with the threshold amount of 0.02 pg. These results highlight the threat posed by ToMMV to tomato and pepper cultivation and offer an efficient detection system for the simultaneous detection of four tobamoviruses and tomato spotted wilt virus infecting tomato plants in the field. 展开更多
关键词 host range multiplex RT-PCR resistance genes SYMPTOM tobamovirus tomato mottle mosaic virus
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油菜花叶病毒的研究进展及其防治 被引量:1
11
作者 赵贤雷 《生物化工》 2019年第5期158-162,共5页
油菜花叶病毒是一种能够侵染十字花科、茄科、葫芦科等植物的植物RNA病毒,其属于烟草花叶病毒属的亚属Ⅲ型病毒。油菜花叶病是油菜的主要病毒病害,在我国各大油菜产区均有分布,每年因此造成较大经济损失。研究油菜花叶病毒对缓解油菜病... 油菜花叶病毒是一种能够侵染十字花科、茄科、葫芦科等植物的植物RNA病毒,其属于烟草花叶病毒属的亚属Ⅲ型病毒。油菜花叶病是油菜的主要病毒病害,在我国各大油菜产区均有分布,每年因此造成较大经济损失。研究油菜花叶病毒对缓解油菜病毒病及其他蔬菜病毒病害的防治有重大意义。本文详细介绍ORMV-SX、ORMV-Wh、ORMV-Sh、ORMV-Br四种类型油菜花叶病毒,并对油菜花叶病毒的防治进行总结。 展开更多
关键词 油菜花叶病毒 烟草花叶病毒属 防治
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云南红河州番茄褐色皱纹果病毒检测
12
作者 吴阔 陈永对 +3 位作者 王田田 吴少政 朱若萌 张仲凯 《贵州农业科学》 CAS 2022年第12期71-75,共5页
【目的】建立云南红河州番茄褐色果病的检测技术,为控制其传播和治疗提供支撑。【方法】采用电子显微镜负染色观察、ELISA检测以及外壳蛋白基因序列RT-PCR检测及序列分析,明确云南红河州番茄褐色皱果病的病原。【结果】电子显微镜观察... 【目的】建立云南红河州番茄褐色果病的检测技术,为控制其传播和治疗提供支撑。【方法】采用电子显微镜负染色观察、ELISA检测以及外壳蛋白基因序列RT-PCR检测及序列分析,明确云南红河州番茄褐色皱果病的病原。【结果】电子显微镜观察到病毒粒子为长300 nm、直径18 nm的杆状病毒,ELISA检测发现与烟草花叶病毒属的烟草花叶病毒(TMV)和番茄花叶病毒(ToMV)有血清学反应;RT-PCR扩增获得的目的片段与番茄褐色皱纹果病毒的病毒基因相似性达99.81%。【结论】引起云南红河番茄褐色皱纹果病的病原是烟草花叶病毒属的番茄褐色皱果病毒。 展开更多
关键词 番茄褐色皱纹果病毒 烟草花叶病毒属 快速检测 细胞学
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新疆辣椒轻微斑驳病毒的分离鉴定 被引量:40
13
作者 向本春 谢浩 +4 位作者 崔星明 李春 刘素萍 席德慧 尹玉琦 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第3期240-245,共6页
从石河子露地辣椒病株上分离到一株病毒分离物(代号P—2),引起辣椒轻微斑驳。该分离物经人工接种能侵染5科9种植物。感染的辣椒种子可传毒,但桃蚜不能传播,P—2致死温度90℃,稀释限点1O-9,体外保毒期50天以上。病... 从石河子露地辣椒病株上分离到一株病毒分离物(代号P—2),引起辣椒轻微斑驳。该分离物经人工接种能侵染5科9种植物。感染的辣椒种子可传毒,但桃蚜不能传播,P—2致死温度90℃,稀释限点1O-9,体外保毒期50天以上。病毒颗粒呈杆状,稍弯曲,大小为295±10×17nm:辣椒病组织超薄切片可见大量以平行或交叉排列的病毒集结体。该分离物与辣椒轻微斑驳病(PMMV)抗血清呈阳性反应。在辣椒上与TMV无任何交叉保护,SDS—聚丙烯酰胺凝胶电泳测得:P—2蛋白亚基由单一组分组成,分子量为17kD,其氨基酸组成明显不同于TMV。琼脂糖凝胶电泳测得:该分离物RNA的分子量为2.10×106。根据上述特性,认为该分离物隶属于PMMV。这是该种病毒在我国的首次报道。 展开更多
关键词 辣椒 轻微斑驳病毒 分离 鉴定
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VFB诱导烟草叶片生理生化变化与TMV抗性的关系 被引量:8
14
作者 殷培军 马志卿 +2 位作者 冯俊涛 杨少雄 张兴 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期91-95,共5页
用VFB对烟草花叶病进行预防和治疗处理,对其抗TMV作用进行初步探讨。结果表明:用VFB的两种处理方式均可使受侵普通烟的叶绿素总含量明显升高,且预防处理要好于治疗处理;可显著降低丙二醛(MDA)的含量;可诱导普通烟中多酚氧化酶(PPO)和过... 用VFB对烟草花叶病进行预防和治疗处理,对其抗TMV作用进行初步探讨。结果表明:用VFB的两种处理方式均可使受侵普通烟的叶绿素总含量明显升高,且预防处理要好于治疗处理;可显著降低丙二醛(MDA)的含量;可诱导普通烟中多酚氧化酶(PPO)和过氧化物酶(POD)的活性增强。可见,VFB是一种良好的植物源病毒抑制剂,可诱导植物产生抗病性,增强对TMV侵染的抵抗力。 展开更多
关键词 生理生化变化 TMV抗性 烟草叶片 诱导 过氧化物酶(POD) 丙二醛(MDA) 烟草花叶病 多酚氧化酶 病毒抑制剂 预防处理 叶绿素 植物源 抗病性 抵抗力 治疗 含量 侵染
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烟草花叶病毒属条形码鉴定方法的建立 被引量:1
15
作者 张永江 马荣群 +1 位作者 辛言言 黄粤 《湖北农业科学》 2015年第11期2624-2627,共4页
烟草花叶病毒属病毒可侵染多种植物,给农业生产带来严重危害。为建立该病毒属的条形码鉴定技术,以该属22个确定种的标准序列为凭证标本序列,分析其保守区域,设计6对候选条形码引物(Tobamo1-Tobamo6),其扩增片段长度为200~1 240 bp。... 烟草花叶病毒属病毒可侵染多种植物,给农业生产带来严重危害。为建立该病毒属的条形码鉴定技术,以该属22个确定种的标准序列为凭证标本序列,分析其保守区域,设计6对候选条形码引物(Tobamo1-Tobamo6),其扩增片段长度为200~1 240 bp。以田间样本对引物进行筛选,通过比较各引物的扩增效率、测序成功率、获得序列的亲缘关系对引物的通用性和物种分辨率进行评价。结果表明,Tobamo6的通用性最高,扩增率和测序成功率均为100%;物种分辨率良好,获得序列的种内种间变异可有效鉴定实际样本中的辣椒轻斑驳病毒、烟草花叶病毒、番茄花叶病毒和黄瓜绿斑驳花叶病毒;可作为烟草花叶病毒属的首选条形码引物。 展开更多
关键词 烟草花叶病毒属(tobamovirus) 条形码技术 鉴定
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应用IC-RT-PCR方法检测齿兰环斑病毒和建兰花叶病毒 被引量:3
16
作者 李志勇 郭京泽 +2 位作者 司贺龙 李兴红 董金皋 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期40-42,共3页
根据已报道的建兰花叶病毒和齿兰环斑病毒外壳蛋白基因序列设计PCR引物,建立了蝴蝶兰建兰花叶病毒和齿兰环斑病毒IC-RT-PCR检测方法。用该方法对天津地区8个蝴蝶兰标样检测,结果显示:8个标样中有4个检测到建兰花叶病毒,另外4个检测到齿... 根据已报道的建兰花叶病毒和齿兰环斑病毒外壳蛋白基因序列设计PCR引物,建立了蝴蝶兰建兰花叶病毒和齿兰环斑病毒IC-RT-PCR检测方法。用该方法对天津地区8个蝴蝶兰标样检测,结果显示:8个标样中有4个检测到建兰花叶病毒,另外4个检测到齿兰环斑病毒。该方法简化了操作程序,为蝴蝶兰种苗病毒的快速检测奠定了基础。 展开更多
关键词 蝴蝶兰 齿兰环斑病毒 建兰花叶病毒 外壳蛋白基因 免疫捕获PCR 序列分析
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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因克隆、亚细胞定位和组织表达分析 被引量:1
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作者 洪森荣 向琼钰 +5 位作者 谢颖 熊晨露 徐晨慧 徐璐珂 陈荣华 蔡红 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期1193-1204,共12页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因的核心片段,利用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因,并采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR进行序列分析和器官表达分析。结果... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因的核心片段,利用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因,并采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR进行序列分析和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因cDNA总长度为888 bp,G+C含量为51.58%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1由295个氨基酸组成,分子量33173.36 u,等电点9.16,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(43.73%)、β-片层(21.69%)、无规则卷曲(34.58%)构成;三级结构为单体;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1主要存在于内质网、内质网-质膜、细胞外、细胞质、线粒体和质膜中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1在进化上与Aegilops tauschii subsp.tauschill(节节麦)、Triticum turgidum subsp.durum(硬粒小麦)、Hordeum vulgare(大麦)的亲缘关系较近,尤其是与Aegilops tauschii subsp.tauschill(节节麦)烟草病毒增殖蛋白1在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白1定位于细胞质(可能包括细胞膜)和细胞核膜中。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,烟草病毒增殖蛋白1基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号在叶中表达量最高,怀玉1号在茎中表达量最高。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1具有典型烟草病毒增殖蛋白1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白1 基因克隆 亚细胞定位 表达分析
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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
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作者 尹明华 曾淑琴 +3 位作者 曾荧 张彩霞 张慧博 张丽佳 《种子》 北大核心 2022年第3期45-51,共7页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77%)、β-片层(16.14%)、无规则卷曲(55.09%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白2 A 基因克隆 亚细胞定位 表达分析
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怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因克隆和功能分析 被引量:1
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作者 尹明华 胡嘉琦 +7 位作者 胡明艳 胡蓉 胡燕荣 黄舒绮 江梦芝 姜梦真 陈荣华 蔡红 《山东农业科学》 北大核心 2021年第8期1-10,共10页
为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,... 为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,并采用生物信息学、转基因瞬时表达和实时定量PCR方法对其进行序列分析、亚细胞定位、组织表达分析和功能分析。结果表明,怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因cDNA总长度为432bp,G+C含量为50.46%;编码143个氨基酸,分子量15392.36Da,等电点7.87,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(50.35%)、β-片层(2.10%)、无规则卷曲(47.55%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青TOM2BisoformX1主要存在于细胞核中;怀玉山三叶青TOM2BisoformX1与葡萄(Vitis vinifera)TOM2BisoformX1(GenBank:XP_010664025.1)的同源性最高,达到83.92%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,TOM2BisoformX1定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,TOM2BisoformX1基因在怀玉山三叶青两个栽培种中的表达存在器官特异性,‘怀玉2号’和‘怀玉1号’均在叶中表达量最高;TOM2BisoformX1转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于TOM2BisoformX1转基因阴性烟草;与转基因阴性烟草相比,转基因阳性烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青TOM2BisoformX1具有典型TOM2BisoformX1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 TOM2BisoformX1 基因克隆 功能分析
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