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西方蜜蜂磁受体基因AmMagR的克隆及表达分析
被引量：
2
1
作者
赵方媛
李茫
+3 位作者
张含
廖春华
王子龙
颜伟玉
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1321-1328,共8页
本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera磁受体基因AmMagR的序列,并分析该基因在工蜂不同日龄、不同组织中的表达特征,以期为该基因的功能研究提供理论基础。以西方蜜蜂工蜂为材料,提取其总RNA,通过RT-PCR技术克隆西方蜜蜂MagR基因的序列...
本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera磁受体基因AmMagR的序列,并分析该基因在工蜂不同日龄、不同组织中的表达特征,以期为该基因的功能研究提供理论基础。以西方蜜蜂工蜂为材料,提取其总RNA,通过RT-PCR技术克隆西方蜜蜂MagR基因的序列;利用多种生物信息学软件对其核酸及氨基酸序列分析;采用实时荧光定量PCR技术(qPCR)分析在西方蜜蜂工蜂不同日龄(1日龄、5日龄和21日龄)和不同组织(头部、胸部和腹部)中MagR基因的相对表达量。克隆到西方蜜蜂MagR基因,并命名为AmMagR(GenBank登录号:MH635411),其序列长度为748 bp,编码区长390 bp,编码130个氨基酸,其蛋白质分子量为14.142 kDa,理论等电点为9.06,无信号肽,无跨膜结构,且在第24~126位氨基酸之间得到一个结构域Fe-S_biosyn。系统发育树显示,西方蜜蜂AmMagR与小蜜蜂Apis florae AfIscA(IscA别称MagR)、中华蜜蜂Apis cerana cerana AcIscA基因聚成一支。荧光定量PCR结果表明,AmMagR基因在西方蜜蜂不同日龄的工蜂头部、胸部和腹部均有表达。5日龄工蜂的相对表达量最高,5日龄工蜂头部和胸部的AmMagR基因表达量显著高于1日龄(P<0.05)和21日龄(P<0.05),腹部AmMagR基因表达量显著高于21日龄(P<0.05),但与1日龄的比较差异不显著(P>0.05)。1日龄、5日龄和21日龄工蜂胸部的AmMagR基因表达量均显著高于头部和腹部(P<0.05);1日龄工蜂头部AmMagR基因表达量均高于腹部(P<0.05),但5日龄和21日龄工蜂AmMagR基因在头部与腹部的表达量无显著差异(P>0.05)。明确了该基因在西方蜜蜂工蜂不同日龄和不同组织中的表达模式,并推测AmMagR可能参与了西方蜜蜂的定位、归巢过程。
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关键词
西方蜜蜂
工蜂
磁受体基因
AmMagR
基因克隆
基因表达
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职称材料
紫色红曲霉磁受体IscA1的基因克隆及功能分析
2
作者
黄胜男
刘应保
+1 位作者
张佳兰
高梦祥
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期752-760,共9页
为初步揭示磁受体IscA1在紫色红曲霉中的生物学功能,采用同源克隆方法,经PCR扩增和DNA测序,获得紫色红曲霉(Monascus purpureus SKY219)中IscA1的编码区序列。进一步的生物信息学分析发现,IscA1蛋白具有典型的Fe-S簇生物合成超家族和磁...
为初步揭示磁受体IscA1在紫色红曲霉中的生物学功能,采用同源克隆方法,经PCR扩增和DNA测序,获得紫色红曲霉(Monascus purpureus SKY219)中IscA1的编码区序列。进一步的生物信息学分析发现,IscA1蛋白具有典型的Fe-S簇生物合成超家族和磁受体的保守结构域,含有60个可能的磷酸化修饰位点,为不稳定的亲水蛋白,主要定位于线粒体。其二、三级结构组成以无规则卷曲为主,其次是α-螺旋、β-转角。蛋白互作的分析结果发现,IscA1可以与Fe-S簇装配辅助蛋白IscA2及Grx5发生非特异性结合,IscA1和Grx可以被分子伴侣DnaJ蛋白激活,IscA1和不同蓝光受体蛋白之间存在较强的亲和力。表明IscA1在紫色红曲霉的Fe-S簇合成和磁感应中发挥重要作用。
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关键词
磁受体
IscA1基因
紫色红曲霉
基因克隆
生物信息分析
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职称材料
MRI联合脑脊液SIL-2R、CGRP水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良的预测研究
被引量：
5
3
作者
朱斌
李炯
+3 位作者
张欣贤
徐超
刘念
朱磊
《中国医疗设备》
2023年第1期139-144,共6页
目的探究磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)联合脑脊液可溶性白细胞介素-2受体(Soluble Interleukin-2 Receptor,SIL-2R)、降钙素基因相关肽(Calcitonin Gene-Related Peptide,CGRP)水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良的预测...
目的探究磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)联合脑脊液可溶性白细胞介素-2受体(Soluble Interleukin-2 Receptor,SIL-2R)、降钙素基因相关肽(Calcitonin Gene-Related Peptide,CGRP)水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良的预测价值。方法选取本院收治的129例重症病毒性脑炎患儿,根据其预后情况分为预后良好组(n=88)和预后不良组(n=41)。对比2组入院时MRI异常率及脑脊液SIL-2R、CGRP水平,采用Logistic回归分析法分析重症病毒性脑炎患儿预后不良的影响因素,并采用ROC曲线分析MRI异常及脑脊液SIL-2R、CGRP水平对其预后不良的预测价值。结果预后不良组MRI检查异常率及脑脊液SIL-2R、CGRP水平均高于预后良好组(P<0.05),且惊厥持续时间、病程均长于预后良好组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,惊厥持续时间、病程、MRI检查异常及脑脊液SIL-2R、CGRP水平高表达均是重症病毒性脑炎患儿预后不良的危险因素(P<0.05);MRI联合脑脊液SIL-2R、CGRP水平预测重症病毒性脑炎患儿预后不良的敏感度及AUC值均高于各单项检测(P<0.05),特异性与各单项预测对比差异无统计学意义(P>0.05)。结论MRI检查异常及脑脊液SIL-2R、CGRP水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良均有一定的预测效能,且联合预测效能更高,可用于临床指导治疗。
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关键词
磁共振成像
脑脊液
可溶性白细胞介素-2受体
降钙素基因相关肽
重症病毒性脑炎
预后
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职称材料
循环肿瘤细胞的磁分离法建立及在肺癌EGFR-TKI治疗中的应用
被引量：
4
4
作者
阴建
尹寒露
+5 位作者
王毅
陈文萍
陈立文
刘志安
胡志斌
沈洪兵
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015年第3期170-174,共5页
目的探索磁分离循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)联合竞争性等位基因特异性Taq ManPCR(Cast PCR)检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的可行性。方法收集12例晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者血液...
目的探索磁分离循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)联合竞争性等位基因特异性Taq ManPCR(Cast PCR)检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的可行性。方法收集12例晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者血液样本各7.5 m L,两步法磁分离CTCs,免疫荧光染色检测上皮细胞黏附分子(Ep CAM)和细胞角蛋白(Cytokeratin)后,流式细胞术检测CTCs数量及纯度;Cast PCR检测CTCs及循环DNA中EGFR基因del EGFR19、T790M和L858R突变;用EGFR基因突变检测试剂盒(ADx-ARMS法)检测癌组织的上述位点突变。结果高表达与不表达Ep CAM的CTCs分别在6例和12例NSCLC患者中被检测出;del EGFR19、T790M和L858R突变例数分别在2例、8例和5例NSCLC患者的CTCs中被检测出,其总检出率为83.3%(10/12);2例患者的循环DNA中检出L858R突变;ADx-ARMS法检测12例NSCLC患者癌组织中上述3种突变分别是2例、5例和3例,总检出率为75.0%(9/12)。CTCs与癌组织的突变具有一致性(Kappa=0.75,P=0.007),循环DNA与癌组织的突变一致性无统计意义(Kappa=0.06,P=0.546)。结论磁分离CTCs联合Cast PCR能有效检测EGFR基因突变,值得在NSCLC患者的EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗中推广应用。
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关键词
循环肿瘤细胞
非小细胞肺癌
磁分离
表皮生长因子受体
基因突变
酪氨酸激酶抑制剂
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职称材料
多巴胺系统基因对注意网络的调控作用
5
作者
陈晨
张英
+1 位作者
刘嘉
胡思源
《心理科学》
CSSCI
CSCD
北大核心
2018年第1期24-30,共7页
多巴胺是脑内重要的神经递质之一,与注意活动紧密相关。本文选取作用于突触前膜、间隙和后膜的多巴胺系统基因——多巴胺转运蛋白基因、儿茶酚氧化甲基转移酶基因和多巴胺受体基因,整合影像遗传学研究,探讨多巴胺基因对注意网络的调控...
多巴胺是脑内重要的神经递质之一,与注意活动紧密相关。本文选取作用于突触前膜、间隙和后膜的多巴胺系统基因——多巴胺转运蛋白基因、儿茶酚氧化甲基转移酶基因和多巴胺受体基因,整合影像遗传学研究,探讨多巴胺基因对注意网络的调控。元分析发现背侧和腹侧注意网络的主要脑区均有较大的基因调控效应,且腹侧网络的效应值显著大于背侧网络,表明多巴胺系统基因在全脑范围内调控注意网络,且对腹侧网络的调控作用强于背侧网络。
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关键词
注意网络
功能磁共振成像
影像遗传学
多巴胺系统
元分析
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职称材料
题名
西方蜜蜂磁受体基因AmMagR的克隆及表达分析
被引量：
2
1
作者
赵方媛
李茫
张含
廖春华
王子龙
颜伟玉
机构
江西农业大学蜜蜂研究所
江西省上饶县农业局
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1321-1328,共8页
基金
国家自然科学基金(31460641,31660696)
江西省蜂产业技术体系(JXARS-14)
文摘
本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera磁受体基因AmMagR的序列,并分析该基因在工蜂不同日龄、不同组织中的表达特征,以期为该基因的功能研究提供理论基础。以西方蜜蜂工蜂为材料,提取其总RNA,通过RT-PCR技术克隆西方蜜蜂MagR基因的序列;利用多种生物信息学软件对其核酸及氨基酸序列分析;采用实时荧光定量PCR技术(qPCR)分析在西方蜜蜂工蜂不同日龄(1日龄、5日龄和21日龄)和不同组织(头部、胸部和腹部)中MagR基因的相对表达量。克隆到西方蜜蜂MagR基因,并命名为AmMagR(GenBank登录号:MH635411),其序列长度为748 bp,编码区长390 bp,编码130个氨基酸,其蛋白质分子量为14.142 kDa,理论等电点为9.06,无信号肽,无跨膜结构,且在第24~126位氨基酸之间得到一个结构域Fe-S_biosyn。系统发育树显示,西方蜜蜂AmMagR与小蜜蜂Apis florae AfIscA(IscA别称MagR)、中华蜜蜂Apis cerana cerana AcIscA基因聚成一支。荧光定量PCR结果表明,AmMagR基因在西方蜜蜂不同日龄的工蜂头部、胸部和腹部均有表达。5日龄工蜂的相对表达量最高,5日龄工蜂头部和胸部的AmMagR基因表达量显著高于1日龄(P<0.05)和21日龄(P<0.05),腹部AmMagR基因表达量显著高于21日龄(P<0.05),但与1日龄的比较差异不显著(P>0.05)。1日龄、5日龄和21日龄工蜂胸部的AmMagR基因表达量均显著高于头部和腹部(P<0.05);1日龄工蜂头部AmMagR基因表达量均高于腹部(P<0.05),但5日龄和21日龄工蜂AmMagR基因在头部与腹部的表达量无显著差异(P>0.05)。明确了该基因在西方蜜蜂工蜂不同日龄和不同组织中的表达模式,并推测AmMagR可能参与了西方蜜蜂的定位、归巢过程。
关键词
西方蜜蜂
工蜂
磁受体基因
AmMagR
基因克隆
基因表达
Keywords
Apis
mellifera
worker
bee
the
magnetic
receptor
gene
AmMagR
gene
cloning
gene
expression
分类号
Q968.1 [生物学—昆虫学]
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
紫色红曲霉磁受体IscA1的基因克隆及功能分析
2
作者
黄胜男
刘应保
张佳兰
高梦祥
机构
长江大学生命科学学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期752-760,共9页
基金
国家自然科学基金(31701573,31730068)。
文摘
为初步揭示磁受体IscA1在紫色红曲霉中的生物学功能,采用同源克隆方法,经PCR扩增和DNA测序,获得紫色红曲霉(Monascus purpureus SKY219)中IscA1的编码区序列。进一步的生物信息学分析发现,IscA1蛋白具有典型的Fe-S簇生物合成超家族和磁受体的保守结构域,含有60个可能的磷酸化修饰位点,为不稳定的亲水蛋白,主要定位于线粒体。其二、三级结构组成以无规则卷曲为主,其次是α-螺旋、β-转角。蛋白互作的分析结果发现,IscA1可以与Fe-S簇装配辅助蛋白IscA2及Grx5发生非特异性结合,IscA1和Grx可以被分子伴侣DnaJ蛋白激活,IscA1和不同蓝光受体蛋白之间存在较强的亲和力。表明IscA1在紫色红曲霉的Fe-S簇合成和磁感应中发挥重要作用。
关键词
磁受体
IscA1基因
紫色红曲霉
基因克隆
生物信息分析
Keywords
magnetic
receptor
IscA1
Monascus
purpureus
gene
cloning
Bioinformatics
analysis
分类号
Q939.9 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
MRI联合脑脊液SIL-2R、CGRP水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良的预测研究
被引量：
5
3
作者
朱斌
李炯
张欣贤
徐超
刘念
朱磊
机构
徐州儿童医院医学影像科
出处
《中国医疗设备》
2023年第1期139-144,共6页
基金
江苏省妇幼保健协会科研项目(FYX201912)。
文摘
目的探究磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)联合脑脊液可溶性白细胞介素-2受体(Soluble Interleukin-2 Receptor,SIL-2R)、降钙素基因相关肽(Calcitonin Gene-Related Peptide,CGRP)水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良的预测价值。方法选取本院收治的129例重症病毒性脑炎患儿,根据其预后情况分为预后良好组(n=88)和预后不良组(n=41)。对比2组入院时MRI异常率及脑脊液SIL-2R、CGRP水平,采用Logistic回归分析法分析重症病毒性脑炎患儿预后不良的影响因素,并采用ROC曲线分析MRI异常及脑脊液SIL-2R、CGRP水平对其预后不良的预测价值。结果预后不良组MRI检查异常率及脑脊液SIL-2R、CGRP水平均高于预后良好组(P<0.05),且惊厥持续时间、病程均长于预后良好组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,惊厥持续时间、病程、MRI检查异常及脑脊液SIL-2R、CGRP水平高表达均是重症病毒性脑炎患儿预后不良的危险因素(P<0.05);MRI联合脑脊液SIL-2R、CGRP水平预测重症病毒性脑炎患儿预后不良的敏感度及AUC值均高于各单项检测(P<0.05),特异性与各单项预测对比差异无统计学意义(P>0.05)。结论MRI检查异常及脑脊液SIL-2R、CGRP水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良均有一定的预测效能,且联合预测效能更高,可用于临床指导治疗。
关键词
磁共振成像
脑脊液
可溶性白细胞介素-2受体
降钙素基因相关肽
重症病毒性脑炎
预后
Keywords
magnetic
resonance
imaging
cerebrospinal
fluid
soluble
interleukin-2
receptor
calcitonin
gene
-related
peptide
severe
viral
encephalitis
prognosis
分类号
R445.2 [医药卫生—影像医学与核医学]
R72 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
循环肿瘤细胞的磁分离法建立及在肺癌EGFR-TKI治疗中的应用
被引量：
4
4
作者
阴建
尹寒露
王毅
陈文萍
陈立文
刘志安
胡志斌
沈洪兵
机构
南京医科大学公共卫生学院流行病学系
南京市胸科医院呼吸科
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015年第3期170-174,共5页
基金
江苏省自然科学基金(BK20141435)
南京医科大学归国人员启动资金(2011RC11)
南京市医学科技发展项目(YKK13088)
文摘
目的探索磁分离循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)联合竞争性等位基因特异性Taq ManPCR(Cast PCR)检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的可行性。方法收集12例晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者血液样本各7.5 m L,两步法磁分离CTCs,免疫荧光染色检测上皮细胞黏附分子(Ep CAM)和细胞角蛋白(Cytokeratin)后,流式细胞术检测CTCs数量及纯度;Cast PCR检测CTCs及循环DNA中EGFR基因del EGFR19、T790M和L858R突变;用EGFR基因突变检测试剂盒(ADx-ARMS法)检测癌组织的上述位点突变。结果高表达与不表达Ep CAM的CTCs分别在6例和12例NSCLC患者中被检测出;del EGFR19、T790M和L858R突变例数分别在2例、8例和5例NSCLC患者的CTCs中被检测出,其总检出率为83.3%(10/12);2例患者的循环DNA中检出L858R突变;ADx-ARMS法检测12例NSCLC患者癌组织中上述3种突变分别是2例、5例和3例,总检出率为75.0%(9/12)。CTCs与癌组织的突变具有一致性(Kappa=0.75,P=0.007),循环DNA与癌组织的突变一致性无统计意义(Kappa=0.06,P=0.546)。结论磁分离CTCs联合Cast PCR能有效检测EGFR基因突变,值得在NSCLC患者的EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗中推广应用。
关键词
循环肿瘤细胞
非小细胞肺癌
磁分离
表皮生长因子受体
基因突变
酪氨酸激酶抑制剂
Keywords
circulating
tumor
cell
non-small
cell
lung
cancer
magnetic
separation
epidermal
growth
factor
receptor
gene
mutation
tyrosine
kinase
inhibitor
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
多巴胺系统基因对注意网络的调控作用
5
作者
陈晨
张英
刘嘉
胡思源
机构
北京师范大学心理学部应用实验心理北京市重点实验室心理学国家级实验教学示范中心(北京师范大学)
出处
《心理科学》
CSSCI
CSCD
北大核心
2018年第1期24-30,共7页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31000507)的资助
文摘
多巴胺是脑内重要的神经递质之一,与注意活动紧密相关。本文选取作用于突触前膜、间隙和后膜的多巴胺系统基因——多巴胺转运蛋白基因、儿茶酚氧化甲基转移酶基因和多巴胺受体基因,整合影像遗传学研究,探讨多巴胺基因对注意网络的调控。元分析发现背侧和腹侧注意网络的主要脑区均有较大的基因调控效应,且腹侧网络的效应值显著大于背侧网络,表明多巴胺系统基因在全脑范围内调控注意网络,且对腹侧网络的调控作用强于背侧网络。
关键词
注意网络
功能磁共振成像
影像遗传学
多巴胺系统
元分析
Keywords
included
but
not
limited
to
functional
magnetic
resonance
imaging
（tMRI）,
and
candidate
doparninergic
system
gene
s
targeting
at
the
presynaptic,
the
postsynaptie
neurons,
or
the
synaptic
cleft,
such
as
the
dopamine
transporter
gene
（DAT）,
the
catechol-O-methyltransferase
gene
（COMT）
or
the
dopamine
receptor
gene
（DRD）.
Reference
lists
were
checked
by
hand
and
a
total
of
forty-four
papers
were
gathered
and
applied
to
our
meta-analysis.
We
extracted
the
coordinates
of
peak
voxels
where
the
gene
tic
modulatory
effect
on
attention
was
reported
in
the
papers
and
then
projected
them
onto
a
brain
template
in
Caret
to
visualize
the
distribution
of
the
modulatory
effects
of
gene
s.
The
effect
sizes
were
calculated
using
Cohen＇s
d
to
quantify
the
magnitude
of
activation
differences
between
the
subjects
with
separate
ganotypes
in
each
att
ntion
task.
The
random-effects
model
was
chosen
for
the
meta-analysis
and
the
effect
sizes
of
effective
modulation
of
dopaminergie
system
gene
s
in
different
brain
regions
were
calculated
with
Comprehensive
Meta-Analysis
program
（CMA）.
To
compare
the
differences
across
attention
networks
and
dopaminergic
gene
s,
the
Q-test
of
homo
gene
ity
was
used
to
test
for
variations
in
effect
sizes.
Our
results
showed
that
the
integrated
effect
sizes
of
effective
modulation
of
dopaminergic
system
gene
s
were
all
above
.8
（Cohen＇s
d）
in
the
ventral
attention
network
（VAN）,
including
the
ventral
prefrontal
cortex
（VLPFC）,
the
orbitofrontal
gyms
（OFG）,
and
the
superior
temporal
gyms
（STG）,
and
also
in
the
dorsal
attention
network
（DAN）,
consisting
of
the
dorsolateral
prefrontal
cortex
（DLPFC）,
the
superior
parietal
lobule
（SPL）
and
the
frontal
eye
field
（FEF）.
The
VAN
presented
a
significantly
higher
effect
size
in
comparison
to
the
DAN
（Qb
=
4.94,p
〈
.05）.
In
addition,
the
variation
test
of
effect
sizes
for
dopaminergic
system
gene
s
showed
that
the
COMT
gene
exhibited
a
significantly
higher
effect
size
than
that
of
DAT
gene
（Qb
=
77.04,p
〈
分类号
R338 [医药卫生—人体生理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西方蜜蜂磁受体基因AmMagR的克隆及表达分析
赵方媛
李茫
张含
廖春华
王子龙
颜伟玉
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
2
紫色红曲霉磁受体IscA1的基因克隆及功能分析
黄胜男
刘应保
张佳兰
高梦祥
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
3
MRI联合脑脊液SIL-2R、CGRP水平对重症病毒性脑炎患儿预后不良的预测研究
朱斌
李炯
张欣贤
徐超
刘念
朱磊
《中国医疗设备》
2023
5
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职称材料
4
循环肿瘤细胞的磁分离法建立及在肺癌EGFR-TKI治疗中的应用
阴建
尹寒露
王毅
陈文萍
陈立文
刘志安
胡志斌
沈洪兵
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015
4
下载PDF
职称材料
5
多巴胺系统基因对注意网络的调控作用
陈晨
张英
刘嘉
胡思源
《心理科学》
CSSCI
CSCD
北大核心
2018
0
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职称材料
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引用分析
参考文献
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统计分析
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