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1株同时携带tet(X6)和tet(X3)的禽源印地不动杆菌比较基因组学分析
被引量：
1
1
作者
李垠树
赵冰
+5 位作者
孙华润
何坤
许慧
梁玉蕾
胡功政
苑丽
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1620-1625,共6页
为了研究动物园禽类散养场分离菌对替加环素敏感性及其耐药机制,2019年从某市动物园禽类散养场采集的1只健康珍珠鸡粪便样品中分离获得分离菌,通过常规细菌分离纯化、革兰染色镜检和全自动细菌鉴定仪鉴定,以及序列比对确定该菌株为印地...
为了研究动物园禽类散养场分离菌对替加环素敏感性及其耐药机制,2019年从某市动物园禽类散养场采集的1只健康珍珠鸡粪便样品中分离获得分离菌,通过常规细菌分离纯化、革兰染色镜检和全自动细菌鉴定仪鉴定,以及序列比对确定该菌株为印地不动杆菌(LYS68A)。采用微量肉汤稀释法测定菌株对8种抗菌药物的敏感性,并通过全基因组测序和比较基因组学分析该菌株的耐药特征。药敏试验及PCR检测发现,尽管该菌株对多西环素和替加环素高度敏感,但却携带对替加环素耐药的tet(X3)基因。进一步全基因组测序发现菌株LYS68A未携带耐药质粒,其染色体上共携带tet(X3)、tet(X6)、floR、sul1、aadA2、dfrA12、aph(3’)-I、mphE和sul2等9个耐药基因,构成了一个29252 bp的多重耐药区并以一个整体插入到基因组tRNA-Gly的上游。耐药基因tet(X6)的基因环境(hp-tet(X6)-α/βhydrolase-GMP synthase)与2020年在1株奇异变形杆菌中发现的tet(X6)的基因环境同源性高达99%,推测其是通过ISVsa3和假定蛋白(hp)之间的热点区域(TCTTCC)经同源重组获得。耐药基因tet(X3)的基因环境与质粒p34AB(MK134375)中tet(X3)的上、下游序列高度相似,主要区别是前者仅一侧含有ISVsa3,而另一侧的插入序列在同源重组后缺失,结果导致tet(X3)失去独立在菌属间水平传播能力。本试验首次在1株替加环素敏感的禽源印地不动杆菌菌株LYS68A的染色体上同时检出tet(X6)和tet(X3)基因,且两种tet(X)的变异体主要通过菌属间的同源重组获得。
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关键词
印地不动杆菌
比较基因组学
tet
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tet
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原文传递
题名
1株同时携带tet(X6)和tet(X3)的禽源印地不动杆菌比较基因组学分析
被引量：
1
1
作者
李垠树
赵冰
孙华润
何坤
许慧
梁玉蕾
胡功政
苑丽
机构
河南农业大学动物医学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1620-1625,共6页
基金
国家自然科学基金面上资助项目(31772800)。
文摘
为了研究动物园禽类散养场分离菌对替加环素敏感性及其耐药机制,2019年从某市动物园禽类散养场采集的1只健康珍珠鸡粪便样品中分离获得分离菌,通过常规细菌分离纯化、革兰染色镜检和全自动细菌鉴定仪鉴定,以及序列比对确定该菌株为印地不动杆菌(LYS68A)。采用微量肉汤稀释法测定菌株对8种抗菌药物的敏感性,并通过全基因组测序和比较基因组学分析该菌株的耐药特征。药敏试验及PCR检测发现,尽管该菌株对多西环素和替加环素高度敏感,但却携带对替加环素耐药的tet(X3)基因。进一步全基因组测序发现菌株LYS68A未携带耐药质粒,其染色体上共携带tet(X3)、tet(X6)、floR、sul1、aadA2、dfrA12、aph(3’)-I、mphE和sul2等9个耐药基因,构成了一个29252 bp的多重耐药区并以一个整体插入到基因组tRNA-Gly的上游。耐药基因tet(X6)的基因环境(hp-tet(X6)-α/βhydrolase-GMP synthase)与2020年在1株奇异变形杆菌中发现的tet(X6)的基因环境同源性高达99%,推测其是通过ISVsa3和假定蛋白(hp)之间的热点区域(TCTTCC)经同源重组获得。耐药基因tet(X3)的基因环境与质粒p34AB(MK134375)中tet(X3)的上、下游序列高度相似,主要区别是前者仅一侧含有ISVsa3,而另一侧的插入序列在同源重组后缺失,结果导致tet(X3)失去独立在菌属间水平传播能力。本试验首次在1株替加环素敏感的禽源印地不动杆菌菌株LYS68A的染色体上同时检出tet(X6)和tet(X3)基因,且两种tet(X)的变异体主要通过菌属间的同源重组获得。
关键词
印地不动杆菌
比较基因组学
tet
(
x
6
)
tet
(
x
3)
Keywords
Acinetobacter indicus
comparative genomics
tet
(
x
6
)
tet
(
x
3)
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
R535 [农业科学—兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1株同时携带tet(X6)和tet(X3)的禽源印地不动杆菌比较基因组学分析
李垠树
赵冰
孙华润
何坤
许慧
梁玉蕾
胡功政
苑丽
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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已选择
0
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引证文献
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