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自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点的筛选及其生物学功能分析
被引量:
5
1
作者
吴倩
王晓玲
+1 位作者
唐勇
张洁
《山东医药》
CAS
2021年第3期37-42,共6页
目的筛选自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点,并分析其生物学功能。方法首先在TCMSP、TCMID及化学专业数据库中收集自拟出血性中风1号方化学成分及作用靶点,利用OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获取与脑出血相关的靶点。利用R软件...
目的筛选自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点,并分析其生物学功能。方法首先在TCMSP、TCMID及化学专业数据库中收集自拟出血性中风1号方化学成分及作用靶点,利用OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获取与脑出血相关的靶点。利用R软件将自拟出血性中风1号方作用靶点与脑出血相关靶点取交集获取共同靶点(潜在作用靶点);将所得到的共同靶点通过String平台进行蛋白质互相作用(PPI)筛选出自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点。利用metascape数据库及R软件对自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点进行生物学功能分析(GO及KEGG富集分析)。最后利用Pymol、AutoDock Vina将自拟出血性中风1号方核心化学成分与关键靶点进行分子对接验证。结果共收集到自拟出血性中风1号方53种有效中药化学成分,124个药物作用靶点,1896个脑出血相关靶点,最终得到自拟出血性中风1号方治疗脑出血的潜在作用靶点71个。PPI筛选出的关键靶点包括JUN、TP53、AKT1、VEGFA等。GO共富集到1715个条目,主要涉及到氧化应激、细胞凋亡等方面;KEGG通路富集到130个条目,主要包括PI3K-AKT信号通路、P53信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路等。分子对接结果显示中风1号方核心化学成分与关键靶点结合能力较强。结论中风1号方治疗脑出血的作用靶点包括JUN、TP53、AKT1、VEGFA等,生物学功能主要是抑制炎症反应及细胞凋亡、降低氧化应激,相关信号通路主要有PI3K-AKT、P53、cAMP、NF-κB等信号通路。
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关键词
中药
出血性中风
1
号方
脑出血
出血性中风
1
号方作用靶点
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职称材料
题名
自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点的筛选及其生物学功能分析
被引量:
5
1
作者
吴倩
王晓玲
唐勇
张洁
机构
陕西中医药大学
安康市中医医院
出处
《山东医药》
CAS
2021年第3期37-42,共6页
文摘
目的筛选自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点,并分析其生物学功能。方法首先在TCMSP、TCMID及化学专业数据库中收集自拟出血性中风1号方化学成分及作用靶点,利用OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获取与脑出血相关的靶点。利用R软件将自拟出血性中风1号方作用靶点与脑出血相关靶点取交集获取共同靶点(潜在作用靶点);将所得到的共同靶点通过String平台进行蛋白质互相作用(PPI)筛选出自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点。利用metascape数据库及R软件对自拟出血性中风1号方治疗脑出血的关键靶点进行生物学功能分析(GO及KEGG富集分析)。最后利用Pymol、AutoDock Vina将自拟出血性中风1号方核心化学成分与关键靶点进行分子对接验证。结果共收集到自拟出血性中风1号方53种有效中药化学成分,124个药物作用靶点,1896个脑出血相关靶点,最终得到自拟出血性中风1号方治疗脑出血的潜在作用靶点71个。PPI筛选出的关键靶点包括JUN、TP53、AKT1、VEGFA等。GO共富集到1715个条目,主要涉及到氧化应激、细胞凋亡等方面;KEGG通路富集到130个条目,主要包括PI3K-AKT信号通路、P53信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路等。分子对接结果显示中风1号方核心化学成分与关键靶点结合能力较强。结论中风1号方治疗脑出血的作用靶点包括JUN、TP53、AKT1、VEGFA等,生物学功能主要是抑制炎症反应及细胞凋亡、降低氧化应激,相关信号通路主要有PI3K-AKT、P53、cAMP、NF-κB等信号通路。
关键词
中药
出血性中风
1
号方
脑出血
出血性中风
1
号方作用靶点
Keywords
traditional
Chinese
medicine
zhongfeng
1
prescription
cerebral
hemorrhage
targets
of
zhongfeng
1
prescription
分类号
R743. [医药卫生—神经病学与精神病学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
自拟出血性中风1号方治疗脑出血作用靶点的筛选及其生物学功能分析
吴倩
王晓玲
唐勇
张洁
《山东医药》
CAS
2021
5
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