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结构基因组学中的衍射相位问题
被引量:
5
1
作者
范海福
梁栋材
《生命科学》
CSCD
2003年第2期65-69,共5页
简要介绍了结构基因组学研究中,用于测定蛋白质结构的X射线分析在解决衍射相位问题方面的最新进展。
关键词
结构基因组学
蛋白质结构分析
晶体学中的直接法
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职称材料
新型零泊松比蜂窝结构的等效弹性参数分析
2
作者
孙士勇
高飞
+1 位作者
杨睿
张雯
《机械设计与制造》
北大核心
2024年第4期7-11,16,共6页
在四角星形蜂窝结构的基础上,提出了一种新型零泊松比蜂窝结构。采用结构基因方法分析研究了蜂窝结构的等效弹性参数,并对结果进行了精细化模型有限元仿真验证;进而分析了蜂窝结构单胞尺寸参数对于结构等效弹性参数的影响。结果表明,结...
在四角星形蜂窝结构的基础上,提出了一种新型零泊松比蜂窝结构。采用结构基因方法分析研究了蜂窝结构的等效弹性参数,并对结果进行了精细化模型有限元仿真验证;进而分析了蜂窝结构单胞尺寸参数对于结构等效弹性参数的影响。结果表明,结构基因法在进行蜂窝结构等效弹性参数预测时具有较高的正确性与效率性;蜂窝结构尺寸参数对结构的等效弹性参数影响很大,与原材料模量相比,蜂窝结构的面内模量会降低(1~2)个数量级。最后,通过与四角星形蜂窝结构进行对比发现,新型蜂窝结构可以保证较为稳定的零泊松比特性,而且在面内变形能力以及抵抗面外变形能力优于四角星形蜂窝结构,具有在变体飞机中的良好应用前景。
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关键词
蜂窝结构
等效参数
结构基因
零泊松比
变体飞机
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职称材料
草鱼出血病病毒武汉南湖株的精细结构与基因组及多肽的研究
被引量:
18
3
作者
王炜
陈延
+1 位作者
柯丽华
蔡宜权
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
1990年第1期44-49,43,共7页
对草鱼出血病病毒(Grass carp hemorrhage virus,GCHV)武汉南湖株的精细结构的研究表明,该病毒具廿面体对称结构,由双层衣壳组成,直径为72nm。外层衣壳上的子粒为中空型,分为五邻体和六邻体。五邻体直径11nm,中心孔径6nm。六邻体直径12....
对草鱼出血病病毒(Grass carp hemorrhage virus,GCHV)武汉南湖株的精细结构的研究表明,该病毒具廿面体对称结构,由双层衣壳组成,直径为72nm。外层衣壳上的子粒为中空型,分为五邻体和六邻体。五邻体直径11nm,中心孔径6nm。六邻体直径12.6nm,中心孔径7.5nm。内层衣壳直径50nm,其上附着有长7.5nm、内径6.4nm、外径10.7nm的圆柱形钉状物.病毒基因组为dsRNA分段基因组,由11个片段组成,分为4组,分子量分别是:2.75×10~?d、2.40×10~?d、2.34×10~?d、1.35×10~?d、1.32×10~?d、1.26×10~?d、0.93×10~?d、0.81×10~?d、0.71×10~?d、0.58×10~?d、0.56×10~?d。病毒多肽组份有11个。分别是VP130(VP表示病毒多肽。130为分子量,即130×10~3d,下同)、VP120、VP113、VP107、VP75、VP65、VP60、VP52、VP42,VP39和VP31,其中VP130、VP120、VP60、VP39和VP31为多肽的主要组份。病毒的内层衣壳具有6个多肽组份,分别是VP130、VP120、VP113、VP107、VP75、和VP39,主要组份是VP130、VP120和VP39.外层衣壳所特有的多肽是VP65、VP60、VP52、VP42和VP31.我们认为草鱼出血病病毒武汉南湖株是呼肠孤病毒科的一员。
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关键词
草鱼病毒
出血病
精细结构
基因组
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职称材料
大豆花叶病毒研究进展
被引量:
7
4
作者
孙浩华
薛峰
陈集双
《生命科学》
CSCD
2007年第3期338-345,共8页
大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)病是在世界范围内广泛分布并普遍发生的病毒病害之一,导致大豆严重减产和种质衰退。这引起了国内外许多学者的科研兴趣,研究内容涉及SMV株系划分与发生分布、传播流行方式、寄主上的症状和影响...
大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)病是在世界范围内广泛分布并普遍发生的病毒病害之一,导致大豆严重减产和种质衰退。这引起了国内外许多学者的科研兴趣,研究内容涉及SMV株系划分与发生分布、传播流行方式、寄主上的症状和影响因素、基因组结构组成及各基因功能、植物生理生化抗性、大豆SMV抗性遗传育种等各方面。本文综述了近年来国内外SMV的科研方向和进展,旨在为进一步的研究提供依据。
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关键词
大豆花叶病毒
寄主症状
基因组结构
基因组功能
生化抗性
遗传育种
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职称材料
猪圆环病毒的分子生物学与检测方法的研究现状
被引量:
6
5
作者
田晓婷
李宝玉
柳纪省
《中国农学通报》
CSCD
2012年第14期66-72,共7页
猪圆环病毒(Porcine Circovirus,PCV)作为引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(postweaningmultisystemic wasting syndrome,PMWS)的主要病原,引起了人们的广泛关注。对猪圆环病毒的分子生物学研究和了解,有利于PMWS的预防和控制。而快速有效...
猪圆环病毒(Porcine Circovirus,PCV)作为引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(postweaningmultisystemic wasting syndrome,PMWS)的主要病原,引起了人们的广泛关注。对猪圆环病毒的分子生物学研究和了解,有利于PMWS的预防和控制。而快速有效的分子生物学诊断技术将有助于PMWS的流行病学调查研究和早期诊断。经过近20年的系统研究,人们对其病原分子生物学等方面有较深入的了解,在此就猪圆环病毒的分子生物学相关研究进展进行了简单的总结。
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关键词
猪圆环病毒
基因组结构
复制模式
分子生物学诊断
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职称材料
侵染云南烟草的粉虱传双生病毒卫星分子基因组结构特征
被引量:
4
6
作者
丁铭
何跃峰
+3 位作者
杨莉
王玉
董家红
张仲凯
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2010年第5期1515-1521,共7页
对侵染云南烟草的粉虱传双生病毒致病性相关分子DNAβ进行PCR扩增和克隆。对9份采自不同时间和地区的样品中的DNAβ分子的全基因组序列分析发现,9个DNAβ都具有典型双生病毒DNAβ卫星分子的基因组结构特征:在互补链上编码1个大小约为11...
对侵染云南烟草的粉虱传双生病毒致病性相关分子DNAβ进行PCR扩增和克隆。对9份采自不同时间和地区的样品中的DNAβ分子的全基因组序列分析发现,9个DNAβ都具有典型双生病毒DNAβ卫星分子的基因组结构特征:在互补链上编码1个大小约为118个氨基酸的βC1蛋白,含有1个卫星分子保守区(Satellite conserved region,SCR)和1个A富含区。核苷酸同源性分析显示,9个分离物的DNAβ分子中,7个分离物的DNAβ属于TYLCCNV伴随的DNAβ分子,1个属于MYVYNV伴随的DNAβ分子,2个属于TYLCTHV伴随的DNAβ分子,1个属于TbCSV伴随的DNAβ分子。系统进化分析发现,这些DNAβ卫星分子具有明显的种类和地理分布差异,但没有因寄主和采集时间的不同而表现出明显的差异。
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关键词
烟草
粉虱传双生病毒
卫星分子
基因组结构特征
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职称材料
基因组研究进展
7
作者
吴友芝
项一宁
《贵州科学》
1995年第4期49-52,64,共5页
基因组结构和遗传语言的研究是现代生物学的前沿和竞争的焦点,对未来生物学、医学、农学和生物技术的发展有十分重要的意义。分子生物学技术的进步为基因组的研究提供了有用的工具。本文对非细胞生物体、原核生物、真核生物的基因组结...
基因组结构和遗传语言的研究是现代生物学的前沿和竞争的焦点,对未来生物学、医学、农学和生物技术的发展有十分重要的意义。分子生物学技术的进步为基因组的研究提供了有用的工具。本文对非细胞生物体、原核生物、真核生物的基因组结构研究现状,特别是人类基因组计划的进展和前景进行了综述。
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关键词
基因组
遗传信息
无性系
分子生物学
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职称材料
核基质附着区广泛参与基因组三维结构折叠的生物信息学分析
被引量:
1
8
作者
何超
李平
+5 位作者
张彦
师明磊
张香媛
谢德建
沈文龙
赵志虎
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期638-644,共7页
在细胞分裂间期,每条染色质都占据着特定的染色质领域(chromosome territory,CT)。每个CT领域内进一步分成不同的拓扑学相关区域(topological associated domain,TAD),每个TAD又由若干子TAD(sub-TAD)构成。不同的TAD相互聚集,形成基因...
在细胞分裂间期,每条染色质都占据着特定的染色质领域(chromosome territory,CT)。每个CT领域内进一步分成不同的拓扑学相关区域(topological associated domain,TAD),每个TAD又由若干子TAD(sub-TAD)构成。不同的TAD相互聚集,形成基因活跃表达和不表达的A、B两种组份或区室(compartment)。然而,目前对于染色质折叠方式及维持机制的研究尚无定论。核基质附着区(matrix attachment regions,MARs)是在不同物种基因组中广泛存在的一类富含AT序列的与核基质结合的DNA元件,能够通过与CTCF、SATB1等调控蛋白质相互作用,对远距离的基因表达进行调控。本研究以染色质三维结构为背景,通过整合染色质三维结构及组蛋白修饰等组学数据,对MARs元件与染色质三维结构的关系进行研究,对MARs元件参与形成的相互作用网络的结构及功能进行探索。结果发现,MARs元件与染色质三维结构高度相关,而且在高强度相互作用中占据较大的比例,提示MARs元件在染色质折叠方面发挥作用。此外,通过拓扑结构聚类分析还首次揭示,MARs元件分为不同类型,包括维持染色质领域及空间构象等的结构单元部分,以及调控基因表达等的功能单元部分。这表明,MARs元件在基因组三维高级结构的建立、维持以及功能等方面发挥重要作用。
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关键词
核基质附着区
染色质三维结构
生物信息学
多组学分析
DNA元件
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职称材料
题名
结构基因组学中的衍射相位问题
被引量:
5
1
作者
范海福
梁栋材
机构
中国科学院物理研究所
中国科学院生物物理研究所
出处
《生命科学》
CSCD
2003年第2期65-69,共5页
基金
中国科技部"973"项目
中国科学院知识创新工程的支持
文摘
简要介绍了结构基因组学研究中,用于测定蛋白质结构的X射线分析在解决衍射相位问题方面的最新进展。
关键词
结构基因组学
蛋白质结构分析
晶体学中的直接法
Keywords
structure
genomics
protein
structure
analysis
direct
methods
in
crystallography
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
Q-331
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职称材料
题名
新型零泊松比蜂窝结构的等效弹性参数分析
2
作者
孙士勇
高飞
杨睿
张雯
机构
大连理工大学机械工程学院精密与特种加工教育部重点实验室
出处
《机械设计与制造》
北大核心
2024年第4期7-11,16,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(51975085,51790173)。
文摘
在四角星形蜂窝结构的基础上,提出了一种新型零泊松比蜂窝结构。采用结构基因方法分析研究了蜂窝结构的等效弹性参数,并对结果进行了精细化模型有限元仿真验证;进而分析了蜂窝结构单胞尺寸参数对于结构等效弹性参数的影响。结果表明,结构基因法在进行蜂窝结构等效弹性参数预测时具有较高的正确性与效率性;蜂窝结构尺寸参数对结构的等效弹性参数影响很大,与原材料模量相比,蜂窝结构的面内模量会降低(1~2)个数量级。最后,通过与四角星形蜂窝结构进行对比发现,新型蜂窝结构可以保证较为稳定的零泊松比特性,而且在面内变形能力以及抵抗面外变形能力优于四角星形蜂窝结构,具有在变体飞机中的良好应用前景。
关键词
蜂窝结构
等效参数
结构基因
零泊松比
变体飞机
Keywords
Honeycomb
Equivalent
Parameter
structure
genom
e
Zero
Poisson’s
Ratio
Morphing
Aircraft
分类号
TH16 [机械工程—机械制造及自动化]
V250.3 [一般工业技术—材料科学与工程]
TB381 [航空宇航科学与技术—航空宇航制造工程]
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职称材料
题名
草鱼出血病病毒武汉南湖株的精细结构与基因组及多肽的研究
被引量:
18
3
作者
王炜
陈延
柯丽华
蔡宜权
机构
中国科学院武汉病毒研究所
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
1990年第1期44-49,43,共7页
文摘
对草鱼出血病病毒(Grass carp hemorrhage virus,GCHV)武汉南湖株的精细结构的研究表明,该病毒具廿面体对称结构,由双层衣壳组成,直径为72nm。外层衣壳上的子粒为中空型,分为五邻体和六邻体。五邻体直径11nm,中心孔径6nm。六邻体直径12.6nm,中心孔径7.5nm。内层衣壳直径50nm,其上附着有长7.5nm、内径6.4nm、外径10.7nm的圆柱形钉状物.病毒基因组为dsRNA分段基因组,由11个片段组成,分为4组,分子量分别是:2.75×10~?d、2.40×10~?d、2.34×10~?d、1.35×10~?d、1.32×10~?d、1.26×10~?d、0.93×10~?d、0.81×10~?d、0.71×10~?d、0.58×10~?d、0.56×10~?d。病毒多肽组份有11个。分别是VP130(VP表示病毒多肽。130为分子量,即130×10~3d,下同)、VP120、VP113、VP107、VP75、VP65、VP60、VP52、VP42,VP39和VP31,其中VP130、VP120、VP60、VP39和VP31为多肽的主要组份。病毒的内层衣壳具有6个多肽组份,分别是VP130、VP120、VP113、VP107、VP75、和VP39,主要组份是VP130、VP120和VP39.外层衣壳所特有的多肽是VP65、VP60、VP52、VP42和VP31.我们认为草鱼出血病病毒武汉南湖株是呼肠孤病毒科的一员。
关键词
草鱼病毒
出血病
精细结构
基因组
Keywords
Grass
carp
hemorrhage
virus
Fine
structure
genom
e
Structural
polypeptides
分类号
S941.41 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
大豆花叶病毒研究进展
被引量:
7
4
作者
孙浩华
薛峰
陈集双
机构
浙江理工大学生物工程研究所
出处
《生命科学》
CSCD
2007年第3期338-345,共8页
基金
科技部国际合作重点项目(2004DFA05000)
文摘
大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)病是在世界范围内广泛分布并普遍发生的病毒病害之一,导致大豆严重减产和种质衰退。这引起了国内外许多学者的科研兴趣,研究内容涉及SMV株系划分与发生分布、传播流行方式、寄主上的症状和影响因素、基因组结构组成及各基因功能、植物生理生化抗性、大豆SMV抗性遗传育种等各方面。本文综述了近年来国内外SMV的科研方向和进展,旨在为进一步的研究提供依据。
关键词
大豆花叶病毒
寄主症状
基因组结构
基因组功能
生化抗性
遗传育种
Keywords
Soybean
mosaic
virus
(SMV)
host
symptoms
structure
of
genom
e
functions
of
genom
e
biochemical
resistance
genetic
breeding
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
S565.103.2 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
猪圆环病毒的分子生物学与检测方法的研究现状
被引量:
6
5
作者
田晓婷
李宝玉
柳纪省
机构
中国农业科学院兰州兽医研究所传染病室/家畜疫病病原生物学国家重点实验室/农业部畜禽病毒学重点开放实验室/农业部草食动物疫病重点开放实验室
出处
《中国农学通报》
CSCD
2012年第14期66-72,共7页
文摘
猪圆环病毒(Porcine Circovirus,PCV)作为引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(postweaningmultisystemic wasting syndrome,PMWS)的主要病原,引起了人们的广泛关注。对猪圆环病毒的分子生物学研究和了解,有利于PMWS的预防和控制。而快速有效的分子生物学诊断技术将有助于PMWS的流行病学调查研究和早期诊断。经过近20年的系统研究,人们对其病原分子生物学等方面有较深入的了解,在此就猪圆环病毒的分子生物学相关研究进展进行了简单的总结。
关键词
猪圆环病毒
基因组结构
复制模式
分子生物学诊断
Keywords
Porcine
Circovirus
the
structure
of
genom
e
replication
Molecular
Diagnosis
分类号
S8 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
侵染云南烟草的粉虱传双生病毒卫星分子基因组结构特征
被引量:
4
6
作者
丁铭
何跃峰
杨莉
王玉
董家红
张仲凯
机构
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
红云红河集团采购中心
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2010年第5期1515-1521,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30860163)
云南省烟草专卖局(公司)科技资助项目(07A07
07A08)
文摘
对侵染云南烟草的粉虱传双生病毒致病性相关分子DNAβ进行PCR扩增和克隆。对9份采自不同时间和地区的样品中的DNAβ分子的全基因组序列分析发现,9个DNAβ都具有典型双生病毒DNAβ卫星分子的基因组结构特征:在互补链上编码1个大小约为118个氨基酸的βC1蛋白,含有1个卫星分子保守区(Satellite conserved region,SCR)和1个A富含区。核苷酸同源性分析显示,9个分离物的DNAβ分子中,7个分离物的DNAβ属于TYLCCNV伴随的DNAβ分子,1个属于MYVYNV伴随的DNAβ分子,2个属于TYLCTHV伴随的DNAβ分子,1个属于TbCSV伴随的DNAβ分子。系统进化分析发现,这些DNAβ卫星分子具有明显的种类和地理分布差异,但没有因寄主和采集时间的不同而表现出明显的差异。
关键词
烟草
粉虱传双生病毒
卫星分子
基因组结构特征
Keywords
Tobacco
Whitefly-transmitted
geminlivrus
Associated
satellites
molecule,
structure
characterization
of
genom
e
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
基因组研究进展
7
作者
吴友芝
项一宁
机构
贵阳二十三中
贵阳医学院
出处
《贵州科学》
1995年第4期49-52,64,共5页
文摘
基因组结构和遗传语言的研究是现代生物学的前沿和竞争的焦点,对未来生物学、医学、农学和生物技术的发展有十分重要的意义。分子生物学技术的进步为基因组的研究提供了有用的工具。本文对非细胞生物体、原核生物、真核生物的基因组结构研究现状,特别是人类基因组计划的进展和前景进行了综述。
关键词
基因组
遗传信息
无性系
分子生物学
Keywords
genom
e
Research
methods
Biological
genom
e
structure
Human
genom
e
project
分类号
Q343.1 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
核基质附着区广泛参与基因组三维结构折叠的生物信息学分析
被引量:
1
8
作者
何超
李平
张彦
师明磊
张香媛
谢德建
沈文龙
赵志虎
机构
军事医学科学院生物工程研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期638-644,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31370762
31030026
+1 种基金
31272416
81372218)资助~~
文摘
在细胞分裂间期,每条染色质都占据着特定的染色质领域(chromosome territory,CT)。每个CT领域内进一步分成不同的拓扑学相关区域(topological associated domain,TAD),每个TAD又由若干子TAD(sub-TAD)构成。不同的TAD相互聚集,形成基因活跃表达和不表达的A、B两种组份或区室(compartment)。然而,目前对于染色质折叠方式及维持机制的研究尚无定论。核基质附着区(matrix attachment regions,MARs)是在不同物种基因组中广泛存在的一类富含AT序列的与核基质结合的DNA元件,能够通过与CTCF、SATB1等调控蛋白质相互作用,对远距离的基因表达进行调控。本研究以染色质三维结构为背景,通过整合染色质三维结构及组蛋白修饰等组学数据,对MARs元件与染色质三维结构的关系进行研究,对MARs元件参与形成的相互作用网络的结构及功能进行探索。结果发现,MARs元件与染色质三维结构高度相关,而且在高强度相互作用中占据较大的比例,提示MARs元件在染色质折叠方面发挥作用。此外,通过拓扑结构聚类分析还首次揭示,MARs元件分为不同类型,包括维持染色质领域及空间构象等的结构单元部分,以及调控基因表达等的功能单元部分。这表明,MARs元件在基因组三维高级结构的建立、维持以及功能等方面发挥重要作用。
关键词
核基质附着区
染色质三维结构
生物信息学
多组学分析
DNA元件
Keywords
matrix
attachment
regions
three-dimensional
structure
of
genom
e
bioinformatics
omics
analysis
DNA
element
分类号
Q34 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结构基因组学中的衍射相位问题
范海福
梁栋材
《生命科学》
CSCD
2003
5
下载PDF
职称材料
2
新型零泊松比蜂窝结构的等效弹性参数分析
孙士勇
高飞
杨睿
张雯
《机械设计与制造》
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
3
草鱼出血病病毒武汉南湖株的精细结构与基因组及多肽的研究
王炜
陈延
柯丽华
蔡宜权
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
1990
18
下载PDF
职称材料
4
大豆花叶病毒研究进展
孙浩华
薛峰
陈集双
《生命科学》
CSCD
2007
7
下载PDF
职称材料
5
猪圆环病毒的分子生物学与检测方法的研究现状
田晓婷
李宝玉
柳纪省
《中国农学通报》
CSCD
2012
6
下载PDF
职称材料
6
侵染云南烟草的粉虱传双生病毒卫星分子基因组结构特征
丁铭
何跃峰
杨莉
王玉
董家红
张仲凯
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2010
4
下载PDF
职称材料
7
基因组研究进展
吴友芝
项一宁
《贵州科学》
1995
0
下载PDF
职称材料
8
核基质附着区广泛参与基因组三维结构折叠的生物信息学分析
何超
李平
张彦
师明磊
张香媛
谢德建
沈文龙
赵志虎
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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职称材料
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