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马兜铃酪氨酸脱羧酶基因克隆、测序及同源性分析
被引量：
8
1
作者
杨瑞仪
曾庆平
《广州中医药大学学报》
CAS
2005年第2期152-156,159,共6页
[目的]从中草药马兜铃中获得酪氨酸脱羧酶基因(tyrDC)互补DNA(cDNA)序列并进行同源性分析,以进一步达 到敲除tyrDC,减轻该药肾毒性的目的。[方法]参照已知的植物酪氨酸脱羧酶的保守性氨基酸序列设计简并引物,并通过 反转录聚合酶链反应(...
[目的]从中草药马兜铃中获得酪氨酸脱羧酶基因(tyrDC)互补DNA(cDNA)序列并进行同源性分析,以进一步达 到敲除tyrDC,减轻该药肾毒性的目的。[方法]参照已知的植物酪氨酸脱羧酶的保守性氨基酸序列设计简并引物,并通过 反转录聚合酶链反应(RT-PCR)从马兜铃中扩增出cDNA片段。将扩增的cDNA序列克隆并测序,用以设计特异引物,并 通过cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)从马兜铃中扩增出全长tyrDC cDNA。[结果]该克隆的 tyrDC cDNA的总长度为1 678 bp,包括一个编码516个氨基酸的1 551bp开读框(ORF)和一段127 bp的下游非翻译区 (3'UTR)。序列比较结果表明,由马兜铃tyrDC核苷酸序列推导的氨基酸序列分别与已发布的罂粟酪氨酸脱羧酶和唐松草酪 氨酸／多巴脱羧酶享有76％和79％的同源性。[结论]从马兜铃中扩增得到tyrDC cDNA全序列,且对酪氨酸脱羧酶的同源检 索显示,不同植物的酪氨酸脱羧酶之间都存在普遍的序列相似性。为去除马兜铃肾毒性奠定了基础。
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关键词
马兜铃/化学
酪氨酸脱羧酶
基因
结构
植物
基因扩增
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职称材料
不同毒株犬瘟热病毒结构基因的通用扩增及序列测定
被引量：
1
2
作者
卜研
史一珺
+5 位作者
薛向红
赵传芳
陈杰
廉士珍
朱言柱
胡博
《特产研究》
2020年第2期9-14,共6页
为了更准确、快速、高通量地追溯犬瘟热病毒流行毒株来源,揭示其进化规律,本研究分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对6个结构基因的保守区设计了特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的6个结构基...
为了更准确、快速、高通量地追溯犬瘟热病毒流行毒株来源,揭示其进化规律,本研究分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对6个结构基因的保守区设计了特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的6个结构基因。经过优化引物对的特异性、通用性、工作浓度及退火温度等,最终确定6对特异性通用扩增引物,对本室保存的3株疫苗毒CDV-3株、OR12株、CDV/R-20/8株,及2个流行毒HBF-1株和SD(14)07株的6个结构蛋白基因进行RT-PCR通用扩增。取5μL扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,结果显示,以上述5株犬瘟热病毒的cDNA为模板,用6对通用引物扩增,分别获得6个特异性条带,大小与预期相符。选取疫苗毒CDV-3株和野毒HBF-1株N、P、M、F、H和L基因连接至p EASY-Blunt载体上,进行序列测定。测序结果显示,与GenBank中已公布的序列同源性均大于99.0%,证实筛选的6对特异性引物能够实现对犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的不同结构基因的准确扩增,并获得精准序列。这提高了犬瘟热病毒检测鉴定的效率和特异性,有利于人们快速、准确地获取犬瘟热病毒未知毒株结构基因的序列,追溯病原来源和分析其进化规律,为疫苗研制提供思路。
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关键词
通用引物
犬瘟热病毒
结构基因扩增
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职称材料
5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶的基因组结构分析
被引量：
8
3
作者
朱慧萍
李竹
李燕
《北京医科大学学报》
CSCD
1998年第5期419-421,共3页
目的：了解５，１０亚甲基四氢叶酸还原酶（ＭＴＨＦＲ）基因组外显子／内含子结构，为进一步的研究ＭＴＨＦＲ基因及寻找突变奠定基础。方法：根据报道的人肝ＭＴＨＦＲｍＲＮＡ序列设计引物，分段扩增基因组ＤＮＡ，进行双向测序，...
目的：了解５，１０亚甲基四氢叶酸还原酶（ＭＴＨＦＲ）基因组外显子／内含子结构，为进一步的研究ＭＴＨＦＲ基因及寻找突变奠定基础。方法：根据报道的人肝ＭＴＨＦＲｍＲＮＡ序列设计引物，分段扩增基因组ＤＮＡ，进行双向测序，确定基因组序列。结果与结论：ＭＴＨＦＲ基因包括１１个外显子和１０个内含子，外显子的长度分别为９９～２５２ｂｐ，内含子长度分别为１９２～９８１ｂｐ。
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关键词
亚甲基
四氢叶酸还原酶
基因组
基因扩增
结构
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职称材料
题名
马兜铃酪氨酸脱羧酶基因克隆、测序及同源性分析
被引量：
8
1
作者
杨瑞仪
曾庆平
机构
广州中医药大学热带医学研究所
出处
《广州中医药大学学报》
CAS
2005年第2期152-156,159,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:30271591)
文摘
[目的]从中草药马兜铃中获得酪氨酸脱羧酶基因(tyrDC)互补DNA(cDNA)序列并进行同源性分析,以进一步达 到敲除tyrDC,减轻该药肾毒性的目的。[方法]参照已知的植物酪氨酸脱羧酶的保守性氨基酸序列设计简并引物,并通过 反转录聚合酶链反应(RT-PCR)从马兜铃中扩增出cDNA片段。将扩增的cDNA序列克隆并测序,用以设计特异引物,并 通过cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)从马兜铃中扩增出全长tyrDC cDNA。[结果]该克隆的 tyrDC cDNA的总长度为1 678 bp,包括一个编码516个氨基酸的1 551bp开读框(ORF)和一段127 bp的下游非翻译区 (3'UTR)。序列比较结果表明,由马兜铃tyrDC核苷酸序列推导的氨基酸序列分别与已发布的罂粟酪氨酸脱羧酶和唐松草酪 氨酸／多巴脱羧酶享有76％和79％的同源性。[结论]从马兜铃中扩增得到tyrDC cDNA全序列,且对酪氨酸脱羧酶的同源检 索显示,不同植物的酪氨酸脱羧酶之间都存在普遍的序列相似性。为去除马兜铃肾毒性奠定了基础。
关键词
马兜铃/化学
酪氨酸脱羧酶
基因
结构
植物
基因扩增
Keywords
ARISTOLOCHIA
CONTORTA
BGE.
/chemistry
TYROSINE
DECARBOXYLASE
gene
S,
structural
,
PLANT
gene
amplification
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
不同毒株犬瘟热病毒结构基因的通用扩增及序列测定
被引量：
1
2
作者
卜研
史一珺
薛向红
赵传芳
陈杰
廉士珍
朱言柱
胡博
机构
中国农业科学院特产研究所
烟台市动物疫病预防与控制中心
出处
《特产研究》
2020年第2期9-14,共6页
基金
“十三五”国家重点研发计划(2016YFD0501001)。
文摘
为了更准确、快速、高通量地追溯犬瘟热病毒流行毒株来源,揭示其进化规律,本研究分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对6个结构基因的保守区设计了特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的6个结构基因。经过优化引物对的特异性、通用性、工作浓度及退火温度等,最终确定6对特异性通用扩增引物,对本室保存的3株疫苗毒CDV-3株、OR12株、CDV/R-20/8株,及2个流行毒HBF-1株和SD(14)07株的6个结构蛋白基因进行RT-PCR通用扩增。取5μL扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,结果显示,以上述5株犬瘟热病毒的cDNA为模板,用6对通用引物扩增,分别获得6个特异性条带,大小与预期相符。选取疫苗毒CDV-3株和野毒HBF-1株N、P、M、F、H和L基因连接至p EASY-Blunt载体上,进行序列测定。测序结果显示,与GenBank中已公布的序列同源性均大于99.0%,证实筛选的6对特异性引物能够实现对犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的不同结构基因的准确扩增,并获得精准序列。这提高了犬瘟热病毒检测鉴定的效率和特异性,有利于人们快速、准确地获取犬瘟热病毒未知毒株结构基因的序列,追溯病原来源和分析其进化规律,为疫苗研制提供思路。
关键词
通用引物
犬瘟热病毒
结构基因扩增
Keywords
universal
primer
canine
distemper
virus
structural
gene
amplification
分类号
S852.655 [农业科学—基础兽医学]
Q786 [农业科学—兽医学]
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职称材料
题名
5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶的基因组结构分析
被引量：
8
3
作者
朱慧萍
李竹
李燕
机构
北京医科大学中国妇婴保健中心
中国预防医学科学院病毒所
出处
《北京医科大学学报》
CSCD
1998年第5期419-421,共3页
基金
国家八六三计划资助
文摘
目的：了解５，１０亚甲基四氢叶酸还原酶（ＭＴＨＦＲ）基因组外显子／内含子结构，为进一步的研究ＭＴＨＦＲ基因及寻找突变奠定基础。方法：根据报道的人肝ＭＴＨＦＲｍＲＮＡ序列设计引物，分段扩增基因组ＤＮＡ，进行双向测序，确定基因组序列。结果与结论：ＭＴＨＦＲ基因包括１１个外显子和１０个内含子，外显子的长度分别为９９～２５２ｂｐ，内含子长度分别为１９２～９８１ｂｐ。
关键词
亚甲基
四氢叶酸还原酶
基因组
基因扩增
结构
Keywords
Methylenetetrahydrofolate
reductase
gene
s,
structural
Genome
gene
amplification
分类号
Q343.24 [生物学—遗传学]
Q554.9
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马兜铃酪氨酸脱羧酶基因克隆、测序及同源性分析
杨瑞仪
曾庆平
《广州中医药大学学报》
CAS
2005
8
下载PDF
职称材料
2
不同毒株犬瘟热病毒结构基因的通用扩增及序列测定
卜研
史一珺
薛向红
赵传芳
陈杰
廉士珍
朱言柱
胡博
《特产研究》
2020
1
下载PDF
职称材料
3
5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶的基因组结构分析
朱慧萍
李竹
李燕
《北京医科大学学报》
CSCD
1998
8
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职称材料
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