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miR-93 suppresses proliferation and colony formation of human colon cancer stem cells 被引量:21
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作者 Xiao-Feng Yu Jian Zou Zhi-Jun Bao Jie Dong 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2011年第42期4711-4717,共7页
AIM: TO identify differentially expressed microRNAs (miRNAs) in human colon cancer stem cells (SW1116csc) and study their function in SW1116csc proliferation. METHODS: SW1116csc were isolated from the human colo... AIM: TO identify differentially expressed microRNAs (miRNAs) in human colon cancer stem cells (SW1116csc) and study their function in SW1116csc proliferation. METHODS: SW1116csc were isolated from the human colon cancer cell line, SW1116 and cultured in serum- free medium. A miRNA microarray was used to detect differential expression profiles of rniRNAs in SW1116csc and SW1116 cells. Real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR) was performed to verify the dif- ferential expression of candidate miRNAs obtained from the microarray. Target mRNAs of differentially expressed miRNAs were predicted with target predic- tion tools, miRNA expression plasmids were transfected into SW1116csc using Lipofectamine 2000 reagent. Cell proliferation curves were generated with trypan blue staining, and the colony formation rate of transfected cells was measured with the soft agar colony formation assay. Expression of target mRNAs and proteins from differentially expressed miRNAs were detected using reverse transcription (RT)-PCR and western blotting.RESULTS: Compared with expression in SW1116 cells, 35 miRNAs (including hsa-miR-192, hsa-miR-29b, hsa-miR-215, hsa-miR-194, hsa-miR-33a and hsa- miR-32) were upregulated more than 1.5-fold, and 11 miRNAs (including hsa-miR-93, hsa-miR-1231, hsa- miRPlus-F1080, hsa-miR-524-3p, hsa-miR-886-3p and hsa-miR-561) were downregulated in SW1116csc. The miRNA microarray results were further validated with quantitative RT-PCR. miR-93 was downregulated, and its predicted mRNA targets included BAMBI, CCND2, CDKNIA, HDACS, KIF23, MAP3K9, MAP3K11, MYCN, PPARD, TLE4 and ZDHHCl. Overexpressed miR-93 sig- nificantly inhibited cell proliferation and colony forma- tion by SW1116csc. Furthermore, miR-93 negatively regulated the mRNA and protein levels of HDAC8 and TLE4. CONCLUSION: Some miRNAs were differentially ex- pressed during differentiation of SW1116csc into SW1116 cells, miR-93 may inhibit SW1116csc proliferation and colony formation. 展开更多
关键词 miR-93 stem cell Colon cancer Expres-sion profile
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基于三维激光点云与断面轮廓曲线的树干材积计算 被引量:4
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作者 尤磊 哈登龙 +4 位作者 谢明坤 张晓鹏 宋新宇 庞勇 唐守正 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第11期63-72,共10页
【目的】利用地面三维激光扫描仪获取的单木树干点云,提出一种基于断面轮廓曲线的树干材积计算方法,为准确测定单木树干材积提供参考。【方法】首先,将树干点云按设定高度thick划分为若干等高垂直分段,对于一个垂直分段,将其树干点云投... 【目的】利用地面三维激光扫描仪获取的单木树干点云,提出一种基于断面轮廓曲线的树干材积计算方法,为准确测定单木树干材积提供参考。【方法】首先,将树干点云按设定高度thick划分为若干等高垂直分段,对于一个垂直分段,将其树干点云投影至下断面得到一个平面点集,以该点集凸包点形成闭合凸多边形的质心为中心点,以角度参数θ对该平面点集角度分区,一个角度分区中所有点的重心点为该角度分区的轮廓点,根据角度分区在上下垂直分段上的相邻性和连续性修复无轮廓点的角度分区;然后,以当前垂直分段所有角度分区的轮廓点为插值点,构建一条闭合连续光滑的三次B样条曲线(称之为垂直分段的断面轮廓曲线),该曲线所围面积为断面积,断面积与高度thick之积为垂直分段体积,所有垂直分段体积累加得到树干材积。分别以可准确计算体积的圆柱体、圆台体和抛物线体的模拟点云与地面三维激光扫描仪获取的来自7个树种183个长度为1 m的树干点云为实测数据,开展模拟试验和实测试验。【结果】模拟试验结果表明,对于圆台体和抛物线体的体积计算,断面轮廓曲线法在合适的thick与θ参数下计算精度高于拟合圆、拟合圆柱体和Bézier凸曲线法的计算精度。实测试验结果表明,与断面轮廓曲线法计算的材积(thick=2 cm,θ=2°)相比,拟合圆、拟合圆柱体和Bézier凸曲线法计算材积的平均绝对百分比误差(MAPE)分别为0.64%、433.65 cm^3和0.54%,均方根误差(RMSE)分别为0.63%、429.06 cm^3和0.53%,总相对误差(TRE)分别为11.88%、3361.36 cm^3和9.51%。【结论】断面轮廓曲线法计算的树干断面积和材积最为精确,传统以横断面是圆为理论计算的树干断面积和材积均大于其真值。 展开更多
关键词 三维激光扫描技术 树干材积 树干断面 断面面积 轮廓曲线
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塞罕坝地区华北落叶松干形特征研究 被引量:2
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作者 付立华 于士涛 +1 位作者 程顺 许中旗 《林业与生态科学》 2018年第3期264-269,共6页
为了解塞罕坝地区华北落叶松的干形特征,以指导华北落叶松的培育,提高木材质量及木材利用率,在塞罕坝机械林场的坝上及坝缘山地进行取样,对华北落叶松的干形质量进行调查和分析,并拟合了华北落叶松干形曲线。结果表明:塞罕坝地区华北落... 为了解塞罕坝地区华北落叶松的干形特征,以指导华北落叶松的培育,提高木材质量及木材利用率,在塞罕坝机械林场的坝上及坝缘山地进行取样,对华北落叶松的干形质量进行调查和分析,并拟合了华北落叶松干形曲线。结果表明:塞罕坝地区华北落叶松的干型较好,树干通直率达到88.47%,其中,坝缘山地干形好于坝上地区,其通直林木占比达92.1%;在弯曲林木中,坝上地区一个弯点的林木比例(61.9%)低于坝缘山地(73.68%),且弯点多位于3m以下(占比52.38%),而坝缘山地弯点多位于6m以上(占比42.11%);塞罕坝地区华北落叶松分杈林木占比不足10%,且分杈位置多位于6m以上;华北落叶松干形曲线以三项式模型效果最佳,相关系数最高,为0.970 6;不同干形曲线在模拟树干不同部位的精度不同,各个模型在树干上部拟合效果都相对较差,在模拟树干中下部和基部的平均相对误差均比较小的模型是二次多项式(分别为0.019 8,-0.007 8)和三次多项式(分别为-0.010 6,0.012 2)。 展开更多
关键词 塞罕坝 华北落叶松 干形质量 干形曲线 通直 弯曲 分杈
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热带地区几个珍贵树种干形曲线研究 被引量:2
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作者 庞丽峰 贾宏炎 +1 位作者 陆元昌 符利勇 《南京林业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期93-98,共6页
准确描述热带珍贵树种的林木干形变化,可为预估各材种数量、蓄积量及合理造材提供支撑。以热带格木、红锥和柚木3个珍贵树种,共120株解析木为研究对象,利用简单削度方程、分段削度方程和可变指数削度方程分别构建格木、红锥和柚木3个热... 准确描述热带珍贵树种的林木干形变化,可为预估各材种数量、蓄积量及合理造材提供支撑。以热带格木、红锥和柚木3个珍贵树种,共120株解析木为研究对象,利用简单削度方程、分段削度方程和可变指数削度方程分别构建格木、红锥和柚木3个热带树种的干形曲线方程,通过相关指数、剩余残差平方和、平均残差、残差方差和均方误差统计量比较分析,找出最佳削度模型作为3个树种最终的干形曲线方程,并对各曲线变化趋势进行了初步的定量分析。结果表明,所选的3类典型基础模型对每个树种的预估效果都很好,其中基于双因素自动优选法拟合且以分段削度方程构建的干形曲线预估效果最好。3个树种的干形曲线变化趋势表明:相对高在(0-0.8)时,柚木干形变化最大,红锥干形变化最小,格木干形介于二者之间;当相对高〉0.8时,红锥干形变化最大,格木和柚木干形变化几乎相同。因此,基于双因素自动优选法拟合的分段削度方程可作为3种热带树种的干形曲线方程,用于3种珍贵树种活立木蓄积量和材种数量的估计,以及指导合理造材。 展开更多
关键词 热带珍贵树种 干形曲线 简单削度方程 分段削度方程 可变指数方程
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Identification of tumorigenic risk genes in human placenta-derived mesenchymal stem cells treated with 3-methylcholanthrene
5
作者 YUANYUAN JIA XIAONA MA +4 位作者 XIURUI YAN JING XUE TINGTING YANG XUEYUN LIANG XIAOMING LIU 《BIOCELL》 SCIE 2022年第2期479-493,共15页
Mesenchymal stem cells(MSCs)capable of tumour topotaxis have been served as cellular vehicles to deliver anti-tumour agents.As cellular components of the tumour microenvironment,MSCs also affect tumour progression.How... Mesenchymal stem cells(MSCs)capable of tumour topotaxis have been served as cellular vehicles to deliver anti-tumour agents.As cellular components of the tumour microenvironment,MSCs also affect tumour progression.However,the tumour transformation-related genes of MSCs remain unclear since either tumorigenic or tumour suppressor effects within these cells have been researched.Hence,we aimed to identify potential biomarkers indicative of tumorigenic risk by RNA-seq analysis of human placenta tissue-derived MSCs(hPTMSCs)exposed to the carcinogenic agent,3-methylcholanthrene(3-MC).Twenty-nine tumour transformation-related genes and three pluripotency-related genes were appraised as differentially expressed genes(DEGs)in hPTMSCs.Overexpression of sfrp1 led to reduced cell viability,migration,and colony formation in A549.In contrast,the overexpression of ptgs2 exerted the opposite effect.These results indicate that A549 cells with high ptgs2 expression but low sfrp1 expression may have a more potential tumorigenic capacity.Taken together,this study suggests that ptgs2 and sfrp1 may be tumorigenic risk genes. 展开更多
关键词 Human placenta-derived mesenchymal stem cells Transcriptional profile Tumorigenicity
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Comparative Analysis of Five Different Homologous Feeder Cell Lines in the Ability to Support Rhesus Embryonic Stem Cells
6
作者 陈栋梁 李荣荣 +5 位作者 张敬 卢斌 魏强 王淑芬 谢云华 季维智 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期345-353,共9页
In our previous study, five homologous feeder cell lines, Monkey ear skin fibroblasts (MESFs), clonally derived fibroblasts from the MESFs (CMESFs), monkey oviductal fibroblasts (MOFs), monkey follicular granulo... In our previous study, five homologous feeder cell lines, Monkey ear skin fibroblasts (MESFs), clonally derived fibroblasts from the MESFs (CMESFs), monkey oviductal fibroblasts (MOFs), monkey follicular granulosa fibroblast-like (MFGs) cells, monkey follicular granulosa epithelium-like (MFGEs) cells, were developed for the maintenance of rhesus embryonic stem cells (rESCs). We found that MESFs, CMESFs, MOFs and MFGs, but not MFGEs, support the growth of rhesus embryonic stem cells. Moreover, we detected some genes that are upregulated in supportive feeder cell lines by semi-quantitative PCR. In the present study, we applied the GeneChip Rhesus Macaque Genome Array of Affymetrix Corporation to study the expression profiles of these five feeder cell lines, in purpose to find out which cytokines and signaling pathways were important in maintaining the rESCs, mRNAs of eight genes, including GREM2, bFGF, KITLG, DKK3, GREM1, AREG, SERPINF1 and LTBP1, were found to be upregulated in supportive feeder cell lines, but not in MFGE. The results indicate that many signaling pathways may play redundant roles in supporting the undifferentiated growth and maintenance of pluripotency in rESCs. 展开更多
关键词 Embryonic stem cells Rhesus monkey feeders SELF-RENEWAL PLURIPOTENCY Expression profile Signaling pathway
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造血干细胞移植患者心理韧性的潜在类别及应对方式研究 被引量:9
7
作者 王营营 吴云 +1 位作者 李惠萍 黄璐 《现代临床护理》 2021年第2期1-7,共7页
目的探索造血干细胞移植患者心理韧性的潜在类别及应对方式差异,为临床采取个体化干预提供依据。方法采用便利抽样法,使用一般人口学调查表、心理韧性量表14条目(resilience-14 items,RS-14)、医学应对方式问卷(medical coping modes qu... 目的探索造血干细胞移植患者心理韧性的潜在类别及应对方式差异,为临床采取个体化干预提供依据。方法采用便利抽样法,使用一般人口学调查表、心理韧性量表14条目(resilience-14 items,RS-14)、医学应对方式问卷(medical coping modes questionnaire,MCMQ)对本省某三级甲等综合医院240例造血干细胞移植后患者进行问卷调查。运用潜在剖面分析方法探讨心理韧性的潜在类别。结果228例患者完成问卷调查。造血干细胞移植患者心理韧性分为3种类别:高心理韧性组(51.60%),中心理韧性组(40.40%)和低心理韧性组(8.00%)。患者心理韧性的3个类别在家庭月总收入(P=0.003)、移植后生存时间(P=0.010)、身体功能状况(P<0.001)、口服抗排异药物(P=0.005)的分布上存在差异。患者心理韧性3个类别在面对应对得分和屈服应对得分存在差异(均P<0.001),在回避应对得分无差异(均P>0.05)。结论造血干细胞移植患者心理韧性具有明显的分类特征,而且应对方式不同,临床医务人员应根据患者心理韧性分类特点及其应对方式采取个性化干预策略,以提高其心理健康水平。 展开更多
关键词 造血干细胞移植 心理韧性 应对方式 潜在剖面分析
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脐带来源间充质干细胞的制备及其质量检定 被引量:7
8
作者 孙瑞婷 陈瑶瑶 +5 位作者 王华 靳继德 汪劲松 刘冬梅 王立生 吴祖泽 《中国医药生物技术》 2013年第6期401-407,共7页
目的研究脐带来源间充质干细胞(UC-MSCs)的扩增工艺及质量检验方法,提出质量控制标准,为临床研究提供合格的干细胞产品。方法新鲜脐带去羊膜及血管,剪碎,组织块放入无菌培养皿,在培养箱进行脐带间充质干细胞培养、扩增。细胞培养至P3代... 目的研究脐带来源间充质干细胞(UC-MSCs)的扩增工艺及质量检验方法,提出质量控制标准,为临床研究提供合格的干细胞产品。方法新鲜脐带去羊膜及血管,剪碎,组织块放入无菌培养皿,在培养箱进行脐带间充质干细胞培养、扩增。细胞培养至P3代,按照《干细胞制剂质量控制及临床前研究指导原则》(征求意见稿)进行干细胞质量的全面检定。检定内容包括无菌检测,支原体检测,人源特定病毒及猪源病毒检测,内毒素检测,细胞形态、细胞数及细胞活率检测,染色体核型分析,干细胞免疫表型检测,STR图谱分析,免疫抑制活性检测及分化能力检测。结果按照标准化流程对18根脐带进行了UC-MSCs的分离、纯化及培养,获得一致性较好的干细胞。通过对干细胞进行质量检定,很好地控制了干细胞的质量。干细胞活性在冻存前≥90%,冻存复苏后≥80%;该工艺生产的脐带MSC产品无细菌、人源特定病毒及猪细小病毒、支原体等微生物污染,内毒素检测阴性;干细胞免疫表型检测CD90、CD105呈阳性,阳性率不低于95%;CD31、CD34、HLA-DR呈阴性,阳性率不高于2%;染色体核型分析为46XX或46XY,无缺失及插入突变;STR图谱分析证实干细胞为单一人来源;UC-MSCs具有成脂及成骨分化潜能;UC-MSCs能抑制异源淋巴细胞增殖。结论按本工艺及标准制备的UC-MSCs符合《干细胞制剂质量控制及临床前研究指导原则》的质量控制标准,为同类干细胞制备及检定过程标准化提供了实验依据。 展开更多
关键词 间质干细胞 质量控制 细胞表型 分化能力 染色体核型分析 STR 图谱分析
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MicroRNA在人结肠癌干细胞中的表达谱 被引量:7
9
作者 邹健 于晓峰 +5 位作者 虞阳 张颖 史冬梅 董洁 李天奇 刘雪静 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2010年第2期173-178,共6页
目的:探讨微小RNA(microRNA,miRNA)在人结肠癌干细胞中的表达,为进一步研究miRNA调控结肠癌干细胞向结肠癌细胞分化的分子机制奠定基础.方法:应用miRNA表达谱芯片检测人结肠癌干细胞和已分化结肠癌细胞中miRNA的表达谱.利用实时定量PCR... 目的:探讨微小RNA(microRNA,miRNA)在人结肠癌干细胞中的表达,为进一步研究miRNA调控结肠癌干细胞向结肠癌细胞分化的分子机制奠定基础.方法:应用miRNA表达谱芯片检测人结肠癌干细胞和已分化结肠癌细胞中miRNA的表达谱.利用实时定量PCR技术检测两种细胞中差异表达的miRNA,验证miRNA芯片结果的可靠性.应用软件对筛选出的显著差异表达miRNA的靶基因进行预测.结果:与已分化结肠癌细胞相比,人结肠癌干细胞中表达上调超过1.5倍的miRNA有35个,为:hsa-miR-192,hsa-miR-29b,hsa-miR-215,hsa-miR-194,hsa-miR-33a,hsa-miR-32等;表达下调超过1.5倍的miRNA有11个,为:hsa-miR-93,hsa-miR-1231,hsa-miR-524-3p,hsa-miR-886-3p等.PCR技术验证,与miRNA芯片结果相符合.表达显著上调miRNA的共同靶mRNA有:AFF2、MTF1、RUNDC2C和ZFHX4.表达显著下调miRNA的共同靶mRNA有:ONECUT2、SH3TC2、PTPRT、RNABP10、NR3C1、RGSL1、RNASEL和TANC2.结论:筛选出的差异表达miRNA可能参与结肠癌的发病,为该病诊治提供了新的思路.其共同靶基因可能具有重要的调控结肠癌干细胞生长和分化的作用. 展开更多
关键词 微小RNA 结肠癌 干细胞 表达谱
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甘蓝型油菜抗菌核病研究进展 被引量:6
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作者 吴健 涂江颖 周永明 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期608-615,共8页
由真菌核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)引起的油菜菌核病是世界范围内最严重的病害之一,也是影响油菜高产稳产的主要生物逆境。选育抗菌核病油菜品种并在生产上大面积种植是防控菌核病最经济有效和环保的途径。本文从核盘菌的致病机... 由真菌核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)引起的油菜菌核病是世界范围内最严重的病害之一,也是影响油菜高产稳产的主要生物逆境。选育抗菌核病油菜品种并在生产上大面积种植是防控菌核病最经济有效和环保的途径。本文从核盘菌的致病机理、油菜抗菌核病的遗传控制、抗病基因表达谱和抗性相关基因的应用等方面综述了油菜抗菌核病研究有关的最新进展。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 菌核病 致病机理 遗传规律 QTL 基因表达谱 抗病基因
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肿瘤坏死因子α预处理人脐带间充质干细胞的生物学特征分析 被引量:5
11
作者 陈自力 曹宁 +4 位作者 徐萌 姜岩 冀美超 郑阳阳 杨莉莉 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2023年第24期3780-3787,共8页
背景:在部分临床前及临床研究中,人脐带间充质干细胞表现出有希望的治疗结果但仍然存在效果有限的问题。因此,通过预处理的方式增强人脐带间充质干细胞的功能为干细胞培养工艺的开发提供新思路。目的:探索炎性因子肿瘤坏死因子α预处理... 背景:在部分临床前及临床研究中,人脐带间充质干细胞表现出有希望的治疗结果但仍然存在效果有限的问题。因此,通过预处理的方式增强人脐带间充质干细胞的功能为干细胞培养工艺的开发提供新思路。目的:探索炎性因子肿瘤坏死因子α预处理人脐带间充质干细胞的生物学特性变化及作用机制。方法:分离获得的人脐带间充质干细胞培养至第6代,进行炎性因子肿瘤坏死因子α预处理,对比未预处理人脐带间充质干细胞和炎性因子预处理后人脐带间充质干细胞的免疫调节能力、抗炎功能、表面标志物、倍增时间、成脂成骨分化能力的变化,此外对比两组的转录组数据,分析具体机制。结果与结论:(1)与未预处理对照组相比,不同质量浓度肿瘤坏死因子α预处理的人脐带间充质干细胞均显著抑制T细胞增殖,促进Treg细胞增殖,其中1 ng/mL肿瘤坏死因子α作用效果最显著;(2)与未预处理对照组相比,不同质量浓度肿瘤坏死因子α预处理的人脐带间充质干细胞在体外炎症模型中释放更低水平的肿瘤坏死因子α和更高水平的白细胞介素10,其抗炎能力显著增强;(3)两组人脐带间充质干细胞的倍增时间、表面标志物表达无显著差异,均具有成骨成脂分化能力;(4)两组人脐带间充质干细胞的转录组变化主要体现在核因子κB信号通路和肿瘤坏死因子α信号通路的活化;(5)上述实验结果表明,肿瘤坏死因子α预处理后人脐带间充质干细胞的免疫调节及抗炎功能显著增强。 展开更多
关键词 脐带间充质干细胞 炎性因子 预处理 免疫调节 抗炎功能 质量属性 转录组表达谱 差异基因
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冷轧宽厚规格深冲钢梗印缺陷成因分析及其控制措施 被引量:5
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作者 胡华东 王乐 +3 位作者 汤化胜 徐国军 文雄 王栋 《轧钢》 2022年第2期124-128,共5页
针对山东钢铁集团日照有限公司2 030 mm冷轧产线宽厚规格深冲钢卷出现大量梗印缺陷问题,通过现场实测与多功能仪自动检测相结合检测缺陷卷热轧卷横断面轮廓曲线,检测热轧卷微观组织及硬度等方法,分析了梗印缺陷的形成原因。结果表明:带... 针对山东钢铁集团日照有限公司2 030 mm冷轧产线宽厚规格深冲钢卷出现大量梗印缺陷问题,通过现场实测与多功能仪自动检测相结合检测缺陷卷热轧卷横断面轮廓曲线,检测热轧卷微观组织及硬度等方法,分析了梗印缺陷的形成原因。结果表明:带钢横断面存在连续局部高点,卷取中局部高点逐层累加形成鼓包,因深冲钢屈服强度较低,成卷后局部高点处存在应力集中,使其沿径向和横向发生延展变形而导致梗印缺陷的形成,且梗印缺陷卷开卷后在带钢边部形成浪形。为此,在热轧工序通过优化轧辊轴向横移、弯辊策略以及调整轧制节奏等措施,增大工作辊辊缝凸度,从而有效改善热轧带钢横断面局部高点缺陷,为冷轧工序提供合格原料。在冷轧工序通过优化工作辊辊缝形状、分小卷卷取等措施,宽厚规格深冲钢的局部高点可得到有效控制,显著降低了因梗印缺陷造成的不良改判率。 展开更多
关键词 深冲钢 宽厚规格 梗印缺陷 边部浪形 断面轮廓 局部高点 辊缝凸度
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狗牙根TCP转录因子基因家族鉴定与分析
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作者 孙启雪 陈焯婷 +1 位作者 陈荣荣 张兵 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期2330-2344,共15页
TCP转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程发挥着关键作用。狗牙根(Cynodon dactylon)是被广泛应用的、具有重要经济价值的暖季型草坪草,具有发达的根状茎和匍匐茎。本研究从狗牙根基因组鉴定了65个分属于PCF、CIN、CYC/... TCP转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程发挥着关键作用。狗牙根(Cynodon dactylon)是被广泛应用的、具有重要经济价值的暖季型草坪草,具有发达的根状茎和匍匐茎。本研究从狗牙根基因组鉴定了65个分属于PCF、CIN、CYC/TB1亚族的TCP转录因子。染色体定位分析表明,65个TCP基因不均衡地分布于狗牙根36条染色体上;共线性分析表明,串联复制机制作用于TCP基因。研究结果表明,3个亚家族族内的TCP转录因子基因成员的基因结构、蛋白结构域均高度保守。亚细胞定位预测结果显示,TCP转录因子能够定位于细胞核、叶绿体和线粒体。启动子元件分析发现,TCP基因启动子区存在数量不等的激素应答顺式作用元件。转录组学数据显示,TCP基因具有不同的组织表达模式,该现象在匍匐茎和根状茎尤为明显。本研究为进一步探究TCP转录因子在狗牙根茎特化和生长发育过程中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 狗牙根 TCP转录因子 系统进化 共线性分析 生长发育 茎特化 基因表达谱
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用于干形描述的2个少参数削度函数(英文) 被引量:4
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作者 Khalid A. Hussein Matthias Schmidt +1 位作者 Heyns Kotze Klaus von Gadow 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第6期20-27,共8页
以修正的Brink函数和Pain函数拟合尾巨桉干形曲线。材料来源于南非暖温带花岗岩低地草原地区桉树工业用材林53块标准地的153株尾巨桉干形测定数据。2个削度方程均能对调查数据进行很好地拟合,只是在不同的相对高度时有小的偏差。参数少... 以修正的Brink函数和Pain函数拟合尾巨桉干形曲线。材料来源于南非暖温带花岗岩低地草原地区桉树工业用材林53块标准地的153株尾巨桉干形测定数据。2个削度方程均能对调查数据进行很好地拟合,只是在不同的相对高度时有小的偏差。参数少的方程具有十分好的应用前景,因为从理论上来说,可以用参数预估的方法建立一个广义的干形模型。参数预估不能运用于修正的Brink函数,但在Pain函数的基础上建立参数预估模型是可能的甚至是必要的,因为Pain函数是把绝对树干直径描述为相对树干高度的函数。为此,对参数预估模型是否能描述的树形差异或者仅仅是大小的差异作了测度评价。应用结果表明,参数预估模型未必能用于描述树形的差异。 展开更多
关键词 干形模型 Brink函数 Pain函数 巨桉
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人牙髓干细胞及非牙髓干细胞中微小RNA表达谱比较研究 被引量:4
15
作者 吕红兵 郑碧琼 +3 位作者 雷丽珊 张明 傅升 樊丽娜 《中国实用口腔科杂志》 CAS 2014年第3期146-150,共5页
目的比较微小RNA(miRNAs)在人牙髓干细胞(dental pulp stem cells,DPSCs)及非DPSCs中的表达差异,探讨其在维持DPSCs干性状态中的作用。方法本研究于2013年1—10月在福建医科大学附属口腔医院完成。原代培养人牙髓细胞,利用结合了STRO-1... 目的比较微小RNA(miRNAs)在人牙髓干细胞(dental pulp stem cells,DPSCs)及非DPSCs中的表达差异,探讨其在维持DPSCs干性状态中的作用。方法本研究于2013年1—10月在福建医科大学附属口腔医院完成。原代培养人牙髓细胞,利用结合了STRO-1特异性抗体的免疫磁珠分选获得DPSCs,并进行成牙本质样细胞的诱导分化,检测碱性磷酸酶(ALP)、骨钙素(OC)值以及进行von Kossa染色,鉴定其分化能力。采用miRNA基因芯片技术,检测DPSCs和非DPSCs中miRNAs的表达,筛选出差异表达的miRNAs。结果与非DPSCs相比,DPSCs中表达上调超过2倍的miRNAs有11个,表达下调超过2倍的miRNAs有3个。结论 miRNAs表达谱的变化可能与DPSCs干性状态的维持相关。 展开更多
关键词 牙髓干细胞 MIRNAS 表达谱 干性
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二维和三维培养脐带间充质干细胞的差异基因表达研究
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作者 徐哲 戴晓宇 +2 位作者 赵莎莎 李树建 李栋 《中国医药生物技术》 2024年第4期333-341,共9页
目的比较二维培养和三维培养的脐带间充质干细胞(UC-MSCs)的细胞形态和基因表达。方法分别采用以聚氟乙烯为支架的三维培养及传统二维培养方法进行稳定增殖期UC-MSCs细胞的培养,使用倒置显微镜、扫描电镜等观察比较二维培养与三维培养... 目的比较二维培养和三维培养的脐带间充质干细胞(UC-MSCs)的细胞形态和基因表达。方法分别采用以聚氟乙烯为支架的三维培养及传统二维培养方法进行稳定增殖期UC-MSCs细胞的培养,使用倒置显微镜、扫描电镜等观察比较二维培养与三维培养在细胞形态、细胞连接等方面的不同;然后应用基因表达谱芯片技术检测二维培养细胞与三维培养细胞的差异表达基因,用KEGG数据库及GO数据库进行生物信息学分析。结果成功分离并培养人UC-MSCs,流式检测高表达CD105、CD73和CD90等。三维培养的UC-MSCs附着在支架的表面生长并向外扩散,支架各层均可见细胞生长,细胞与细胞间连接紧密。基因表达谱芯片分析显示,三维培养的UC-MSCs与二维培养的UC-MSCs相比,升高的基因主要与生物学过程、分子功能及细胞组分相关,且参与了多个细胞信号通路的调控。结论与二维培养相比,三维细胞培养环境更适合脐带间充质干细胞的生长。 展开更多
关键词 脐带间充质干细胞 三维细胞培养 二维细胞培养 基因表达谱芯片
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大鼠BMSCs自发钙化过程中成骨相关基因表达谱的分析 被引量:4
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作者 焦雪峰 黄永灿 +2 位作者 黄益洲 吴诚光 邓力 《中国修复重建外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期133-141,共9页
目的分析大鼠BMSCs自发钙化过程中成骨相关基因表达谱的改变。方法取健康3日龄SD大鼠骨髓分离培养BMSCs并扩增至第4代,体外构建自发钙化模型。于培养7、14 d,倒置相差显微镜观察细胞生长状况及自发钙化进程,并行茜素红染色观察。分别于... 目的分析大鼠BMSCs自发钙化过程中成骨相关基因表达谱的改变。方法取健康3日龄SD大鼠骨髓分离培养BMSCs并扩增至第4代,体外构建自发钙化模型。于培养7、14 d,倒置相差显微镜观察细胞生长状况及自发钙化进程,并行茜素红染色观察。分别于培养0、7、14 d时收集细胞进行基因芯片分析,并对差异表达基因进行生物信息学分析。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)验证芯片分析结果。结果大鼠BMSCs在体外发生了自发钙化,并于培养7 d后细胞开始堆集,茜素红染色为弱阳性;培养14 d后细胞堆积明显并形成典型的茜素红染色阳性钙结节样结构。自发钙化过程中共检测到576个差异表达的基因探针,对应378个大鼠基因。其中0 d和7 d相比有359个差异表达的基因探针,而7 d和14 d相比只有13个差异表达的基因探针。差异表达基因依据表达模式不同可分为6类;依据生物学功能亲和关系,与骨细胞生物学密切关联的差异表达基因又可分为7大类,即血管生成、细胞凋亡、骨相关基因、细胞周期、发育、细胞通讯和成骨信号通路。基因功能关联性分析显示有12个在功能上联系密切的细胞周期类基因在自发钙化过程中发生了下调;此外,基质金属蛋白酶13(matrix metalloproteinase 13,Mmp13)、分泌型磷酸蛋白1(secreted phosphoprotein 1,Spp1)、Cxcl12、Mmp2、Mmp3、Apoe和Itga7与较多的差异表达基因存在功能上的联系。Spp1、Mgp、Mmp13、Wnt抑制因子1、Cxcl12和细胞周期素A2的RT-qPCR验证结果与基因芯片结果一致。结论细胞接种后的前7 d是决定大鼠BMSCs自发钙化的关键期。BMSCs自发钙化过程受细胞通讯类基因、骨相关基因、细胞周期类基因、TGF-β信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路和Wnt信号通路等多方面的共同调控。 展开更多
关键词 BMSCS 自发钙化 基因芯片 基因表达谱 生物信息学 大鼠
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骨髓瘤细胞可诱导骨髓间充质干细胞的基因表达谱发生暂时和(或)长期性改变 被引量:4
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作者 李俊霞 李皎 +7 位作者 王欢 汤郁 杨姣 夏雷 朱彦 陆化 王丽霞 费小明 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期25-31,共7页
目的:正常骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC)在与骨髓瘤细胞相互作用过程中,MSC的全基因表达谱的改变目前尚未有报道,本研究就对此进行研究并进一步探索多发性骨髓瘤的发病机制。方法:正常人骨髓MSC与骨髓瘤细胞株在Transwel... 目的:正常骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC)在与骨髓瘤细胞相互作用过程中,MSC的全基因表达谱的改变目前尚未有报道,本研究就对此进行研究并进一步探索多发性骨髓瘤的发病机制。方法:正常人骨髓MSC与骨髓瘤细胞株在Transwell共培养体系培养前后,用全基因表达芯片检测MSC全基因mRNA的表达谱,比较正常MSC在与骨髓瘤细胞共培养(MC组)或共培养后去除骨髓瘤细胞后继续单独培养的MSC(MA组),和MSC单独培养的对照组(MK组)基因表达谱的变化。结果:MC组与MK组相比较,在所有分析的10 000个基因中共发现837个差异基因(837/10 000,8.37%),其中有472个基因表达上调(472/837,56.39%),365个基因表达下调(365/837,43.61%)。而MA组与MK组相比较,共发现367个差异基因,其中有218个基因表达上调(218/367,59.40%),149个基因表达下调(149/367,40.60%)。从芯片结果中筛选出MMP1、FGFR2、ANGPTL4、MFAP5、TGM2、STC1、CCL7和IL-32这8个基因,经定量PCR验证后的结果与基因芯片结果相一致。结论:骨髓瘤细胞可以诱导正常骨髓MSC多种基因表达改变,并且有些改变即使在骨髓MSC脱离骨髓瘤细胞后仍可存在;此外,初步筛选到8个差异表达基因,其中7个基因在多发性骨髓瘤发病机制中的作用既往未见报道,有待今后进一步研究。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 骨髓间充质干细胞 共培养 基因表达谱
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人骨髓间充质干细胞基因表达谱的芯片分析
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作者 刘丹丹 王悦增 +1 位作者 赵东海 李玉林 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期914-917,共4页
目的:探讨骨髓间充质干细胞(MSCs)作为组织工程种子细胞的分子遗传学基础和临床应用价值。方法:通过密度梯度离心法和贴壁筛选法的联合应用,分离人骨髓间充质干细胞,流式细胞仪分析细胞同源性,UNIQ-10柱式Trizol总RNA抽提法获取足量的R... 目的:探讨骨髓间充质干细胞(MSCs)作为组织工程种子细胞的分子遗传学基础和临床应用价值。方法:通过密度梯度离心法和贴壁筛选法的联合应用,分离人骨髓间充质干细胞,流式细胞仪分析细胞同源性,UNIQ-10柱式Trizol总RNA抽提法获取足量的RNA,用于MSCs基因表达谱的分析研究。结果:流式细胞仪检测表明了所分离hMSCs的高度同源性,基因表达谱芯片分析首次揭示了MSCs表达多种间充质细胞和非间充质细胞的特异性mRNA,如脂肪细胞、成软骨细胞、成骨细胞、成肌细胞、造血支持基质、神经元、神经胶质细胞和上皮/内皮细胞等。结论:hMSCs具有高度可塑性和广泛分化潜能,是以干细胞工程为代表的现代组织工程的重要细胞来源。 展开更多
关键词 间充质干细胞 基因表达谱 基因芯片 组织工程
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基于实时荧光定量反转录PCR技术的动物miRNA表达分析策略 被引量:3
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作者 宋嘉哲 孙福伯 +1 位作者 庄开歌 薛恺 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第9期109-113,共5页
在人体内有约60%的蛋白质编码基因受到到miRNA调控。近年来,miRNA参与调控的与动物生长相关的细胞周期、发育、分化和新陈代谢等多种生物学过程也越来越受到关注。目前针对miRNA表达检测的常用方法有很多,其中基于反转录PCR(RT-PCR)的... 在人体内有约60%的蛋白质编码基因受到到miRNA调控。近年来,miRNA参与调控的与动物生长相关的细胞周期、发育、分化和新陈代谢等多种生物学过程也越来越受到关注。目前针对miRNA表达检测的常用方法有很多,其中基于反转录PCR(RT-PCR)的放大检测技术是应用范围最广,实施手段最灵活的一种研究策略。主要包括miRNA的全定量PCR法(miR-Q)、基于茎环引物的实时荧光定量PCR法、Poly(A)加尾性通用反转录法、miRNA表达谱的高通量RT-PCR分析和miRNA扩增谱系(mRAP)法。作者对这几种基于实时荧光定量RT-PCR技术的动物miRNA表达分析策略分别进行了介绍,对其原理、方法和应用范畴进行了概括性总结。 展开更多
关键词 动物miRNA 实时荧光定量PCR miRNA的全定量PCR 茎-环引物 miRNA扩增谱系
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