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环氧角鲨烯合成通路在大肠杆菌中的构建和优化
被引量:
4
1
作者
邵喜喜
孟云鹤
+6 位作者
周沈婷
刘欣婷
蒋慧姝
效啸
杨京
卫功元
王崇龙
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期2105-2115,共11页
三萜类化合物是一类广泛应用于医药、保健和化妆品等行业的天然产物,具有巨大的商业价值。生物合成三萜类化合物依赖于环氧角鲨烯的高效合成。角鲨烯环氧化酶是整个合成途径中的关键酶,其催化NADPH依赖的环氧化反应将角鲨烯转变为环氧...
三萜类化合物是一类广泛应用于医药、保健和化妆品等行业的天然产物,具有巨大的商业价值。生物合成三萜类化合物依赖于环氧角鲨烯的高效合成。角鲨烯环氧化酶是整个合成途径中的关键酶,其催化NADPH依赖的环氧化反应将角鲨烯转变为环氧角鲨烯。通过筛选不同来源的角鲨烯环氧化酶,截短的大鼠角鲨烯环氧化酶(RnSETC)在大肠杆菌Escherichia coli工程菌中表现出最强的活性;进一步考察内源性细胞色素P450还原酶样(CPRL)蛋白对环氧角鲨烯合成的影响显示,在中度拷贝质粒上以Lac启动子调控NADH:醌氧化还原酶(WrbA)的表达使得环氧角鲨烯产量提高近2.5倍。研究结果表明,所构建的环氧角鲨烯合成途径可以在大肠杆菌中实现三萜类合成关键前体环氧角鲨烯的合成,为生物合成三萜类化合物提供了重要借鉴。
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关键词
环氧角鲨烯
角鲨烯环氧化酶
类细胞色素P450还原酶蛋白
大肠杆菌
原文传递
药用植物中鲨烯环氧酶的生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
赵志新
王凡
《商洛学院学报》
2017年第6期51-55,68,共6页
从系统进化角度对药用植物中三萜皂苷合成通路中的关键酶——鲨烯环氧酶(Squalene epoxidase,SE)进行生物信息学分析。通过检索已发表的相关文献,从NCBI数据库中下载文献中实验验证的SE基因序列,然后使用生物信息分析软件对所搜集序列...
从系统进化角度对药用植物中三萜皂苷合成通路中的关键酶——鲨烯环氧酶(Squalene epoxidase,SE)进行生物信息学分析。通过检索已发表的相关文献,从NCBI数据库中下载文献中实验验证的SE基因序列,然后使用生物信息分析软件对所搜集序列进行同源性分析,并构建系统进化树。结果表明,刺五加与拟南芥、丹参的同源性较高,刺五加actin1,2,3SE(拟南芥)和刺五加actin SE(丹参)亲缘关系较近,而枇杷SE(拟南芥)的亲缘关系较远。
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关键词
鲨烯环氧酶
生物信息学
药用植物
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职称材料
三叶木通转录组分析及三萜皂苷生物合成途径关键酶基因的发掘
被引量:
1
3
作者
钱程程
赵历强
+3 位作者
杨亚湉
韩邦兴
吴家文
欧金梅
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期378-389,共12页
为了解三叶木通(Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.)的三萜皂苷合成途径及其关键酶,本研究对其花、叶、根、茎进行转录组测序,组装获得了57.25 Gb数据,含140859个unigenes,序列平均长度为1350 bp。KEGG代谢通路富集结果显示,517个unigene...
为了解三叶木通(Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.)的三萜皂苷合成途径及其关键酶,本研究对其花、叶、根、茎进行转录组测序,组装获得了57.25 Gb数据,含140859个unigenes,序列平均长度为1350 bp。KEGG代谢通路富集结果显示,517个unigenes参与三萜皂苷合成相关的3条代谢途径,其中415个unigenes编码三萜皂苷生物合成途径的19个关键酶。对三萜皂苷生物合成过程中的关键酶角鲨烯环氧酶(SE)进行序列分析和同源建模,发现其具有保守的底物结合结构域。将三叶木通茎与花、叶、根的基因表达水平进行比较,发现茎与根相比较其上调基因数目最多,其中295个差异表达基因(DEGs)与三萜皂苷生物合成途径相关。
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关键词
三叶木通
转录组测序
三萜皂苷
生物合成
角鲨烯环氧酶
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职称材料
题名
环氧角鲨烯合成通路在大肠杆菌中的构建和优化
被引量:
4
1
作者
邵喜喜
孟云鹤
周沈婷
刘欣婷
蒋慧姝
效啸
杨京
卫功元
王崇龙
机构
苏州大学基础医学与生物科学学院
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期2105-2115,共11页
基金
国家自然科学基金(No.21878198)
苏州大学“大学生创新创业训练计划”(No.2019xj073)资助。
文摘
三萜类化合物是一类广泛应用于医药、保健和化妆品等行业的天然产物,具有巨大的商业价值。生物合成三萜类化合物依赖于环氧角鲨烯的高效合成。角鲨烯环氧化酶是整个合成途径中的关键酶,其催化NADPH依赖的环氧化反应将角鲨烯转变为环氧角鲨烯。通过筛选不同来源的角鲨烯环氧化酶,截短的大鼠角鲨烯环氧化酶(RnSETC)在大肠杆菌Escherichia coli工程菌中表现出最强的活性;进一步考察内源性细胞色素P450还原酶样(CPRL)蛋白对环氧角鲨烯合成的影响显示,在中度拷贝质粒上以Lac启动子调控NADH:醌氧化还原酶(WrbA)的表达使得环氧角鲨烯产量提高近2.5倍。研究结果表明,所构建的环氧角鲨烯合成途径可以在大肠杆菌中实现三萜类合成关键前体环氧角鲨烯的合成,为生物合成三萜类化合物提供了重要借鉴。
关键词
环氧角鲨烯
角鲨烯环氧化酶
类细胞色素P450还原酶蛋白
大肠杆菌
Keywords
squalene
epoxide
squalene
epoxidase
CPR-like
Escherichia
coli
分类号
Q936 [生物学—微生物学]
Q78
原文传递
题名
药用植物中鲨烯环氧酶的生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
赵志新
王凡
机构
商洛学院生物医药与食品工程学院
出处
《商洛学院学报》
2017年第6期51-55,68,共6页
基金
商洛市科研计划项目(SK-2014-01-19)
商洛学院科研基金项目(14SKY028)
文摘
从系统进化角度对药用植物中三萜皂苷合成通路中的关键酶——鲨烯环氧酶(Squalene epoxidase,SE)进行生物信息学分析。通过检索已发表的相关文献,从NCBI数据库中下载文献中实验验证的SE基因序列,然后使用生物信息分析软件对所搜集序列进行同源性分析,并构建系统进化树。结果表明,刺五加与拟南芥、丹参的同源性较高,刺五加actin1,2,3SE(拟南芥)和刺五加actin SE(丹参)亲缘关系较近,而枇杷SE(拟南芥)的亲缘关系较远。
关键词
鲨烯环氧酶
生物信息学
药用植物
Keywords
squalene
epoxide
bioinformatics
medicinal
plants
分类号
S567.5 [农业科学—中草药栽培]
下载PDF
职称材料
题名
三叶木通转录组分析及三萜皂苷生物合成途径关键酶基因的发掘
被引量:
1
3
作者
钱程程
赵历强
杨亚湉
韩邦兴
吴家文
欧金梅
机构
安徽中医药大学药学院
安徽中医药大学科研实验中心
皖西学院生物与制药工程学院
中药饮片制造新技术安徽省重点实验室
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期378-389,共12页
基金
安徽中医药大学人才项目(2021rcyb011)
中央财政林业科技推广示范资金项目(Z175070050002)
安徽高校自然科学研究项目(KJ2019A0479)。
文摘
为了解三叶木通(Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.)的三萜皂苷合成途径及其关键酶,本研究对其花、叶、根、茎进行转录组测序,组装获得了57.25 Gb数据,含140859个unigenes,序列平均长度为1350 bp。KEGG代谢通路富集结果显示,517个unigenes参与三萜皂苷合成相关的3条代谢途径,其中415个unigenes编码三萜皂苷生物合成途径的19个关键酶。对三萜皂苷生物合成过程中的关键酶角鲨烯环氧酶(SE)进行序列分析和同源建模,发现其具有保守的底物结合结构域。将三叶木通茎与花、叶、根的基因表达水平进行比较,发现茎与根相比较其上调基因数目最多,其中295个差异表达基因(DEGs)与三萜皂苷生物合成途径相关。
关键词
三叶木通
转录组测序
三萜皂苷
生物合成
角鲨烯环氧酶
Keywords
Akebia
trifoliata
RNA-Seq
Triterpenoid
saponins
Biosynthesis
squalene
epoxide
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
环氧角鲨烯合成通路在大肠杆菌中的构建和优化
邵喜喜
孟云鹤
周沈婷
刘欣婷
蒋慧姝
效啸
杨京
卫功元
王崇龙
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
原文传递
2
药用植物中鲨烯环氧酶的生物信息学分析
赵志新
王凡
《商洛学院学报》
2017
3
下载PDF
职称材料
3
三叶木通转录组分析及三萜皂苷生物合成途径关键酶基因的发掘
钱程程
赵历强
杨亚湉
韩邦兴
吴家文
欧金梅
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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