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基于分裂注意力机制的DNA转录因子结合位点预测
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作者 姜博文 冯子健 黄伟鸿 《软件导刊》 2024年第2期32-39,共8页
准确识别DNA序列中的转录因子结合位点对于基因表达解析和药物设计等具有重要意义。基于深度学习的各种预测方法已被应用于转录因子结合位点任务中,但预测性能尚有提升空间。为此,提出一种新的深度学习方法ResNest-TFBS,用于预测690个Ch... 准确识别DNA序列中的转录因子结合位点对于基因表达解析和药物设计等具有重要意义。基于深度学习的各种预测方法已被应用于转录因子结合位点任务中,但预测性能尚有提升空间。为此,提出一种新的深度学习方法ResNest-TFBS,用于预测690个ChIP-seq数据集上的转录因子结合位点。该方法首先在序列One-hot编码的基础上通过引入DNA的分子动力学特征与静电势能特征提取DNA的空间结构特性;其次利用分裂注意力机制与残差结构组成ResNest模型进行训练,从而将通道注意力机制应用于不同通道分支,以捕获其在全局数据集上学习到的特征间交互与多通道表示;最后将上述先验知识迁移至690个ChIP-seq数据集上,并进行广泛测试。实验结果表明,ResNest-TFBS性能优异,平均AUC为0.929。此外,通过SHAP工具验证不同特征在该任务中的贡献程度,证实所引入的特征为转录因子结合位点预测提供了更具价值的生物学线索。 展开更多
关键词 DNA 转录因子结合位点 深度学习 迁移学习 分裂注意力机制
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结合拆分注意力机制和下一次预期观察的视觉导航 被引量:1
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作者 刘紫燕 杨模 +3 位作者 袁浩 梁静 梁水波 孙昊堃 《电子测量与仪器学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期96-105,共10页
针对深度强化学习视觉导航算法因导航场景变化而导致导航精度下降,影像匹配的实时性和可靠性降低的问题,提出一种融合拆分注意力机制和下一次预期观测(NEO)的视觉导航模型。首先使用ResNest50骨干网络提取当前状态和目标状态的特征以降... 针对深度强化学习视觉导航算法因导航场景变化而导致导航精度下降,影像匹配的实时性和可靠性降低的问题,提出一种融合拆分注意力机制和下一次预期观测(NEO)的视觉导航模型。首先使用ResNest50骨干网络提取当前状态和目标状态的特征以降低网络冗余,利用跨阶段部分连接CSP强化捕获浅层目标特征信息以增强模型的学习能力。然后提出改进的损失函数,使得推理网络更加接近于真实后验,从而智能体能在当前环境下做出最佳决策,进一步提升不同场景下模型的导航精度。在AVD数据集和AI2-THOR场景进行训练及测试,实验结果表明,本文算法导航精度高达96.8%,平均SR提升约3%,平均SPL提升约6%,可以满足导航精度和实时匹配的要求。 展开更多
关键词 视觉导航 深度强化学习 拆分注意力机制 下一次预期观测
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一种基于功用性图的目标推抓技能自监督学习方法 被引量:1
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作者 吴培良 刘瑞军 +3 位作者 毛秉毅 史浩洋 陈雯柏 高国伟 《机器人》 EI CSCD 北大核心 2022年第4期385-398,共14页
提出了一种基于功用性图的目标推抓技能自监督学习方法。首先,给出了杂乱环境下面向目标推抓任务的机器人技能自监督学习问题描述,将工作空间中机器人推抓操作的决策过程定义为一个全新的马尔可夫决策过程(MDP),分别训练视觉机制模块与... 提出了一种基于功用性图的目标推抓技能自监督学习方法。首先,给出了杂乱环境下面向目标推抓任务的机器人技能自监督学习问题描述,将工作空间中机器人推抓操作的决策过程定义为一个全新的马尔可夫决策过程(MDP),分别训练视觉机制模块与动作机制模块。其次,在视觉机制模块中融合自适应参数与分组拆分注意力模块设计了特征提取网络RGSA-Net,可由输入网络的原始状态图像生成功用性图,为目标推抓操作提供良好的前提。然后,在动作机制模块中搭建了基于演员-评论家(actor-critic)框架的深度强化学习自监督训练框架DQAC,机器人根据功用性图执行动作后利用该框架进行动作评判,更好地实现了推、抓之间的协同。最后,进行了实验对比与分析,验证了本文方法的有效性。 展开更多
关键词 推抓技能学习 功用性图 自监督学习 自适应参数 拆分注意力机制
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基于分散注意力与路径增强特征金字塔的文本检测 被引量:1
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作者 程琦 王国栋 赵毅 《激光与光电子学进展》 CSCD 北大核心 2020年第24期241-249,共9页
为了进一步提升基于卷积神经网络的文本检测器的检测精度,首先,用具有分散注意力机制的特征提取网络替代原始算法的主干网络,如残差网络,以促进通道间的信息交互,最大化地激活文本特征。其次,在原始特征金字塔网络的基础上增加自底向上... 为了进一步提升基于卷积神经网络的文本检测器的检测精度,首先,用具有分散注意力机制的特征提取网络替代原始算法的主干网络,如残差网络,以促进通道间的信息交互,最大化地激活文本特征。其次,在原始特征金字塔网络的基础上增加自底向上的路径,以减少文本特征信息的损耗。实验结果表明,本算法在CTW1500、Total-Text曲线数据集上的平均精度分别为78.7%、79.0%,在多方向数据集和多语言数据集的平均精度分别为82.7%、79.3%,相比其他算法均有一定的提升。 展开更多
关键词 图像处理 卷积神经网络 主干网络 分散注意力机制 特征金字塔网络
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DNeStCount:数据相关的拆分注意力机制的编码器-解码器结构的人群计数方法
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作者 孟晓龙 《计算机与现代化》 2022年第9期68-77,共10页
人群数量估计是人群管理系统的关键,对于预防踩踏事故和引导人群至关重要,已成为一个日益重要的任务和具有挑战性的研究方向。本文提出一种数据相关的拆分注意力机制的编码器-解码器结构的人群计数方法,称为DNe StCount。为应对视频监... 人群数量估计是人群管理系统的关键,对于预防踩踏事故和引导人群至关重要,已成为一个日益重要的任务和具有挑战性的研究方向。本文提出一种数据相关的拆分注意力机制的编码器-解码器结构的人群计数方法,称为DNe StCount。为应对视频监控的尺度变化和透视失真的挑战,将更密集的空洞采样比率应用到密集空洞空间金字塔池化模块DASPP设计中。为提升密度图估计的准确性,将可学习的、数据相关的上采样方法 DUpsampling应用到特征聚合模块DFA设计中。为弥补欧几里德损失可能存在对离群值敏感、训练不稳定等缺点,采用Smooth L1损失设计损失函数。在具有挑战性的数据集上进行的实验和分析表明,本文提出的人群计数方法 DNe St Count与其他主流方法相比更具有竞争力。 展开更多
关键词 人群计数 编码器-解码器结构 拆分注意力机制 密集空洞空间金字塔池化 数据相关上采样 Smooth L1损失
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