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汉语地名时空信息的一体化表达 被引量:13
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作者 李金良 张雪英 樊晓春 《地理与地理信息科学》 CSSCI CSCD 北大核心 2010年第6期6-10,23,共6页
地名信息中蕴含着丰富的地名时空信息,而目前已建立的大部分地名数据库,从信息内容看,描述了历史地名信息,但忽略了时空信息;从信息结构看,存在描述的范围、完备性和丰富性等方面的差异,缺乏统一的数据结构。该文通过分析地名及其相关... 地名信息中蕴含着丰富的地名时空信息,而目前已建立的大部分地名数据库,从信息内容看,描述了历史地名信息,但忽略了时空信息;从信息结构看,存在描述的范围、完备性和丰富性等方面的差异,缺乏统一的数据结构。该文通过分析地名及其相关信息内容,设计了能够较为完善地表达地名实体、时间信息、空间信息、属性信息和地名空间关系等时空一体化的地名数据库规范,包括地名数据库的结构和数据组织。该研究成果有助于拓展地名数据库在公共卫生、数据信息管理、文化历史和基于文本的地理参考自动化等领域的应用服务。 展开更多
关键词 汉语地名 时空信息 一体化表达
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转cry1Ab/cry2Aj和G10evo-epsps基因玉米中Bt蛋白的时空表达及抗性评价 被引量:9
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作者 孙红炜 李凡 +3 位作者 高瑞 徐晓辉 杨淑珂 路兴波 《生物安全学报》 2018年第1期63-68,共6页
【目的】探讨转cry1Ab/cry2Aj和G10evo-epsps基因玉米双抗505-12-5中外源Bt蛋白时空表达规律,对3种主要鳞翅目害虫亚洲玉米螟、黏虫和棉铃虫的抗性进行鉴定,为转基因玉米双抗505-12-5的商业化推广提供科学的数据支撑。【方法】Bt蛋白时... 【目的】探讨转cry1Ab/cry2Aj和G10evo-epsps基因玉米双抗505-12-5中外源Bt蛋白时空表达规律,对3种主要鳞翅目害虫亚洲玉米螟、黏虫和棉铃虫的抗性进行鉴定,为转基因玉米双抗505-12-5的商业化推广提供科学的数据支撑。【方法】Bt蛋白时空表达规律采用酶联免疫法(ELISA),田间抗虫性和室内抗虫性鉴定分别采用田间人工接虫和离体组织生测方法。【结果】在玉米6~8叶期,Bt含量表现为根>心叶>茎,分别为517.3、453.8和312.8 ng·g^(-1);大喇叭口期,Bt含量表现为心叶>根>茎,分别为353.3、281.3和232.9 ng·g^(-1);吐丝期,Bt含量表现为心叶>根>茎,分别为188.9、114.1和53.6 ng·g^(-1);乳熟期,根、茎和心叶含量相当,分别为178.0、160.3和185.4 ng·g^(-1);繁殖器官中Bt蛋白含量表现为籽粒>花丝>花粉>雄穗,分别为181.3、100.1、95.0和79.8 ng·g^(-1)。室内抗虫性鉴定表明,转基因玉米双抗505-12-5心叶饲喂黏虫24 h,幼虫死亡率低,但48 h后达98.21%;双抗505-12-5心叶、花丝和籽粒饲喂玉米螟,24 h幼虫死亡率分别为87.37%、100%、100%;双抗505-12-5花丝饲喂棉铃虫,24 h幼虫死亡率达80.18%,48 h死亡率为92.45%。田间鉴定结果显示,转基因玉米双抗505-12-5在心叶期和雌穗期对玉米螟、心叶期对黏虫、雌穗期对棉铃虫的抗性均达高抗水平。【结论】转基因玉米双抗505-12-5各器官在不同生育期中均能表达Bt蛋白,尤其在鳞翅目害虫为害的主要时期6~8叶期和吐丝期及乳熟期,易受害器官中Bt蛋白表达量较高。转基因玉米双抗505-12-5田间及室内对3种鳞翅目害虫均表现了显著的抗性效果,具有推广应用的潜力。 展开更多
关键词 BT蛋白 时空表达 鳞翅目害虫 室内抗虫性 田间抗虫性 抗性评价
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Spatial and temporal expression of germ cell nuclear factorin murine epididymis 被引量:7
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作者 Zong-YaoZhou ChenXu +3 位作者 Qiang-SuGuo Yuan-XinHu Yong-LianZhang Yi-FeiWang 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2004年第1期23-28,共6页
Aim: To investigate the spatial and temporal expression of germ cell nuclear factor (GCNF) in mouse and rat epididymis during postnatal period. Methods: The epididymal sections from different postnatal days were stain... Aim: To investigate the spatial and temporal expression of germ cell nuclear factor (GCNF) in mouse and rat epididymis during postnatal period. Methods: The epididymal sections from different postnatal days were stained for GCNF by the indirect immunofluorescence technique and digital photographs were taken by a Carl Zeiss confocal microscope. Results: GCNF was first detected on day 12 in mouse epididymis and day 14 in rat epididymis. The highest expression of GCNF was observed on day 35 in both mouse and rat epididymis. In adults, GCNF exhibited a region-specific expression pattern, i.e., it was expressed predominantly in the initial segment, caput and proximal corpus of rat epididymis and was abundant in the proximal corpus of mouse epididymis. GCNF could be found in the nuclei of the principal, apical, narrow, clear and halo cells. Conclusion: GCNF may play an important role in epididymal differentiation and development and in sperm maturation. 展开更多
关键词 germ cell nuclear factor EPIDIDYMIS spatial and temporal expression
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日本沼虾血蓝蛋白基因cDNA全长克隆及表达分析 被引量:7
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作者 王文锋 夏西超 +3 位作者 王雪参 吕黎 杨洪 宁黔冀 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期214-219,共6页
目的克隆日本沼虾血蓝蛋白基因,进行生物信息学及时空表达分析。方法利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)从肝胰腺中克隆血蓝蛋白基因cDNA全长序列,用生物学软件对其序列进行生物信息学分析,时空表达分析采用实时荧光定量PCR方法。结果日本... 目的克隆日本沼虾血蓝蛋白基因,进行生物信息学及时空表达分析。方法利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)从肝胰腺中克隆血蓝蛋白基因cDNA全长序列,用生物学软件对其序列进行生物信息学分析,时空表达分析采用实时荧光定量PCR方法。结果日本沼虾血蓝蛋白基因cDNA全长2 151 bp,包含14 bp的5'UTR、148 bp的3'UTR和189 bp的开放阅读框(ORF)。ORF编码663个氨基酸,预测分子量为76.65kD,理论等电点为5.42,含有典型的3个血蓝蛋白结构域和2个保守的铜离子结合位点。与淡水螯虾、凡纳滨对虾血蓝蛋白相似性分别为70%和63%。该基因在肝胰腺中的相对表达量最高,肌肉和血细胞表达较弱,大颚器官、表皮和卵巢几乎不表达;肝胰腺血蓝蛋白基因的表达量在蜕皮间期最高,蜕皮后期和蜕皮前期较低;嗜水气单胞菌刺激后肝胰腺中的表达量显著增加。结论与其他甲壳动物相似,日本沼虾血蓝蛋白基因具有典型的结构域和保守的铜离子结合位点,在蜕皮间期的肝胰腺中呈高表达,是参与机体免疫防御反应的一种重要分子。 展开更多
关键词 血蓝蛋白 基因克隆 CDNA末端快速扩增 实时荧光定量PCR 时空表达 日本沼虾
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转Cry1Ab-Ma基因玉米CM8101对亚洲玉米螟抗性研究 被引量:8
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作者 张爽 鲁鑫 +7 位作者 张嘉月 杨小艳 谢树章 武凤慈 宋新元 王振华 李新海 翁建峰 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期59-64,共6页
利用q RT-PCR和ELISA等方法测定转Cry1Ab-Ma基因玉米CM8101不同世代、不同组织目标基因表达量,开展玉米螟室内和田间生测鉴定,评价转Cry1Ab-Ma基因玉米CM8101对亚洲玉米螟的抗性。结果表明,Cry1Ab-Ma基因在CM8101各组织中均有表达,不同... 利用q RT-PCR和ELISA等方法测定转Cry1Ab-Ma基因玉米CM8101不同世代、不同组织目标基因表达量,开展玉米螟室内和田间生测鉴定,评价转Cry1Ab-Ma基因玉米CM8101对亚洲玉米螟的抗性。结果表明,Cry1Ab-Ma基因在CM8101各组织中均有表达,不同世代间目的基因的表达量无显著性差异,遗传稳定。室内生测结果表明,转基因玉米CM8101各组织均对亚洲玉米螟具有显著的杀虫效果,不同世代间玉米螟的存活率均无显著性差异。田间接虫鉴定结果表明,CM8101在T3、T4、T5世代的抗性等级均为1级,抗性水平为高抗。 展开更多
关键词 转基因玉米 时空表达 亚洲玉米螟 抗虫性鉴定
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家蚕整合素基因Bmintegrin αPS3的鉴定及亚细胞定位 被引量:7
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作者 谈娟 张奎 +2 位作者 徐曼 陈思源 崔红娟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第22期4808-4815,共8页
【目的】克隆家蚕整合素基因BmintegrinαPS3,分析其mRNA表达及亚细胞定位特征,并进行原核表达及蛋白纯化,为进一步探究BmintegrinαPS3在家蚕中的功能奠定基础。【方法】利用RACE方法克隆获得BmintegrinαPS3的cDNA全长序列;采用RT-PC... 【目的】克隆家蚕整合素基因BmintegrinαPS3,分析其mRNA表达及亚细胞定位特征,并进行原核表达及蛋白纯化,为进一步探究BmintegrinαPS3在家蚕中的功能奠定基础。【方法】利用RACE方法克隆获得BmintegrinαPS3的cDNA全长序列;采用RT-PCR方法检测BmintegrinαPS3的时空表达;在原核表达系统中表达获得BmintegrinαPS3重组蛋白;并构建BmintegrinαPS3真核表达载体,转染家蚕胚胎细胞系分析其蛋白亚细胞定位。【结果】家蚕整合素基因BmintegrinαPS3编码框全长为2 895 bp,编码965个氨基酸,含有整合素家族蛋白典型的integrin alpha结构域,预测其为跨膜蛋白。构建了BmintegrinαPS3的原核表达系统,并利用亲和层析纯化获得高纯度的BmintegrinαPS3原核表达蛋白,为进一步制备抗体获得足够的抗原。在家蚕细胞系中外源表达BmintegrinαPS3蛋白,显示其主要定位于细胞质和细胞膜中。另外,RT-PCR结果显示BmintegrinαPS3 mRNA在血细胞中为特异持续表达。【结论】获得了BmintegrinαPS3的完整cDNA序列及表达特征,经原核表达、纯化获得其融合蛋白,在细胞水平上初步分析了其亚细胞定位情况。 展开更多
关键词 家蚕整合素基因 克隆 时空表达 原核表达 亚细胞定位
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基于空时注意力网络的面部表情识别 被引量:7
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作者 冯晓毅 黄东 +1 位作者 崔少星 王坤伟 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期319-327,共9页
基于视频序列的面部表情识别问题主要有两个特点:空时性和显著性。近年来,许多研究人员利用卷积神经网络、循环神经网络、三维卷积神经网络等深度学习方法处理该问题的空时特性。但是,面部表情的显著性问题却往往被忽视。随着注意力机... 基于视频序列的面部表情识别问题主要有两个特点:空时性和显著性。近年来,许多研究人员利用卷积神经网络、循环神经网络、三维卷积神经网络等深度学习方法处理该问题的空时特性。但是,面部表情的显著性问题却往往被忽视。随着注意力机制在深度学习网络中的应用发展,其能够有效地解决各类任务中的显著性问题。该文将空时注意力机制应用到面部表情识别中,使得深度网络更多地关注空时特征中的显著性。具体地,该文将空间注意力模块嵌入到卷积网络中,以使空域特征更加关注对表情识别重要的区域,将时间注意力模块嵌入到门控循环单元(gated recurrent units,GRU)后,使得时域特征更加关注信息丰富的视频帧。在RECOLA情感数据库上的实验表明,与一般的深度模型相比,该文的深度空时注意力网络显著提高了面部表情识别的性能。 展开更多
关键词 深度学习 空时方法 注意力机制 面部表情识别
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西花蓟马FoccOBP3的分子克隆、序列分析及表达特征 被引量:6
8
作者 张治科 虎花 马荣 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期495-507,共13页
鉴定昆虫嗅觉相关蛋白基因并对其序列和时空表达进行研究,可为阐明昆虫与寄主间的化学通讯机制提供依据。本文新克隆并鉴定获得一个西花蓟马OBP基因FoccOBP3(Gen Bank登录号:MT682352),c DNA序列全长1226 bp,读码框全长432 bp,编码143... 鉴定昆虫嗅觉相关蛋白基因并对其序列和时空表达进行研究,可为阐明昆虫与寄主间的化学通讯机制提供依据。本文新克隆并鉴定获得一个西花蓟马OBP基因FoccOBP3(Gen Bank登录号:MT682352),c DNA序列全长1226 bp,读码框全长432 bp,编码143个氨基酸残基。氨基酸序列中六个保守的半胱氨酸位点排列方式为C_1-X_(26)-C_(2)-X_(3)-C_(3)-X_(37)-C_4-X_(10)-C_(5)-X_8-C_(6),完全符合典型气味结合蛋白所具有的六个保守的半胱氨酸位点结构模型。氨基酸序列中有5个亲脂性区域,其中第62~75位的氨基酸残基形成明显的亲脂性口袋。预测该蛋白分子量为15.50 kD,等电点为5.24,N-末端包含21个氨基酸组成的信号肽序列。FoccOBP3与横缝茧蜂Diachasmaalloeum的DallGOBP(Gen Bank登录号为XP_015125081.1)、赤拟谷盗Triboliumcastaneum的TcasPBP(Gen Bank登录号为XP_015835846.1)和TcasOBP07(Gen Bank登录号为EFA04593.1)的氨基酸序列一致性较高。FoccOBP3与埋葬甲虫Nicrophorusvespilloides的NvesGOBP(Gen Bank登录号为XP_017781594.1)聚在最小的一个分支,表明与该基因亲缘关系最近。Focc OBP3蛋白含有组成α-螺旋的氨基酸残基127个,形成β-折叠的氨基酸残基58个,形成β-转角的氨基酸残基15个。Focc OBP3蛋白骨架是由6个α-螺旋和连接这些螺旋的回折构成,其中5个α-螺旋形成一个结合口袋。FoccOBP3在西花蓟马1龄若虫中高表达,其次是羽化5d的雌虫,其余发育阶段的表达量均较低;且在雌、雄性成虫中的表达量亦有差异,除了羽化10d的,羽化1、5、15d雌虫的表达量均比同发育阶段雄虫的高。该基因在西花蓟马成虫触角中高表达,其次是头部,在腹、足中的表达较低,在胸部微表达。本研究克隆获得西花蓟马气味结合蛋白基因FoccOBP3,明确了其核苷酸、氨基酸序列特征,预测了该蛋白的二级、三维结构,测定了FoccOBP3在西花蓟马中的时空表达,推测该基因可能在西花蓟马气味� 展开更多
关键词 西花蓟马 气味结合蛋白 基因克隆 序列分析 结构预测 时空表达
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菜心BrcuFCA基因的克隆与表达分析 被引量:6
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作者 肖旭峰 雷建军 +1 位作者 曹必好 陈国菊 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期31-36,共6页
本文以菜心(Brassica campestris L.ssp.chinensis(L.)Makino var.utilis)为实验材料,比较了Trizol法、改进Trizol法及改良SDS法提取菜心总RNA的效果。结果表明改进Trizol法集中了操作简单、耗时短、所需试剂种类少,且完整性好,产量和... 本文以菜心(Brassica campestris L.ssp.chinensis(L.)Makino var.utilis)为实验材料,比较了Trizol法、改进Trizol法及改良SDS法提取菜心总RNA的效果。结果表明改进Trizol法集中了操作简单、耗时短、所需试剂种类少,且完整性好,产量和纯度均高等多重优点,成为提取菜心总RNA首选方案。同时文章以甘蓝型油菜及其它物种的FCA保守区设计引物,将质量高的菜心总RNA反转录合成cDNA,通过RT-PCR从菜心的早、晚熟品种中均克隆得到与开花有关的基因片段,将之命名为BrcuFCA,片段长1001bp,GenBank登录号为EU700363,与甘蓝型油菜及拟南芥FCA氨基酸同源性分别达到了98%和82%。另一方面,本研究还利用半定量RT-PCR研究了BrcuFCA不同时空表达特性,并结合已发表的开花调控遗传途径中两个关键基因BrcuFLC和BrcuFRI时空表达特性研究结果,推测菜心主要的抽薹开花途径不是春化和FRI-依赖途径,而很可能是自主开花途径。本研究为菜心抽薹开花分子机理的研究提供理论依据。 展开更多
关键词 菜心 总RNA提取 FCA基因 时空表达
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甘草β-AS基因时空表达模式研究 被引量:5
10
作者 刘颖 刘春生 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期528-531,共4页
目的:揭示甘草β-AS基因表达的时间特异性及空间特异性。方法:通过PCR扩增获得不同时间、不同部位甘草β-AS基因的cDNA序列,琼脂糖凝胶电泳后用Gel-Pro分析软件对电泳条带进行光密度分析,计算其相对表达量。结果:空间特异性实验显示β-A... 目的:揭示甘草β-AS基因表达的时间特异性及空间特异性。方法:通过PCR扩增获得不同时间、不同部位甘草β-AS基因的cDNA序列,琼脂糖凝胶电泳后用Gel-Pro分析软件对电泳条带进行光密度分析,计算其相对表达量。结果:空间特异性实验显示β-AS基因在甘草的地上部分没有表达,地下组织中,新陈代谢最旺盛的根尖部分表达量高于根茎。时间特异性实验显示甘草β-AS基因在全年中的表达水平可分为4个阶段。12月至2月,β-AS基因表达低于检测水平;3月至5月,β-AS基因开始表达,表达量逐渐上升;5、6及8、9月,β-AS基因表达量保持较高水平;10、11月表达量开始下降。结论:在研究甘草β-AS基因时,应该选取转录水平较高的5、6及8、9月份;选取转录水平较高的根尖作为提取总RNA的部位。 展开更多
关键词 甘草 β-AS基因 时空表达
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Commercial production of transgenic Bt insect-resistant cotton varieties and the resistance management for bollworm (Helicoverpa armigera Hubner) 被引量:3
11
作者 ZHANG Tianzhen & TANG CanmingKey Laboratory of Crop Germplasm & Breeding, Ministry of Agriculture Department of Agronomy, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2000年第14期1249-1257,共9页
There are currently three kinds of transgenic Bt insect-resistant cotton germplasm lines, Shanxi 94-24, Zhongxin 94 and R19, in China. They showed high resistance to the neonate larvae of bollworm (Helicoverpa armiger... There are currently three kinds of transgenic Bt insect-resistant cotton germplasm lines, Shanxi 94-24, Zhongxin 94 and R19, in China. They showed high resistance to the neonate larvae of bollworm (Helicoverpa armigera). Transgenic Bt insect-resistant cotton varieties or hybrids have been bred using the three kinds of germplasm lines as parents. Our researches reveal that there exist different expressions in resistant level at different developmental stages in the three categories of germplasm lines. When neonate larvae are fed with leaves of cotton plant at the seeding stage with less than 10 leaves on the main stem, the mortality of the neonate larvae is 100%, but the resistance level will decline at later season. When Bt gene has been transferred to the cotton genome, it can be steadily transferred to the progeny, the level of resistance to bollworm keeps fundamentally uniform. Such insects as tobacco budworm (Heliothis virencens) in laboratory directive selection are very apt to produce resistance 展开更多
关键词 TRANSGENIC BT insect-resistant cotton HELICOVERPA ARMIGERA RESISTANCE spatial and temporal expression insect RESISTANCE management.
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一个新型水稻不育突变体91FS受精卵发育的时间和空间表达 被引量:2
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作者 钟蓉 董微 吴伯骥 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2003年第5期471-473,共3页
水稻 91FS是一个稳定遗传的籼粳型不育突变体 ,大约 2 5 %的受精卵能正常发育成胚 ,约 75 %的受精卵核仁不融合 ,受精卵不再分裂 ,导致不育和不结实 ,育性六代稳定遗传 ,受精卵致死时空位点发生在精细胞进入卵细胞完成受精作用后。开花... 水稻 91FS是一个稳定遗传的籼粳型不育突变体 ,大约 2 5 %的受精卵能正常发育成胚 ,约 75 %的受精卵核仁不融合 ,受精卵不再分裂 ,导致不育和不结实 ,育性六代稳定遗传 ,受精卵致死时空位点发生在精细胞进入卵细胞完成受精作用后。开花前后 ,91FS、籼粳杂种可育材料 91FM和以 91FS为父本的杂种F1代的花药、颖壳、叶片和子房的可溶性蛋白质SDS PAGE和IEF/SDS PAGE分析表明 ,91FS、91FM和F1代的蛋白质谱带多代保持稳定 ,3个材料间蛋白质谱带的异同 ,既表明了它们在遗传和发育上的某些共同功能和相互关系 ,又表明不同品种、器官和组织在遗传和发育上的某些特异性 ;91FS的子房在开花 1~ 2天 ,具有一条Mr=15 8.5× 10 3 的特有蛋白带 ,结合 91FS受精卵发育的细胞学和胚胎学时空定位 ,表明它们极有可能与 91FS稳定遗传的受精卵发育的时间和空间表达有关 .图 4表 1参 展开更多
关键词 籼粳稻杂种 不育突变体 育性发育 空间表达 时间表达
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新疆南部棉区转Bt基因棉花Bt杀虫蛋白表达规律研究 被引量:4
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作者 王冬梅 丁瑞丰 +5 位作者 李海强 李号宾 汪飞 阿克旦.吾外士 徐遥 刘建 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期97-101,共5页
为研究新疆南部植棉区转Bt基因棉花Bt杀虫蛋白时空表达规律,本文利用ELISA技术于2009年和2010年对南疆种植的转Bt基因棉花‘中棉所41’、‘中棉所43’、‘236’、‘K9030’、‘T3’、‘中棉所44’、‘中棉所45’、‘K7’和‘SGK321’各... 为研究新疆南部植棉区转Bt基因棉花Bt杀虫蛋白时空表达规律,本文利用ELISA技术于2009年和2010年对南疆种植的转Bt基因棉花‘中棉所41’、‘中棉所43’、‘236’、‘K9030’、‘T3’、‘中棉所44’、‘中棉所45’、‘K7’和‘SGK321’各生育期中不同器官中的Bt杀虫蛋白含量进行测定。结果发现:在时间表达上,大多数转Bt基因棉花叶片的Bt杀虫蛋白含量随着棉花发育进程而逐渐下降,在子叶期含量最高,至蕾期或吐絮期达到最低点。并且不同品种间Bt杀虫蛋白含量差异显著。在空间表达上,在花铃期,棉铃和花苞叶的Bt杀虫蛋白含量最低,大多数品种表现为叶片>棉蕾>花瓣(花柱)>棉铃和花苞叶。 展开更多
关键词 转BT基因棉花 BT杀虫蛋白 ELISA技术 时空表达 新疆南部
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精子抗原基因在猪生殖道及成熟精子中的表达特性 被引量:4
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作者 宋成义 高波 +5 位作者 吴晗 王霄燕 王升智 周辉云 陈国宏 毛九德 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第21期4482-4489,共8页
【目的】揭示若干精子抗原基因(SPAG1、SPAG5、SPAG6、SPAG11C和SPAG11E)在梅山公母猪生殖道及成熟精子中的mRNA时空表达规律。【方法】利用RT-PCR技术分析各基因在生殖道和精子中组织表达谱,利用半定量RT-PCR分析其在初生至150d梅山公... 【目的】揭示若干精子抗原基因(SPAG1、SPAG5、SPAG6、SPAG11C和SPAG11E)在梅山公母猪生殖道及成熟精子中的mRNA时空表达规律。【方法】利用RT-PCR技术分析各基因在生殖道和精子中组织表达谱,利用半定量RT-PCR分析其在初生至150d梅山公猪睾丸中的发育性表达特性。【结果】5个基因在梅山公母猪生殖道组织中呈现不同的表达特性。其中SPAG1在睾丸中表达丰度最高,在精囊腺、前列腺、附睾体、子宫角和输卵管呈现中等丰度表达,而在附睾尾、子宫颈和卵巢的表达信号较弱。SPAG5在睾丸中表达丰度最高,在前列腺、附睾体和子宫颈中表达信号较弱。而SPAG6在睾丸中高丰度表达,在输卵管中呈现中等丰度表达,在子宫角的表达信号很弱。SPAG11C在附睾体和睾丸中高水平表达,而SPAG11E则在附睾体和附睾尾中低水平表达。在成熟精子中只有SPAG11E有mRNA表达。SPAG1、SPAG5、SPAG6和SPAG11C基因在公猪睾丸中发育性表达分析表明,总体上所检测的4个精子抗原基因的表达水平都随着日龄增加而提高,但存在一些差异。其中SPAG1和SPAG11C呈现相似的表达规律,在初生和30日龄时表达相对较低,但在60、90、150日龄都有显著提高(P<0.05)。而SPAG5在初生和30日龄时表达也相对较低,在60和90日龄时均有显著提高(P<0.05),但150日龄时略有下降,但差异不显著。SPAG6在初生和30日龄时表达水平很低,至60日龄有显著提高(P<0.05),90日龄时维持这一水平,而到150日龄时则有显著下降(P<0.05)。【结论】SPAG1、SPAG5、SPAG6、SPAG11C和SPAG11E在梅山公母猪生殖道组织广泛表达,在睾丸组织中其mRNA表达水平变化与性发育相一致,SPAG11E在精子中存在低丰度mRNA表达。 展开更多
关键词 精子抗原 生殖道 精子 时空表达
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日本沼虾酚氧化酶原基因cDNA的全长克隆及表达分析 被引量:4
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作者 王文锋 马建敏 +3 位作者 杨洪 刘方 陈香丽 宁黔冀 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期744-750,共7页
目的克隆日本沼虾酚氧化酶原(proPO)基因,进行生物信息学及时空表达分析。方法利用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(RACE)技术从血细胞中克隆proPO基因cDNA全长序列,用生物软件对其序列进行生物信息学分析;proPO基因时空表达分析采用RT-PCR和R... 目的克隆日本沼虾酚氧化酶原(proPO)基因,进行生物信息学及时空表达分析。方法利用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(RACE)技术从血细胞中克隆proPO基因cDNA全长序列,用生物软件对其序列进行生物信息学分析;proPO基因时空表达分析采用RT-PCR和Real-time PCR方法;腹部肌肉注射嗜水气单胞菌(5.0×109/L)诱导酚氧化酶(PO),20μl/只,注射后3、6、12、24h取其血淋巴,分别测定血细胞proPO mRNA水平及血清酚氧化酶(PO)活力。结果日本沼虾proPO基因cDNA全长2428bp,包含71 bp的5’UTR、344 bp的3’UTR和2013bp的开放阅读框(ORF)。ORF编码671个氨基酸,预测蛋白分子量为76.5kD,理论等电点(pI)约为7.31;含有2个保守的铜离子结合位点和6个组氨酸残基、1个蛋白酶水解位点和硫酯样的基序(GCGWPRHM);含有3个血蓝蛋白结构域;与罗氏沼虾proPO的相似性最高,为93%,与其他甲壳动物proPO相似性为50%~53%。该基因表达具有组织特异性,血细胞最高,肝胰腺有较弱表达,肌肉、鳃、肠、大颚器官和卵巢不表达;血细胞proPO基因的表达量在蜕皮前期(D0/1)最高;嗜水气单胞菌刺激后6 h血细胞proPO mRNA水平及血清中PO活力均显著增加。结论与其他甲壳动物相似,日本沼虾proPO基因具有2个保守的铜离子结合位点;其表达呈组织特异性,最高出现在血细胞;在蜕皮周期的前期(D0/1)血细胞表达量最高;嗜水气单胞菌可诱导proPO基因的表达以及PO活力,提示该基因是参与机体免疫防御反应的一种重要分子。 展开更多
关键词 酚氧化酶原 时空表达 快速扩增cDNA末端技术 实时荧光定量聚合酶链反应 日本沼虾
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Non-Frontal Facial Expression Recognition Using a Depth-Patch Based Deep Neural Network 被引量:2
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作者 Nai-Ming Yao Hui Chen +1 位作者 Qing-Pei Guo Hong-An Wang 《Journal of Computer Science & Technology》 SCIE EI CSCD 2017年第6期1172-1185,共14页
The challenge of coping with non-frontal head poses during facial expression recognition results in considerable reduction of accuracy and robustness when capturing expressions that occur during natural communications... The challenge of coping with non-frontal head poses during facial expression recognition results in considerable reduction of accuracy and robustness when capturing expressions that occur during natural communications. In this paper, we attempt to recognize facial expressions under poses with large rotation angles from 2D videos. A depth^patch based 4D expression representation model is proposed. It was reconstructed from 2D dynamic images for delineating continuous spatial changes and temporal context under non-frontal cases. Furthermore, we present an effective deep neural network classifier, which can accurately capture pose-variant expression features from the depth patches and recognize non-frontal expressions. Experimental results on the BU-4DFE database show that the proposed method achieves a high recognition accuracy of 86.87% for non-frontal facial expressions within a range of head rotation angle of up to 52%, outperforming existing methods. We also present a quantitative analysis of the components contributing to the performance gain through tests on the BU-4DFE and Multi-PIE datasets. 展开更多
关键词 facial expression recognition non-frontal head pose DEPTH spatial-temporal convolutional neural network
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斜纹夜蛾几丁质酶家族基因鉴定与时空表达分析 被引量:2
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作者 张晓娟 丁洋 +2 位作者 陈亚青 黄立华 郑思春 《华南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2015年第3期100-106,共7页
昆虫GH18家族几丁质酶属于多基因家族,在昆虫的蜕皮与变态过程中发挥着至关重要的作用,它催化表皮几丁质的降解.斜纹夜蛾是一种重要的农业害虫,危害290多种植物,但对其几丁质酶未深入研究.该文通过斜纹夜蛾转录组学分析,发现了12种潜在... 昆虫GH18家族几丁质酶属于多基因家族,在昆虫的蜕皮与变态过程中发挥着至关重要的作用,它催化表皮几丁质的降解.斜纹夜蛾是一种重要的农业害虫,危害290多种植物,但对其几丁质酶未深入研究.该文通过斜纹夜蛾转录组学分析,发现了12种潜在的几丁质酶,分属于8类.对这些几丁质酶在斜纹夜蛾变态发育时在表皮、中肠以及脂肪体的时空表达分析结果表明,Sl Cht5,Sl Cht9和Sl Cht2的表达水平在幼虫转化为蛹时上调表达,说明这些几丁质酶可能参与了斜纹夜蛾变态时期的脱皮作用;而其他几丁质酶的表达具有组织特性,表明它们可能具有不同功能,如Sl Cht6仅在中肠和脂肪体中表达,Sl Cht11,Sl Cht12和Sl Cht16主要在中肠和表皮表达,Sl IDGF2仅在表皮有表达,Sl IDGF3和Sl Cht9在三大组织均有表达.本研究结果对斜纹夜蛾几丁质酶家族基因的鉴定和时空表达作了初步的分析,为研究它们在斜纹夜蛾发育中的功能与调控打下基础. 展开更多
关键词 几丁质酶家族 时空表达 重组蛋白表达 变态发育 斜纹夜蛾
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翘嘴鳜miR-125b的时空表达特征及饥饿对其节律性表达的调控 被引量:1
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作者 朱鑫 秦家鑫 +7 位作者 何雅芝 孟杨杨 丁颖 褚武英 向静 成嘉 陈圆华 张建社 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期34-43,共10页
为探究翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)miR-125b的时空表达特征以及饥饿条件对其节律性表达调控的影响,本研究利用实时定量PCR技术分析了miR-125b在翘嘴鳜不同组织和胚胎不同发育阶段以及饥饿5 d后的昼夜节律表达特征。结果显示,miR-125b在... 为探究翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)miR-125b的时空表达特征以及饥饿条件对其节律性表达调控的影响,本研究利用实时定量PCR技术分析了miR-125b在翘嘴鳜不同组织和胚胎不同发育阶段以及饥饿5 d后的昼夜节律表达特征。结果显示,miR-125b在翘嘴鳜的红肌表达最高,在心肌表达次之,在其他组织表达较低;miR-125b在2细胞至32细胞期表达处于最高水平,进入囊胚期后表达降低,并一直保持低表达直至心博期,然后在出膜期表达开始上调。正常投喂时,miR-125b在白肌中的表达无明显的昼夜节律性;而饥饿5 d后白肌中miR-125b的表达呈现明显的昼夜节律,为昼高夜低的节律性振荡;正常投喂和饥饿状态下,Arntl2的表达与miR-125b趋势相反,且用miR-125b抑制剂处理后Arntl2的表达显著上升。研究结果表明miR-125b呈母源性高表达,推测其调控的靶基因可能抑制胚胎的早期发育并且具有广泛的生物学功能;miR-125b可能通过负调控昼夜节律基因Arntl2的表达,参与在饥饿条件下翘嘴鳜肌肉的适应性生理代谢功能的调节。 展开更多
关键词 翘嘴鳜 miR-125b 时空表达 昼夜节律 饥饿
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致聋基因EYA4在斑马鱼胚胎发育中的时空表达特征分析 被引量:2
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作者 钱方舟 黄啸博 +1 位作者 魏钦俊 陈智斌 《山东大学耳鼻喉眼学报》 CAS 2019年第3期49-55,共7页
目的研究致聋基因EYA4在斑马鱼胚胎发育不同时期的表达及其定位,为进一步利用斑马鱼模型探索其可能的致病机制奠定基础。方法利用生物信息学分析斑马鱼与人EYA4基因的同源性,同时通过整胚原位杂交和半定量PCR分析斑马鱼eya4基因在早期6... 目的研究致聋基因EYA4在斑马鱼胚胎发育不同时期的表达及其定位,为进一步利用斑马鱼模型探索其可能的致病机制奠定基础。方法利用生物信息学分析斑马鱼与人EYA4基因的同源性,同时通过整胚原位杂交和半定量PCR分析斑马鱼eya4基因在早期64细胞胚胎、oblong-sphere、50%-epiboly、15-somite、24hpf、36hpf、48hpf、60hpf、72hpf和1周的时空表达分析。结果生物信息学分析显示斑马鱼eya4与人EYA4基因高度同源。半定量PCR结果显示斑马鱼eya4在胚胎发育早期(64细胞~50%-epiboly)不表达,15-somite期逐渐开始表达并于24~48hpf达到高峰,此后表达水平稍降低并维持在一定水平。全胚原位杂交检测结果显示eya4在斑马鱼64-细胞,oblong-sphere和50%-epiboly时期均未表达,提示该基因为非母源性表达,在15-somite期开始出现可检测的表达,24~48hpf期表达水平达到顶峰,并且在头部神经系统、听囊内耳毛细胞和侧线系统中均有表达,至60hpf^1-week期表达水平减弱并维持稳定在一定水平。结论斑马鱼eya4与人致聋基因EYA4具有高度同源性,通过研究eya4在斑马鱼胚胎早期发育中的时空表达模式,可为后续利用斑马鱼作为动物模型深入研究人类EYA4在胚胎发育中的作用及其突变致聋机制奠定重要的实验基础。 展开更多
关键词 EYA4基因 斑马鱼 胚胎发育 整胚原位杂交 时空表达
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路基沉降时空演变可视化表达与分析
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作者 郑磊 姚龙龙 +1 位作者 宋保全 谭儒蛟 《天津建设科技》 2023年第5期4-6,13,共4页
为快速分析与把握路基整体形变规律,以实测数据为基础,应用SURFER软件绘制了某公路多期路基沉降累计变化量及月沉降速率等值线图,实现了路基沉降时空演变的可视化表达。
关键词 时空演变 可视化表达 等值线图 路基沉降
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