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基于网络药理学联合分子对接技术探讨色苷酸钠预防低氧性急性肺动脉高压的作用机制
1
作者
史玉玲
张长荣
+4 位作者
范勇
李海霞
杨国娟
马爽
刘杰
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2024年第3期156-166,共11页
目的基于网络药理学联合分子对接技术探讨肥大细胞(Mast cells,MCs)脱颗粒抑制剂—色苷酸钠(Sodium Cromolyn,SCG)预防低氧性急性肺动脉高压(Acute Pulmonary Hypertension,APH)的作用机制。方法(1)从Swiss Target Predicition、Target...
目的基于网络药理学联合分子对接技术探讨肥大细胞(Mast cells,MCs)脱颗粒抑制剂—色苷酸钠(Sodium Cromolyn,SCG)预防低氧性急性肺动脉高压(Acute Pulmonary Hypertension,APH)的作用机制。方法(1)从Swiss Target Predicition、TargetNet、UniProt、OMIM、GeneCards、NCBI gene数据库中获取色苷酸(Cromolyn)治疗APH的靶基因,使用Venny 2.1.0在线工具绘制Venn图并获取交集基因。通过String数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。使用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析,使用DAVID数据库做基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,并筛选出相关信号通路,使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。(2)给予SD大鼠SCG预处理(100 mg/kg,ig,Bid,3 d),利用低压舱(模拟海拔7000 m,12 h)构建急性低氧动物模型。将SD大鼠随机分为低氧对照组(HC组,12只)和低氧SCG处理组(HSCG组,12只)。将低压舱海拔由7000 m降至3500 m,应用颈外静脉插管术监测肺动脉压(Pulmonary arterial pressure,PAP),通过蛋白质印迹(Western Blot,WB)实验检测FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白在SD大鼠肺组织中的表达水平。结果(1)基于网络药理学分析方法筛选出FcεRⅠ蛋白和mTOR信号通路及核心蛋白FcεRⅠ、SYK、mTOR。FcεRⅠ、SYK、mTOR分别与Cromolyn对接,均具有良好的结合活性,构象较稳定。(2)SD大鼠mPAP结果:与HC组比较,HSCG组的mPAP下降(P<0.05)。(3)肺组织WB结果:与HC组比较,HSCG组SD大鼠肺组织中的FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白表达均下降(P<0.05),p-mTOR(Ser2448)/mTOR亦下降(P<0.05)。结论经SCG预处理,可减弱急性低氧应激SD大鼠肺组织MCs中的FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白表达、降低p-mTOR(Ser2448)/mTOR,致FcεRⅠ、mTOR信号通路的激活水平降低,进而抑制肺组织中MCs的活化脱颗粒过程,减少收�
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关键词
色苷酸钠
急性肺动脉高压
低氧
肥大细胞
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学联合分子对接技术探讨色苷酸钠预防低氧性急性肺动脉高压的作用机制
1
作者
史玉玲
张长荣
范勇
李海霞
杨国娟
马爽
刘杰
机构
青海大学医学部
青海大学附属医院
出处
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2024年第3期156-166,共11页
基金
青海省科技厅应用基础研究项目(2020-ZJ-772)。
文摘
目的基于网络药理学联合分子对接技术探讨肥大细胞(Mast cells,MCs)脱颗粒抑制剂—色苷酸钠(Sodium Cromolyn,SCG)预防低氧性急性肺动脉高压(Acute Pulmonary Hypertension,APH)的作用机制。方法(1)从Swiss Target Predicition、TargetNet、UniProt、OMIM、GeneCards、NCBI gene数据库中获取色苷酸(Cromolyn)治疗APH的靶基因,使用Venny 2.1.0在线工具绘制Venn图并获取交集基因。通过String数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。使用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析,使用DAVID数据库做基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,并筛选出相关信号通路,使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。(2)给予SD大鼠SCG预处理(100 mg/kg,ig,Bid,3 d),利用低压舱(模拟海拔7000 m,12 h)构建急性低氧动物模型。将SD大鼠随机分为低氧对照组(HC组,12只)和低氧SCG处理组(HSCG组,12只)。将低压舱海拔由7000 m降至3500 m,应用颈外静脉插管术监测肺动脉压(Pulmonary arterial pressure,PAP),通过蛋白质印迹(Western Blot,WB)实验检测FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白在SD大鼠肺组织中的表达水平。结果(1)基于网络药理学分析方法筛选出FcεRⅠ蛋白和mTOR信号通路及核心蛋白FcεRⅠ、SYK、mTOR。FcεRⅠ、SYK、mTOR分别与Cromolyn对接,均具有良好的结合活性,构象较稳定。(2)SD大鼠mPAP结果:与HC组比较,HSCG组的mPAP下降(P<0.05)。(3)肺组织WB结果:与HC组比较,HSCG组SD大鼠肺组织中的FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白表达均下降(P<0.05),p-mTOR(Ser2448)/mTOR亦下降(P<0.05)。结论经SCG预处理,可减弱急性低氧应激SD大鼠肺组织MCs中的FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白表达、降低p-mTOR(Ser2448)/mTOR,致FcεRⅠ、mTOR信号通路的激活水平降低,进而抑制肺组织中MCs的活化脱颗粒过程,减少收�
关键词
色苷酸钠
急性肺动脉高压
低氧
肥大细胞
网络药理学
分子对接
Keywords
sodium
cromolyn
(
scg
)
acute
pulmonary
hypertension(APH)
hypoxia
mast
cells(MCs)
network
pharmacology
moleculardocking
分类号
R364.4 [医药卫生—病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于网络药理学联合分子对接技术探讨色苷酸钠预防低氧性急性肺动脉高压的作用机制
史玉玲
张长荣
范勇
李海霞
杨国娟
马爽
刘杰
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2024
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