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应用鸟枪法LC-MS/MS鉴定烟粉虱唾液蛋白
被引量：
6
1
作者
邵若玄
徐红星
+1 位作者
刘树生
王晓伟
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2018年第2期433-439,共7页
烟粉虱是一种刺吸式口器小型昆虫,每年对我国农业生产造成巨大危害。烟粉虱在取食植物时分泌多种唾液蛋白帮助其取食,同时唾液中的效应因子在调控植物防御反应过程中发挥重要作用。由于烟粉虱个体微小,唾液收集十分困难,有关其唾液蛋白...
烟粉虱是一种刺吸式口器小型昆虫,每年对我国农业生产造成巨大危害。烟粉虱在取食植物时分泌多种唾液蛋白帮助其取食,同时唾液中的效应因子在调控植物防御反应过程中发挥重要作用。由于烟粉虱个体微小,唾液收集十分困难,有关其唾液蛋白的研究难以开展。本研究收集了3万头烟粉虱唾液,利用高精度Q-Exactive质谱,采用shotgun的方法首次鉴定了烟粉虱唾液中蛋白组分。应用双层膜收集装置收集到的烟粉虱唾液经浓缩等处理后其蛋白浓度约为1.698 g/L。唾液蛋白样品经胶内酶解、LC-MS/MS检测、序列分析,最终鉴定出42个烟粉虱唾液蛋白。功能分析表明烟粉虱唾液蛋白组分与蚜虫唾液蛋白组分具有一定的相似性,但多数蛋白为功能未知蛋白。通过质谱鉴定烟粉虱唾液蛋白组分为深入研究烟粉虱唾液蛋白的功能奠定了基础,有利于明确烟粉虱危害寄主植物的分子机制,为开发害虫防治新方法提供新思路。
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关键词
烟粉虱
唾液
Q-Exactive
shotgun
lc
-
ms
/
ms
蛋白鉴定
下载PDF
职称材料
利用质谱技术结合EST库搜索鉴定厚壳贻贝新型足丝蛋白(英文)
被引量：
1
2
作者
孙敬敬
李楠楠
+1 位作者
王信超
廖智
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期75-84,共10页
贻贝利用足丝粘附于水下各种基质表面.作为一种具有优异粘附性能的生物材料,贻贝足丝蛋白在新型水下粘附剂及表面保护涂层的研制与开发中具有重要的仿生学意义.目前,已报道的贻贝足丝蛋白分子达11种,但是仍然有更多的足丝蛋白分子不为人...
贻贝利用足丝粘附于水下各种基质表面.作为一种具有优异粘附性能的生物材料,贻贝足丝蛋白在新型水下粘附剂及表面保护涂层的研制与开发中具有重要的仿生学意义.目前,已报道的贻贝足丝蛋白分子达11种,但是仍然有更多的足丝蛋白分子不为人知.为进一步探讨贻贝足丝蛋白的分子多样性,并从中筛选具有特殊生物学功能的足丝蛋白分子,本文采用鸟枪法-液相色谱-质谱/质谱技术(shotgun-LC-MS/MS)对厚壳贻贝足丝蛋白进行了蛋白质组学分析.将厚壳贻贝足丝分为足丝纤维和足丝盘两部分,每一部分均采用醋酸-尿素溶液,以及醋酸-盐酸胍溶液进行蛋白质抽提;抽提后的足丝蛋白经胰蛋白酶酶解,利用线性离子阱四级杆质谱(LTQ)进行鸟枪法质谱分析.二级质谱图(MS/MS)用以搜索公共数据库中的贻贝表达序列标签(expressed sequence tag,EST)数据库.采用上述方法,获得14种贻贝新型足丝蛋白的高可信度结果及其所匹配的部分或全长cDNA序列;经结构域分析,发现上述新型贻贝足丝蛋白分子的序列中多数包含各种类型的结构域,包括胶原蛋白结构域、C1Q结构域、C1Q结合结构域、微管蛋白辅助折叠结构域、蛋白酶拮抗结构域、VWA结构域、几丁质酶结构域等.在此基础上,对上述新型足丝蛋白在贻贝足丝形成以及粘附方面的功能进行了推测.上述结果对进一步了解贻贝足丝的分子组成以及粘附机理奠定了基础.
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关键词
厚壳贻贝
足丝蛋白
鸟枪法-液相色谱-质谱
质谱
表达序列标签
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职称材料
题名
应用鸟枪法LC-MS/MS鉴定烟粉虱唾液蛋白
被引量：
6
1
作者
邵若玄
徐红星
刘树生
王晓伟
机构
浙江大学昆虫科学研究所
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2018年第2期433-439,共7页
基金
浙江省自然科学基金项目(LR15C140001)
文摘
烟粉虱是一种刺吸式口器小型昆虫,每年对我国农业生产造成巨大危害。烟粉虱在取食植物时分泌多种唾液蛋白帮助其取食,同时唾液中的效应因子在调控植物防御反应过程中发挥重要作用。由于烟粉虱个体微小,唾液收集十分困难,有关其唾液蛋白的研究难以开展。本研究收集了3万头烟粉虱唾液,利用高精度Q-Exactive质谱,采用shotgun的方法首次鉴定了烟粉虱唾液中蛋白组分。应用双层膜收集装置收集到的烟粉虱唾液经浓缩等处理后其蛋白浓度约为1.698 g/L。唾液蛋白样品经胶内酶解、LC-MS/MS检测、序列分析,最终鉴定出42个烟粉虱唾液蛋白。功能分析表明烟粉虱唾液蛋白组分与蚜虫唾液蛋白组分具有一定的相似性,但多数蛋白为功能未知蛋白。通过质谱鉴定烟粉虱唾液蛋白组分为深入研究烟粉虱唾液蛋白的功能奠定了基础,有利于明确烟粉虱危害寄主植物的分子机制,为开发害虫防治新方法提供新思路。
关键词
烟粉虱
唾液
Q-Exactive
shotgun
lc
-
ms
/
ms
蛋白鉴定
Keywords
Whitefly
saliva
Q-Exactive
shotgun
lc
-
ms
/
ms
protein
identification
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
S433.39 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
利用质谱技术结合EST库搜索鉴定厚壳贻贝新型足丝蛋白(英文)
被引量：
1
2
作者
孙敬敬
李楠楠
王信超
廖智
机构
浙江海洋学院海洋科学学院海洋生物资源及分子工程实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期75-84,共10页
基金
Supported by Key Discipline Project of Zhejiang Province(Biochemistry and Molecular Biology)~~
文摘
贻贝利用足丝粘附于水下各种基质表面.作为一种具有优异粘附性能的生物材料,贻贝足丝蛋白在新型水下粘附剂及表面保护涂层的研制与开发中具有重要的仿生学意义.目前,已报道的贻贝足丝蛋白分子达11种,但是仍然有更多的足丝蛋白分子不为人知.为进一步探讨贻贝足丝蛋白的分子多样性,并从中筛选具有特殊生物学功能的足丝蛋白分子,本文采用鸟枪法-液相色谱-质谱/质谱技术(shotgun-LC-MS/MS)对厚壳贻贝足丝蛋白进行了蛋白质组学分析.将厚壳贻贝足丝分为足丝纤维和足丝盘两部分,每一部分均采用醋酸-尿素溶液,以及醋酸-盐酸胍溶液进行蛋白质抽提;抽提后的足丝蛋白经胰蛋白酶酶解,利用线性离子阱四级杆质谱(LTQ)进行鸟枪法质谱分析.二级质谱图(MS/MS)用以搜索公共数据库中的贻贝表达序列标签(expressed sequence tag,EST)数据库.采用上述方法,获得14种贻贝新型足丝蛋白的高可信度结果及其所匹配的部分或全长cDNA序列;经结构域分析,发现上述新型贻贝足丝蛋白分子的序列中多数包含各种类型的结构域,包括胶原蛋白结构域、C1Q结构域、C1Q结合结构域、微管蛋白辅助折叠结构域、蛋白酶拮抗结构域、VWA结构域、几丁质酶结构域等.在此基础上,对上述新型足丝蛋白在贻贝足丝形成以及粘附方面的功能进行了推测.上述结果对进一步了解贻贝足丝的分子组成以及粘附机理奠定了基础.
关键词
厚壳贻贝
足丝蛋白
鸟枪法-液相色谱-质谱
质谱
表达序列标签
Keywords
Mytilus
coruscus
byssal
proteins
shotgun
-
lc
-
ms
/
ms
expressed
sequence
tag
（EST）
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用鸟枪法LC-MS/MS鉴定烟粉虱唾液蛋白
邵若玄
徐红星
刘树生
王晓伟
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2018
6
下载PDF
职称材料
2
利用质谱技术结合EST库搜索鉴定厚壳贻贝新型足丝蛋白(英文)
孙敬敬
李楠楠
王信超
廖智
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
下载PDF
职称材料
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