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基于生物信息学分析阿尔茨海默病相关多脑区免疫机制及治疗中药预测
1
作者 宋晓娜 高耀 +4 位作者 王晓堂 陈文璐 闫晓如 范炤 宋国华 《药物评价研究》 CAS 北大核心 2024年第7期1520-1528,共9页
目的利用生物信息学技术筛选阿尔茨海默病(AD)不同脑区差异表达基因,探讨各脑区的免疫机制,以预测潜在的治疗中药。方法从GEO数据库获得AD的样本数据,进行差异表达基因(DEGs)分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA),对各脑区最相关的模块... 目的利用生物信息学技术筛选阿尔茨海默病(AD)不同脑区差异表达基因,探讨各脑区的免疫机制,以预测潜在的治疗中药。方法从GEO数据库获得AD的样本数据,进行差异表达基因(DEGs)分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA),对各脑区最相关的模块进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析获得核心基因,并使用受试者工作特征曲线(ROC)曲线评估其诊断价值。对差异基因进行免疫通路富集分析,并使用CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润模式,通过Coremine Medical筛选治疗AD的潜在中药。结果大脑的内嗅皮层(EC)区有3280个差异基因、海马体(HIP)区有1591个差异基因、内侧颞回(MTG)区有3995个差异基因、后扣带(PC)区有2056个差异基因、额上回(SFG)区有907个差异基因、初级视觉皮层(VCX)区有1480个差异基。其中EC与VCX区与blue模块相关性高、HIP与PC区与turquoise模块相关性高、MTG、SFG别与绿色和黄色模块相关性高。PPI网络显示EC区有4个Hub基因,HIP区有13个Hub基因,MTG区有4个Hub基因,PC区有9个Hub基因,SFG区有17个Hub基因,VCX区有13个Hub基因。不同脑区富集有不同免疫通路的模块。通过基因映射到姜黄为治疗AD的潜在中药,其映射到EP300、PPARG、CCND1、GSK3B、BCL2、EGFR、KDR、MYC和IL1B等基因上。结论AD患者在不同脑区表现出多样化的免疫途径,这种差异与AD发病机制紧密相连。姜黄有望作为治疗AD的潜在中药。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 生物信息学 中药筛选 免疫细胞浸润 姜黄
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抗糖尿病中药开发前景展望 被引量：39
2
作者 陈广耀 《中国新药杂志》 CAS CSCD 2000年第7期448-451,共4页
对中药抗糖尿病的现状及研究进展进行了综述 ,并从筛选具有多种降糖机制。
关键词 糖尿病 中药筛选 中成药 开发
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基于分子对接虚拟筛选PBP2a蛋白蒲公英活性成分抗菌剂 被引量：2
3
作者 刘旭 吕小刚 +1 位作者 梁引库 穆阿宁 《陕西理工大学学报（自然科学版）》 2021年第5期71-79,共9页
青霉素结合蛋白PBP2a是使耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)产生耐药的原因之一,基于该靶点的中药成分虚拟筛选有助于发现中药在治疗细菌耐药的有效物质,因此基于分子对接技术从蒲公英中筛选出可能抗MRSA的天然药物,并初步探讨所筛选活性... 青霉素结合蛋白PBP2a是使耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)产生耐药的原因之一,基于该靶点的中药成分虚拟筛选有助于发现中药在治疗细菌耐药的有效物质,因此基于分子对接技术从蒲公英中筛选出可能抗MRSA的天然药物,并初步探讨所筛选活性化合物与PBP2a蛋白相互作用机制。选择PBP2a蛋白3D结构(PDB ID:5M19),用Autodock vina进行分子对接,以原配体苯唑西林打分值为参考进行筛选,在PBP2a蛋白活性位点处,打分值高于原配体的候选化合物共计57个。其中,蒲公英甾醇、异绿原酸A、款冬二醇、羽扇豆醇、齐墩果酸对PBP2a蛋白有较好的结合作用。这5种物质都与ARG151、ARG241氨基酸残基形成氢键作用,且异绿原酸A和齐墩果酸报道有增敏和抑菌作用。实验结果可以为发现新型抗菌药提供理论基础。 展开更多
关键词 分子对接 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 中药筛选 青霉素结合蛋白
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肿瘤坏死因子-α中药小分子抑制剂的计算机虚拟筛选 被引量：15
4
作者 朱伟 姚丽梅 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2010年第13期199-202,共4页
目的:运用计算机虚拟筛选技术快速搜索肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)的中药小分子抑制剂。方法:采用Accelrys公司Discovery Studio分子模拟软件包(版本2.5),对蛋白质晶体结构数据库PDB中TNF-α与小分子抑制剂(化合... 目的:运用计算机虚拟筛选技术快速搜索肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)的中药小分子抑制剂。方法:采用Accelrys公司Discovery Studio分子模拟软件包(版本2.5),对蛋白质晶体结构数据库PDB中TNF-α与小分子抑制剂(化合物307)形成的复合物(PDB代码:2AZ5)三维结构活性部位进行分析,通过ligandfit模块进行分子对接。运用药代动力学参数预测和毒性预测等模块对分子对接结果进行2次筛选。结果:以原配体(化合物307)的Dockscore值为阈值,筛选出中国天然产物数据库中12个类药性良好的化学成分与TNF-α存在较强的相互作用。结论:该研究结果可促进治疗类风湿性关节炎、炎性肠病等病的新型药物研制。 展开更多
关键词 计算机虚拟筛选 中药 肿瘤坏死因子-Α
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小鼠脾淋巴细胞模型在中药复方免疫活性物质筛选中的应用研究 被引量：3
5
作者 田维毅 杨娟 +2 位作者 蔡琨 俞琦 韩洁 《四川中医》 2009年第2期17-20,共4页
目的:观察四物汤等6个方剂不同提取物对小鼠离体脾淋巴细胞转化增殖能力的影响,探讨小鼠脾淋巴细胞模型在中药复方免疫活性成分筛选中的应用。方法:制备四物汤、四君子汤、六味地黄汤、玉屏风散、桂枝汤、龙胆泻肝汤等6个方剂的水提物... 目的:观察四物汤等6个方剂不同提取物对小鼠离体脾淋巴细胞转化增殖能力的影响,探讨小鼠脾淋巴细胞模型在中药复方免疫活性成分筛选中的应用。方法:制备四物汤、四君子汤、六味地黄汤、玉屏风散、桂枝汤、龙胆泻肝汤等6个方剂的水提物、水提醇沉物、醇提物,选择其没有明显细胞毒性的浓度范围,在96孔板中分别与小鼠正常的和经PMW诱导的小鼠脾淋巴细胞共同孵育,以MTT法检测细胞转化增殖情况。结果:四物汤上述三种提取物、四君子汤与六味地黄汤水提物和水提醇沉物、龙胆泻肝汤水提物能明显增强经PMW诱导的小鼠脾淋巴细胞转化增殖能力(P<0.05或P<0.01);桂枝汤醇提物能明显抑制经PMW诱导的小鼠脾淋巴细胞转化增殖能力(P<0.01);仅有四物汤水提物能明显增强小鼠正常脾淋巴细胞转化增殖能力(P<0.01),其活性明显较PMW诱导组低(P<0.01)。上述方剂刺激淋巴细胞转化增殖的效应具有提取物和浓度的差异性。结论:在中药复方免疫活性物质的筛选中,丝裂原刺激下的小鼠脾淋巴细胞模型作用稳定,应用时注意选择没有明显细胞毒性的药物浓度。 展开更多
关键词 淋巴细胞 筛选模型 中药复方 免疫活性物质
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以人CCR5启动子为靶的药物筛选方法的初步建立 被引量：5
6
作者 卫艳萍 冯龙 +3 位作者 马云云 董子明 韩志强 赵国强 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第5期1043-1046,1063,共5页
构建靶向人趋化因子受体5(CCchemokine receptors5,CCR5)启动子的药物筛选系统。将CCR5启动子序列克隆入改建后的报告载体pGL3-neo,转染pGL3-neo-CCR5入Jurkat细胞(急性T淋巴细胞性白血病细胞),G418筛选后分组;用7种中药分别作用于各组... 构建靶向人趋化因子受体5(CCchemokine receptors5,CCR5)启动子的药物筛选系统。将CCR5启动子序列克隆入改建后的报告载体pGL3-neo,转染pGL3-neo-CCR5入Jurkat细胞(急性T淋巴细胞性白血病细胞),G418筛选后分组;用7种中药分别作用于各组细胞16h后,检测细胞中CCR5启动子的表达水平。结果显示,双黄连组比对照组的荧光值明显降低(P<0.05);川琥宁组、黄芩组、黄芪组比对照组的荧光值明显升高(P<0.01)。双黄连可使体外培养细胞转染的CCR5启动子活性降低,川琥宁、黄芩、黄芪可使体外培养细胞转染的CCR5启动子活性增高。表明初步构建成功靶向人CCR5启动子的药物筛选系统。 展开更多
关键词 报告载体pGL3 CCR5启动子 体外筛选 中药
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具有神经细胞保护作用的中药组分快速筛选方法研究 被引量：4
7
作者 呙敏 张玉峰 +1 位作者 王毅 赵筱萍 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1581-1584,共4页
采用二乙酸荧光素(fluorescein diacetate,FDA)标记经L-谷氨酸损伤的SH-SY5Y细胞,并使用细胞荧光显微成像平台检测细胞活力,建立了一种神经细胞保护药物快速筛选方法。将其应用于筛选葛根芩连汤抗神经细胞损伤活性组分,发现C15,D06,D07,... 采用二乙酸荧光素(fluorescein diacetate,FDA)标记经L-谷氨酸损伤的SH-SY5Y细胞,并使用细胞荧光显微成像平台检测细胞活力,建立了一种神经细胞保护药物快速筛选方法。将其应用于筛选葛根芩连汤抗神经细胞损伤活性组分,发现C15,D06,D07,E05这4个组分对L-谷氨酸损伤神经细胞具有较好的保护作用。LC-Q/TOF-MS分析鉴定结果表明,葛根芩连汤活性组分的主要成分是大豆苷、3'-甲氧基大豆苷、芹糖甘草苷、白杨素-6-C-L-阿拉伯糖-8-C-D-葡萄糖苷、芹糖异甘草苷、黄芩苷、千层纸素A-7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷及汉黄芩苷,提示这些化合物可能具有神经细胞保护作用。 展开更多
关键词 神经细胞保护药物筛选 SH-SY5Y细胞荧光图像 中药有效组分快速发现 葛根芩连汤
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