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添加不同酵母培养物对瘤胃纤维分解菌群和纤维素酶活的影响 被引量:41
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作者 黄庆生 王加启 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期144-148,共5页
用3种酵母培养物(YC- 1、YC 2和YC- 3)分别饲喂4头带有永久性瘤胃瘘管的肉牛,研究培养物对瘤胃发酵、纤维分解酶活性和3种纤维分解菌数量的影响,结果表明:YC 2处理的乙酸、丙酸、丁酸和总 VFA浓度显著高于对照组(P<0 .05),YC 1和YC ... 用3种酵母培养物(YC- 1、YC 2和YC- 3)分别饲喂4头带有永久性瘤胃瘘管的肉牛,研究培养物对瘤胃发酵、纤维分解酶活性和3种纤维分解菌数量的影响,结果表明:YC 2处理的乙酸、丙酸、丁酸和总 VFA浓度显著高于对照组(P<0 .05),YC 1和YC 3处理的乙酸/丙酸比例显著降低(P<0 .01);各处理均能显著提高瘤胃内羧甲基纤维素酶、水杨苷酶和木聚糖酶的活性(P<0 .01);各处理都显著提高黄化瘤胃球菌的相对比例(P<0 .01),16SrRNA特异性寡聚核苷酸探针杂交法分析测定结果表明 3 种纤维分解菌在瘤胃细菌中所占比例为 3. 80%±0 .2%。 展开更多
关键词 瘤胃发酵 酵母培养物 饲喂 羧甲基纤维素酶 黄化 比例 添加 处理 菌群 胃瘘
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应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究 被引量:22
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作者 石鹏君 柏映国 +6 位作者 袁铁铮 姚斌 范云六 周志刚 孟昆 伍宁丰 刁其玉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期285-289,共5页
采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有... 采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%~96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。 展开更多
关键词 DGGE 16S RDNA基因 编码RNA聚合酶β亚基(rpoB)基因 瘤胃细菌 遗传多样性
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复合菌剂发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响 被引量:23
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作者 郭威 郭晓军 +2 位作者 周贤 李术娜 朱宝成 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期736-745,共10页
旨在通过16SrDNA高通量测序技术研究发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响。本研究选用装有瘤胃瘘管的南非肉用美利奴♂×东北细毛羊♀的F1代成年公羊12只,随机平均分为两组,分别饲喂青贮玉米秸秆和发酵玉米秸秆。分别在饲喂前... 旨在通过16SrDNA高通量测序技术研究发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响。本研究选用装有瘤胃瘘管的南非肉用美利奴♂×东北细毛羊♀的F1代成年公羊12只,随机平均分为两组,分别饲喂青贮玉米秸秆和发酵玉米秸秆。分别在饲喂前1天、饲喂第7、21天晨饲后6h取瘤胃液。同一时间所采取的同一处理的样品混合均匀,分别命名为青贮组(CS:YD0、YD7、YD21)和发酵组(FCS:YS0、YS7、YS21),之后通过高通量测序进行分析。结果显示:1)绵羊瘤胃内细菌群落包括29个门,74个纲,135个目,215个科和428个属。2)青贮组以拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌群,其次为黏胶球形菌门(Lentisphaerae)、厚壁菌门(Firmicutes)和纤维杆菌门(Fibrobacteres),发酵组优势菌亦为拟杆菌门,其次为厚壁菌门、黏胶球形菌门和纤维杆菌门。通过21d的饲喂试验可知,青贮组拟杆菌门和厚壁菌门所占比例较发酵组降低,两组黏胶球形菌门和纤维杆菌门菌群数量都有所增加,但青贮组增加幅度更大。3)拟杆菌门的普雷沃氏菌属(Prevotella)在发酵组饲喂7d后成为最优势菌属(丰度达15.56%),而在青贮组明显降低(丰度从10.48%降至3.17%);纤维杆菌属(Fibrobacter)相对丰度在饲喂21d后青贮组增加量大于发酵组。4)在97%相似性水平下,饲喂21d后发酵组的Shannon和Simpson指数更高,表明它拥有更高的瘤胃细菌多样性。复合菌剂发酵玉米秸秆提高了绵羊瘤胃细菌多样性。饲喂发酵玉米秸秆的绵羊瘤胃内拟杆菌门和厚壁菌门菌群的比例降低,而黏胶球形菌门和纤维杆菌门菌群的数量增加。 展开更多
关键词 发酵玉米秸秆 绵羊 瘤胃细菌 多样性
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不同生理阶段荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性研究 被引量:20
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作者 李子健 李大彪 +2 位作者 高民 王典 兰儒冰 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期3017-3025,共9页
本试验旨在探究不同生理阶段荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性。选取处于围产前期、泌乳前期、泌乳中期和泌乳后期的经产荷斯坦奶牛各4头,共16头,采集瘤胃液用于测定瘤胃发酵参数和提取微生物DNA,采用Illumina Miseq PE300平台测定瘤胃细菌组... 本试验旨在探究不同生理阶段荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性。选取处于围产前期、泌乳前期、泌乳中期和泌乳后期的经产荷斯坦奶牛各4头,共16头,采集瘤胃液用于测定瘤胃发酵参数和提取微生物DNA,采用Illumina Miseq PE300平台测定瘤胃细菌组成。结果表明:1)围产前期奶牛瘤胃微生物蛋白、乙酸、丁酸、总挥发性脂肪酸浓度与乙酸/丙酸显著高于泌乳期(P<0.05)。围产前期奶牛瘤胃丙酸浓度显著低于泌乳期(P<0.05)。2)在门的水平上,围产前期奶牛瘤胃内的优势菌门为拟杆菌门和厚壁菌门,泌乳期奶牛瘤胃内的优势菌门则为拟杆菌门、变形菌门和厚壁菌门。围产前期奶牛瘤胃内的拟杆菌门、SR1细菌、蓝菌门、柔膜菌门、TM7细菌和纤维杆菌门的相对丰度显著高于泌乳期(P<0.05),而泌乳期各阶段之间差异不显著(P>0.05);围产前期奶牛瘤胃内的变形菌门的相对丰度显著低于泌乳期(P<0.05)。3)在科的水平上,围产前期奶牛瘤胃内的优势菌科为普雷沃氏菌科,而泌乳期奶牛瘤胃内的优势菌科为琥珀酸弧菌科和普雷沃氏菌科。围产前期奶牛瘤胃内的普雷沃氏菌科、瘤胃菌科、理研菌科、BS11细菌、RF16细菌、SR1细菌、Gastranaerophilales、克里斯滕森菌科、TM7细菌、RF9细菌和纤维杆菌科的相对丰度显著高于泌乳期(P<0.05);围产前期奶牛瘤胃内的琥珀酸弧菌科、毛螺菌科和韦荣球菌科则显著低于泌乳期(P<0.05)。综上得出,奶牛从围产前期进入到泌乳期,瘤胃细菌多样性显著降低;泌乳期各阶段瘤胃细菌组成差异较小。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 生理阶段 瘤胃细菌 多样性
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瘤胃中乳酸的代谢及其调控机制 被引量:16
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作者 陈连民 王洪荣 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期972-980,共9页
有关瘤胃酸中毒发生机制研究表明,瘤胃乳酸的累积可能对酸中毒诱导起重要作用,而高精料日粮下瘤胃乳酸累积主要取决于瘤胃乳酸产生菌和乳酸利用菌间的平衡程度。本文综述了瘤胃微生物对乳酸的代谢机制,包括主要乳酸产生菌[溶纤维丁酸弧... 有关瘤胃酸中毒发生机制研究表明,瘤胃乳酸的累积可能对酸中毒诱导起重要作用,而高精料日粮下瘤胃乳酸累积主要取决于瘤胃乳酸产生菌和乳酸利用菌间的平衡程度。本文综述了瘤胃微生物对乳酸的代谢机制,包括主要乳酸产生菌[溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)、牛链球菌(Streptococcus bovis)、乳酸杆菌(Lactobacillus)]和主要乳酸利用菌[反刍兽新月单胞菌(Selenomonus ruminantium)、埃氏巨型球菌(Megasphaera elsdenii)],并简要概述了酸中毒的调控方法,旨在为反刍动物瘤胃酸中毒的乳酸中毒机制深入解析提供参考。 展开更多
关键词 反刍动物 瘤胃酸中毒 瘤胃微生物 乳酸
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牦牛瘤胃细菌中核糖核酸含量及其与细菌总氮比值的研究 被引量:9
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作者 韩兴泰 胡令浩 +2 位作者 谢敖云 石成银 王青莉 《动物营养学报》 CAS CSCD 1998年第2期35-39,共5页
7头带有瘤胃瘘管的生长阉牦牛,在两个试验中分别给予不同的日粮以研究其瘤胃细菌中核糖核酸(RNA,下同)含量及RNA与细菌总氮(BN,下同)的比值(RNA/BN)和核糖核酸氮(RNA—N,下同)与BN的比值(RNA—N... 7头带有瘤胃瘘管的生长阉牦牛,在两个试验中分别给予不同的日粮以研究其瘤胃细菌中核糖核酸(RNA,下同)含量及RNA与细菌总氮(BN,下同)的比值(RNA/BN)和核糖核酸氮(RNA—N,下同)与BN的比值(RNA—N/BN)。试验Ⅰ的4头牛分两期分别喂给粗蛋白(CP)8%和12%的等能(96MJME/kgDM)日粮;试验Ⅱ的3头牛通过3×3拉丁方设计喂给蛋白饲料为菜籽饼、豌豆和蚕豆,精粗比为7:3,5:5和3:7的等能(96MJME/kgDM)、等氮(CP为12%)日粮。结果表明,日粮精粗比与蛋白来源对细菌中RNA含量及RNA/BN和RNA-N/BN均无明显影响,而蛋白水平对其有显著影响。当日粮CP为8%时,瘤胃细菌中RNA与CP含量及RNA/BN与RNA-N/BN分别为169%、288%、37,033;当日粮CP为12%时,则上述4项指标依次为985%、371%、169、015。 展开更多
关键词 牦牛 瘤胃细菌 核糖核酸 细菌氮 核糖核酸氮
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藏系绵羊瘤胃细菌数量及其放牧地牧草养分随季节变化的研究 被引量:16
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作者 淡瑞芳 张海涛 +2 位作者 龙瑞军 丁学智 张欣5 《草业学报》 CSCD 北大核心 2009年第1期100-104,共5页
试验分别于春、夏、秋和冬季,随机选择3只同群常年放牧健康的藏系绵羯羊(2岁),屠宰后采集瘤胃内容物。采用瘤胃细菌通用引物和实时定量PCR技术,研究瘤胃细菌数量随季节的动态变化。结果表明,1)夏季瘤胃细菌数量显著(P<0.05)高于其他... 试验分别于春、夏、秋和冬季,随机选择3只同群常年放牧健康的藏系绵羯羊(2岁),屠宰后采集瘤胃内容物。采用瘤胃细菌通用引物和实时定量PCR技术,研究瘤胃细菌数量随季节的动态变化。结果表明,1)夏季瘤胃细菌数量显著(P<0.05)高于其他3个季节,分别是春季、秋季、冬季细菌数量的5.56,2.35和2.49倍;秋、冬季是春季细菌数量的2.38和2.23倍;而秋和冬季瘤胃细菌的数量差异不显著(P>0.05)。2)夏季藏系绵羊采食量分别为春季、冬季和秋季的1.98,1.61和1.80倍,饲料中的纤维性物质含量增高,采食量也随着降低,瘤胃细菌的数量也相应降低;3)实时定量PCR技术能准确的反映出放牧藏系绵羊瘤胃细菌数量随季节的动态变化。 展开更多
关键词 实时定量PCR 藏系绵羊 季节 瘤胃细菌数量
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藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态分析 被引量:13
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作者 淡瑞芳 龙瑞军 +2 位作者 张海涛 张欣 丁学智 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期798-802,共5页
本文旨在研究不同季节牧草营养成分变化及藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态变化。试验在不同季节分别随机选取3只藏系绵羊,采用PCR-DGGE技术对12只藏系绵羊瘤胃内容物中的细菌区系进行分子生态学的分析,对细菌16S rDNA的V6~V8可变区的... 本文旨在研究不同季节牧草营养成分变化及藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态变化。试验在不同季节分别随机选取3只藏系绵羊,采用PCR-DGGE技术对12只藏系绵羊瘤胃内容物中的细菌区系进行分子生态学的分析,对细菌16S rDNA的V6~V8可变区的扩增产物进行DGGE图谱分析、相似性分析和Shannon多样指数分析。结果表明:(1)秋季瘤胃细菌种群丰富度极显著(P<0.01)高于冬、春季节,显著(P<0.05)高于夏季,而其他3个季节之间差异不显著(P>0.05);(2)瘤胃细菌区系组成结构在春季和夏季相似性高于90%,在秋、冬季相似性低于70%,而春、夏季与秋、冬季之间的相似性低于60%;(3)夏季牧草中DE和CP含量极显著(P<0.01)高于其他季节,其瘤胃液pH极显著(P<0.01)低于其他季节,瘤胃细菌区系丰富度也相应降低;秋季牧草的DE和CP含量显著(P<0.05)高于春、冬季节,其瘤胃液pH范围为7.1~7.3,瘤胃细菌区系丰富度高于其他3个季节。由以上结果可以看出,不同季节瘤胃内优势菌群发生了改变,瘤胃细菌区系的季节变化与瘤胃pH、瘤胃内容物的物理特性、营养成分及其比例等有关。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 藏系绵羊 瘤胃细菌 季节动态分析
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酶菌混合处理稻草和苜蓿干草对滩羊生长性能、血清生化指标、瘤胃细菌多样性及KEGG通路的影响 被引量:15
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作者 姜碧薇 周玉香 +1 位作者 王甜 李斐 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1482-1492,共11页
本试验旨在研究酶菌混合处理稻草和苜蓿干草对滩羊生长性能、血清生化指标、瘤胃细菌多样性及KEGG通路的影响。选择体重相近、健康状况良好的3月龄宁夏滩羊20只,随机分为2组,每组10只。设定试验饲粮的精粗比为30∶70,其中粗饲料由稻草... 本试验旨在研究酶菌混合处理稻草和苜蓿干草对滩羊生长性能、血清生化指标、瘤胃细菌多样性及KEGG通路的影响。选择体重相近、健康状况良好的3月龄宁夏滩羊20只,随机分为2组,每组10只。设定试验饲粮的精粗比为30∶70,其中粗饲料由稻草与苜蓿干草(二者的比例为60∶40)组成,对照组饲粮中稻草和苜蓿干草未经处理,试验组饲粮中稻草和苜蓿干草经纤维素酶(活性≥10000 U/g,添加量为0.1%)与复合益生菌(主要成分为酵母菌、枯草芽孢杆菌和乳酸菌,添加量为2 kg/t)混合处理。预试期15 d,正试期60 d。分别于正试期第1天、第30天和第60天空腹静脉采血用于血清生化指标测定。饲养试验结束当天,空腹口腔采集瘤胃液并提取DNA用于瘤胃细菌多样性和宏基因组分析。结果显示:1)试验组滩羊的总增重、平均日增重极显著高于对照组(P<0.01),料重比极显著低于对照组(P<0.01)。2)试验组滩羊血清总蛋白和球蛋白含量显著高于对照组(P<0.05),血清尿素含量极显著低于对照组(P<0.01)。3)试验组的操作分类单元(OTU)数量和Shannon指数极显著高于对照组(P<0.01);试验组与对照组的差异菌门有8个,它们是变形菌门、Patescibacteria、拟杆菌门、Kiritimatiellaeota、浮霉菌门、蓝藻门、螺旋体门和互养菌门。4)在KEGG通路中,试验组的嘧啶代谢、氨基糖与核苷酸糖代谢、二羧酸代谢这3条通路的基因数量极显著高于对照组(P<0.01)。综上所述,酶菌混合处理稻草和苜蓿干草可以提高滩羊的增重和养殖的经济效益,同时,该处理方式提高了滩羊血清总蛋白和球蛋白含量,降低了血清尿素含量,改变了滩羊瘤胃细菌多样性和部分功能基因的数量。在本试验条件下,用酶菌混合处理的稻草和苜蓿干草饲喂滩羊的效果较优,有益于滩羊的健康养殖,可在生产中推广使用。 展开更多
关键词 纤维素酶 复合益生菌 稻草 滩羊 生长性能 瘤胃细菌 KEGG通路
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沙棘黄酮对泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃发酵参数、细菌菌群结构及代谢产物的影响 被引量:11
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作者 赵慧颖 余诗强 +3 位作者 贺李莹 熊本海 王慧 蒋林树 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期5809-5823,共15页
本试验旨在研究沙棘黄酮对泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃发酵参数、细菌菌群结构及代谢产物的影响。试验选取胎次、体重、日产奶量和泌乳期相近的中国荷斯坦奶牛30头,随机分为3组,每组10头,在全混合日粮(TMR)基础上分别添加0、60、100 g/(d... 本试验旨在研究沙棘黄酮对泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃发酵参数、细菌菌群结构及代谢产物的影响。试验选取胎次、体重、日产奶量和泌乳期相近的中国荷斯坦奶牛30头,随机分为3组,每组10头,在全混合日粮(TMR)基础上分别添加0、60、100 g/(d·头)的沙棘黄酮,分别标记为BC组、BL组和BM组。试验共计75 d,其中预试期15 d,正试期60 d。结果表明:1)与BC组相比,BL组瘤胃液中乙酸浓度及乙酸/丙酸显著提高(P<0.05),BL组和BM组戊酸浓度显著降低(P<0.05)。2)在门水平上,与BC组相比,添加沙棘黄酮对瘤胃细菌相对丰度均无显著影响(P>0.05)。在属水平上,与BC组相比,BL组拟杆菌目RF16菌群(Bacteroidales_RF16_group)、理研菌科_RC9_肠道菌群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、瘤胃梭菌属(Ruminiclostridium)的相对丰度显著提高(P<0.05)。3)与BC相比,BL组中19种代谢物[苯丙酮酸、邻氨基苯甲酸、岩白菜素、烟胺比林、天竺葵色素、芦丁等]的含量显著上调(P<0.05),6种代谢物[(2S)-2-氨基-5-戊酮酸、3-脱氢奎尼酸、来苏糖、磷酸高丝氨酸、5,6-二羟基-1,3-二烯-1-羧酸以及N-acetylpuromycin]的含量显著下调(P<0.05);通过KEGG分析可知,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成途径、氨基酸的生物合成途径为差异代谢物显著富集途径。综上所述,奶牛饲粮中添加沙棘黄酮提高了泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃中乙酸浓度,降低了戊酸浓度,提高了纤维降解菌的相对丰度,并使瘤胃中与氨基酸的生物合成通路相关的代谢物含量上调。 展开更多
关键词 沙棘黄酮 荷斯坦奶牛 瘤胃细菌 瘤胃代谢物
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荞麦秸秆饲粮条件下甘露寡糖对滩羊瘤胃菌群结构的影响 被引量:13
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作者 马秀花 桂瑞麒 +3 位作者 焦娜 杨万宗 李庆敏 周玉香 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期2365-2377,共13页
本试验旨在利用16S rDNA高通量测序技术探究荞麦秸秆饲粮条件下添加不同水平甘露寡糖(MOS)对滩羊瘤胃菌群结构的影响。选取健康、体重在30.5 kg左右的宁夏断奶滩羊羯羊20只,随机分为4组,每组5只。其中,CK⁃3组为对照组,饲喂基础饲粮;Y1⁃... 本试验旨在利用16S rDNA高通量测序技术探究荞麦秸秆饲粮条件下添加不同水平甘露寡糖(MOS)对滩羊瘤胃菌群结构的影响。选取健康、体重在30.5 kg左右的宁夏断奶滩羊羯羊20只,随机分为4组,每组5只。其中,CK⁃3组为对照组,饲喂基础饲粮;Y1⁃3组、Y2⁃3组、Y3⁃3组为试验组,分别饲喂在基础饲粮基础上添加1%、2%、3%MOS的试验饲粮。试验期为75 d,其中预试期15 d,正试期60 d。结果显示:1)除Y1⁃3组、Y2⁃3组瘤胃液乙酸含量显著高于Y3⁃3组(P<0.05)外,各瘤胃发酵参数在各组间无显著差异(P>0.05)。2)Alpha多样性分析显示,Y1⁃3组、Y2⁃3组、Y3⁃3组较CK⁃3组瘤胃菌群多样性增加。聚类分析显示,与CK⁃3组瘤胃菌群构成相比差异由大到小的试验组依次为Y2⁃3组、Y1⁃3组、Y3⁃3组。3)在门水平上,Y2⁃3组较其他组极显著提高了厚壁菌门、拟杆菌门的相对丰度(P<0.01),而极显著降低了变形菌门的相对丰度(P<0.01),且浮霉菌门、Kiritimatiellaeota和黏胶球形菌门相对丰度较其他组高。4)在属水平上,相比其他组,添加2%MOS对滩羊瘤胃菌群结构的影响最大,包括赖氨酸芽孢杆菌属、普雷沃氏菌属1、醋杆菌属3种优势菌属在内的9种菌属的相对丰度极显著大于其他组(P<0.01)。总体而言,荞麦秸秆饲粮中添加MOS可以增加滩羊瘤胃菌群多样性,其中2%MOS对滩羊瘤胃菌群结构的影响最大,其有利于增强滩羊对饲粮纤维物质的降解能力。 展开更多
关键词 甘露寡糖 16S rDNA 滩羊 瘤胃细菌
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饲粮不同NFC/NDF对奶山羊瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌含量变化的影响 被引量:13
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作者 赵培厅 刘大程 +5 位作者 高民 胡红莲 韩昊奇 周向丽 邓维康 王鹏飞 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1716-1724,共9页
本试验旨在探讨在饲粮不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维(NFC/NDF)条件下,奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(subacute rumen acidosis,SARA)过程中瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌数量的变化。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的... 本试验旨在探讨在饲粮不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维(NFC/NDF)条件下,奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(subacute rumen acidosis,SARA)过程中瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌数量的变化。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的泌乳期关中奶山羊为试验动物,采用动物自身前后对照法,试验分4期进行,每期10 d,依次饲喂NFC/NDF比分别为1.02(Ⅰ期)、1.24(Ⅱ期)、1.63(Ⅲ期)、2.58(Ⅳ期)的4种饲粮,以逐渐增加饲粮精料含量的方式诱导奶山羊发生SARA,并采用实时定量PCR技术对瘤胃内溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌的数量变化进行定量分析。结果表明:1)随着饲粮NFC/NDF比的逐步升高,溶纤维丁酸弧菌和埃氏巨型球菌的数量均增加,但当饲粮NFC/NDF比升至2.58时,与其他试验期相比,埃氏巨型球菌的数量极显著增加(P<0.01),而溶纤维丁酸弧菌的数量却菜显著降低(P<0.01)。2)牛链球菌的数量随着饲粮NFC/NDF比的逐步增加呈显著下降(P<0.05),但到Ⅳ期又恢复到Ⅰ期数量。结果提示,当奶山羊发生SARA时,瘤胃牛链球菌的数量无明显变化,对低pH敏感的溶纤维丁酸弧菌数量急剧下降,而耐酸性的埃氏巨型球菌数量表现为大幅增加。 展开更多
关键词 饲粮NFC/NDF比 亚急性瘤胃酸中毒 实时定量PCR 瘤胃细菌
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酵母发酵饲料对瘤胃菌群数量及多样性的影响 被引量:13
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作者 郝凌魁 刘世雄 +6 位作者 李冬芳 于春微 李松建 陈灰 高民 胡红莲 刘大程 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第2期116-124,共9页
本试验研究日粮中添加酵母发酵饲料对蒙古绵羊瘤胃菌群数量及多样性的影响。选用10只安装永久性瘤胃瘘管且体重约40 kg的14月龄蒙古羯羊,分为对照组和试验组,每组各5只。对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂基础日粮+酵母发酵饲料(13.37%)。... 本试验研究日粮中添加酵母发酵饲料对蒙古绵羊瘤胃菌群数量及多样性的影响。选用10只安装永久性瘤胃瘘管且体重约40 kg的14月龄蒙古羯羊,分为对照组和试验组,每组各5只。对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂基础日粮+酵母发酵饲料(13.37%)。预试期15 d,正试期5 d。于正试期晨饲后0、3、6、9、12 h依次采集瘤胃液,每天采集一个时间点,共采集5次。实时荧光定量PCR(探针法)检测9种瘤胃菌群的数量,并用16S rRNA高通量测序技术分析菌群多样性。结果表明:试验组溶纤维丁酸弧菌、黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌、埃氏巨球型菌、牛链球菌和栖瘤胃普雷沃氏菌数量均高于对照组(P<0.05),反刍兽甲烷短杆菌数量低于对照组(P<0.05),嗜淀粉瘤胃杆菌和白色瘤胃球菌在两组间差异不显著;试验组中菌群多样性低于对照组(P<0.05),拟杆菌门、纤维杆菌门、密螺旋体门含量升高,厚壁菌门含量降低(P>0.05);理研菌科_RC9菌属含量升高,克里斯滕森菌属_R-7含量降低(P<0.05)。综上,酵母发酵饲料能够影响瘤胃菌群数量,改善瘤胃菌群结构,降低瘤胃菌群的多样性。 展开更多
关键词 酵母发酵饲料 瘤胃细菌 产甲烷菌 实时荧光定量PCR 16S rRNA高通量测序
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降解有毒的含羞草素和二羟基吡啶化合物的瘤胃细菌 被引量:11
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作者 谭蓓英 王旭明 汪儆 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第5期379-384,共6页
从采食银合欢不引起中毒症状的我国广西北海市涠洲岛的黄牛瘤胃中,分离出4株厌氧细菌.经高效液相色谱分析证实,菌株BR-1,BR-2,BR-5和BR-7能降解有毒的含羞草素(mimosine)、3-羟基-4(1氢)吡啶酮(3,4 DHP)和2,3-二羟基吡啶(2,3DHP).在宿... 从采食银合欢不引起中毒症状的我国广西北海市涠洲岛的黄牛瘤胃中,分离出4株厌氧细菌.经高效液相色谱分析证实,菌株BR-1,BR-2,BR-5和BR-7能降解有毒的含羞草素(mimosine)、3-羟基-4(1氢)吡啶酮(3,4 DHP)和2,3-二羟基吡啶(2,3DHP).在宿主体外进行纯菌和混菌液体培养,3天分别降解含羞草素44—59%,3,4DHP 30—47%和2,3DHP58—60%.经分类鉴定,确定为三个种:BR-1和BR-2很相似,为乳杆菌属(Lactobacillus),可能是一个新种.BR-5为牛链球菌(Streptococcus bovis)和BR-7为生孢梭菌(Clostridiumsporogenes).上述这些兼性和严格厌氧的革兰氏阳性细菌对含羞草素和二羟基吡啶类毒素具有降解活性,这是以前没有报道过的.由于这些脱毒细菌栖居于瘤胃的微生态系统中,从而保护宿主动物免受银合欢的毒害. 展开更多
关键词 瘤胃细菌 含羞草素 二羟基吡啶
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基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及群落结构 被引量:12
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作者 陈芸 刘旗 +3 位作者 邓俊良 任志华 杨颜铱 高爽 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期286-291,共6页
采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对... 采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16S rDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338 830条,聚类后得3 400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰度为拟杆菌门的(占总序列数的40.87%),其次为厚壁菌门的(27.19%),样品F最高相对丰度为拟杆菌门的(47.12%),其次为变形菌门的(19.99%),再次为厚壁菌门的(18.05%),样品A厚壁菌门的相对丰度极显著高于样品F的(P<0.01);4)在属水平上,样品A与样品F的最高相对丰度均为普雷沃氏菌属的(样品A的为25.54%,样品F的为27.67%),样品A中月形单胞菌属、丁酸弧菌属、瘤胃球菌属、琥珀酸弧菌属、琥珀酸菌属等的相对丰度显著高于样品F的(P<0.05)。试验结果表明,川中黑山羊瘤胃中相对丰度最高的菌门为拟杆菌门,相对丰度最高的菌属为普雷沃氏菌属,且两瘤胃样品中部分细菌相对丰度间的差异显著。 展开更多
关键词 川中黑山羊 瘤胃细菌 多样性 群落结构 MiSeq测序 拟杆菌门 普雷沃氏菌属
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Association of residual feed intake with abundance of ruminal bacteria and biopolymer hydrolyzing enzyme activities during the peripartal period and early lactation in Holstein dairy cows 被引量:10
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作者 Ahmed A.Elolimy José M.Arroyo +2 位作者 FernANDa Batistel Michael A.Iakiviak Juan J.Loor 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2018年第3期717-726,共10页
Background: Residual feed intake(RFI) in dairy cattle typically calculated at peak lactation is a measure of feed efficiency independent of milk production level. The objective of this study was to evaluate difference... Background: Residual feed intake(RFI) in dairy cattle typically calculated at peak lactation is a measure of feed efficiency independent of milk production level. The objective of this study was to evaluate differences in ruminal bacteria, biopolymer hydrolyzing enzyme activities, and overall performance between the most-and the leastefficient dairy cows during the peripartal period. Twenty multiparous Holstein dairy cows with daily ad libitum access to a total mixed ration from d-10 to d 60 relative to the calving date were used. Cows were classified into most-efficient(i.e. with low RFI, n = 10) and least-efficient(i.e. with high RFI, n = 10) based on a linear regression model involving dry matter intake(DMI), fat-corrected milk(FCM), changes in body weight(BW), and metabolic BW.Results: The most-efficient cows had ~ 2.6 kg/d lower DMI at wk 4, 6, 7, and 8 compared with the least-efficient cows. In addition, the most-efficient cows had greater relative abundance of total ruminal bacterial community during the peripartal period. Compared with the least-efficient cows, the most-efficient cows had 4-fold greater relative abundance of Succinivibrio dextrinosolvens at d-10 and d 10 around parturition and tended to have greater abundance of Fibrobacter succinogenes and Megaspheara elsdenii. In contrast, the relative abundance of Butyrivibrio proteoclasticus and Streptococcus bovis was lower and Succinimonas amylolytica and Prevotella bryantii tended to be lower in the most-efficient cows around calving. During the peripartal period, the most-efficient cows had lower enzymatic activities of cellulase, amylase, and protease compared with the least-efficient cows.Conclusions: The results suggest that shifts in ruminal bacteria and digestive enzyme activities during the peripartal period could, at least in part, be part of the mechanism associated with better feed efficiency in dairy cows. 展开更多
关键词 Dairy COWS Enzyme activity Peripartal PERIOD RFI rumen bacteria
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酶菌混合处理荞麦秸秆和苜蓿干草对滩羊生长性能、屠宰性能、瘤胃细菌多样性和碳水化合物活性酶类的影响 被引量:11
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作者 姜碧薇 王甜 +1 位作者 周玉香 李斐 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期2335-2346,共12页
本试验旨在研究酶菌混合处理荞麦秸秆和苜蓿干草对滩羊生长性能、屠宰性能、肉品质、瘤胃细菌多样性和碳水化合物活性酶类(CAZy)的影响。选择体重相近、健康状况良好的3月龄断奶宁夏滩羊20只,随机分为2组,每组10只。对照组以未经处理的... 本试验旨在研究酶菌混合处理荞麦秸秆和苜蓿干草对滩羊生长性能、屠宰性能、肉品质、瘤胃细菌多样性和碳水化合物活性酶类(CAZy)的影响。选择体重相近、健康状况良好的3月龄断奶宁夏滩羊20只,随机分为2组,每组10只。对照组以未经处理的荞麦秸秆和苜蓿干草(荞麦秸秆和苜蓿干草的比例为20∶80)作为粗饲料,试验组以纤维素酶(活性≥10000 U/g)与复合益生菌(主要成分为酵母菌、枯草芽孢杆菌和乳酸菌)混合处理的荞麦秸秆和苜蓿干草(荞麦秸秆和苜蓿干草的比例为20∶80)作为粗饲料,2组饲粮精料相同,精粗比均为30∶70。预试期15 d,正试期60 d。饲养试验结束当天早晨,空腹口腔采集瘤胃液并提取DNA用于瘤胃细菌多样性和宏基因组分析,采集瘤胃液后每组选择5只体重接近平均体重的羊只禁食24 h、禁水2 h后屠宰,进行屠宰性能和肉品质指标检测。结果显示:1)试验组的总增重和平均日增重极显著高于对照组(P<0.01),料重比极显著低于对照组(P<0.01)。2)试验组各项屠宰性能、肉品质指标和羊肉营养成分含量与对照组相比均无显著差异(P>0.05)。3)试验组Chao指数和ACE指数极显著低于对照组(P<0.01);在门水平上,试验组厚壁菌门的丰度显著高于对照组(P<0.05),拟杆菌门和Kiritimatiellaeota的丰度极显著低于对照组(P<0.01)。在属水平上,试验组普雷沃菌属1和库特氏菌属的丰度极显著高于对照组(P<0.01)。4)CAZy注释结果显示,在A层级中,试验组与对照组的主要家族均为糖苷水解酶(GH)、糖基转移酶(GT)和碳水化合物结合模块(CBM);在B层级中,与对照组相比,试验组丰度显著上调的基因有12个(P<0.05),显著下调的基因有3个(P<0.05)。综上所述,用酶菌混合处理的荞麦秸秆和苜蓿干草饲喂滩羊,能够提高滩羊的生长性能,有改善滩羊肉色和肉品质的趋势,同时有益于滩羊瘤胃内纤维降解菌的形成,并影 展开更多
关键词 纤维素酶 复合益生菌 滩羊 生长性能 屠宰性能 肉品质 瘤胃细菌
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放牧与舍饲对彭波半细毛羊瘤胃细菌群落的生物学信息影响 被引量:11
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作者 田发益 武俊喜 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2252-2263,共12页
旨在通过不同蛋白质、非纤维性碳水化合物(NFC)和纤维素含量对瘤胃微环境细菌群落结构的影响研究,阐明瘤胃优势菌群结构的消长情况,清晰地了解瘤胃微生物对养分的依赖程度,以期为西藏传统放牧补饲及规模化养殖营养配比奠定理论基础。本... 旨在通过不同蛋白质、非纤维性碳水化合物(NFC)和纤维素含量对瘤胃微环境细菌群落结构的影响研究,阐明瘤胃优势菌群结构的消长情况,清晰地了解瘤胃微生物对养分的依赖程度,以期为西藏传统放牧补饲及规模化养殖营养配比奠定理论基础。本研究选用年龄2岁左右,体重相近((23.77±2.34)kg)的健康彭波半细毛母羊20只,放牧组及舍饲组各10只(每组各2个重复,每个重复5只)。采用凯氏定氮法、范氏(van soest)法和差值法分别测定放牧组可饲用牧草混合样、舍饲组饲草的粗蛋白、纤维素、NFC含量。饲养半年后,抽取瘤胃液,提取总DNA,构建重组标准质粒对瘤胃细菌进行绝对荧光定量(qRT-PCR)研究。结果:1)在门水平上,发现优势菌群集中在拟杆菌门,其在放牧组的丰度((49.52±6.07)%)比舍饲组((55.52±12.18)%)低6.00%,但差异不显著(P>0.05);放牧组厚壁菌门的丰度((43.28±4.59)%)比舍饲组((36.68±9.78)%)高6.60%,两组差异显著(P<0.05);放牧组螺旋体门的丰度((1.99±1.75)%)比舍饲组((0.76±0.59)%)高1.23%,两组差异显著(P<0.05)。2)通过PLS-DA和LEfSe分析发现,两组间均差异显著的主要细菌有:纤维素或其代谢产物主要依赖菌(放牧组)为假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、月形单胞菌属(Selenomonas)、粪球菌属(Coprococcus)、梭菌属(Clostridium)、厌氧弧菌属(Anaerovibrio)、毛螺旋菌科下一属(Shuttleworthia)、类普雷沃氏菌科下一属(CF231)、丁酸弧菌属(Butyrivibrio)、类普雷沃氏菌科下一属(YRC22)、毛螺菌属(Lachnospira)、毛螺菌科下一属(Moryella);高蛋白和NFC或其代谢产物主要依赖菌(舍饲组)为脱硫叶菌属(Desulfobulbus)、奇异菌属(Atopobium)、韦荣球菌科下一属(p-75-a5)、普氏菌属(Prevotella)、布劳特氏菌属(Blautia)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)和链球菌属(Streptococcus)。结果说明,合理蛋白质能量水平的饲料,不仅利于蛋白、淀粉依赖菌的增殖,也有利 展开更多
关键词 彭波半细毛羊 TMR 丰度 瘤胃细菌 OTUs 放牧组和舍饲组
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大额牛瘤胃细菌16S rRNA基因序列分析 被引量:10
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作者 毛华明 马松成 +2 位作者 陈静 邓卫东 和天宝 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期3769-3775,共7页
【目的】研究大额牛(Bos frontalis)瘤胃细菌16S rRNA基因序列,为揭示大额牛瘤胃细菌组成的多样性以及开发这一珍稀生物资源提供分子生物学依据。【方法】采用细菌通用引物F27和R1492对目标基因进行PCR扩增,克隆、测序后利用Neighbor-jo... 【目的】研究大额牛(Bos frontalis)瘤胃细菌16S rRNA基因序列,为揭示大额牛瘤胃细菌组成的多样性以及开发这一珍稀生物资源提供分子生物学依据。【方法】采用细菌通用引物F27和R1492对目标基因进行PCR扩增,克隆、测序后利用Neighbor-joining方法构建系统进化树。【结果】共获得147个16S rRNA基因序列,在GenBank登录号为DQ673466~DQ673612。按照97%的相似性标准,这些序列被分为86个操作分类单元。有16个序列与已培养菌的序列相似性≥97%,占总序列的10.9%;另有22个序列与已培养菌的序列相似性为90%~97%,占总序列的15%;剩余109个序列为未培养、鉴定菌,所占比例高达74.1%。系统进化分析显示,大额牛瘤胃细菌主要分布于低G+C含量细菌门(57.1%)和噬纤维菌/屈扰杆菌/拟杆菌门(42.2%),仅有一个序列位于螺旋体门。【结论】本试验获得了大额牛瘤胃细菌16S rRNA基因序列,为进一步研究大额牛瘤胃微生态系统组成及其与饲料消化之间的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 大额牛 瘤胃细菌 16SrRNA基因序列 系统进化分析
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复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响 被引量:11
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作者 陈芸 刘旗 +4 位作者 邓俊良 杨颜铱 高爽 陈憧 姚淑华 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第11期1800-1808,共9页
试验旨在探讨复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响,以期为抗菌肽应用于反刍动物提供理论依据。选取24只4月龄川中黑山羊,分为4组,每组6只,正常精料组(A),正常精料+抗菌肽组(C),双倍精料组(D),双倍精料+抗菌肽组(E)分别饲喂精料300、300... 试验旨在探讨复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响,以期为抗菌肽应用于反刍动物提供理论依据。选取24只4月龄川中黑山羊,分为4组,每组6只,正常精料组(A),正常精料+抗菌肽组(C),双倍精料组(D),双倍精料+抗菌肽组(E)分别饲喂精料300、300、600和600 g·d^(-1)·只^(-1),C与E组饲喂3 g·d^(-1)·只^(-1)复合抗菌肽。于21 d晨饲前每组随机选取3只采集瘤胃液,提取样品总DNA,扩增16S rRNA V4区,扩增产物采用Miseq平台测序。结果表明:1)共获得高质量序列629 634条,97%相似度下聚类后共获得13227个OTU。2)所得OTU经物种注释后,门水平上,除D组最优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)(34.30%)外,其余各组最优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidetes)(38.52%~43.68%),且添加复合抗菌肽显著降低变形菌门(Proteobacteria)与螺旋菌门(Spirochaetes)含量(P<0.05);增加精料量显著增加厚壁菌门与螺旋菌门含量(P<0.05),显著降低拟杆菌门与变形菌门含量(P<0.05)。3)属水平上,普雷沃菌属(Prevotella)为所有样品中最优势菌属(25.54%~33.88%),添加抗菌肽后,琥珀酸菌属(Succiniclasticum)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)显著或极显著增加(P<0.05或P<0.01),琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)极显著降低(P<0.01),且不受精料量影响,但月形单胞菌属(Selenomonas)与密螺旋体(Treponema)的变化趋势与精料量相关,正常精料组显著降低(P<0.05),而双倍精料组无显著变化(P>0.05);增加精料量显著增加普雷沃菌属、密螺旋体等含量(P<0.05),降低琥珀酸弧菌属等含量(P<0.05)。4)各样品在alpha多样性Chao、ACE、Shannon和Simpson指数上,差异不显著(P>0.05)。表明添加复合抗菌肽降低变形菌门和螺旋菌门的相对含量,提高部分降解纤维菌属的含量;增加精料量可增加厚壁菌门和螺旋菌门相对含量,降低拟杆菌门和变形菌门的相对含量,增加普雷沃菌属相� 展开更多
关键词 山羊 瘤胃细菌 菌群结构 高通量测序 复合抗菌肽 精料
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