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蕨类植物叶绿体rps4基因的适应性进化分析 被引量:11
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作者 张丽君 陈洁 王艇 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期42-50,共9页
在原核生物和植物叶绿体中,RPS4(ribosomal protein small subunit4)在核糖体30S小亚基形成起始过程中发挥重要作用;该蛋白在植物中由叶绿体rps4基因编码。为验证蕨类植物在白垩纪适应被子植物兴起而发生分化的观点,本文以23种蕨类植物... 在原核生物和植物叶绿体中,RPS4(ribosomal protein small subunit4)在核糖体30S小亚基形成起始过程中发挥重要作用;该蛋白在植物中由叶绿体rps4基因编码。为验证蕨类植物在白垩纪适应被子植物兴起而发生分化的观点,本文以23种蕨类植物为研究对象,利用分支模型、位点模型和分支位点模型对其叶绿体rps4基因进化适应性进行分析。分支模型检测到4个可能存在正选择的分支;位点模型和分支位点模型虽然没有检测出正选择位点,但是位点模型检测出了85个负选择位点。通过研究我们仅仅得出a、b两个代表水龙骨类的分支处于正选择压力下,这与水龙骨类在白垩纪发生辐射式演化的理论相一致。同时rps4基因处于强烈的负选择压力这一事实表明该基因的功能与结构已经趋于稳定。 展开更多
关键词 蕨类植物 核糖体蛋白S4 rps4基因 适应性进化
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基于rps4基因探讨中国丛藓科苔藓植物系统学研究 被引量:3
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作者 杨鹏 杨成龙 +3 位作者 王健 胡贤锋 成宇 赵财 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期4282-4288,共7页
本研究采用PCR直接测序法,对中国丛藓科苔藓植物42个不同样品的rps4序列进行系统学研究。结果表明,rps4总长度为562 bp,其中包含201个变异位点,132个信息位点,碱基之间的转换与颠换比为1.77,平均G+C含量为27.5%,遗传距离值最小为0,最大... 本研究采用PCR直接测序法,对中国丛藓科苔藓植物42个不同样品的rps4序列进行系统学研究。结果表明,rps4总长度为562 bp,其中包含201个变异位点,132个信息位点,碱基之间的转换与颠换比为1.77,平均G+C含量为27.5%,遗传距离值最小为0,最大的是小墙藓属与扭口藓属为0.3。基于贝叶斯法构建系统发育树,结果显示,贝叶斯树分为3个大支,分别为毛口藓亚科、扭口藓亚科及丛藓亚科,同时支持毛口藓亚科为一并系群,扭口藓亚科为一单系群,表明rps4基因比较适合于研究中国丛藓科植物的分子系统学。 展开更多
关键词 丛藓科 rps4基因 系统学 遗传距离
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基于叶绿体rps4基因序列的部分苔藓植物的亲缘关系 被引量:1
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作者 张安世 张为民 +1 位作者 陈娟 刘永英 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第12期52-53,共2页
以小叶苔为外类群,利用ClustalX2.0和MEGA4.1软件对12种苔藓植物的rps4基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果表明:叶绿体rps4序列长度变异范围为669~677 bp,排序后总长度为683 bp,其中变异位点200个,信息位点122个。遗传距离为... 以小叶苔为外类群,利用ClustalX2.0和MEGA4.1软件对12种苔藓植物的rps4基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果表明:叶绿体rps4序列长度变异范围为669~677 bp,排序后总长度为683 bp,其中变异位点200个,信息位点122个。遗传距离为0.008~0.202,平均遗传距离为0.122。利用UPGMA法建立的系统树显示,12种苔藓植物分为3组,其中6种丛藓科(Pottiaceae)植物聚为一组,3种青藓科(Brachytheciaceae)植物聚为一组,3种灰藓科(Hypnaceae)植物聚为另一组。序列分析结果与形态学结果一致,表明rps4序列可用于苔藓植物的亲缘关系分析。 展开更多
关键词 苔藓 DNA条形码 rps4基因 亲缘关系 系统发育分析
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