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题名桔梗科rps2基因簇断裂对进化速率的影响
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作者
栗锦烨
平晶耀
崔贵峰
苏应娟
王艇
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机构
华南农业大学生命科学学院
国有南召林场(河南伏牛山国家级自然保护区南召宝天曼管理局)
中山大学生命科学学院
中山大学深圳研究院
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出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期333-342,共10页
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基金
国家自然科学基金项目(31770587)。
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文摘
保守的rps2基因簇(rps2-atpI-atpH-atpF-atpA)在桔梗科的叶绿体基因组中发生了断裂。为探究该基因簇断裂后,相关基因的进化速率是否发生变化,本研究选取50种桔梗科植物和2种睡菜科植物的叶绿体基因组序列进行系统发育关系的构建,对rps2基因簇相关基因的进化速率、选择压力以及适应性进化过程进行分析。结果显示,桔梗科中rps2基因簇发生断裂的物种均来自风铃草亚科,且在系统发育树上组成单系分支;与未断裂物种相比,断裂物种中相关基因的进化速率均值降低;基因间的非同义替换速率存在显著差异。适应性进化分析中,位点模型在atpI和rps2基因中检测到正选择位点。本研究结果表明基因簇断裂可能具有系统发育意义,基因簇断裂后进化速率会发生改变,不同基因也经历了不同的进化历程。
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关键词
rps2基因簇
桔梗科
进化速率
选择压力
适应性进化
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Keywords
rps2 gene cluster
Campanulaceae
Evolutionary rate
Selection pressure
Adaptive evolution
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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