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双重荧光RT-ERA技术快速检测贝类食品中诺如病毒
被引量:
3
1
作者
吴占文
王帅
+6 位作者
康婕
李涛
李红娜
蔡杰
张昊
杨艳歌
袁飞
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第18期355-363,共9页
目的:基于逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription-enzymatic recombinase amplification,RTERA)技术,以MS2作为模式过程控制病毒,建立一种贝类食品中GI与GII型诺如病毒(norovirus,NoV)双重荧光RT-ERA快速检测方法。方法:分别...
目的:基于逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription-enzymatic recombinase amplification,RTERA)技术,以MS2作为模式过程控制病毒,建立一种贝类食品中GI与GII型诺如病毒(norovirus,NoV)双重荧光RT-ERA快速检测方法。方法:分别将GI、GII NoV参考靶序列克隆到带有T7启动子的载体中,通过体外转录的方式获得高纯度NoV RNA参考样品。以设计的MS2噬菌体引物探针,与实验室前期筛选的GI、GII NoV引物探针进行双重荧光RT-ERA实验,并对反应体系和反应程序进行优化,分析方法的灵敏度。最后,采用建立的方法开展真实样本检测,以GB 4789.42-2016《食品微生物学检验诺如病毒检验》为参比方法进行检测结果对比,确定方法的准确性和可行性。结果:建立MS2与GI、MS2与GII两组双重荧光RT-ERA检测方法,最佳引物及探针体积分别为4.1μL与1.8μL,检测时间可缩短至10 min左右,且最低可检出102拷贝/μL的NoV核酸样品。应用所建立的方法对29份真实样品进行检测,检测结果与GB 4789.42-2016一致。结论:本研究建立的双重荧光RT-ERA检测方法可实现对MS2、GI和GII NoV的同时检测,且灵敏度高、准确性强,为今后NoV现场快速检测提供一定基础。
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关键词
诺如病毒
逆转录-酶促重组等温扩增技术
双重荧光
快速检测
贝类
下载PDF
职称材料
酶促重组等温扩增实时荧光法快速检测基孔肯雅病毒方法的建立
2
作者
罗正汉
蒯月璋
+6 位作者
韩一芳
叶福强
胡丹
王太武
汪春晖
何君花
张锦海
《国际病毒学杂志》
北大核心
2024年第1期28-32,共5页
目的建立一种快速、准确、高灵敏度检测基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)的逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription enzymatic recombinase amplification,RT-ERA)的基因检测技术方法.方法以CHIKV非结构蛋白1(non-structu...
目的建立一种快速、准确、高灵敏度检测基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)的逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription enzymatic recombinase amplification,RT-ERA)的基因检测技术方法.方法以CHIKV非结构蛋白1(non-structural protein 1,NSP1)基因的保守序列为靶标,根据RT-ERA反应原理设计、合成荧光探针及对应引物,以pUC18为载体构建靶标质粒并在体外转录后作为阳性对照品,将阳性对照品倍比稀释后筛选出扩增效率最高的探针引物组合.利用筛选的探针引物组合,对不同拷贝数的CHIKV进行荧光RT-ERA法扩增,评价该方法的最低检出限;再分别以森林脑炎病毒、登革热病毒、寨卡病毒、乙型脑炎病毒、新布尼亚病毒的RNA为模板进行荧光RT-ERA法扩增,评价该方法的特异性.结果在40℃恒温条件下,利用荧光RT-ERA法10 min内可以完成CHIKV核酸扩增,该方法最低检出限可达10拷贝/μL,且当CHIKV核酸扩增为阳性时,其他病毒检测结果为阴性.结论成功建立一种可用于检测CHIKV NSP1基因的荧光RT-ERA法,该方法操作简便、检测限低且特异性好.
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关键词
基孔肯雅病毒
逆转录-酶促恒温扩增
NSP1基因
原文传递
题名
双重荧光RT-ERA技术快速检测贝类食品中诺如病毒
被引量:
3
1
作者
吴占文
王帅
康婕
李涛
李红娜
蔡杰
张昊
杨艳歌
袁飞
机构
中国检验检疫科学研究院
黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院
陕西省产品质量监督检验研究院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第18期355-363,共9页
基金
中国检验检疫科学研究院基本科研业务费专项(2022JK36)
“十三五”国家重点研发计划重点专项(2018YFC1603606)。
文摘
目的:基于逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription-enzymatic recombinase amplification,RTERA)技术,以MS2作为模式过程控制病毒,建立一种贝类食品中GI与GII型诺如病毒(norovirus,NoV)双重荧光RT-ERA快速检测方法。方法:分别将GI、GII NoV参考靶序列克隆到带有T7启动子的载体中,通过体外转录的方式获得高纯度NoV RNA参考样品。以设计的MS2噬菌体引物探针,与实验室前期筛选的GI、GII NoV引物探针进行双重荧光RT-ERA实验,并对反应体系和反应程序进行优化,分析方法的灵敏度。最后,采用建立的方法开展真实样本检测,以GB 4789.42-2016《食品微生物学检验诺如病毒检验》为参比方法进行检测结果对比,确定方法的准确性和可行性。结果:建立MS2与GI、MS2与GII两组双重荧光RT-ERA检测方法,最佳引物及探针体积分别为4.1μL与1.8μL,检测时间可缩短至10 min左右,且最低可检出102拷贝/μL的NoV核酸样品。应用所建立的方法对29份真实样品进行检测,检测结果与GB 4789.42-2016一致。结论:本研究建立的双重荧光RT-ERA检测方法可实现对MS2、GI和GII NoV的同时检测,且灵敏度高、准确性强,为今后NoV现场快速检测提供一定基础。
关键词
诺如病毒
逆转录-酶促重组等温扩增技术
双重荧光
快速检测
贝类
Keywords
norovirus
reverse transcription
-
enzymatic
recombinase
amplification
dual
fluorescence
rapid
detection
shellfish
分类号
TS201.6 [轻工技术与工程—食品科学]
下载PDF
职称材料
题名
酶促重组等温扩增实时荧光法快速检测基孔肯雅病毒方法的建立
2
作者
罗正汉
蒯月璋
韩一芳
叶福强
胡丹
王太武
汪春晖
何君花
张锦海
机构
东部战区疾病预防控制中心传染病防控一科
东部战区总医院妇产科
出处
《国际病毒学杂志》
北大核心
2024年第1期28-32,共5页
基金
国家重点研发计划(2022YFF0710100)。
文摘
目的建立一种快速、准确、高灵敏度检测基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)的逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription enzymatic recombinase amplification,RT-ERA)的基因检测技术方法.方法以CHIKV非结构蛋白1(non-structural protein 1,NSP1)基因的保守序列为靶标,根据RT-ERA反应原理设计、合成荧光探针及对应引物,以pUC18为载体构建靶标质粒并在体外转录后作为阳性对照品,将阳性对照品倍比稀释后筛选出扩增效率最高的探针引物组合.利用筛选的探针引物组合,对不同拷贝数的CHIKV进行荧光RT-ERA法扩增,评价该方法的最低检出限;再分别以森林脑炎病毒、登革热病毒、寨卡病毒、乙型脑炎病毒、新布尼亚病毒的RNA为模板进行荧光RT-ERA法扩增,评价该方法的特异性.结果在40℃恒温条件下,利用荧光RT-ERA法10 min内可以完成CHIKV核酸扩增,该方法最低检出限可达10拷贝/μL,且当CHIKV核酸扩增为阳性时,其他病毒检测结果为阴性.结论成功建立一种可用于检测CHIKV NSP1基因的荧光RT-ERA法,该方法操作简便、检测限低且特异性好.
关键词
基孔肯雅病毒
逆转录-酶促恒温扩增
NSP1基因
Keywords
Chikungunya
virus
reverse transcription
enzymatic
recombinase
amplification
NSP1
gene
分类号
R511 [医药卫生—内科学]
R44 [医药卫生—临床医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
双重荧光RT-ERA技术快速检测贝类食品中诺如病毒
吴占文
王帅
康婕
李涛
李红娜
蔡杰
张昊
杨艳歌
袁飞
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
下载PDF
职称材料
2
酶促重组等温扩增实时荧光法快速检测基孔肯雅病毒方法的建立
罗正汉
蒯月璋
韩一芳
叶福强
胡丹
王太武
汪春晖
何君花
张锦海
《国际病毒学杂志》
北大核心
2024
0
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