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利用抑制差减杂交技术分离马铃薯晚疫病抗性相关基因(英文) 被引量:22
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作者 田振东 柳俊 谢从华 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第7期597-605,共9页
以晚疫病病原菌混合小种接种处理 4 8h的马铃薯水平抗性材料 (R gene free)叶片为目的材料 ,以未处理材料作为对照 ,用抑制差减杂交技术构建了一个富集晚疫病抗性相关基因的差减文库。应用反向Northern技术对84 0个克隆进行斑点杂交筛... 以晚疫病病原菌混合小种接种处理 4 8h的马铃薯水平抗性材料 (R gene free)叶片为目的材料 ,以未处理材料作为对照 ,用抑制差减杂交技术构建了一个富集晚疫病抗性相关基因的差减文库。应用反向Northern技术对84 0个克隆进行斑点杂交筛选 ,筛选出 15 0个病原诱导后信号明显增强的克隆。 2 6个片段测序结果表明 :部分片段基因功能与抗病性明显相关。 7个差异表达片段与GenBankEST数据库中已有晚疫病原诱导马铃薯叶片得到的EST有很高同源性 (达 95 %~ 10 0 % ) ;部分片段核苷酸或氨基酸序列分别与番茄、烟草、拟南芥等的EST序列或氨基酸序列有较高同源性 ;另有 4个基因片段在GenBankEST数据库中未找到明显的同源序列 ,可能为新发现的基因片段。 展开更多
关键词 马铃薯 晚疫病 抗病相关基因 抑制差减杂交(SSH) 反向Northern斑点杂交
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Isolation, Cloning, and Identification of Expressed Sequence Tags from the Backfat Tissue in Duroc and Tongcheng Pigs by mRNA Differential Display
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作者 REN Zhu-qing XIONG Yuan-zhu DENG Chang-yan LEI Ming-gang ZUO Bo LI Feng-e ZHENG Rong XU De-quan 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2006年第2期141-145,共5页
mRNA differential display technique was performed to discuss the differential expression of genes in fat tissue between introduced European and Chinese indigenous pigs. Four anchor primers in combination with five arb... mRNA differential display technique was performed to discuss the differential expression of genes in fat tissue between introduced European and Chinese indigenous pigs. Four anchor primers in combination with five arbitrary primers (20 sets in total) were used and nearly 300 bands were observed in polyacrylamide gel, among which 29 differential display bands were obtained. Twelve of 29 cDNA fragments were identified using reverse Northern dot blot, and subsequently cloned and sequenced. Eight of 12 cDNAs had no matches in GenBank and were submitted to GenBank, and the other 4 showed similarity to identified genes from GenBank. Three among 8 novel ESTs were selected to be further identified by semiquantitative RT-PCR. In our experiment, silver staining DDRT-PCR and DIG primer DNA labeling reverse Northern dot blot were used to avoid radioactive pollution. The result showed that the expressions of 5 among 8 novel ESTs were stronger in the backfat of Tongcheng pigs and the others were weaker than that in Duroc pigs. These novel ESTs were prepared for selecting genes related to adipose cells. 展开更多
关键词 ESTS fat tissue reverse Northern dot blot semi-quantitative RT-PCR mRNA differential display
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大鼠骨组织内一些细胞因子和胶原蛋白基因的表达与雌激素和年龄有关
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作者 黄海宁 涂正超 +5 位作者 廖珊 赵寿元 李昌本 黄遂柱 汤亭亭 戴克戎 《实验生物学报》 CSCD 1999年第4期373-379,共7页
三月龄SD大鼠30只,分三组:卵巢切除组(OVX)、假手术组和卵巢切除后补充雌二醇组;每组10只,术后一月和三月每组分别各取五只。提取长骨骨组织mRNA,反转录为单链cDNA探针,以持家基因(gapdh)为内对照,针对多种胶原和细胞因子基因进行反向No... 三月龄SD大鼠30只,分三组:卵巢切除组(OVX)、假手术组和卵巢切除后补充雌二醇组;每组10只,术后一月和三月每组分别各取五只。提取长骨骨组织mRNA,反转录为单链cDNA探针,以持家基因(gapdh)为内对照,针对多种胶原和细胞因子基因进行反向North-ern杂交和反向点杂交。大鼠骨组织中,colIα(1)、col Iα(2)和col Ⅲ的表达与年龄有关,与卵巢切除无关;但补充外源雌二醇可严重抑制col Ⅲ和colⅠα(2)的表达。col、Ⅴ、IL-1和IL-6的表达受雌激素抑制,切除卵巢后抑制作用消失,而补充雌二醇后它们的表达又降至正常水平。TGF-β的表达也受雌激素抑制,但雌激素的影响还与年龄有关;卵巢切除后一个月TGF-β表达增加,补充外源雌二醇后表达有所降低;但是卵巢切除三个月后的大鼠TGF-β表达的这一变化不明显。本实验为进一步研究安全可靠的骨质疏松治疗方法打下基础。 展开更多
关键词 细胞因子 胶原蛋白 雌激素 年龄 骨质疏松症
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用抑制消减杂交法分离巴西橡胶树胶乳特异表达基因 被引量:8
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作者 邓柳红 罗明武 +2 位作者 曾会才 杨卫帆 张春发 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第6期32-36,共5页
采用巴西橡胶树常割树胶乳的Poly(A+)RNA为Tester,叶片Poly(A+)RNA为Driver,通过抑制消减杂交法(suppressivesubtractivehybridization,SSH)构建了一个胶乳特异表达基因差减文库,通过菌落PCR及反式NorthernDot-Blot筛选鉴定阳性差异片段... 采用巴西橡胶树常割树胶乳的Poly(A+)RNA为Tester,叶片Poly(A+)RNA为Driver,通过抑制消减杂交法(suppressivesubtractivehybridization,SSH)构建了一个胶乳特异表达基因差减文库,通过菌落PCR及反式NorthernDot-Blot筛选鉴定阳性差异片段,获得79个胶乳特异表达阳性克隆,部分阳性克隆还通过NorthernBlot杂交及RT-PCR进一步验证。随机挑选部分阳性克隆序列比较分析,结果表明有部分克隆与巴西橡胶树中已知的基因相同,而多数克隆在巴西橡胶树中是新发现,它们与橡胶生物合成、物质代谢运输、信号传导和形态建成等相关。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 抑制消减杂交法 胶乳 反式Northern Dot—Blot
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黑胫病菌诱导的烟草SSH文库构建及其分析 被引量:11
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作者 苏振刚 杨爱国 +7 位作者 孙玉合 罗成刚 刘贯山 周佳 李元元 杨帆 赵百英 王元英 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1763-1770,共8页
黑胫病是危害严重的世界性烟草主要病害之一,探究烟草对黑胫病的抗病机制,可以为该病的综合防治提供理论依据。本研究以烟草黑胫病抗性品种革新3号为材料,利用黑胫病0号生理小种诱导其水平抗性,分别在接种后0.5、1、3、6、10和16d取样,... 黑胫病是危害严重的世界性烟草主要病害之一,探究烟草对黑胫病的抗病机制,可以为该病的综合防治提供理论依据。本研究以烟草黑胫病抗性品种革新3号为材料,利用黑胫病0号生理小种诱导其水平抗性,分别在接种后0.5、1、3、6、10和16d取样,通过抑制差减杂交技术(SSH)构建cDNA文库,获得了960个阳性克隆。利用反向Northern斑点杂交技术对其中240个阳性克隆进行杂交筛选,筛选出57个表达差异明显的基因,序列拼接后获得33条高质量EST,测序及其比对分析表明,革新3号对烟草黑胫病抗性相关基因主要涉及抗病防卫、光合作用、信号传导和能量代谢等方面。进一步基因功能分析显示,病程相关PR1b蛋白、半胱氨酸蛋白、延伸因子1-α、α-微管蛋白、细胞色素P450、精胺合成酶、水通道蛋白、过氧化物酶体膜蛋白、甘氨酸延伸因子等可能参与了烟草与黑胫病菌非亲和互作过程。 展开更多
关键词 烟草 黑胫病病菌 抑制差减杂交 反向Northern斑点杂交 非亲和互作
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无核荔枝果实形成差异表达基因cDNA的克隆 被引量:4
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作者 禤维言 郑学勤 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期597-601,共5页
采用抑制差减杂交技术(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)分离与海南无核荔枝果实形成相关的差异表达基因的cDNA片段,为克隆相关基因提供研究基础。分别以无核荔枝的有核幼果为driver;无核幼果为tester,建立差减cDNA文库。经R... 采用抑制差减杂交技术(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)分离与海南无核荔枝果实形成相关的差异表达基因的cDNA片段,为克隆相关基因提供研究基础。分别以无核荔枝的有核幼果为driver;无核幼果为tester,建立差减cDNA文库。经Reverse Northern Dot-Blot筛选该文库,共获得61个阳性克隆,随机选取17个克隆进行测序,共获得10条非重复序列,对其中较长的7个序列进行同源分析,结果表明:有6个序列在荔枝中为首次报道。 展开更多
关键词 无核荔枝 无核果实 抑制差减杂交(SSH) Reverse NORTHERN DOT-BLOT
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