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快速筛选高纯合度天麻PCR-RFLP鉴定方法
被引量:
17
1
作者
谢莹
华中一
+3 位作者
赵玉洋
周骏辉
李晓琳
袁媛
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第17期113-118,共6页
目的:建立一种快速筛选高纯合度天麻种质材料的方法,为其纯系育种和杂交育种奠定基础。方法:以本课题组前期天麻全基因组测序和群体重测序为基础,利用单核苷酸多态性(SNP)位点开发20个限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)标记,并采用聚合...
目的:建立一种快速筛选高纯合度天麻种质材料的方法,为其纯系育种和杂交育种奠定基础。方法:以本课题组前期天麻全基因组测序和群体重测序为基础,利用单核苷酸多态性(SNP)位点开发20个限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)标记,并采用聚合酶链式反应(PCR)-RFLP法对15份天麻种质的20个RFLP标记进行限制性内切酶实验,根据20个RFLP标记位点酶切条带数目,计算15份天麻种质的纯合度,进而对天麻种质纯合度进行评估;在此基础上,利用基因组重测序技术对评估结果进行验证。结果:利用PCR-RFLP法筛选获得10份纯合度>95%的种质材料,其中3份种质材料的纯合度为95%,7份种质材料的纯合度为100%;利用基因组重测序法筛选获得9份纯合度>95%的种质材料,其中8份种质材料与PCR-RFLP法检测结果一致。结论:该文所建立的用于筛选高纯合度天麻种质的PCR-RFLP法精确度为80%,准确率为89%。该方法实验操作简便、检测效率高,且成本显著低于基因组重测序技术,为天麻纯系育种提供了技术支撑,也为其他中药材品种选育研究提供了借鉴。
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关键词
天麻
单核苷酸多态性(SNP)位点
限制性内切酶片段长度多态性(
rflp
)标记
纯合度
原文传递
题名
快速筛选高纯合度天麻PCR-RFLP鉴定方法
被引量:
17
1
作者
谢莹
华中一
赵玉洋
周骏辉
李晓琳
袁媛
机构
广东药科大学中药学院
中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第17期113-118,共6页
基金
国家自然科学基金重大项目(81891013,81891010)
中国中医科学院科技创新工程重大攻关项目(CI2021A041//CI2021B014)
+3 种基金
国家科技性基础资源调查专项(2018FY100800)
中央本级重大增减支项目(2060302)
青年岐黄学者项目
东城区优秀人才培养项目(2021-dchrcpyzz-7)。
文摘
目的:建立一种快速筛选高纯合度天麻种质材料的方法,为其纯系育种和杂交育种奠定基础。方法:以本课题组前期天麻全基因组测序和群体重测序为基础,利用单核苷酸多态性(SNP)位点开发20个限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)标记,并采用聚合酶链式反应(PCR)-RFLP法对15份天麻种质的20个RFLP标记进行限制性内切酶实验,根据20个RFLP标记位点酶切条带数目,计算15份天麻种质的纯合度,进而对天麻种质纯合度进行评估;在此基础上,利用基因组重测序技术对评估结果进行验证。结果:利用PCR-RFLP法筛选获得10份纯合度>95%的种质材料,其中3份种质材料的纯合度为95%,7份种质材料的纯合度为100%;利用基因组重测序法筛选获得9份纯合度>95%的种质材料,其中8份种质材料与PCR-RFLP法检测结果一致。结论:该文所建立的用于筛选高纯合度天麻种质的PCR-RFLP法精确度为80%,准确率为89%。该方法实验操作简便、检测效率高,且成本显著低于基因组重测序技术,为天麻纯系育种提供了技术支撑,也为其他中药材品种选育研究提供了借鉴。
关键词
天麻
单核苷酸多态性(SNP)位点
限制性内切酶片段长度多态性(
rflp
)标记
纯合度
Keywords
Gastrodia
elata
single
nucleotide
polymorphism
(SNP)sites
restriction
fragment
length
polymorphism
(
rflp
)
markers
purity
分类号
R284.2 [医药卫生—中药学]
R289 [医药卫生—中医学]
R22
R2-031
R33
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
快速筛选高纯合度天麻PCR-RFLP鉴定方法
谢莹
华中一
赵玉洋
周骏辉
李晓琳
袁媛
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
17
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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