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Modulation of mitochondrial bioenergetics as a therapeutic strategy in Alzheimer's disease 被引量:11
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作者 Isaac G. Onyango 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2018年第1期19-25,共7页
Alzheimer’s disease (AD) is an increasingly pressing worldwide public-health, social, political and economic concern. Despite significant investment in multiple traditional therapeutic strategies that have achieved... Alzheimer’s disease (AD) is an increasingly pressing worldwide public-health, social, political and economic concern. Despite significant investment in multiple traditional therapeutic strategies that have achieved success in preclinical models addressing the pathological hallmarks of the disease, these efforts have not translated into any effective disease-modifying therapies. This could be because interventions are being tested too late in the disease process. While existing therapies provide symptomatic and clinical benefit, they do not fully address the molecular abnormalities that occur in AD neurons. The pathophysiology of AD is complex; mitochondrial bioenergetic deficits and brain hypometabolism coupled with increased mitochondrial oxidative stress are antecedent and potentially play a causal role in the disease pathogenesis. Dysfunctional mitochondria accumulate from the combination of impaired mitophagy, which can also induce injurious inflammatory responses, and inadequate neuronal mitochondrial biogenesis. Altering the metabolic capacity of the brain by modulating/potentiating its mitochondrial bioenergetics may be a strategy for disease prevention and treatment. We present insights into the mechanisms of mitochondrial dysfunction in AD brain as well as an overview of emerging treatments with the potential to prevent, delay or reverse the neurodegenerative process by targeting mitochondria. 展开更多
关键词 Alzheimer's disease mitochondria BIOENERGETICS mitochondrial DNA neuroinflammation mitohormesis caloric restriction HYPOMETABOLISM MITOPHAGY mitochondrial biogenesis recombinant-human mitochondrial transcription factor A antioxidants PROTEASOME mitochondrial transcription activator-like effector nucleases clustered regularly interspaced short palindromic repeats/associated protein 9 (CRISPR/Cas9) caloric restriction stem cells
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益生菌遗传育种方法研究进展
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作者 高娉娉 刘汉清 +3 位作者 张凤 凌新 郭丽琼 林俊芳 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第22期302-310,共9页
益生菌的多样化益生作用使其在人类健康领域发挥着重要作用,基于益生菌生产的药品、食品和膳食补充剂也受到越来越多的关注。目前,研究人员致力于为药品和食品行业选育新型益生菌,以期为食品药品行业的发展提供新的思路。遗传育种为选... 益生菌的多样化益生作用使其在人类健康领域发挥着重要作用,基于益生菌生产的药品、食品和膳食补充剂也受到越来越多的关注。目前,研究人员致力于为药品和食品行业选育新型益生菌,以期为食品药品行业的发展提供新的思路。遗传育种为选育具有有益特性的益生菌菌株提供了一个很好的平台,这对提升益生菌的市场价值和人类健康具有重要意义。为了今后更好的开展益生菌育种工作,该文综述了原生质体融合、基因组重排、常压室温等离子体诱变及基因编辑技术[成簇规律间隔的短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated,CRISPR-Cas)技术和碱基编辑技术]等遗传育种技术的研究现状及在益生菌中的应用,并讨论了遗传育种的安全性,旨在为优良益生菌的选育提供参考,促进益生菌资源的开发和利用。 展开更多
关键词 益生菌 原生质体融合 基因组重排 常压室温等离子体 成簇规律间隔的短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated CRISPR-Cas) 碱基编辑
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Cautious optimism in anticipation of hepatitis B curative therapies
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作者 Alla Turshudzhyan Micheal Tadros 《World Journal of Virology》 2022年第4期212-215,共4页
Despite relative effectiveness of current hepatitis B therapies,there is still no curative agents available.The new emerging approaches hold promise to achieve cure and loss of hepatitis B surface antigen.Studies or c... Despite relative effectiveness of current hepatitis B therapies,there is still no curative agents available.The new emerging approaches hold promise to achieve cure and loss of hepatitis B surface antigen.Studies or clinical trials investigating new therapies remain small and either focus on patients with low viral load and without hepatotoxic injury or patients with hepatitis D co-infection,which makes it challenging to assess their effectiveness and side effect profile in hepatitis B population. 展开更多
关键词 Hepatitis B Hepatitis B virus Hepatitis B virus entry inhibitor Bulevirtide Transcription activator-like effector nucleases Zinc-finger nucleases Clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated 9 Nucleocapsid assembly modulators Hepatitis B virus transcription inhibitors Hepatitis B surface antigen release inhibitors
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CRISPR-Cas System for RNA Detection and Imaging 被引量:1
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作者 CHEN Siyu WANG Rujia +1 位作者 LEI Chunvang NIE Zhou 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2020年第2期157-163,共7页
The system of clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)and CRISPR-associated endonucleases(Cas)have been widely used in gene editing,disease treatment,molecular diagnosis and chromosome imaging... The system of clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)and CRISPR-associated endonucleases(Cas)have been widely used in gene editing,disease treatment,molecular diagnosis and chromosome imaging.On account of the programmable target recognition of CRISPR-Cas system and the specific targeting function toward RNA of type Ⅵ class Ⅱ Cas proteins,CRISPR-Cas system has been deployed as RNA recognition and detection tools,exhibiting promising application potentials in the field of RNA detection and imaging.In this review,we summarize the latest research progresses as well as development prospects of CRISPR-Cas system in RNA diagnosis and live cell RNA imaging. 展开更多
关键词 Clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated endonucleases(CRISPR-Cas) RNA detection RNA IMAGING COLLATERAL cleavage
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鱼类产品中嗜水气单胞菌重组酶聚合酶扩增结合CRISPR/Cas12a快速检测及耐药性分析
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作者 高子惠 曲心平 +7 位作者 凌莉 于海洋 张蕾 胡蝶 吴笛 何雨霏 郑秋月 曹际娟 《食品安全质量检测学报》 CAS 2024年第11期90-97,共8页
目的建立重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)结合簇状规则间隔短链重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated protein,CRISPR-Cas)新方法,检测鱼类产品中... 目的建立重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)结合簇状规则间隔短链重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated protein,CRISPR-Cas)新方法,检测鱼类产品中嗜水气单胞菌,并分析其耐药性。方法采用基于最新的CRISPR基因编辑技术建立RPA结合CRISPR/Cas12a新方法,快速检测嗜水气单胞菌,同时采用环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法比对两种方法的检出率。筛查嗜水气单胞菌分离株的耐药性,采用纸片扩散法测定耐药表型,采用荧光染料(SYBR green,SYBG)实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)测定耐药基因,分析耐药表型与耐药基因结果的一致性。结果在74例鱼类样品中,基于RPA-CRISPR/Cas12a和LAMP同时检测出6例嗜水气单胞菌。分析耐药性测试结果发现,分离株对5大类10种抗生素的耐药情况差异较大,耐药表型与耐药基因结果一致性较高。结论所建立的RPA-CRISPR/Cas12a方法适用于嗜水气单胞菌快速检测。而细菌耐药性的产生机制比较复杂,耐药表型的产生在一定程度上受耐药基因调控。研究结果为水产品中嗜水气单胞菌快速检测和耐药性筛查提供新思路和方法。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 重组酶聚合酶扩增 簇状规则间隔短链重复序列及其相关蛋白 环介导等温扩增 实时荧光定量聚合酶链式反应 耐药表型 耐药基因
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CRISPR-Cas系统在食源性致病菌检测中的研究进展
6
作者 郭浩宇 王瑞曦 +5 位作者 秦琳琳 王邵天 于淏芃 赵枳熒 尹丹阳 马龙 《食品安全质量检测学报》 CAS 2024年第8期154-163,共10页
食源性致病菌的快速检测对预防食源性疾病的爆发具有重要意义。成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromicrepeats,CRISPR)及CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated protein,Cas)构成的CRISPR-Cas系统... 食源性致病菌的快速检测对预防食源性疾病的爆发具有重要意义。成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromicrepeats,CRISPR)及CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated protein,Cas)构成的CRISPR-Cas系统已被广泛的应用于核酸检测,并在对食源性致病菌的检测中展现出快速、灵敏度高、特异性强等优势。本文介绍了CRISPR-Cas系统的原理、机制,总结了CRISPR-Cas系统与不同扩增方法和信号输出模式相结合在食源性致病菌检测中的应用,并讨论了这些检测方法存在的一些问题和挑战,最后对该技术的未来发展前景进行展望,旨在为食源性致病菌的快速检测提供新思路。 展开更多
关键词 成簇规律间隔短回文重复序列相关蛋白 食源性致病菌 核酸检测
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RPA-CRISPR/Cas12a在病原微生物检测中的研究进展
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作者 王文涛 赵良 +6 位作者 侯立功 张万存 孙萌 王慧英 凡雪静 陈东辉 杨辉 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2785-2796,共12页
重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)可以在恒温条件下高效扩增靶标序列以快速达到可以检测的水平,具有检测灵敏度高、检测速度快和设备依赖程度低等优点,是应用较广泛的恒温扩增技术之一。然而,RPA的非特异扩... 重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)可以在恒温条件下高效扩增靶标序列以快速达到可以检测的水平,具有检测灵敏度高、检测速度快和设备依赖程度低等优点,是应用较广泛的恒温扩增技术之一。然而,RPA的非特异扩增会导致假阳性等问题。成簇的规律间隔短回文重复序列相关蛋白12a(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/associated protein 12a,CRISPR/Cas12a)具有特异性酶切靶标双链功能,并且其最适温度与RPA反应温度相近。近年来,研究者将RPA与CRISPR/Cas12a联合对目的基因进行双重特异性识别,极大地提高了检测特异性,同时也进一步提升了检测的灵敏度,展示出检测特异性强、灵敏度高、适用范围广和操作简单等诸多优点,尤其在病原微生物检测方面展示出较大的应用前景。本文就RPA-CRISPR/Cas12a的技术原理、产物检测策略和在病原微生物检测等方面的研究进展进行综述,以期为RPA-CRISPR/Cas12a进一步开发、利用以及在病原微生物检测方面的应用提供借鉴。 展开更多
关键词 重组酶聚合酶扩增 成簇的规律间隔短回文重复序列相关蛋白12a 病原微生物 实时检测 肉眼观测 现场检测
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基于CRISPR-Cas12a系统的鼠伤寒沙门氏菌可视化检测方法的建立
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作者 林冬媛 谢龙飞 +2 位作者 李芙蓉 梁玮珩 熊文广 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第8期68-76,共9页
为了建立一种特异性强、灵敏度高的鼠伤寒沙门氏菌可视化检测方法,试验将聚合酶链式反应(PCR)与成簇的有规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated, CRISPR-... 为了建立一种特异性强、灵敏度高的鼠伤寒沙门氏菌可视化检测方法,试验将聚合酶链式反应(PCR)与成簇的有规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated, CRISPR-Cas)系统相结合,首先根据鼠伤寒沙门氏菌的spy基因序列3′末端的保守区设计crRNA及靶标序列扩增引物,根据可视化检测原理设计单链DNA(single-stranded DNA, ssDNA)荧光报告探针;然后对靶标序列进行PCR扩增,将扩增产物加入CRISPR-Cas12a系统,在蓝光下通过肉眼观察是否产生绿色荧光实现对靶标的检测;最后进行特异性试验和灵敏度试验。结果表明:建立的方法仅能检测到鼠伤寒沙门氏菌,检测不到除鼠伤寒沙门氏菌外其他血清型的沙门氏菌及大肠杆菌、巴氏杆菌、鸭疫里默氏杆菌,能检测到循环数为14个的PCR产物和0.53 copies/μL的重组质粒,灵敏度优于常规PCR方法和实时荧光定量PCR方法。说明本试验建立的方法可以实现鼠伤寒沙门氏菌的可视化检测,具有特异性强、灵敏度高的特点。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门氏菌 成簇的有规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白12a(CRISPR-Cas12a)系统 可视化 检测方法 聚合酶链式反应(PCR)
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CRISPR/Cas12a技术在动物疫病检测方面的应用
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作者 孔玉方 王慧煜 +2 位作者 袁向芬 许晓琳 吴绍强 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期92-97,共6页
CRISPR/Cas系统是由簇状规则间隔的短回文重复序列(CRISPR)和CRISPR相关蛋白(Cas)组成的一种基因编辑技术,可以特异地切割和识别靶标核酸基因。该技术具有检测速度快、灵敏度高和特异性强的优势,因此被广泛应用于动物疫病检测领域。本文... CRISPR/Cas系统是由簇状规则间隔的短回文重复序列(CRISPR)和CRISPR相关蛋白(Cas)组成的一种基因编辑技术,可以特异地切割和识别靶标核酸基因。该技术具有检测速度快、灵敏度高和特异性强的优势,因此被广泛应用于动物疫病检测领域。本文就CRISPR/Cas12a结合等温核酸扩增技术和可视化技术在动物疫病检测中的应用进行综述,并对其应用前景进行展望,以期为我国的养殖业和进境动物疫病的监测提供技术支撑。 展开更多
关键词 簇状规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白12a(CRISPR/Cas12a) 动物疫病 核酸检测 试纸条
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CRISPR/Cas系统在食品质量安全检测中的应用研究进展 被引量:5
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作者 曹菁 王梓莹 +4 位作者 汪官曌 但琨 施远国 魏波 何庆华 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第17期7052-7058,共7页
规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated,CRISPR/Cas)是基于细菌和古细菌等原核生物的一种适应性免疫系统,因其可编程性和易操作的优点已被开发为基因编辑技术... 规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated,CRISPR/Cas)是基于细菌和古细菌等原核生物的一种适应性免疫系统,因其可编程性和易操作的优点已被开发为基因编辑技术,并且凭借其快速和高效的特点被广泛用于生物、医学等领域。目前,凭借其灵敏、快速、准确和特异性强的技术优势,CRISPR/Cas系统已开始在基于核酸检测和单核苷酸多态性检测等食品安全检测技术中应用,发展迅速,具有广阔的应用前景。本文对CRISPR/Cas系统中Cas9、Casl2a和Cas13a的原理进行综述,总结其在掺假检测、溯源检测、食源性微生物和动物疫病等食品质量安全检测中的应用进展,探讨该技术目前存在的问题和局限性,并对其未来的发展进行展望,以期为CRISPR/Cas系统应用于食品质量安全的现场快速检测提供理论和技术参考。 展开更多
关键词 规律间隔成簇短回文重复序列 Cas9 Cas12a Cas13a 食品安全检测
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抗菌肽AMP-17抗白念珠菌作用靶点鉴定 被引量:1
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作者 杨隆兵 田竺青 +5 位作者 周罗雄 孙朝琴 黄明娇 田淳仁 彭建 国果 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期304-317,共14页
白念珠菌(Candida albicans)是侵袭性真菌感染的主要致病性病原体。抗菌肽AMP-17有较强的抗念珠菌活性,经AMP-17作用白念珠菌后的蛋白组学结果显示,细胞壁(XOG1)和氧化应激(SRR1)蛋白基因表达差异显著,提示AMP-17可能通过影响XOG1和SRR... 白念珠菌(Candida albicans)是侵袭性真菌感染的主要致病性病原体。抗菌肽AMP-17有较强的抗念珠菌活性,经AMP-17作用白念珠菌后的蛋白组学结果显示,细胞壁(XOG1)和氧化应激(SRR1)蛋白基因表达差异显著,提示AMP-17可能通过影响XOG1和SRR1基因发挥其抗白念珠菌作用。为进一步探究XOG1和SRR1基因是否为AMP-17的作用靶点,本研究利用规律成簇间隔短回文重复序列相关蛋白9(clustered regulatory interspaced short palindromic repeats-associated protein 9,CRISPR/Cas9)系统构建了白念珠菌xog1Δ/Δ和srr1Δ/Δ缺失菌;表型观察结果发现除XOG1基因缺失可影响白念珠菌的体外应激和菌丝形成,2个基因缺失对白念珠菌生长繁殖和生物膜形成无明显影响;药敏实验分析显示AMP-17对xog1Δ/Δ和srr1Δ/Δ缺失菌的MIC80值从野生菌的8μg/mL增至16μg/mL,而对srr1Δ/Δ::srr1回补菌的MIC80值降至野生菌水平。此外,AMP-17抑制2株缺失菌生物膜形成的能力均较野生菌明显降低,表明缺失菌在酵母态及生物膜形成过程中对AMP-17的敏感性均降低,提示XOG1和SRR1基因可能是AMP-17发挥抗白念珠菌的潜在靶点。本研究结果为进一步探讨新型肽类抗真菌药物的抗菌机制提供了一定的实验依据和基础。 展开更多
关键词 抗菌肽 AMP-17 白念珠菌 XOG1 SRR1 规律成簇间隔短回文重复序列相关蛋白9(CRISPR/Cas9)
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基于CRISPR/Cas系统的核酸即时检测技术现状及研究进展 被引量:2
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作者 冯柳 唱凯 陈鸣 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期910-916,共7页
在全球疫情背景下,现场条件下的核酸检测在疫情防控中发挥越来越重要的作用,这促使核酸即时检测(point-ofcare testing,POCT)工具的开发面临空前的需求。基于规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白系统(clustered regularly interspac... 在全球疫情背景下,现场条件下的核酸检测在疫情防控中发挥越来越重要的作用,这促使核酸即时检测(point-ofcare testing,POCT)工具的开发面临空前的需求。基于规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated nuclease,CRISPR/Cas)应用于核酸POCT在近年来得到飞速发展并取得良好成果。在疫情封控区、海关以及灾区等特殊现场,可以将恒温放大技术与CRISPR有机结合并集成到小型手持设备中,这些技术使用起来更简单,非专业人员能够更快捷准确地进行感染源的核酸检测。这篇综述首先简要介绍了CRISPR/Cas系统和不同的效应蛋白,回顾了基于CRISPR/Cas系统特异识别和切割特性在核酸POCT中的不同应用策略,最后讨论CRISPR/Cas用于核酸POCT面临的挑战及未来的研究前景。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 即时检测 核酸
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靶向叉头框蛋白J2的CRISPR/Cas9基因敲除质粒的构建及其对肝癌细胞转化生长因子β/Smads表达和增殖的影响 被引量:3
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作者 曲明娟 郑煜 +3 位作者 李延敏 宋洋 王蕾 周菊华 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期231-236,共6页
目的构建靶向叉头框蛋白J2(FOXJ2)的规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9(CRISPR/Cas9)基因敲除质粒,探讨干扰FOXJ2基因后对小鼠肝癌细胞Hepa1-6的信号通路转化生长因子β/Smads家族蛋白(TGF-β/Smads)表达和增殖的影响。方法设计小鼠... 目的构建靶向叉头框蛋白J2(FOXJ2)的规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9(CRISPR/Cas9)基因敲除质粒,探讨干扰FOXJ2基因后对小鼠肝癌细胞Hepa1-6的信号通路转化生长因子β/Smads家族蛋白(TGF-β/Smads)表达和增殖的影响。方法设计小鼠FOXJ2的小向导RNA(sgRNA)序列,与PX458载体连接并转化感受态大肠埃希菌,挑取单克隆扩增提质粒。利用脂质体将重组质粒PX458-FOXJ2-sgRNAs转染入肝癌细胞Hepa1-6,对照组只转染空载体,48 h后RT-PCR检测对Hepa1-6细胞FOXJ2的抑制作用,同时检测FOXJ2被抑制后TGF-β和Smads的表达情况;MTT法检测干扰FOXJ2后对肝癌细胞增殖能力的影响。结果成功构建3个FOXJ2的CRISPR/Cas9基因敲除质粒PX458-FOXJ2-sgRNAs,其中质粒PX458-FOXJ2-sgRNA2可以有效抑制FOXJ2的表达,同时检测到干扰了FOXJ2的细胞的TGF-β、Smad2和Smad4的表达均高于对照组,差异显著;并且FOXJ2被抑制组肝癌细胞的增殖能力明显提高。结论小鼠肝癌细胞中的FOXJ2基因在一定程度上抑制TGF-β、Smad2和Smad4基因的表达,抑制细胞的增殖,推测在体情况下,肝癌细胞的增殖和TGF-β信号通路的激活与FOXJ2基因的负调控有一定的相关性,FOXJ2可以作为肝癌预防和治疗的靶点分子进行干预。 展开更多
关键词 规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9 小向导RNA 肝癌细胞 转化生长因子Β SMADS蛋白 四甲基偶氮唑盐法 小鼠
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成簇的规律间隔的短回文重复序列/成簇的规律间隔的短回文重复序列关联系统在核酸检测中的应用进展
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作者 李宗祥 王金林 +1 位作者 王佳芮 罗继全 《医疗装备》 2022年第13期187-192,共6页
成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR关联基因(Cas)系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古生菌中的一种后天免疫系统,以消灭外来的质体或者噬菌体,其中CRISPR/Cas9、CRISPR/Cas12和CRISPR/Cas13系统在核酸检测领域得到... 成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR关联基因(Cas)系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古生菌中的一种后天免疫系统,以消灭外来的质体或者噬菌体,其中CRISPR/Cas9、CRISPR/Cas12和CRISPR/Cas13系统在核酸检测领域得到应用。该研究简要介绍了CRISPR/Cas系统的分类、作用机制及在核酸检测中的应用。 展开更多
关键词 成簇的规律间隔的短回文重复序列/成簇的规律间隔的短回文重复序列关联系统 核酸检测 应用进展
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CRISPR/Cas9系统在腺样囊性癌细胞中编辑纤连蛋白基因EDA片段的研究 被引量:1
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作者 杨月 王海丞 +3 位作者 许舒宇 彭靖 江久汇 李翠英 《中华口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期490-495,共6页
目的 利用成簇的规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(associated proteins,Cas)编辑纤连蛋白(fibronectin)基因抑制其可变剪接片段... 目的 利用成簇的规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(associated proteins,Cas)编辑纤连蛋白(fibronectin)基因抑制其可变剪接片段基因外显子A(extra domain A,EDA),并观察对腺样囊性癌(adenoid cystic carcinoma,ACC)的促肿瘤作用.方法 根据纤连蛋白序列设计两段互补于EDA上游和一段与下游互补的引导RNA (single guide RNA,sgRNA,20 bp),分别连接至PX330质粒的U6启动子下游.质粒转染至ACC细胞系SACC-83,PCR扩增基因组并测序验证其定点敲除EDA结果及效率.质粒转染后的细胞进行稳定株的筛选及鉴定,将筛选后的稳定株作为EDA敲除实验组,SACC-83细胞为对照组,进行CCK-8细胞增殖和Transwell侵袭能力检测,每组实验重复3次.结果 sgRNA连接至PX330质粒U6启动子下游,成功构建了质粒敲除模型;SACC-83的基因组EDA外显子被敲除,敲除效率达70%以上,但纤连蛋白总量未发生明显变化.筛选出3株EDA敲除稳定株(A+C-2、A+C-6、B+C-10),并通过PCR鉴定证实其可靠性.划痕实验中实验组细胞运动速率[A+C-2 (21.67±1.87) μm/h;A+C-6(12.22±2.13) μm/h;B+C-10(20.00±2.56) μm/h]相对对照组[(27.78±3.20) μm/h]降低;增殖实验显示EDA敲除组细胞倍增时间增加[对照组SACC-83 (38.52±4.26)h,实验组A+C-2(62.05±5.80)h,A+C-6(46.32±6.35)h,B+C-10(40.7±3.88)h].结论 在sgRNA的引导下,CRISPR/Cas系统能简洁、高效地敲除细胞基因组中的EDA可变剪接外显子,EDA敲除对肿瘤细胞运动和侵袭有明显抑制作用. 展开更多
关键词 腺样囊性 基因敲除 短回文重复序列/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统 基因外显子A
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利用CRISPR/Cas-9技术抑制热休克蛋白Gp96的表达对小鼠酒精性肝纤维化的影响 被引量:1
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作者 朱文枫 李三强 +3 位作者 宋晓改 郭威 杨欢 张兵兵 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期777-783,共7页
目的探讨热休克蛋白Gp96对小鼠酒精性肝纤维化的影响。方法健康雄性C57BL/6 J小鼠220只,随机分为4组:正常对照组(n=10),生理盐水+酒精诱导纤维化组(n=70)。尾静脉注射CRISPR表达质粒Gp96-sgRNA3+酒精诱导肝纤维化组(n=70),腹腔注射核因... 目的探讨热休克蛋白Gp96对小鼠酒精性肝纤维化的影响。方法健康雄性C57BL/6 J小鼠220只,随机分为4组:正常对照组(n=10),生理盐水+酒精诱导纤维化组(n=70)。尾静脉注射CRISPR表达质粒Gp96-sgRNA3+酒精诱导肝纤维化组(n=70),腹腔注射核因子κB(NF-κB)抑制剂PDTC+酒精诱导肝纤维化组(n=70)。于酒精诱导第8周眼球取血后处死各组小鼠,测定各组小鼠血清谷草转氨酶(AST)活性,HE染色检测各组小鼠肝脏病理变化,天狼猩红染色检测各组小鼠肝纤维化情况,过碘酸-雪夫(PAS)染色检测各组小鼠肝糖原变化情况;免疫印迹法检测小鼠肝脏Gp96和转化生长因子β1(TGF-β1)的表达变化。结果与正常对照组相比,其余3组AST酶活性显著上升,肝纤维化加重,糖原显著减少(P<0.01);与生理盐水+酒精组相比,注射质粒Gp96-sg RNA3+酒精组和注射NF-κB抑制剂+酒精组AST上升更为明显,肝纤维化更严重,糖原减少更多,Gp96表达显著下降,TGF-β1表达显著增加(P<0.01或P<0.05)。结论尾静脉注射CRISPR表达质粒Gp96-sgRNA3显著抑制了小鼠肝脏Gp96的表达,促进了小鼠酒精性肝纤维化程度,NF-κB信号通路对Gp96的表达起到一定的调控作用。 展开更多
关键词 热休克蛋白GP96 酒精性肝纤维化 规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9 免疫印迹法 小鼠
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成簇规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9敲除Ku80基因提高HEK293T细胞对阿霉素的敏感性
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作者 赖永平 曾金华 +2 位作者 谭雄红 柯坤 赵必星 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1437-1440,共4页
目的利用成簇规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR/Cas9)技术将293T细胞中的Ku80基因敲除,建立Ku80敲除的293T细胞株,并验证Ku80缺失对DNA损伤修复的影响以及对293T细胞阿霉素耐药性的影响。方法首先,设计识别针对靶位点... 目的利用成簇规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR/Cas9)技术将293T细胞中的Ku80基因敲除,建立Ku80敲除的293T细胞株,并验证Ku80缺失对DNA损伤修复的影响以及对293T细胞阿霉素耐药性的影响。方法首先,设计识别针对靶位点的1对DNA Oligos,利用pSpCas9(BB)-2A-Puro (PX459)质粒构建表达导向RNA(sgRNA)载体。载体转染293T细胞。通过定点聚合酶链式反应(PCR)和T7E1内切酶酶切鉴定,确认所设计的sgRNA的有效性。进一步通过细胞有限稀释法和嘌呤霉素筛选,挑选单细胞克隆进行Western blot检测筛选出稳定敲除Ku80基因的293T细胞株。最后通过定点测序确认Ku80编码基因是否发生突变。使用阿霉素处理诱导DNA损伤,以磷酸化组蛋白H2AX(γ-H2AX)为指标检测DNA损伤,同时用细胞计数试剂盒(CCK-8)检测Ku80敲除的293T细胞对阿霉素的药物敏感性。结果成功构建Ku80基因敲除的293T细胞,用阿霉素处理诱导DNA损伤并经过修复之后,对照组和Ku80敲除组γ-H2AX染色的阳性率分别为(30.67±2.49)%和(88.00±1.63)%(P=0.000),表明Ku80敲除的293T细胞的DNA损伤修复功能显著受到抑制。同时Ku80敲除显著提高293T细胞对阿霉素的敏感性,阿霉素对Ku80敲除组细胞和对照组细胞的生长抑制率分别为(53.99±1.29)%和(32.42±1.20)%(P=0.000)。结论293T细胞中敲除Ku80抑制了DNA损伤的修复和提高了细胞对阿霉素的敏感性。 展开更多
关键词 成簇规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9技术 293T细胞 Ku80基因 阿霉素
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规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9靶向Rho GDIα基因敲除质粒的构建及其对小鼠肝癌细胞系Hepa 1-6迁移的影响
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作者 曲明娟 李延敏 +3 位作者 谢静 秦苗苗 王静 周菊华 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期55-59,共5页
目的利用规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9(CRISPR/Cas9)技术构建Rho鸟苷酸解离抑制因子α(GDIα)的基因敲除载体,并探讨干扰Rho GDIα后对小鼠肝癌细胞Hepa 1-6迁移的影响。方法根据CRISPR/Cas9靶点设计原则,设计Rho GDIα的向导R... 目的利用规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9(CRISPR/Cas9)技术构建Rho鸟苷酸解离抑制因子α(GDIα)的基因敲除载体,并探讨干扰Rho GDIα后对小鼠肝癌细胞Hepa 1-6迁移的影响。方法根据CRISPR/Cas9靶点设计原则,设计Rho GDIα的向导RNA(sgRNA)序列,并与PX458载体相连,构建Rho GDIα基因敲除重组质粒PX458-Rho GDIα-sgRNA1和PX458-Rho GDIα-sgRNA2;脂质体转染法将重组质粒转染入Hepa 1-6细胞抑制Rho GDIα的基因表达;RT-PCR法检测Rho GDIα被抑制后的mRNA表达情况;划痕法检测Rho GDIα干扰后Hepa 1-6细胞迁移距离的差异;迁移小室法检测抑制Rho GDIα后Hepa 1-6细胞迁移数量的差异。结果成功构建了Rho GDIα的CRISPR/Cas9基因敲除质粒PX458-Rho GDIα-sgRNAs;转染有PX458-Rho GDIα-sgRNA1的Hepa 1-6细胞与对照组只转染空载体PX458的细胞相比,Rho GDIα的表达被明显抑制(P<0.05),而且该组细胞从划痕起始处迁移到空白处距离较远,从迁移小室上端迁移到底端数目明显增多,差异极其显著(P<0.01),说明Rho GDIα被抑制后肝癌细胞的迁移能力提高。结论CRISPR/Cas9法构建的重组质粒PX458-Rho GDIα-sgRNA1可以有效抑制Rho GDIα的基因表达;Rho GDIα被抑制后明显促进小鼠肝癌细胞Hepa 1-6的迁移,提示在体情况下,Rho GDIα的表达可能起到抑制细胞迁移的重要作用,在肿瘤组织中,可以利用过表达Rho GDIα来抑制肿瘤细胞的转移。 展开更多
关键词 规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9 鸟苷酸解离抑制因子α 向导RNA PX458质粒 肝癌细胞系Hepa 1-6 反转录聚合酶链反应 小鼠
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规律簇集间断的短回文重复序列及其相关核酸酶9系统应用于糖尿病领域的研究进展
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作者 杨帆 张丽 王双 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1144-1146,共3页
规律簇集间断的短回文重复序列及其相关核酸酶9(CRISPR/Cas9)系统是一种新型的基因编辑工具,可同时研究多个基因的功能及相互关系,已在多种疾病中显示出巨大的潜在价值。与其他基因编辑技术,如锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活样核酸酶(TALE... 规律簇集间断的短回文重复序列及其相关核酸酶9(CRISPR/Cas9)系统是一种新型的基因编辑工具,可同时研究多个基因的功能及相互关系,已在多种疾病中显示出巨大的潜在价值。与其他基因编辑技术,如锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活样核酸酶(TALENs)相比,CRISPR/Cas9更简单、高效。随着CRISPR/Cas9系统技术的广泛应用,在糖尿病领域有不少相关研究出现。本文从基础到临床对CRISPR/Cas9在糖尿病领域的研究进展作文献回顾,期待为相关人员提供参考。 展开更多
关键词 规律簇集间断的短回文重复序列及其相关核酸酶9 基因编辑 糖尿病
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利用规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9系统敲减α2δ1对人肝癌细胞系Hep-12干性的影响
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作者 何琦 赵威 张志谦 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期882-887,共6页
目的通过规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统敲减人肝癌细胞系Hep12中电压依赖性钙离子通道α2δ1的表达,观察α2δ1敲减后对肝癌细胞干性的影响。方法设计3对靶向α2δ1的向导(sgRNA),长度为20 bp,构建到lenti CRI... 目的通过规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统敲减人肝癌细胞系Hep12中电压依赖性钙离子通道α2δ1的表达,观察α2δ1敲减后对肝癌细胞干性的影响。方法设计3对靶向α2δ1的向导(sgRNA),长度为20 bp,构建到lenti CRISPRv2-puro载体上,然后在体外检测sgRNA切割活性,利用慢病毒包装系统包装含有sgRNA的重组质粒,将包装好的病毒感染Hep-12细胞,2 d后加入嘌呤霉素筛选。利用Western blotting验证α2δ1的敲减效果和干性相关基因的表达。通过成球实验检测其体外自我更新能力的变化。结果测序结果显示,sgRNA成功插入载体质粒;体外切割实验显示,3条sgRNA均有切割活性;Western blotting结果显示,α2δ1基因的表达显著降低,干性相关基因B细胞特异性莫洛尼白血病病毒插入位点1(BMI1)和Nanog的表达显著被抑制;无血清培养基成球实验结果表明,敲减α2δ1导致Hep-12细胞的体外自我更新能力减弱。结论利用CRISPR/Cas9技术成功构建敲除α2δ1基因的Hep-12细胞系;敲除α2δ1基因后能抑制Hep-12细胞肿瘤干细胞样特性。 展开更多
关键词 α2δ1 规律间隔成簇短回文重复序列/相关蛋白9 肝癌干细胞 基因敲减 自我更新 免疫印迹法
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