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rDNA-ITS序列分析在真菌鉴定中的应用 被引量:136
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作者 燕勇 李卫平 +3 位作者 高雯洁 沈志英 王恒辉 陈黎霞 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第10期1958-1961,共4页
目的:通过对3株真菌的rDNA-ITS序列进行分析,以探讨、说明基于核糖体RNA基因(即rDNA)内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)的多态性的序列分析(rDNA-ITS序列分析)在真菌鉴定中的应用。方法:通过PCR扩增与测序的方法测得待检... 目的:通过对3株真菌的rDNA-ITS序列进行分析,以探讨、说明基于核糖体RNA基因(即rDNA)内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)的多态性的序列分析(rDNA-ITS序列分析)在真菌鉴定中的应用。方法:通过PCR扩增与测序的方法测得待检真菌菌株的rDNA-ITS序列,从GENBANK获取相似序列,使用BLAST和DNAMAN工具对rDNA-ITS序列进行比对分析。结果:1号真菌菌株与Xylariales sp.LM40(属炭角菌目)同源性高,但尚不能鉴定到具体的属、种;2号真菌菌株可鉴定到种,为草酸青霉Penicillium oxalicum;3号真菌菌株可鉴定到种内组水平,为近平滑假丝酵母III组(最新命名为Candida metapsilosis)。结论:相对于传统的真菌形态学鉴定方法,rDNA-ITS序列分析用于真菌鉴定更客观、省时、简便、快速,但目前也存在一定的应用限制(受基因库的完善程度、高度同源性序列的多少以及具体物种ITS区的可变程度等影响)并不能鉴定出所有真菌,宜与传统的形态学鉴定方法相结合用于真菌鉴定。 展开更多
关键词 rdna 内转录间隔区(ITS) PCR 测序 真菌 鉴定
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养殖刺参腐皮综合征病原菌的分离与鉴定 被引量:118
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作者 张春云 王印庚 荣小军 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期118-123,共6页
2003年春季,山东省青岛地区刺参养殖场暴发了较为严重的传染性疾病-“腐皮综合征”,该病引起的死亡造成约30%的损失。养殖刺参的发病症状表现为:厌食、摇头、肿嘴、排脏、身体萎缩、口部溃烂乃至体表大面积溃疡。从患病个体溃疡部位分... 2003年春季,山东省青岛地区刺参养殖场暴发了较为严重的传染性疾病-“腐皮综合征”,该病引起的死亡造成约30%的损失。养殖刺参的发病症状表现为:厌食、摇头、肿嘴、排脏、身体萎缩、口部溃烂乃至体表大面积溃疡。从患病个体溃疡部位分离得到一种优势细菌KL1,KL1经人工回接感染实验证明对健康刺参具有较强的致病性,且感染病参的症状与自然发病海参的症状相同。通过形态学、生理生化和16SrDNA分子生物学方法对该菌进行的分类鉴定表明,导致养成刺参“腐皮综合征”的致病菌是灿烂弧菌(Vibriosplendidus)。本文首次揭示了该地区“腐皮综合征”导致养成刺参大规模死亡的致病原因,对刺参病害防治和健康养殖具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 刺参 海水养殖 疾病 细菌 腐皮综合征 16S rdna
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核糖体rDNAITS序列在真菌学研究中的应用 被引量:68
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作者 匡治州 许杨 《生命的化学》 CAS CSCD 2004年第2期120-122,共3页
rDNA序列的同源性和变化性使其用于真菌各级水平的系统学研究 ,其中ITS区进化速率较快、长度适中 ,广泛用于属内种间或种内群体的系统学研究。该文就rDNA序列结构特点、ITS序列在真菌分子系统学及病原学中的应用等方面进行综述。
关键词 rdna ITS 分子系统学 真菌
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冬虫夏草无性型的分子鉴别 被引量:78
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作者 赵锦 王宁 +2 位作者 陈月琴 李泰辉 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期121-123,共3页
采用分子生物学手段,以rDNAITS区为分子指标,对冬虫夏草Cordycepssinensis的有性和无性阶段进行比较分析,从分子水平证明冬虫夏草的无性阶段是中国被子毛孢Hirsutelasinensis.
关键词 冬虫夏草 无性型 rdna ITS区 分子鉴别 麦角菌目
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红树林土壤细菌群落16SrDNAV3片段PCR产物的DGGE分析 被引量:64
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作者 王岳坤 洪葵 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期201-204,共4页
从土壤中抽提微生物总DNA ,直接扩增 16SrDNAV3片段 ,应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和分子克隆技术分析 16SrDNAV3片段的多态性 ,发现地域因素和红树品种都是影响土壤细菌群落结构的因素。通过对杯萼海桑土壤 16SrDNAV3片段PCR产物两个D... 从土壤中抽提微生物总DNA ,直接扩增 16SrDNAV3片段 ,应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和分子克隆技术分析 16SrDNAV3片段的多态性 ,发现地域因素和红树品种都是影响土壤细菌群落结构的因素。通过对杯萼海桑土壤 16SrDNAV3片段PCR产物两个DGGE条带进行分子克隆、序列测定和Blast分析 ,发现每个DGGE条带包含着许多不同的 16SrDNAV3片段 ,并且其中多数为NCBI未收录的序列。这表明DGGE和克隆技术相结合的方法是研究土壤微生物群落结构的一种可行方法。 展开更多
关键词 红树林土壤 16S rdna DGGE
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PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究 被引量:78
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作者 赵兴青 杨柳燕 +6 位作者 陈灿 肖琳 蒋丽娟 马喆 朱昊巍 于振洋 尹大强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期3610-3616,共7页
采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构,研究结果表明,三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp,为16S rDNA V3~V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中... 采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构,研究结果表明,三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp,为16S rDNA V3~V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20种优势菌群,且同一湖泊不同采样点DGGE图谱的差异性不大,细菌群落结构具有较高的相似性,而太湖样品DGGE条带的数目和位置表现出明显差异,且不同采样点图谱的差异性较大。三湖泊除具有特征性的微生物种属外,还分布约5个相同的细菌种群,可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关。对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序,结果显示其优势菌群具有不同的序列组成,其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99%,2个序列的同源性为96%和93%,其中2个相似的细菌类群目前尚未获得纯培养。 展开更多
关键词 沉积物 微生物多样性 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 16S rdna 序列测定
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松材线虫rDNA的测序和 PCR-SSCP分析 被引量:63
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作者 张立海 廖金铃 冯志新 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期84-89,共6页
本文为克服形态鉴定的不足 ,用分子生物学的方法鉴别松材线虫。线虫核糖体 DNA(r DNA)的内部转录间隔区 (ITS1)区 (约 30 8bp)的测序结果显示 :松材线虫种内区别很小 ,不超过 1bp;拟松材线虫种内区别较大 ,最大达 7bp;这 2种线虫的种间... 本文为克服形态鉴定的不足 ,用分子生物学的方法鉴别松材线虫。线虫核糖体 DNA(r DNA)的内部转录间隔区 (ITS1)区 (约 30 8bp)的测序结果显示 :松材线虫种内区别很小 ,不超过 1bp;拟松材线虫种内区别较大 ,最大达 7bp;这 2种线虫的种间区别为 32~ 39bp。根据以上测序结果 ,本文结合单条线虫 DNA的提取技术 ,对 14个松材线虫和拟松材线虫样本进行了单链构象多态性 (PCR-SSCP)分析 ,结果表明 PCR- SSCP分析技术可明确区分这 2种线虫 ,该技术可为单条松材线虫的鉴定提供一套灵敏而可靠的方法。 展开更多
关键词 松材线虫 测序 核糖体DNA ITS PCR-SSCP分析 鉴定方法 森林病害
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核酸序列直接分析在真菌鉴定方面的应用 被引量:66
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作者 张志华 洪葵 《华南热带农业大学学报》 2006年第2期39-43,共5页
综述核酸序列直接分析在真菌分类鉴定方面的基础理论及特点,介绍核酸序列直接分析在真菌鉴定方面的应用及常用的引物,比较真菌分类鉴定中常用的18SrDNA,ITS分子生物学方法。
关键词 真菌鉴定 核酸序列直接分析 18S rdna ITS
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不同16SrDNA靶序列对DGGE分析活性污泥群落的影响 被引量:66
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作者 邢德峰 任南琪 +2 位作者 宋佳秀 曲敏 徐香玲 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第7期1424-1428,共5页
为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16... 为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16S rDNA序列,用DGGE分离PCR扩增产物.研究表明采用不同引物对进行DGGE分析时,群落多样性和动态存在显著的差异.341f/534r和968f/1 401r的靶序列分离效果较好,341f/926r的靶序列分离效果较差.引物341f/534r和341f/926r DGGE图谱显示S2和S3相似性高,引物968f/1 401r DGGE图谱显示S1和S2相似性高.由此可见采用不同引物对进行DGGE分析时,群落结构之间的相似性和动态是不一致的.341f/534r的DGGE图谱中条带丰富,多样性最好,968f/1 401r的DGGE图谱次之,341f/926r DGGE图谱条带最少,多样性也较差.因此,在利用DGGE分析活性污泥样品时采用引物341f/534r和968f/1 401r是比较适宜的. 展开更多
关键词 DGGE 16S rdna 活性污泥 群落动态 群落多样性
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F型、H型居群的铁皮石斛rDNAITS区序列差异及SNP现象的研究 被引量:63
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作者 丁小余 王峥涛 +3 位作者 徐珞珊 徐红 周开亚 施国新 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期85-89,共5页
目的 :研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNAITS碱基序列的差异。方法 :运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rDNAITS区 (包括ITS1,5 .8SrDNA ,ITS2 )碱基序列进行了序列测定。结果 :在铁皮石斛各居群中 ,F型居群与H... 目的 :研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNAITS碱基序列的差异。方法 :运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rDNAITS区 (包括ITS1,5 .8SrDNA ,ITS2 )碱基序列进行了序列测定。结果 :在铁皮石斛各居群中 ,F型居群与H型居群植株的rDNAITS区碱基序列有 2个位点差异 ,且变异分别发生在ITS1区及 5 .8S区内。研究表明 :铁皮石斛居群内部rDNAITS区的差异与植物生活型的差异呈一定的相关性 ,H型居群的铁皮石斛是F型的变种。在F型与H型居群间 ,其 5 .8SrDNA区存在单核苷酸多态 (SNP)现象。首次报道了铁皮石斛ITS区的碱基序列 ,ITS区总长度为 6 34bp ,其中ITS1为 2 31bp ,5 .8S为 16 3bp ,ITS2为 2 4 0bp。结论 :rDNAITS区碱基序列的比较分析进一步证明铁皮石斛F型居群与H型居群间具有显著的差异性。 展开更多
关键词 铁皮石斛 rdna ITS区 DNA序列 单核苷酸多态 居群差异
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养殖大菱鲆溃疡症病原菌的分离鉴定及系统发育分析 被引量:67
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作者 范文辉 黄倢 +2 位作者 王秀华 史成银 刘莉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期665-670,共6页
2004年夏季山东海阳一带养殖大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)暴发溃疡病。症状主要表现为体表病灶部位出血、肌肉溃烂、眼球凸出等,解剖可见鳃丝贫血,肝脏充血,肾脏和胆囊肿大,肠壁充血并呈透明状,从出现发病症状起,大约一周后开始出现... 2004年夏季山东海阳一带养殖大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)暴发溃疡病。症状主要表现为体表病灶部位出血、肌肉溃烂、眼球凸出等,解剖可见鳃丝贫血,肝脏充血,肾脏和胆囊肿大,肠壁充血并呈透明状,从出现发病症状起,大约一周后开始出现死亡。从病鱼体表溃疡部位及内脏分离出优势菌并命名为H1,经人工感染证实H1即为引起本次养殖大菱鲆体表溃疡症的病原菌。对病原菌进行鉴定揭示该菌革兰氏染色阴性,菌体呈短杆状,极生单鞭毛。综合该菌在形态、生理生化、API20NE与API20E自动鉴定结果、16S rDNA同源性等方面的特性,确认H1为哈维氏弧菌(Vibrio harveyi),该菌对呋喃妥因、菌必治等多种抗生素敏感。哈维氏弧菌是海水养殖鱼类的常见致病菌,但作为养殖大菱鲆的病原菌属首次报道。 展开更多
关键词 哈维氏弧菌 大菱鲆 溃疡症 病原菌 16S rdna
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真菌rDNA的特点及在外生菌根菌鉴定中的应用 被引量:58
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作者 林晓民 李振岐 王少先 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期120-125,共6页
核糖体DNA(rDNA)是真菌基因组中的一类中度或高度重复序列,每一重复单位包括高度保守、中度保守和不保守三类区段,在真菌的系统发育分析和分类鉴定中,rDNA是很重要的靶序列。本文主要评述了真菌rDNA的结构特点及应用,特别是内转录间隔区... 核糖体DNA(rDNA)是真菌基因组中的一类中度或高度重复序列,每一重复单位包括高度保守、中度保守和不保守三类区段,在真菌的系统发育分析和分类鉴定中,rDNA是很重要的靶序列。本文主要评述了真菌rDNA的结构特点及应用,特别是内转录间隔区(ITS)在外生菌根菌鉴定上的应用,并对一些名词概念进行了讨论。 展开更多
关键词 外生菌根菌 rdna 真菌 应用 定中 高度重复序列 系统发育分析 内转录间隔区 结构特点 基因组 核糖体 靶序列
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四君子汤对脾虚大鼠肠道菌群多样性的影响 被引量:76
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作者 孟良艳 陈秀琴 +2 位作者 石达友 黄海定 郭世宁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期2029-2035,共7页
探讨四君子汤对脾虚大鼠肠道菌群多样性的影响。将48只大鼠随机分为空白组、模型组、中药四君子汤组、柳氮磺吡啶肠溶片(SASP)组,每组12只。将除空白组外的其余各组大鼠用利血平法造脾虚模型。然后给四君子汤、SASP分别灌胃治疗后,通过1... 探讨四君子汤对脾虚大鼠肠道菌群多样性的影响。将48只大鼠随机分为空白组、模型组、中药四君子汤组、柳氮磺吡啶肠溶片(SASP)组,每组12只。将除空白组外的其余各组大鼠用利血平法造脾虚模型。然后给四君子汤、SASP分别灌胃治疗后,通过16SrDNA测序法分析肠道菌群多样性变化。结果表明:与模型组比较,四君子汤组中的肠道菌群多样性明显升高,但与西药组中的肠道菌群多样性有差异。四君子汤能通过改善肠道菌群的多样性调理脾虚证。 展开更多
关键词 四君子汤 脾虚 肠道菌群 16S rdna
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黄芪多糖对肥胖小鼠的减肥作用与调节肠道菌群的关系研究 被引量:68
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作者 何旭云 贺姣姣 +2 位作者 郑宁宁 王顺春 李后开 《世界中医药》 CAS 2016年第11期2379-2384,2388,共7页
目的:观察黄芪多糖(Astragalus Polysaccharides,APS)对于高脂饮食诱导的肥胖小鼠的减肥作用与调节肠道菌群的关系。方法:1)将50只C57bl/6J小鼠随机分为5组(n=10),分别为正常对照组(Con)、HFD(high-fat diet)组和APS低中高(在高脂饮食... 目的:观察黄芪多糖(Astragalus Polysaccharides,APS)对于高脂饮食诱导的肥胖小鼠的减肥作用与调节肠道菌群的关系。方法:1)将50只C57bl/6J小鼠随机分为5组(n=10),分别为正常对照组(Con)、HFD(high-fat diet)组和APS低中高(在高脂饮食中添加分别添加2%,4%,或8%的APS)剂量组。利用高脂饮食连续喂养8周诱导出小鼠肥胖模型,给药组同步喂养,每周进行称重。实验周期结束后,收集各组粪便样本,利用基于细菌16S r DNA测序的元基因组学方法,分析了APS对于高脂喂养小鼠肠道菌的影响。2)将10只C57bl/6J小鼠随机分为2组(n=5),分别为HFD_R组(HFD_Receptor)和APS_R组(APS_Receptor),每天分别灌胃来自HFD组和APS低剂量组(2%APS)小鼠的新鲜粪便提取液进行肠道菌移植,前八周给予正常饮食,后四周更换为HFD。结果:APS能够明显抑制高脂喂养小鼠肥胖的形成、减轻肝脏脂肪变性、降低肝脏TG水平、改善胰岛素敏感性、显著恢复高脂喂养小鼠的肠道菌群紊乱,增加拟杆菌(Bacteroidetes)与厚壁门(Firmicutes)菌的相对丰度、降低变形菌门(Proteobacteria)细菌的相对丰度,并且,APS的减肥效应能够通过肠道菌移植转移给高脂喂养受体小鼠。结论:APS对高脂喂养小鼠具有减肥作用,且APS的减肥作用与调节肥胖小鼠的肠道菌群有关。 展开更多
关键词 黄芪多糖 肥胖 肠道菌群 胰岛素敏感性 脂肪变性 16S rdna
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一株溶藻细菌的分离鉴定及其溶藻特性 被引量:62
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作者 裴海燕 胡文容 +2 位作者 曲音波 母锐敏 李小彩 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期796-802,共7页
从对藻类及藻毒素有良好去除作用的海绵固定化微生物系统中分离到一株溶藻细菌P0 7,对该菌溶解铜绿微囊藻(Microcystisaeruginosa)、栅藻(Scenedesmus)及小球藻(Chlorella)的效果、溶藻方式进行了研究,利用16SrDNA序列分析对其进行了鉴... 从对藻类及藻毒素有良好去除作用的海绵固定化微生物系统中分离到一株溶藻细菌P0 7,对该菌溶解铜绿微囊藻(Microcystisaeruginosa)、栅藻(Scenedesmus)及小球藻(Chlorella)的效果、溶藻方式进行了研究,利用16SrDNA序列分析对其进行了鉴定.结果表明,该菌株不但对铜绿微囊藻具有良好的溶解效果,而且对淡水中常见的栅藻及小球藻也具有良好的去除作用.初始菌浓度越大,溶藻效果越明显,达到最佳溶藻效果的时间越短.当菌浓度为2 . 4×10 7个·mL- 1 时,3d后铜绿微囊藻的去除率可达到81 .67% .该菌溶藻无需菌体与藻细胞直接接触,是通过分泌某种非蛋白质类物质溶藻.该菌革兰氏染色呈阳性,可运动;不能利用大多数常见碳源.16SrDNA序列分析表明,P0 7菌株与多株芽孢杆菌的16SrDNA核苷酸序列的同源性均在99. 7%以上,归属于芽孢杆菌属. 展开更多
关键词 溶藻细菌 溶藻特性 16S rdna 芽孢杆菌
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产广谱细菌素乳酸菌的筛选和鉴定 被引量:59
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作者 张艾青 刘书亮 敖灵 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期753-756,共4页
以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、藤黄微球菌、铜绿假单胞杆菌和枯草芽孢杆菌为指示菌,从分离自四川传统发酵食品中的267株乳酸菌中,采用平板打孔法初筛、牛津杯法复筛(排除酸、过氧化氢干扰以及胰蛋白酶和木瓜蛋白酶处理),筛选出1株分离... 以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、藤黄微球菌、铜绿假单胞杆菌和枯草芽孢杆菌为指示菌,从分离自四川传统发酵食品中的267株乳酸菌中,采用平板打孔法初筛、牛津杯法复筛(排除酸、过氧化氢干扰以及胰蛋白酶和木瓜蛋白酶处理),筛选出1株分离自醪糟的具有较强抑菌作用的产广谱细菌素的乳杆菌菌株P158,结合形态学、生理生化特性和16S rDNA序列同源性分析,该菌株被鉴定为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)。 展开更多
关键词 乳酸菌 细菌素 抑菌实验 16S rdna
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一株牙鲆皮肤溃烂症病原菌的鉴定 被引量:48
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作者 莫照兰 茅云翔 +1 位作者 陈师勇 张培军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期263-269,共7页
从山东荣成养鱼场发病牙鲆分离到一株病原菌M3 ,革兰氏阴性 ,杆状 ,能运动 ,菌落半透明 ,用BIOLOG细菌鉴定系统不能鉴定。通过 1 6SrDNA序列分析和同源性检索发现M3菌株与弧菌属的同源性较高 ,为 94%~ 98%。系统发育学分析表明菌株M3... 从山东荣成养鱼场发病牙鲆分离到一株病原菌M3 ,革兰氏阴性 ,杆状 ,能运动 ,菌落半透明 ,用BIOLOG细菌鉴定系统不能鉴定。通过 1 6SrDNA序列分析和同源性检索发现M3菌株与弧菌属的同源性较高 ,为 94%~ 98%。系统发育学分析表明菌株M3与鳗弧菌关系最近 ,相似性为 99 6 % ,其生化性状也和鳗弧菌的特征相似 ,故可把M3定为鳗弧菌 (Vibrioan guillarum)。 展开更多
关键词 牙鲆 皮肤溃烂症 病原菌 鉴定 鳗弧菌 16S rdna 系统发育
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生态养猪模式中发酵床优势细菌的微生物学性质及其应用研究 被引量:62
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作者 张庆宁 胡明 +5 位作者 朱荣生 任相全 武英 王怀忠 刘玉庆 王述柏 《山东农业科学》 2009年第4期99-105,共7页
从生态养猪模式的发酵床中分离纯化到14株优势好氧细菌,通过形态学、16S rDNA序列分析和同源性比较,鉴定均为芽孢杆菌属不同的种。发酵试验和饲养试验表明,这些菌株在猪粪和垫料组成的发酵床生长优势强,耐发酵高热,能够产生多种与猪粪... 从生态养猪模式的发酵床中分离纯化到14株优势好氧细菌,通过形态学、16S rDNA序列分析和同源性比较,鉴定均为芽孢杆菌属不同的种。发酵试验和饲养试验表明,这些菌株在猪粪和垫料组成的发酵床生长优势强,耐发酵高热,能够产生多种与猪粪降解相关的酶类,除臭效果明显;对某些病原菌具有抑制作用,对猪安全并有促进生长的功能,随着在发酵床饲养时间的延长,从对应猪分离的大肠杆菌的抗药性逐渐降低。生态养猪模式是安全环保节约的饲养模式,可以降低大肠杆菌的抗药性,减少药残。 展开更多
关键词 发酵床养殖 芽孢杆菌 16S rdna 降解猪粪 抗药性
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小麦禾谷胞囊线虫(Heterodera avenae)的核糖体基因(rDNA)限制性片段长度多态性研究 被引量:46
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作者 彭德良 S.Subbotin M.Moens 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期323-329,共7页
采用PCR技术扩增出中国和摩洛哥禾谷胞囊线虫群体的核糖体基因 (rDNA)的内转录间隔区 (ITS)片段的长度约为 10 6 0bp。用 11种限制性内切酶 (RE)酶切禾谷胞囊线虫ITS扩增产物 ,共产生 2 7个酶切片段。用AluI和RsaI酶切ITS扩增产物证明... 采用PCR技术扩增出中国和摩洛哥禾谷胞囊线虫群体的核糖体基因 (rDNA)的内转录间隔区 (ITS)片段的长度约为 10 6 0bp。用 11种限制性内切酶 (RE)酶切禾谷胞囊线虫ITS扩增产物 ,共产生 2 7个酶切片段。用AluI和RsaI酶切ITS扩增产物证明中国禾谷胞囊线虫ITS属于“B型” ,而摩洛哥禾谷胞囊线虫ITS属于“A型”。用HinfI酶切后 ,7个中国禾谷胞囊线虫群体产生 2个RFLP片段 (86 0和 2 0 0bp) ,而摩洛哥群体产生 3个RFLP片段 (5 2 0、340和 2 0 0bp) ,HinfI揭示出中国与摩洛哥禾谷胞囊线虫ITS之间存在差异。AvaI和HindIII不能酶切禾谷胞囊线虫ITS。用CfoI、Bsh12 36I、MsrFI、ScrFI、HaeIII和MvaI 6种RE酶切中国和摩洛哥禾谷胞囊线虫群体的rDNA ITS ,均分别得到相同类型的RFLP分布型 ,因此这 6种RE不能揭示中国与摩洛哥群体的rDNA ITS的差异。 展开更多
关键词 小麦 禾谷胞囊线虫 Heterodera-avenae 核糖体基因 rdna 限制性 片段长度 多态性
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PCR-DGGE技术解析针叶和阔叶凋落物混合分解对土壤微生物群落结构的影响 被引量:54
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作者 陈法霖 张凯 +3 位作者 郑华 林学强 欧阳志云 屠乃美 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期145-150,共6页
为深入理解凋落物类型和微生物群落之间的相互关系,通过小盆+凋落袋控制实验,运用PCR-DGGE技术解析了南方红壤丘陵区典型针叶树种马尾松和湿地松的凋落物分别与白栎、青冈两个阔叶树种凋落物混合分解对土壤微生物基因型多样性的影响.结... 为深入理解凋落物类型和微生物群落之间的相互关系,通过小盆+凋落袋控制实验,运用PCR-DGGE技术解析了南方红壤丘陵区典型针叶树种马尾松和湿地松的凋落物分别与白栎、青冈两个阔叶树种凋落物混合分解对土壤微生物基因型多样性的影响.结果表明:1)针叶凋落物中加入阔叶后细菌群落结构未发生显著变化,将所有处理归为一类的相似度达72%,其差异仅表现在马尾松+白栎和湿地松+青冈处理土壤微生物群落16S rDNA的丰富度和多样性分别显著高于单一马尾松和湿地松;2)针叶凋落物中加入阔叶后真菌群落结构发生了显著变化,单一针叶处理与针阔混合处理间18S rDNA基因泳道带型的相似度只有28%,并且单一马尾松处理土壤18S rDNA的丰富度和多样性显著高于马尾松+白栎和马尾松+青冈,单一湿地松处理土壤18S rDNA的丰富度也显著高于湿地松+白栎和湿地松+青冈,多样性显著高于湿地松+白栎处理;3)土壤真菌18S rDNA的丰富度与凋落物初始C含量呈显著正相关,与凋落物初始N含量呈显著负相关.针叶凋落物中引入阔叶凋落物后,增加了凋落物中N的比重,C的比重则下降,显著影响了土壤真菌群落的结构. 展开更多
关键词 森林凋落物 混合分解 土壤微生物 群落结构 16S rdna 18S rdna 多样性 DGGE
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