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降解多环芳烃的菌株Gordonia sp.He4的分离鉴定及其在菲污染土壤修复过程中的动态变化
被引量：
21
1
作者
刘磊
李习武
+1 位作者
刘双江
刘志培
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期617-622,共6页
从石油污染土壤中分离得到1株降解石油烃类污染物的He4菌株.该菌株能够以正十六烷、苯、萘、蒽、菲和芘作为唯一的碳源生长.经过对其形态特征、生理生化、以及16SrRNA基因序列分析,该菌株初步鉴定为Gordoniasp..通过分析其16SrRNA基因序...
从石油污染土壤中分离得到1株降解石油烃类污染物的He4菌株.该菌株能够以正十六烷、苯、萘、蒽、菲和芘作为唯一的碳源生长.经过对其形态特征、生理生化、以及16SrRNA基因序列分析,该菌株初步鉴定为Gordoniasp..通过分析其16SrRNA基因序列,设计引物并构建了竞争性模板.通过竞争性定量PCR(quantitative competitive-PCR)分析了该菌株在含有菲的污染土壤中数量的变化.结果表明,部分菌株He4在土壤中转变为不可培养状态,采用传统的稀释涂布菌落计数法(CFU)无法对其进行定量,而通过QC-PCR能够较准确地测定土壤中微生物的动态变化.
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关键词
多环芳烃
生物降解
生物修复
qc
—
pcr
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职称材料
宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法建立
被引量：
4
2
作者
王恒波
郭晋隆
+3 位作者
陈平华
阙友雄
陈如凯
许莉萍
《热带作物学报》
CSCD
2009年第10期1511-1516,共6页
利用宿根矮化病菌的特异检测引物,构建竞争定量PCR检测的非同源模板,建立宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法。实验中非同源模板(竞争模板)构建是采用PCR方法对大肠杆菌基因组进行低严谨度扩增,回收合适的DNA片段并将其构建到T-esay载体...
利用宿根矮化病菌的特异检测引物,构建竞争定量PCR检测的非同源模板,建立宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法。实验中非同源模板(竞争模板)构建是采用PCR方法对大肠杆菌基因组进行低严谨度扩增,回收合适的DNA片段并将其构建到T-esay载体上,通过测序和序列比对,除两端引物序列完全相似外,其余部分没有同源性,因此可以作为定量检测的非同源模板。通过计算非同源模板的拷贝数,进行竞争定量PCR检测宿根矮化病,建立宿根矮化病菌的标准竞争曲线和直线回归方程。本研究建立的竞争定量PCR检测方法操作简单、特异性和敏感性高,适合于宿根矮化病菌的检测,并可为其它病菌竞争定量PCR检测方法的建立提供参考。
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关键词
甘蔗
宿根矮化病菌
非同源模板
竞争定量
pcr
检测
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职称材料
应用循环逆转录PCR技术检测丙型肝炎病毒RNA
被引量：
3
3
作者
陈燃
伍迪
+2 位作者
唐榕
汪进
毛裕民
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2000年第3期266-269,共4页
循环逆转录 (circulatoryreversetranscription ,CRT)是线性增长逆转录cDNA产量的一种新技术。为了将该技术用于检测HCVRNA ,通过改变CRT的循环次数 ,结合竞争PCR ,作出标准曲线。采用 16次CRT加 34次循环PCR检测了 136例HCVELISA阳性、...
循环逆转录 (circulatoryreversetranscription ,CRT)是线性增长逆转录cDNA产量的一种新技术。为了将该技术用于检测HCVRNA ,通过改变CRT的循环次数 ,结合竞争PCR ,作出标准曲线。采用 16次CRT加 34次循环PCR检测了 136例HCVELISA阳性、5 4例HCVELISA阴性和 10 8例临床可疑病人全血标本 ,并与逆转录PCR(RT -PCR)和巢式PCR (NT -PCR)的检测结果相比较 ,显示HCVRNA总检出率分别为 :5 7 9%、35 6 %、5 8 6 %。结果提示 ,CRT -PCR是一种简便有效的提高RNA检测灵敏度的方法 。
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关键词
循环逆转录
RT-
pcr
HCV
竞争定量
pcr
丙型肝炎病
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职称材料
猪圆环病毒2型竞争定量PCR检测方法的建立及应用
被引量：
1
4
作者
司兴奎
郭鑫
杨汉春
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1115-1117,共3页
根据猪圆环病毒2型(PCV2)BF的序列设计引物,扩增472bp的ORF2部分基因片段,并克隆到pGEM-T载体中,构建含PCV2-ORF2部分基因片段的重组质粒。利用XbaⅠ限制性内切酶消化后获得共用同1对引物但缺失196bp的竞争重组子。通过重组质粒与竞争...
根据猪圆环病毒2型(PCV2)BF的序列设计引物,扩增472bp的ORF2部分基因片段,并克隆到pGEM-T载体中,构建含PCV2-ORF2部分基因片段的重组质粒。利用XbaⅠ限制性内切酶消化后获得共用同1对引物但缺失196bp的竞争重组子。通过重组质粒与竞争重组子间的竞争定量PCR方法(qc-PCR),建立猪PCV2-ORF2的标准竞争曲线和直线回归方程,并对PCV2试验感染猪血清中PCV2核酸的动态变化进行了研究。
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关键词
猪圆环病毒2型
竞争定量
pcr
病毒含量
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职称材料
题名
降解多环芳烃的菌株Gordonia sp.He4的分离鉴定及其在菲污染土壤修复过程中的动态变化
被引量：
21
1
作者
刘磊
李习武
刘双江
刘志培
机构
中国科学院微生物研究所
出处
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期617-622,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863)项目(2002AA601150)
中国科学院百人计划项目(BRJH-200)
文摘
从石油污染土壤中分离得到1株降解石油烃类污染物的He4菌株.该菌株能够以正十六烷、苯、萘、蒽、菲和芘作为唯一的碳源生长.经过对其形态特征、生理生化、以及16SrRNA基因序列分析,该菌株初步鉴定为Gordoniasp..通过分析其16SrRNA基因序列,设计引物并构建了竞争性模板.通过竞争性定量PCR(quantitative competitive-PCR)分析了该菌株在含有菲的污染土壤中数量的变化.结果表明,部分菌株He4在土壤中转变为不可培养状态,采用传统的稀释涂布菌落计数法(CFU)无法对其进行定量,而通过QC-PCR能够较准确地测定土壤中微生物的动态变化.
关键词
多环芳烃
生物降解
生物修复
qc
—
pcr
Keywords
polycyclic
aromatic
compounds
biodegradation
bioremediation
quantitative
competitive pcr
（
qc
-
pcr
）
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法建立
被引量：
4
2
作者
王恒波
郭晋隆
陈平华
阙友雄
陈如凯
许莉萍
机构
福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2009年第10期1511-1516,共6页
基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(No.nycytx-24)
农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(No.2006-G37)
+3 种基金
国家"863"计划项目(No.2007AA100701)
福建省科技计划重点项目(No.2007I0036)
福建省自然科学基金项目(No.2009J05050)
福建科技项目备案(No.F2007AA100701)资助
文摘
利用宿根矮化病菌的特异检测引物,构建竞争定量PCR检测的非同源模板,建立宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法。实验中非同源模板(竞争模板)构建是采用PCR方法对大肠杆菌基因组进行低严谨度扩增,回收合适的DNA片段并将其构建到T-esay载体上,通过测序和序列比对,除两端引物序列完全相似外,其余部分没有同源性,因此可以作为定量检测的非同源模板。通过计算非同源模板的拷贝数,进行竞争定量PCR检测宿根矮化病,建立宿根矮化病菌的标准竞争曲线和直线回归方程。本研究建立的竞争定量PCR检测方法操作简单、特异性和敏感性高,适合于宿根矮化病菌的检测,并可为其它病菌竞争定量PCR检测方法的建立提供参考。
关键词
甘蔗
宿根矮化病菌
非同源模板
竞争定量
pcr
检测
Keywords
sugarcane
ratoon
stunning
disease
heterologous
template
quantitative
competitive pcr
（
qc
-
pcr
）
detection
分类号
S432.42 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
应用循环逆转录PCR技术检测丙型肝炎病毒RNA
被引量：
3
3
作者
陈燃
伍迪
唐榕
汪进
毛裕民
机构
复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2000年第3期266-269,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目!(批准号 :3 970 0 0 82 )
文摘
循环逆转录 (circulatoryreversetranscription ,CRT)是线性增长逆转录cDNA产量的一种新技术。为了将该技术用于检测HCVRNA ,通过改变CRT的循环次数 ,结合竞争PCR ,作出标准曲线。采用 16次CRT加 34次循环PCR检测了 136例HCVELISA阳性、5 4例HCVELISA阴性和 10 8例临床可疑病人全血标本 ,并与逆转录PCR(RT -PCR)和巢式PCR (NT -PCR)的检测结果相比较 ,显示HCVRNA总检出率分别为 :5 7 9%、35 6 %、5 8 6 %。结果提示 ,CRT -PCR是一种简便有效的提高RNA检测灵敏度的方法 。
关键词
循环逆转录
RT-
pcr
HCV
竞争定量
pcr
丙型肝炎病
Keywords
circulatory
reverse
transcription
(CRT)
RT
-
pcr
HCV
quantitative
competitive pcr
(
qc
-
pcr
)
分类号
R373.21 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
猪圆环病毒2型竞争定量PCR检测方法的建立及应用
被引量：
1
4
作者
司兴奎
郭鑫
杨汉春
机构
中国农业大学农业部预防兽医学重点开放实验室
佛山科学技术学院动物医学系
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1115-1117,共3页
基金
教育部优秀跨世纪优秀人才计划资助项目(2003)
文摘
根据猪圆环病毒2型(PCV2)BF的序列设计引物,扩增472bp的ORF2部分基因片段,并克隆到pGEM-T载体中,构建含PCV2-ORF2部分基因片段的重组质粒。利用XbaⅠ限制性内切酶消化后获得共用同1对引物但缺失196bp的竞争重组子。通过重组质粒与竞争重组子间的竞争定量PCR方法(qc-PCR),建立猪PCV2-ORF2的标准竞争曲线和直线回归方程,并对PCV2试验感染猪血清中PCV2核酸的动态变化进行了研究。
关键词
猪圆环病毒2型
竞争定量
pcr
病毒含量
Keywords
porcine
circovirus
virus
type
2
（PCV2）
quantitative
competitive pcr
（
qc
-
pcr
）
viral
load
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
降解多环芳烃的菌株Gordonia sp.He4的分离鉴定及其在菲污染土壤修复过程中的动态变化
刘磊
李习武
刘双江
刘志培
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007
21
下载PDF
职称材料
2
宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法建立
王恒波
郭晋隆
陈平华
阙友雄
陈如凯
许莉萍
《热带作物学报》
CSCD
2009
4
下载PDF
职称材料
3
应用循环逆转录PCR技术检测丙型肝炎病毒RNA
陈燃
伍迪
唐榕
汪进
毛裕民
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2000
3
下载PDF
职称材料
4
猪圆环病毒2型竞争定量PCR检测方法的建立及应用
司兴奎
郭鑫
杨汉春
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
下载PDF
职称材料
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