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焦磷酸测序技术在猪繁殖与呼吸综合征诊断检测中的应用
1
作者
曹丙蕾
张群
+2 位作者
刘敏
王群
尹伟力
《农业技术与装备》
2021年第12期142-143,145,共3页
为建立高效准确的猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)快速确诊的检测方法,基于RT-PCR的焦磷酸测序检测方法,采用PSQ Assay Design SW软件分析PRRSV N蛋白基因的保守序列,设计扩增引物和测序引物,经过RT-PCR扩增和焦磷酸测序后,通过直观的序列结...
为建立高效准确的猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)快速确诊的检测方法,基于RT-PCR的焦磷酸测序检测方法,采用PSQ Assay Design SW软件分析PRRSV N蛋白基因的保守序列,设计扩增引物和测序引物,经过RT-PCR扩增和焦磷酸测序后,通过直观的序列结果显示,可直接进行PRRSV的确证,所建立的焦磷酸测序检测方法特异性好,且提高了检出率和准确性,避免了假阳性的出现,为猪繁殖与呼吸综合征的快速确诊提供了技术支撑,建立了PRRSV N蛋白基因的焦磷酸测序方法。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
焦磷酸测序
PCR
鉴定
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职称材料
猪流行性腹泻焦磷酸测序检测方法的建立
2
作者
曹丙蕾
邱洪凯
+2 位作者
孙涛
凌宗帅
张群
《中国动物检疫》
CAS
2016年第5期75-79,共5页
本研究旨在建立一种基于RT-PCR的焦磷酸测序方法,以便对猪流行性腹泻(PED)进行高效准确地检测。利用PSQ Assay Design SW软件分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)N蛋白基因的保守区域,设计了一对扩增引物及一条测序引物,建立了PEDV N蛋白基因...
本研究旨在建立一种基于RT-PCR的焦磷酸测序方法,以便对猪流行性腹泻(PED)进行高效准确地检测。利用PSQ Assay Design SW软件分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)N蛋白基因的保守区域,设计了一对扩增引物及一条测序引物,建立了PEDV N蛋白基因的焦磷酸测序检测方法。实验结果表明,该方法可以直接通过PSQ的序列结果直观地判定PEDV,大大提高了PEDV的检出率和准确性。该方法特异性强,不与其他猪源病毒发生交叉反应,最低核酸检测限为0.05 pg/μL。本研究所建立的焦磷酸测序方法灵敏度高、稳定性好,能从基因序列水平上精确鉴定PEDV,避免了假阳性结果的出现,对于PED的快速确诊具有重要意义。
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关键词
猪流行性腹泻
猪流行性腹泻病毒
RT-PCR
焦磷酸测序
鉴定
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职称材料
LINE-1甲基化水平与食管鳞状细胞癌免疫状态的关系
3
作者
肖梅仙
赵金波
+1 位作者
王波
匡黎
《局解手术学杂志》
2022年第8期664-668,共5页
目的探讨食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中长散布核元件-1(LINE-1)甲基化水平与免疫状态之间的关系。方法收集107例经术后病理证实为ESCC的肿瘤组织样本,采用亚硫酸氢盐焦磷酸测序法检测ESCC组织中LINE-1甲基化水平。根据HE染色法和免疫组织...
目的探讨食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中长散布核元件-1(LINE-1)甲基化水平与免疫状态之间的关系。方法收集107例经术后病理证实为ESCC的肿瘤组织样本,采用亚硫酸氢盐焦磷酸测序法检测ESCC组织中LINE-1甲基化水平。根据HE染色法和免疫组织化学染色法检测4种组织学淋巴细胞反应[克罗恩样淋巴样反应、瘤周淋巴细胞反应、间质淋巴细胞反应、肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)反应],并进一步分析ESCC组织中LINE-1甲基化水平与组织学淋巴细胞反应及患者临床病理特征的关系。结果ESCC组织中LINE-1平均甲基化率为(64.27±9.72)%,中位值为63.51%(43.81%~85.10%)。ESCC组织中LINE-1甲基化水平与患者年龄、淋巴结转移、TNM分期、瘤周淋巴细胞反应有关(P<0.05)。缺失/低瘤周淋巴细胞反应的肿瘤组织中LINE-1基因甲基化率低于中、高瘤周淋巴细胞反应的肿瘤组织(P<0.05)。经单因素和多因素Logistic回归模型分析,ESCC组织中LINE-1低甲基化水平是缺失/低瘤周淋巴细胞反应的独立危险因素(P trend<0.001)。结论ESCC组织中LINE-1甲基化水平与患者临床病理、分子特征有关,此外LINE-1低甲基化水平是ESCC组织中缺失/低瘤周淋巴细胞反应的独立危险因素。
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关键词
LINE-1甲基化
亚硫酸氢盐焦磷酸测序法
食管鳞状细胞癌
组织学淋巴细胞反应
瘤周淋巴细胞反应
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职称材料
题名
焦磷酸测序技术在猪繁殖与呼吸综合征诊断检测中的应用
1
作者
曹丙蕾
张群
刘敏
王群
尹伟力
机构
济南海关技术中心
青岛海关技术中心
出处
《农业技术与装备》
2021年第12期142-143,145,共3页
基金
畜禽疫病液相芯片高通量检测技术及东部沿海口岸监测应用示范(2016YFD050110401)
原国家质检总局科研项目(2016IK193)
+1 种基金
原山东出入境检验检疫科研项目(SK201401)(SK201713)
济南海关科研项目(2019JK004)。
文摘
为建立高效准确的猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)快速确诊的检测方法,基于RT-PCR的焦磷酸测序检测方法,采用PSQ Assay Design SW软件分析PRRSV N蛋白基因的保守序列,设计扩增引物和测序引物,经过RT-PCR扩增和焦磷酸测序后,通过直观的序列结果显示,可直接进行PRRSV的确证,所建立的焦磷酸测序检测方法特异性好,且提高了检出率和准确性,避免了假阳性的出现,为猪繁殖与呼吸综合征的快速确诊提供了技术支撑,建立了PRRSV N蛋白基因的焦磷酸测序方法。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
焦磷酸测序
PCR
鉴定
Keywords
porcine
reproductive
and
respiration
syndrome
virus
pyrosequencing
assay
PCR
identification
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
猪流行性腹泻焦磷酸测序检测方法的建立
2
作者
曹丙蕾
邱洪凯
孙涛
凌宗帅
张群
机构
济南出入境检验检疫局
山东临沂新程金锣牧业有限公司
山东出入境检验检疫局
出处
《中国动物检疫》
CAS
2016年第5期75-79,共5页
基金
山东出入境检验检疫局科研项目(SK201401)
动物病原微生物DNA条形码检测技术研究与示范应用(2012BAK11B04)
文摘
本研究旨在建立一种基于RT-PCR的焦磷酸测序方法,以便对猪流行性腹泻(PED)进行高效准确地检测。利用PSQ Assay Design SW软件分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)N蛋白基因的保守区域,设计了一对扩增引物及一条测序引物,建立了PEDV N蛋白基因的焦磷酸测序检测方法。实验结果表明,该方法可以直接通过PSQ的序列结果直观地判定PEDV,大大提高了PEDV的检出率和准确性。该方法特异性强,不与其他猪源病毒发生交叉反应,最低核酸检测限为0.05 pg/μL。本研究所建立的焦磷酸测序方法灵敏度高、稳定性好,能从基因序列水平上精确鉴定PEDV,避免了假阳性结果的出现,对于PED的快速确诊具有重要意义。
关键词
猪流行性腹泻
猪流行性腹泻病毒
RT-PCR
焦磷酸测序
鉴定
Keywords
porcine
epidemic
diarrhea
porcine
epidemic
diarrhea
virus
reverse-transcriptase
polymerase
chain
reac
tion
pyrosequencing
assay
detection
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
LINE-1甲基化水平与食管鳞状细胞癌免疫状态的关系
3
作者
肖梅仙
赵金波
王波
匡黎
机构
十堰市国药东风总医院肿瘤科
大连医科大学附属第二医院肿瘤科
十堰市郧阳区人民医院普外一科
出处
《局解手术学杂志》
2022年第8期664-668,共5页
基金
十堰市科学技术研究与开发项目(14Y49)。
文摘
目的探讨食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中长散布核元件-1(LINE-1)甲基化水平与免疫状态之间的关系。方法收集107例经术后病理证实为ESCC的肿瘤组织样本,采用亚硫酸氢盐焦磷酸测序法检测ESCC组织中LINE-1甲基化水平。根据HE染色法和免疫组织化学染色法检测4种组织学淋巴细胞反应[克罗恩样淋巴样反应、瘤周淋巴细胞反应、间质淋巴细胞反应、肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)反应],并进一步分析ESCC组织中LINE-1甲基化水平与组织学淋巴细胞反应及患者临床病理特征的关系。结果ESCC组织中LINE-1平均甲基化率为(64.27±9.72)%,中位值为63.51%(43.81%~85.10%)。ESCC组织中LINE-1甲基化水平与患者年龄、淋巴结转移、TNM分期、瘤周淋巴细胞反应有关(P<0.05)。缺失/低瘤周淋巴细胞反应的肿瘤组织中LINE-1基因甲基化率低于中、高瘤周淋巴细胞反应的肿瘤组织(P<0.05)。经单因素和多因素Logistic回归模型分析,ESCC组织中LINE-1低甲基化水平是缺失/低瘤周淋巴细胞反应的独立危险因素(P trend<0.001)。结论ESCC组织中LINE-1甲基化水平与患者临床病理、分子特征有关,此外LINE-1低甲基化水平是ESCC组织中缺失/低瘤周淋巴细胞反应的独立危险因素。
关键词
LINE-1甲基化
亚硫酸氢盐焦磷酸测序法
食管鳞状细胞癌
组织学淋巴细胞反应
瘤周淋巴细胞反应
Keywords
LINE-1
methylation
bisulfite
pyrosequencing
assay
esophageal
squamous
cell
carcinoma
histological
lymphocyte
reaction
peritumoral
lymphocyte
reaction
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
焦磷酸测序技术在猪繁殖与呼吸综合征诊断检测中的应用
曹丙蕾
张群
刘敏
王群
尹伟力
《农业技术与装备》
2021
0
下载PDF
职称材料
2
猪流行性腹泻焦磷酸测序检测方法的建立
曹丙蕾
邱洪凯
孙涛
凌宗帅
张群
《中国动物检疫》
CAS
2016
0
下载PDF
职称材料
3
LINE-1甲基化水平与食管鳞状细胞癌免疫状态的关系
肖梅仙
赵金波
王波
匡黎
《局解手术学杂志》
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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