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基于基因组学分析Pseudoalteromonas paragorgicola GHS18菌株产絮凝活性物质基础
1
作者 王玉霞 崔霞 +1 位作者 周海军 穆军 《浙江海洋大学学报（自然科学版）》 CAS 2021年第2期101-108,共8页
从天然生物絮凝剂资源菲律宾蛤仔黏附污泥中分离获得1株新的高絮凝活性菌株GHS18,絮凝率为75.1%。综合序列比对和生理生化特征结果,GHS18被鉴定为Pseudoalteromonas paragorgicola。通过Illumina测序平台对菌株GHS18进行全基因组框架扫... 从天然生物絮凝剂资源菲律宾蛤仔黏附污泥中分离获得1株新的高絮凝活性菌株GHS18,絮凝率为75.1%。综合序列比对和生理生化特征结果,GHS18被鉴定为Pseudoalteromonas paragorgicola。通过Illumina测序平台对菌株GHS18进行全基因组框架扫描测序,基于基因组的分子水平来探索菌株GHS18产絮凝活性物质的基础。生物信息学分析结果表明菌株主要参与淀粉、蔗糖、果糖、甘露糖、半乳糖、氨基糖、核苷酸糖、肽聚糖、脂多糖的生物合成与代谢,具有絮凝多糖合成途径中重要的前体底物(UDP-Glucose、GDP-mannose和UDP-glucuronate)和重复寡糖单元(UDP-Gal、dNTP-D-Glu、dNTP-L-Rham、UDP-3-O-(3-acetyl)-GlcNAc),将重复寡糖单元聚合成多糖的eps基因簇并未发现,推测其具有类似的基因簇代替行使功能。本研究为未来开发该菌株为发酵产品提供了一定的理论依据,也为更进一步的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 菲律宾蛤仔黏附污泥 产絮凝剂菌 基因组测序 pseudoalteromonas paragorgicola 胞外多糖
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交替假单胞杆菌RS-2培养基优化 被引量：1
2
作者 劳军 祁自忠 +2 位作者 陈刚 郝鲁江 包振民 《山东轻工业学院学报（自然科学版）》 CAS 2007年第4期1-5,共5页
用响应面法对交替假单胞杆菌RS-2(pseudoalteromonas paragorgicola)的液体培养基进行优化。首先,采用了Plackett-Burman实验设计研究,确定了对菌体浓度主要影响组分:蛋白胨、酵母粉、NaCl。第二步,通过最陡爬坡实验逼近以上三种因素最... 用响应面法对交替假单胞杆菌RS-2(pseudoalteromonas paragorgicola)的液体培养基进行优化。首先,采用了Plackett-Burman实验设计研究,确定了对菌体浓度主要影响组分:蛋白胨、酵母粉、NaCl。第二步,通过最陡爬坡实验逼近以上三种因素最优水平,最后用响应面设计法对培养基进行了优化,实验结果表明培养基最佳组分为蛋白胨0.6698 g/100 mL,酵母粉0.3296 g/100 mL,NaCl 24.38 g/L,Fe2(PO4)30.01 g/L,MgSO4.7H2O 6.92 g/L,MgCl2.6 H2O5.51 g/L,CaCl2.H2O 1.45 g/L,KCl 0.67 g/L,在此条件下发酵,得到菌体浓度为1.067×109cfu/mL。而原始2116E培养基达到8.7×108cfu/mL,优化后提高1.22倍。 展开更多
关键词 交替假单胞杆菌 培养基优化 响应面
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