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单细胞转录组测序技术及其在植物中的应用
被引量:
1
1
作者
张舒婷
张雪莹
+5 位作者
朱晨
李卓蕴
傅卓然
张梓浩
赖钟雄
林玉玲
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期2163-2173,共11页
近年来发展起来的基于高通量测序技术的高分辨率单细胞转录组测序技术,能够在单细胞水平解析植物组织的异质性,鉴定组织中的不同细胞类型,构建不同细胞类型的连续分化轨迹及其转录调控网络,并能够寻找组织中的稀有细胞类型,深入解析组...
近年来发展起来的基于高通量测序技术的高分辨率单细胞转录组测序技术,能够在单细胞水平解析植物组织的异质性,鉴定组织中的不同细胞类型,构建不同细胞类型的连续分化轨迹及其转录调控网络,并能够寻找组织中的稀有细胞类型,深入解析组织发育的分子机制。为探究单细胞转录组测序技术在植物中的应用,本文中对单细胞转录组测序技术的发展及其在植物中的应用进行了综述。首先,介绍了单细胞转录组测序技术的发展进程;其次,分析其在鉴定植物组织不同细胞类型、筛选不同细胞类型特异表达标记基因及解析植物组织发育过程的连续分化轨迹及其转录调控网络的应用中所取得的进展;最后,总结单细胞转录组测序技术在植物应用中存在的挑战及未来的研究方向。以期为单细胞转录组测序技术在更多植物物种上得以应用提供参考。
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关键词
单细胞RNA测序
植物组织
细胞异质性
标记基因
拟时分析
原文传递
题名
单细胞转录组测序技术及其在植物中的应用
被引量:
1
1
作者
张舒婷
张雪莹
朱晨
李卓蕴
傅卓然
张梓浩
赖钟雄
林玉玲
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期2163-2173,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31672127)
福建省自然科学基金项目(2020J01543)
+1 种基金
福建省高原学科建设经费项目(102/71201801101)
福建农林大学创新基金项目(CXZX2019033S,CXZX2018078)。
文摘
近年来发展起来的基于高通量测序技术的高分辨率单细胞转录组测序技术,能够在单细胞水平解析植物组织的异质性,鉴定组织中的不同细胞类型,构建不同细胞类型的连续分化轨迹及其转录调控网络,并能够寻找组织中的稀有细胞类型,深入解析组织发育的分子机制。为探究单细胞转录组测序技术在植物中的应用,本文中对单细胞转录组测序技术的发展及其在植物中的应用进行了综述。首先,介绍了单细胞转录组测序技术的发展进程;其次,分析其在鉴定植物组织不同细胞类型、筛选不同细胞类型特异表达标记基因及解析植物组织发育过程的连续分化轨迹及其转录调控网络的应用中所取得的进展;最后,总结单细胞转录组测序技术在植物应用中存在的挑战及未来的研究方向。以期为单细胞转录组测序技术在更多植物物种上得以应用提供参考。
关键词
单细胞RNA测序
植物组织
细胞异质性
标记基因
拟时分析
Keywords
single-cell
RNA
sequencing
plant
tissue
cellular
heterogeneity
marker
gene
pseudo
-
timeline
analysis
分类号
Q813 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞转录组测序技术及其在植物中的应用
张舒婷
张雪莹
朱晨
李卓蕴
傅卓然
张梓浩
赖钟雄
林玉玲
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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参考文献
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