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血清蛋白质质谱模型在大肠癌诊断中的应用 被引量:42
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作者 陈益定 郑树 +1 位作者 余捷凯 胡汛 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第7期417-420,共4页
目的 建立蛋白质芯片技术检测血清蛋白质质谱的方法 ,探讨基于人工神经网络的血清蛋白质质谱模型在大肠癌诊断中的应用价值。方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪(SELDI TOF MS) ,测定了 14 7例血清标本 (其中大肠癌 5 5例 ... 目的 建立蛋白质芯片技术检测血清蛋白质质谱的方法 ,探讨基于人工神经网络的血清蛋白质质谱模型在大肠癌诊断中的应用价值。方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪(SELDI TOF MS) ,测定了 14 7例血清标本 (其中大肠癌 5 5例 ,健康人 92例 )的蛋白质质谱 ,用随机抽取的 87例标本 (大肠癌 32例 ,健康人 5 5例 )作为训练组 ,进行训练与交叉验证 ,将筛选出来的 5 910 ,8930 ,4 4 76和 8817的 4个质荷比峰作为输入 ,建立人工神经网络预测模型。并用另外测试组 (大肠癌2 3例 ,健康人 37例 )的血清标本盲法验证该模型。结果 利用从训练组得出的基于人工神经网络的血清蛋白质质谱模型 ,对测试组的 6 0例 (包括DukesA)未知血清进行预测 ,得到该方法对大肠癌的检出率为 82 .6 % (19/ 2 3) ,排除率为 91.9% (34/ 37)。结论 蛋白质芯片技术检测血清蛋白质质谱法在大肠癌的诊断中较以往的传统方法具有更高的检出率和排除率 ,值得进一步研究与应用。 展开更多
关键词 血清蛋白质 质谱模型 大肠癌 肿瘤 人工神经网络
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华蟾毒精抑制HeLa细胞增殖作用机制的探讨 被引量:35
2
作者 王鹂 吴军 +2 位作者 李敏 杨秀伟 崔景荣 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期717-720,共4页
目的观察中药成份华蟾毒精(CBG)对HeLa细胞增殖的作用,并初步探讨其作用机理.方法 SRB和MTT法观察CBG对人肝癌细胞(Bel-7402)、宫颈癌细胞(HeLa)、乳腺癌细胞(MCF-7)、胃癌细胞(BGC-823)和白血病淋巴细胞(HL60)等几种人体肿瘤细胞增殖... 目的观察中药成份华蟾毒精(CBG)对HeLa细胞增殖的作用,并初步探讨其作用机理.方法 SRB和MTT法观察CBG对人肝癌细胞(Bel-7402)、宫颈癌细胞(HeLa)、乳腺癌细胞(MCF-7)、胃癌细胞(BGC-823)和白血病淋巴细胞(HL60)等几种人体肿瘤细胞增殖的影响;采用流式细胞仪法观察CBG对HeLa细胞周期的影响;通过双向电泳的方法,进一步探讨CBG作用于HeLa细胞蛋白质组的情况.结果 CBG对多种人体肿瘤细胞的增殖都有明显抑制作用,其Bel-7402、HeLa、MCF-7、BGC-823和HL60细胞的IC5o值分别为0.011,0.019,0.116,0.149,1.369 μmol/L,其中以人宫颈癌细胞(HeLa)和人肝癌细胞(Bel-7402)最为敏感.流式方法测定的结果显示,不同浓度的CBG与HeLa细胞作用72 h,可使G2/M期的HeLa细胞由17.3%增加到35.6%.双向电泳的结果显示,0.02 μmol/L CBG作用48 h后,与对照组相比,HeLa细胞中相对分子质量较小(约30 000~90 000)的偏酸性蛋白(pH约4~6)发生了较大的改变.结论 CBG对多种人体肿瘤细胞的增殖均有显著抑制作用.CBG可使HeLa细胞周期阻滞在G2/M期,并对HeLa细胞内相对分子质量较小的酸性蛋白表达有明显的影响. 展开更多
关键词 华蟾毒精 细胞增殖 细胞周期 蛋白质组 HELA细胞
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Proteomic analysis reveals molecular biological details in varioliform gastritis without Helicobacter pylori infection 被引量:22
3
作者 Lin Zhang Yan-Hong Hou +2 位作者 Kai Wu Jun-Shan Zhai Nan Lin 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2010年第29期3664-3673,共10页
AIM:To investigate and elucidate the molecular mechanism underlying varioliform gastritis for early detection,prevention and intervention of gastric cancer.METHODS:A combination of two-dimensional gel electrophoresis ... AIM:To investigate and elucidate the molecular mechanism underlying varioliform gastritis for early detection,prevention and intervention of gastric cancer.METHODS:A combination of two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry was used to detect the differentially expressed proteins between varioliform gastritis and matched normal mucosa.The selected proteins were confirmed by Western blotting and reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR) in additional samples and the function of some proteins in varioliform gastritis was analyzed by bio-method preliminarily.RESULTS:We identified 21 differentially expressed proteins in varioliform gastritis,and compared them with matched normal mucosa.Eleven proteins were upregulated and ten downregulated in varioliform gastritis when compared with the same proteins in individualmatched normal gastric mucosa.These proteins are related to metabolism,oxidation,cytoskeleton,apoptosis,signal transduction and other aspects of cells.Two novel proteins,thioredoxin domain-containing protein 5(TXNDC5) upregulated in varioliform gastritis,and neuropolypeptide h3 [phosphatidylethanolamine-binding protein 1(PEBP1)] downregulated in varioliform gastritis,were further investigated.Their expressions were validated by Western blotting and RT-PCR in 12 cases of varioliform gastritis which was matched with normal mucosa.The expression level of PEBP1 in varioliform gastritis was significantly lower(P<0.05) while that of TXNDC5 was significantly higher than that in matched normal gastric mucosa(P<0.05).CONCLUSION:There are some changes of protein expression in varioliform gastritis.Downregulation of PEBP1 and upregulation of TXNDC5 are involved in the development of varioliform gastritis. 展开更多
关键词 Differentially expressed proteins Varioliform gastritis proteomic study Helicobacter pylori
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Comparative proteomic and metabolomic analyses reveal mechanisms of improved cold stress tolerance in bermudagrass (Cynodon dactylon(L.) Pers.) by exogenous calcium 被引量:19
4
作者 Haitao Shi Tiantian Ye +2 位作者 Bao Zhong Xun Liu Zhulong Chan 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2014年第11期1064-1079,共16页
As an important second messenger, calcium is involved in plant cold stress response, including chilling(〈20 °C) and freezing(〈0 °C). In this study, exogenous application of calcium chloride(CaCl2) im... As an important second messenger, calcium is involved in plant cold stress response, including chilling(〈20 °C) and freezing(〈0 °C). In this study, exogenous application of calcium chloride(CaCl2) improved both chilling and freezing stress tolerances, while ethylene glycol‐bis‐(b‐aminoethyl) ether‐N,N,N,N‐tetraacetic acid(EGTA) reversed CaCl2 effects in bermudagrass(Cynodon dactylon(L.) Pers.).Pysiological analyses showed that CaCl2 treatment alleviated the reactive oxygen species(ROS) burst and cell damage triggered by chilling stress, via activating antioxidant enzymes,non‐enzymatic glutathione antioxidant pool, while EGTA treatment had the opposite effects. Additionally, comparative proteomic analysis identified 51 differentially expressed proteins that were enriched in redox, tricarboxylicacid cycle,glycolysis, photosynthesis, oxidative pentose phosphate pathway, and amino acid metabolisms. Consistently, 42 metabolites including amino acids, organic acids, sugars, and sugar alcohols were regulated by CaCl2 treatment under control and cold stress conditions, further confirming the Researchcommon modulation of CaCl2 treatment in carbon metabolites and amino acid metabolism. Taken together, this study reported first evidence of the essential and protective roles of endogenous and exogenous calcium in bermudagrass response to cold stress, partially via activation of the antioxidants and modulation of several differentially expressed proteins and metabolic homeostasis in the process of cold acclimation. 展开更多
关键词 Antioxidant bermudagrass calcium chilling freezing metabolite proteomic
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多维液相色谱及其在生命科学中的应用 被引量:13
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作者 厉欣 陈学国 +1 位作者 孔亮 邹汉法 《生命科学》 CSCD 2003年第2期95-100,共6页
介绍了一种适用于复杂体系样品分析的分离技术一多维液相色谱。对该技术的原理、分类、模式的选择做了介绍,并引证了其在蛋白质组研究、药物研究等复杂体系样品分析领域的最新应用及发展。
关键词 高效液相色谱 蛋白质组 药物 生命科学 多维液相色谱 分离技术 原理 分类 复杂体系 样品分析
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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术筛选肺腺癌血清肿瘤标记物 被引量:17
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作者 罗晓阳 陈海泉 +2 位作者 王文静 廖萍 项翠琴 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2006年第1期14-16,19,共4页
背景与目的:肺癌是目前世界上最常见的恶性肿瘤,由于大多数患者确诊时疾病已属进展期,总体5年生存率较低,所以改善预后的关键在于早期诊断。表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELD I-TOF-MS)是一种检测肿瘤标志物的新兴技术。本... 背景与目的:肺癌是目前世界上最常见的恶性肿瘤,由于大多数患者确诊时疾病已属进展期,总体5年生存率较低,所以改善预后的关键在于早期诊断。表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELD I-TOF-MS)是一种检测肿瘤标志物的新兴技术。本研究使用该技术筛选了肺腺癌患者血清相对特异标记物。方法:肺腺癌患者71例,均经手术病理证实;正常人71名,按照性别,年龄,吸烟史与71例肺腺癌患者配对。用WCX2芯片检测各血清标本,筛选肺腺癌相对特异性蛋白质峰。结果:与正常人比较发现肺腺癌显著高表达的潜在标记物5个,相对分子量分别为4047.79±1.60、4203.99±1.91、4959.81±2.13、5329.30±2.55和7760.12±4.11,以峰值比1.5为界值时,其诊断肺腺癌的敏感性分别为90.14%、78.87%、50.70%、57.75%、73.24%,特异性分别为97.18%、92.96%、70.42%、76.06%、94.37%。结论:SELD I-TOF-MS蛋白质质谱技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,不仅能直接筛选出肺腺癌患者血清中相对特异的潜在标记物,而且可能具有较好的临床应用前景。 展开更多
关键词 肺肿瘤 腺癌 生物标记物 SELDI—TOF—MS 蛋白质组学
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植物功能基因组研究进展 被引量:5
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作者 于玲 王莱 +1 位作者 牛吉山 陈佩度 《西北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第1期104-112,116,共10页
基因组学研究已开始从结构基因组学转向功能基因组学 .对功能基因组学研究的重要意义及内容、方法进行了综述 。
关键词 植物功能基因组 研究进展 功能基因组学 基因芯片 蛋白质组学 表达序列标签 生物信息学
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染氟成骨细胞的双向电泳和质谱鉴定 被引量:16
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作者 徐辉 井玲 +2 位作者 张承巍 齐玲 李广生 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期35-38,共4页
目的探讨双向电泳和质谱鉴定技术在染氟成骨细胞蛋白表达变化中的意义,为探索氟骨症发病机制提供有效手段。方法采用小鼠乳鼠颅骨来源的成骨细胞进行培养,抽提染氟(2mg/L)72h组和对照组成骨细胞蛋白,用双向凝胶电泳进行分离及ImageMaste... 目的探讨双向电泳和质谱鉴定技术在染氟成骨细胞蛋白表达变化中的意义,为探索氟骨症发病机制提供有效手段。方法采用小鼠乳鼠颅骨来源的成骨细胞进行培养,抽提染氟(2mg/L)72h组和对照组成骨细胞蛋白,用双向凝胶电泳进行分离及ImageMaster2DElite软件分析电泳图谱,基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱仪对两组间比较具有统计学意义的差异蛋白点进行鉴定。结果在对照组成骨细胞蛋白双向电泳图谱上可观察到671个蛋白点,而在染氟组双向电泳图谱上可见到837个蛋白点;在染氟成骨细胞表达有明显差异的蛋白点经质谱鉴定出12种(7种蛋白表达增多,5种降低),主要是与细胞代谢旺盛、蛋白质氧化折叠和氧化应激等相关的蛋白。结论实验所采用的双向电泳和质谱鉴定方法可有效分离和鉴定成骨细胞蛋白点,为氟骨症的发生机制提供了有价值的新线索,表明蛋白质组学技术较其他方法具有很大的优越性。 展开更多
关键词 成骨细胞 氟化物 双向电泳 质谱 蛋白质组
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Distinct serumal proteomic patterns between ascending and descending types of loco-regionally advanced nasopharyngeal carcinoma assessed by surface enhanced laser desorption ionization and artificial neural network analyses 被引量:13
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作者 GUO Xiang CAO Su-mei +8 位作者 YU Jie-kai HONG Ming-huang ZHANG Chang-qing LI Ning-wei XIANG Yan-qun QIAN Chao-nan HU Xun MIN Hua-qing ZENG Yi-xin 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2005年第22期1912-1917,共6页
Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is rare in most countries, especially in Europe and NorthAmerica (incidence rate below 1/100 000 people per year). However, it has a high incidence in several southern areas in China... Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is rare in most countries, especially in Europe and NorthAmerica (incidence rate below 1/100 000 people per year). However, it has a high incidence in several southern areas in China, especially in the Cantonese region, including Guangzhou city, where the incidence rate is approximately 30-80/100 000 people per year. In the high incidence areas, more than 95% NPCs are poorly differentiated (WHO types 2 and 3), which are sensitive to radiotherapy and chemotherapy. Besides its special epidemiological and pathological characteristics, 展开更多
关键词 nasopharyngeal neoplasms · prognosis· proteomic
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Hypocrellin A-based photodynamic action induces apoptosis in A549 cells through ROS-mediated mitochondrial signaling pathway 被引量:13
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作者 Shanshan Qi Lingyuan Guo +3 位作者 Shuzhen Yan Robert J.Lee Shuqin Yu Shuanglin Chen 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2019年第2期279-293,共15页
Over recent decades, many studies have reported that hypocrellin A(HA) can eliminate cancer cells with proper irradiation in several cancer cell lines. However, the precise molecular mechanism underlying its anticance... Over recent decades, many studies have reported that hypocrellin A(HA) can eliminate cancer cells with proper irradiation in several cancer cell lines. However, the precise molecular mechanism underlying its anticancer effect has not been fully defined. HA-mediated cytotoxicity and apoptosis in human lung adenocarcinoma A549 cells were evaluated after photodynamic therapy(PDT). A temporal quantitative proteomics approach by isobaric tag for relative and absolute quantitation(iTRAQ) 2 D liquid chromatography with tandem mass spectrometric(LC–MS/MS) was introduced to help clarify molecular cytotoxic mechanisms and identify candidate targets of HA-induced apoptotic cell death. Specific caspaseinhibitors were used to further elucidate the molecular pathway underlying apoptosis in PDT-treated A549 cells. Finally, down-stream apoptosis-related protein was evaluated. Apoptosis induced by HA was associated with cell shrinkage, externalization of cell membrane phosphatidylserine, DNA fragmentation,and mitochondrial disruption, which were preceded by increased intracellular reactive oxygen species(ROS) generations. Further studies showed that PDT treatment with 0.08 mmol/L HA resulted in mitochondrial disruption, pronounced release of cytochrome c, and activation of caspase-3,-9, and-7.Together, HA may be a possible therapeutic agent directed toward mitochondria and a promising photodynamic anticancer candidate for further evaluation. 展开更多
关键词 HYPOCRELLIN A Photodynamic therapy REACTIVE oxygen species proteomic LC–MS/MS ITRAQ
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New strategies for colorectal cancer screening 被引量:12
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作者 Maria Di Lena Elisabetta Travaglio Donato F Altomare 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2013年第12期1855-1860,共6页
Colorectal cancer (CRC) is still one of the leading causes of cancer-related death in Western countries, despite major improvements in its treatment. The dramatically high social and economic impact of CRC on human he... Colorectal cancer (CRC) is still one of the leading causes of cancer-related death in Western countries, despite major improvements in its treatment. The dramatically high social and economic impact of CRC on human health makes the identification of a reliable screening tool of paramount importance. Current screening methods, such as the fecal occult blood test and colonoscopy do not adequately meet the ideal requisites of a screening test because, even if they are effective, they are limited first by too low specificity and sensitivity, or second by high invasiveness, costs and risk. Nowadays extended efforts are made by researchers to look for more reliable and effective screening tests based on a systems biology approach, using biological samples easily available, such as urine, breath, serum and feces. The effectiveness and reliability of several new attempts to screen these patients by non-invasive analysis of their biological samples using genomic (genetic and epigenetic alteration), transcriptomic (miRNA), proteomic (cancer-related antigens, new antibodies against tumor-associated antigens, mutated proteins) and metabolomic (volatile organic metabolites) methods are discussed in this review. Among the most interesting new screening tools, fecal fluorescent long-DNA, fecal miRNA and metabolomic evaluation in breath and/ or serum seem to be most promising. 展开更多
关键词 COLORECTAL cancer Screening FECAL OCCULT blood test Systems BIOLOGY Metabolomics proteomic microRNA VOLATILE organic compounds
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慢性乙型病毒性肝炎湿热中阻证血浆蛋白质组学分析 被引量:14
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作者 魏嵋 刘友平 +3 位作者 郭芳宏 王磊琼 王小栋 李洪 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1341-1345,共5页
目的从蛋白质组学的角度探讨慢性乙型病毒性肝炎(chronic viral hepatitisB,CHB)湿热中阻证的本质内涵。方法采用双向凝胶电泳(2-DE)技术结合质谱分析等生物信息学分析方法对CHB湿热中阻证组(20例)及健康对照组(5名)的血浆全蛋白进行比... 目的从蛋白质组学的角度探讨慢性乙型病毒性肝炎(chronic viral hepatitisB,CHB)湿热中阻证的本质内涵。方法采用双向凝胶电泳(2-DE)技术结合质谱分析等生物信息学分析方法对CHB湿热中阻证组(20例)及健康对照组(5名)的血浆全蛋白进行比较蛋白质组学分析。结果 CHB湿热中阻证组2-DE检测获得8个有明显规律性变化的差异表达蛋白点,通过质谱分析鉴定获得7个蛋白点(有1个蛋白点未检出结果):载脂蛋白C2(apoplipoprotein C2,APO-C2)、玻连蛋白(vitronectin,VN)、结合珠蛋白(haptoglobin,HPT)、甲状腺素结合蛋白(transthyretin,TTHY)、载脂蛋白A1(APO-A1)、血清淀粉蛋白P(serum amyloid Pcomponent,SAMP)、载脂蛋白A4(APO-A4),其中与健康对照组比较,APO-A1、APO-A4蛋白点表达量有所升高,其余5个差异蛋白点表达明显下调。结论差异表达蛋白质APO-A1、APO-A4具有潜在的作为CHB湿热中阻证诊断、预后标记物或治疗靶点的意义。 展开更多
关键词 慢性乙型病毒性肝炎 湿热中阻证 血浆蛋白 蛋白质组学
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基于定量蛋白质组学技术探究半夏泻心汤对慢性胃炎大鼠影响的作用机制 被引量:13
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作者 纪万里 王婷婷 +2 位作者 安叡 梁琨 王新宏 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1-8,共8页
目的:应用定量蛋白质组学探究半夏泻心汤抗慢性胃炎的生物学基础。方法:实验大鼠分为正常组、慢性胃炎模型组、半夏泻心汤组,采用56%乙醇灌胃法,4周建立慢性胃炎模型,给药治疗后,取胃组织进行苏木素-伊红(HE)染色,观察各组大鼠胃组织病... 目的:应用定量蛋白质组学探究半夏泻心汤抗慢性胃炎的生物学基础。方法:实验大鼠分为正常组、慢性胃炎模型组、半夏泻心汤组,采用56%乙醇灌胃法,4周建立慢性胃炎模型,给药治疗后,取胃组织进行苏木素-伊红(HE)染色,观察各组大鼠胃组织病理损伤及改善情况,提取胃组织蛋白质,运用串联质谱标签(TMT)定量蛋白质组学研究各组之间的差异蛋白情况,采用蛋白免疫印迹法(Western blot)验证关键的差异表达蛋白。结果:从大鼠胃组织中鉴定出4 452个蛋白,其中模型组与正常组差异蛋白为318个。经半夏泻心汤干预后,与模型组相比,共有258个差异蛋白,这些差异蛋白主要富集于cell killing,nucleoid及hijacked molecular function等。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集发现,作用涉及到三羧酸循环,steroid hormone biosynthesis,retrograde endocannabinoid等信号通路,同时还涉及磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)和核转录因子(NF)-κB信号通路。Western blot验证发现14-3-3 theta,干细胞因子(SCF),肌腱蛋白C(TN-C),半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3),细胞间黏附分子-1(ICAM-1),线粒体丙酮酸载体(Mpc1)和免疫相关蛋白GTP酶4(GIMAP4)可能是该方治疗慢性胃炎的关键蛋白。结论:半夏泻心汤治疗慢性胃炎的作用机制涉及到能量代谢、激素调节、炎症反应及免疫过程,利用差异蛋白质组学寻找的靶点蛋白及其涉及的信号通路可能是半夏泻心汤治疗慢性胃炎的生物学基础。 展开更多
关键词 半夏泻心汤 慢性胃炎 蛋白质组学 作用机制
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盐胁迫对燕麦叶片生理指标和差异蛋白组学的影响 被引量:13
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作者 陈晓晶 刘景辉 +4 位作者 杨彦明 赵洲 徐忠山 海霞 韩宇婷 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1431-1439,共9页
为探讨盐胁迫对燕麦叶片生理指标及蛋白组的影响,对燕麦进行6d盐胁迫(摩尔浓度NaCl∶Na2SO4=1∶1)处理,测定CK与盐胁迫燕麦叶片MDA含量,SOD、POD活性与游离脯氨酸含量,并运用Label-Free技术分析叶片差异表达蛋白质。结果表明,盐胁迫下... 为探讨盐胁迫对燕麦叶片生理指标及蛋白组的影响,对燕麦进行6d盐胁迫(摩尔浓度NaCl∶Na2SO4=1∶1)处理,测定CK与盐胁迫燕麦叶片MDA含量,SOD、POD活性与游离脯氨酸含量,并运用Label-Free技术分析叶片差异表达蛋白质。结果表明,盐胁迫下燕麦叶片MDA含量、SOD、POD活性分别较对照降低了16.7%、23.4%和21.2%,游离脯氨酸较对照升高1.12%;满足P-value≤0.05,ratio>2的差异蛋白76个(51个蛋白上调表达,25个蛋白下调表达);通过GO注释得到27个差异蛋白显著富集16个代谢路径,其中氧化还原过程为33.9%,level 3统计富集的生物学过程有氧气结合和氧化还原酶活性;运用KEGG注释得到22个差异蛋白显著富集10个生化代谢途径,主要表现在内质网中的蛋白质加工、长寿调节途径、抗原处理和呈现、雌激素信号通路4个过程;STRING蛋白质互作网络显示21个差异蛋白中涉及翻译后修饰、蛋白质周转、分子伴侣功能的有10个,且HSP70(F2DYT5)和HSP90(F4Y589)可能在盐胁迫燕麦幼苗的调控中发挥重要作用。 展开更多
关键词 盐胁迫 燕麦 LABEL-FREE 蛋白组
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蛋白质组学技术在食品品质检测及鉴伪中的应用 被引量:13
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作者 赵方圆 吴亚君 +2 位作者 韩建勋 葛毅强 陈颖 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第11期128-135,共8页
蛋白质组学技术的发展已经成为现代生物技术快速发展的重要支撑,被广泛地应用到食品功能研究、品质评价、营养分析、安全检测及真伪鉴别等研究中,为食品科学相关研究提供了新的思路和技术,具有很好的发展前景。本文概述了蛋白质组学的... 蛋白质组学技术的发展已经成为现代生物技术快速发展的重要支撑,被广泛地应用到食品功能研究、品质评价、营养分析、安全检测及真伪鉴别等研究中,为食品科学相关研究提供了新的思路和技术,具有很好的发展前景。本文概述了蛋白质组学的概念及主要研究技术,分析了蛋白质组学技术在食品研究中的应用,展望了蛋白质组学技术在食品品质检测及鉴伪中的发展前景。 展开更多
关键词 蛋白质组学 食品 检测 鉴伪 应用
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酿酒酵母与地衣芽孢杆菌相互作用及基于蛋白组学的作用机制分析 被引量:12
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作者 孟醒 吴群 徐岩 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1679-1688,共10页
【目的】为解析酱香型白酒发酵过程中群体微生物的酿造特征,研究酱香型白酒酿造中贡献特征风味的地衣芽孢杆菌和贡献酒精的酿酒酵母之间的相互作用。【方法】通过构建酿酒酵母纯培养及与地衣芽孢杆菌共培养发酵体系,比较不同培养体系中... 【目的】为解析酱香型白酒发酵过程中群体微生物的酿造特征,研究酱香型白酒酿造中贡献特征风味的地衣芽孢杆菌和贡献酒精的酿酒酵母之间的相互作用。【方法】通过构建酿酒酵母纯培养及与地衣芽孢杆菌共培养发酵体系,比较不同培养体系中的生物量、乙醇产量及有机酸产量差异,并从蛋白组学角度加以分析和认识二者之间的相互作用。【结果】在共培养体系中,酿酒酵母抑制地衣芽孢杆菌生长,其自身生长不受地衣芽孢杆菌的影响,然而代谢产物却发生变化,其中乙醇及有机酸中的丙酮酸、苹果酸、乳酸、琥珀酸及酒石酸的最高产量分别高出其纯培养的11.8%、56.8%、36.3%、24.3%、48.2%及27.7%,而柠檬酸的最高产量低于其纯培养的35.1%;蛋白组分析显示,地衣芽孢杆菌诱导酿酒酵母胞内69个蛋白差异表达(>2倍),质谱鉴定出24个,主要功能为参与糖酵解过程、乙醇代谢过程、细胞壁稳定性调控及应激反应等。糖酵解和乙醇代谢途径相关蛋白对酿酒酵母混合培养条件下的代谢变化起重要作用,其余蛋白可能与微生物相互作用时的防御和适应性相关。【结论】在混合培养发酵体系中地衣芽孢杆菌能够影响酿酒酵母的乙醇及有机酸代谢,这对于白酒品质调控及微生物间相互作用都具有重要意义。蛋白组学结果为从分子层面深入认识酿酒酵母与地衣芽孢杆菌之间的相互作用提供理论基础,有利于促进酱香型白酒发酵过程中群体微生物酿造特征的解析。 展开更多
关键词 酱香型白酒 酿酒酵母 地衣芽孢杆菌 乙醇 有机酸 蛋白组
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Proteomic analysis of human epithelial ovarian cancer xenografts in immunodeficient mice exposed to chronic psychological stress 被引量:11
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作者 GAO Jun GAO GuoLan +1 位作者 ZHANG YanYu WANG Fen 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2011年第2期112-120,共9页
This work aims at comparing alterations in the proteomes of human epithelial ovarian cancer xenografts between stressed and non-stressed immunodeficient mice as well as exploring the molecular mechanisms linking chron... This work aims at comparing alterations in the proteomes of human epithelial ovarian cancer xenografts between stressed and non-stressed immunodeficient mice as well as exploring the molecular mechanisms linking chronic psychological stress to ovarian cancer oncogenesis and progression.SK-OV-3 cells were injected subcutaneously into nude mice.The stress group was subjected to a chronic physical restraint protocol for 6 h on 35 consecutive days,while the control group was unrestrained.All mice were sacrificed on day 36 after SK-OV-3 cell injection,and tumors were excised.Tumor tissues were processed for 2D gel electrophoresis,mass spectrometry(nanoUPLC-ESI-MS/MS) and Western blotting.The expression of 20 proteins was found to be significantly altered between the stress and control groups,of which 14 were up-regulated,five were down-regulated,and one protein was found only in the stress group.All proteins were identified by UPLC-ESI-MS/MS,and Western blotting results were consistent with those of proteomic methods.The present results provide new evidence relating to the molecular mechanism underlying the relationship between psychological stress and tumor progression. 展开更多
关键词 proteomic psychological stress ovarian cancer 2D electrophoresis UPLC-ESI-MS/MS
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差异蛋白质组学在植物研究中的应用 被引量:8
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作者 刘卫群 李浩 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第17期4201-4203,共3页
差异蛋白质组学是蛋白质组学的研究策略之一,主要目标是研究有意义的因素引起的蛋白质组成的变化以发现有差异的蛋白质。介绍了差异蛋白质组学应用于植物研究中的基本方法和新兴技术。植物样品制备方法主要为TCA/丙酮法和植物组织分级... 差异蛋白质组学是蛋白质组学的研究策略之一,主要目标是研究有意义的因素引起的蛋白质组成的变化以发现有差异的蛋白质。介绍了差异蛋白质组学应用于植物研究中的基本方法和新兴技术。植物样品制备方法主要为TCA/丙酮法和植物组织分级提取法。2-DE仍是目前主要的分离方法,多维液相色谱等新型分离模式可以弥补2-DE的不足,新型质谱和蛋白质芯片技术的应用可大大提高差异蛋白质的鉴定速度。差异蛋白质组学目前在植物生理、植物组织器官和亚细胞、植物突变体、植物遗传多样性等多方面研究中都有应用。 展开更多
关键词 蛋白质组 植物 差异蛋白 应用
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丹栀逍遥散防治大鼠多囊卵巢综合征的蛋白质组学研究 被引量:11
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作者 张丽华 靖林林 +2 位作者 黄璜 孙学刚 刘颖 《中药药理与临床》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期1-4,共4页
目的:观察丹栀逍遥散对多囊卵巢综合症(PCOS)大鼠差异蛋白质表达谱的影响。方法:应用皮下埋植左旋18-甲基炔诺酮硅胶棒联合人绒毛膜促性腺激素注射复制PCOS模型;双向电泳技术分离差异蛋白表达谱,基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALD... 目的:观察丹栀逍遥散对多囊卵巢综合症(PCOS)大鼠差异蛋白质表达谱的影响。方法:应用皮下埋植左旋18-甲基炔诺酮硅胶棒联合人绒毛膜促性腺激素注射复制PCOS模型;双向电泳技术分离差异蛋白表达谱,基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定差异蛋白点;免疫组化、蛋白免疫印迹和荧光定量PCR验证结果。结果:丹栀逍遥散3.75g/kg显著改善大鼠卵巢增大及卵泡扩张,质谱成功鉴定8个蛋白点,其中点5为β抑制蛋白2(β-arrestin 2,β-arr2),β-arr2在模型组显著降低,丹栀逍遥散显著增加其表达(P<0.01)。结论:丹栀逍遥散通过增加β-arr2表达,调控β-arr2介导的信号通路防治PCOS。 展开更多
关键词 丹栀逍遥散 多囊卵巢综合征 蛋白质组学 β-arrestin2
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志贺菌敏感株与基因转移耐多药株蛋白组学分析 被引量:9
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作者 宋春花 黄学勇 +2 位作者 郗园林 张梅喜 段广才 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期42-45,共4页
目的对志贺菌敏感株与基因转移耐多药株全菌蛋白进行蛋白质组比较,寻找细菌耐多药相关蛋白。方法采用接合基因转移实验对临床分离鉴定志贺菌敏感株进行基因转移耐多药试验;并对志贺菌敏感株及基因转移耐多药株全菌蛋白进行双向电泳;电... 目的对志贺菌敏感株与基因转移耐多药株全菌蛋白进行蛋白质组比较,寻找细菌耐多药相关蛋白。方法采用接合基因转移实验对临床分离鉴定志贺菌敏感株进行基因转移耐多药试验;并对志贺菌敏感株及基因转移耐多药株全菌蛋白进行双向电泳;电泳图谱采用Image Master 2D Platinum软件分析,并对差异表达蛋白进行基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MOLDITOF-TOF)分析。结果成功获得志贺菌基因转移耐多药株,在志贺菌敏感株与耐多药株全菌蛋白质图谱中分析别检出(946±37)和(1 013±157)个蛋白质斑点;经分析共发现43个差异表达的蛋白点,初步对其中7个差异表达蛋白进行质谱鉴定,基因转移耐多药株中发现2个新出现的耐多药相关蛋白分别为成簇插入的DNA重复序列(CRISPR)相关蛋白及Hsp60的分子伴侣蛋白(Groel-Groes-Adp7);ATP结合盒(ABC)转运蛋白、胱氨酸合成酶、预测的胞浆脂蛋白表达量上调;翻译延长因子Tu及DNA单链结合蛋白表达量下降。结论对7个耐多药相关蛋白鉴定分析表明,供体菌中一些耐多药相关基因通过基因转移方式插入志贺菌敏感株中并大量表达,同时一些在细胞代谢中起重要作用的酶类表达量上调,ABC转运蛋白在志贺菌基因转移耐多药机制中也起重要作用。 展开更多
关键词 志贺菌 耐多药 蛋白质组学 双向电泳 质谱分析 差异表达
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