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蛋白质互作组学技术及其在植物研究中的应用进展 被引量:1
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作者 张文洋 张胜 +1 位作者 易干军 晏石娟 《广东农业科学》 CAS 2022年第11期86-95,共10页
蛋白质互作组学技术是一门鉴定和量化蛋白质与其他代谢物或蛋白质等分子相互作用的前沿技术,已成为研究植物系统生物学和多组学研究的重要组成部分。近年来,基于质谱的组学技术迅速发展,也促进蛋白质-代谢物相互作用(Protein-metabolite... 蛋白质互作组学技术是一门鉴定和量化蛋白质与其他代谢物或蛋白质等分子相互作用的前沿技术,已成为研究植物系统生物学和多组学研究的重要组成部分。近年来,基于质谱的组学技术迅速发展,也促进蛋白质-代谢物相互作用(Protein-metabolite interaction,PMI)、蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)的发现和验证方法取得巨大进步,这些蛋白质互作组学技术在功能基因组和功能代谢组研究中逐渐展示出巨大的应用潜力。系统总结了过去10年不同蛋白质互作组学技术(主要包括PMI和PPI)的分析策略,并详细分析了它们各自的优缺点和适用的相互作用类型,综述了蛋白质互作组学技术在植物研究领域的应用进展,对植物蛋白质互作组学技术的应用策略和需要攻克的关键技术瓶颈进行了总结。蛋白质互作组学技术的不断发展将进一步推动植物胞内信号转导及代谢调控通路的解析,而精准解析信号网络中关键相互作用将为植物自身生长发育以及适应外界环境等机制研究提供重要的信息。 展开更多
关键词 蛋白质互作组学技术 蛋白质-代谢物互作 蛋白质-蛋白质互作 蛋白质组学 功能代谢组学
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Biochemical reactions in metabolite-protein interaction
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作者 Wen Wang Dinesh Singh Tekcham +4 位作者 Min Yan Zhichao Wang Huan Qi Xiaolong Liu Hai-Long Piao 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期645-647,共3页
Active endogenous metabolites regulate the viability of cells. This process is controlled by a series ofinteractions between small metabolites and large proteins. Previously, several studies had reported thatmetabolit... Active endogenous metabolites regulate the viability of cells. This process is controlled by a series ofinteractions between small metabolites and large proteins. Previously, several studies had reported thatmetabolite regulates the protein functions, such as diacylglycerol to protein kinase C, lactose regulationof the lac repressor, and HIF-1α stabilization by 2-hydroxyglutarate. However, decades old traditionalbiochemical methods are insufficient to systematically investigate the bio-molecular reactions for a high-throughput discovery. Here, we have reviewed an update on the recently developed chemical proteomicscalled activity-based protein profiling (ABPP). ABPP is able to identify proteins interacted eithercovalently or non-covalently with metabolites significantly. Thus, ABPP will facilitate the characteriza-tion of specific metabolite regulating; proteins in human disease progression. 展开更多
关键词 Post translational modification Activity-based protein profiling metabolite-protein interaction Chemical probe Mass spectrometry
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