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nr数据库分析及其本地化 被引量:104
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作者 邓泱泱 荔建琦 +3 位作者 吴松锋 朱云平 陈耀文 贺福初 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期71-73,76,共4页
通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问... 通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问,为蛋白质注释系统整合nr数据库做好了第一步工作。 展开更多
关键词 蛋白质序列数据库 序列比对 蛋白质注释 本地化
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植物蛋白质的亚细胞定位研究进展 被引量:41
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作者 邢浩然 刘丽娟 刘国振 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第B11期1-6,共6页
细胞是生命形式的基本组成单元,各种蛋白质按照其功能有序地分布在细胞的每个分区中。植物细胞的主要分区包括细胞膜和其他内膜系统、细胞核、细胞质以及位于其中的线粒体、叶绿体、高尔基体和内质网等各种细胞器。植物蛋白质的亚细胞... 细胞是生命形式的基本组成单元,各种蛋白质按照其功能有序地分布在细胞的每个分区中。植物细胞的主要分区包括细胞膜和其他内膜系统、细胞核、细胞质以及位于其中的线粒体、叶绿体、高尔基体和内质网等各种细胞器。植物蛋白质的亚细胞定位是功能基因组学的重要内容。主要的植物蛋白质亚细胞定位技术包括:融合报告基因定位法、免疫组织化学定位法、蛋白质组学定位技术以及共分离标记酶辅助定位法,而生物信息学预测也成为亚细胞定位研究的一种重要手段。高通量蛋白质亚细胞定位技术的发展和应用,为构建定位数据库积累了数据。在模式植物拟南芥中,有亚细胞定位信息的蛋白质已经超过4 000个。 展开更多
关键词 蛋白质 亚细胞定位 细胞分区 蛋白质组学 高通量
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Physiological roles of mitogen-activated-protein-kinase-activated p38-regulated/activated protein kinase 被引量:8
3
作者 Sergiy Kostenko Gianina Dumitriu +1 位作者 Kari Jenssen Lgreid Ugo Moens 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2011年第5期73-89,共17页
Mitogen-activated protein kinases(MAPKs)are a family of proteins that constitute signaling pathways involved in processes that control gene expression,cell division, cell survival,apoptosis,metabolism,differentiation ... Mitogen-activated protein kinases(MAPKs)are a family of proteins that constitute signaling pathways involved in processes that control gene expression,cell division, cell survival,apoptosis,metabolism,differentiation and motility.The MAPK pathways can be divided into conventional and atypical MAPK pathways.The first group converts a signal into a cellular response through a relay of three consecutive phosphorylation events exerted by MAPK kinase kinases,MAPK kinase,and MAPK.Atypical MAPK pathways are not organized into this three-tiered cascade.MAPK that belongs to both conventional and atypical MAPK pathways can phosphorylate both non-protein kinase substrates and other protein kinases.The latter are referred to as MAPK-activated protein kinases.This review focuses on one such MAPK-activated protein kinase,MAPK-activated protein kinase 5(MK5)or p38-regulated/activated protein kinase(PRAK).This protein is highly conserved throughout the animal kingdom and seems to be the target of both conventional and atypical MAPK pathways.Recent findings on the regulation of the activity and subcellular localization,bona fide interaction partners and physiological roles of MK5/PRAK are discussed. 展开更多
关键词 MITOGEN-ACTIVATED protein KINASE p38- regulated/activated protein KINASE Extracellular signalregulated KINASE protein KINASE A SUBCELLULAR localization Phosphorylation protein interaction
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拟南芥中一个未知功能蛋白的叶绿体亚细胞定位研究 被引量:11
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作者 王鹏程 王晨 +2 位作者 米华玲 周根余 杨仲南 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2006年第3期249-254,共6页
生物信息学分析表明,模式植物拟南芥叶绿体中含有大约4000多种蛋白质,目前只分离得到1000多种,其他预测的叶绿体蛋白的实验验证对叶绿体功能研究有重要意义。本文对一个预测的叶绿体未知功能蛋白AT5G48790进行了亚细胞定位研究。我们克... 生物信息学分析表明,模式植物拟南芥叶绿体中含有大约4000多种蛋白质,目前只分离得到1000多种,其他预测的叶绿体蛋白的实验验证对叶绿体功能研究有重要意义。本文对一个预测的叶绿体未知功能蛋白AT5G48790进行了亚细胞定位研究。我们克隆了该基因5'端长178bp的DNA片段,与绿色荧光蛋白(GFP)基因构建重组载体pMON530-cTP-GFP。转基因植株通过激光共聚焦显微镜观察,GFP只在叶绿体中特异表达。实验结果表明,AT5G48790的确为叶绿体蛋白。本实验方法也可用于其他预测的蛋白质的实验验证。 展开更多
关键词 融合蛋白 亚细胞定位 转运肽
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猪流行性腹泻病毒核衣壳蛋白与感染细胞核磷蛋白的共定位分析 被引量:13
5
作者 吕茂杰 陈建飞 +4 位作者 时洪艳 陈小金 范秀萍 申识川 冯力 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期643-647,共5页
【目的】阐明猪流行性腹泻病毒(PEDV)核衣壳蛋白与病毒感染细胞核仁成分B23.1蛋白的共定位特征。【方法】分别参照GenBank中PEDV CV777株的N基因序列(AF353511)和编码人细胞核仁蛋白B23.1基因序列(BC050628.1),设计、合成扩增N基因和B2... 【目的】阐明猪流行性腹泻病毒(PEDV)核衣壳蛋白与病毒感染细胞核仁成分B23.1蛋白的共定位特征。【方法】分别参照GenBank中PEDV CV777株的N基因序列(AF353511)和编码人细胞核仁蛋白B23.1基因序列(BC050628.1),设计、合成扩增N基因和B23.1基因的引物,利用RT-PCR技术扩增了N基因和Vero E6细胞的B23.1基因的cDNA,分别克隆到真核表达载体pAcGFP1-C1和pDsRed2-N1,获得重组质粒pAcGFP1-C1/N和pDsRed2-N1/B23.1,共转染Vero E6细胞。【结果】Western blots分析表明这些融合蛋白在转染的Vero E6细胞中表达;共聚焦显微镜技术分析表明在共转染Vero E6细胞中猪流行性腹泻病毒N蛋白与Vero E6细胞核磷蛋白B23.1发生共定位。【结论】为进一步鉴定PEDV N蛋白中核仁定位信号和N蛋白核仁定位机制提供可靠依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 核衣壳蛋白 核磷蛋白B23.1 共定位
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双分子荧光互补技术及其在蛋白质相互作用研究中的应用 被引量:9
6
作者 严晶 霍克克 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第6期589-595,共7页
双分子荧光互补(bimolecularfluorescencecomplementation,BiFC)分析技术,是由Hu等在2002年最先报道的一种直观、快速地判断目标蛋白在活细胞中的定位和相互作用的新技术.该技术巧妙地将荧光蛋白分子的两个互补片段分别与目标蛋白融合表... 双分子荧光互补(bimolecularfluorescencecomplementation,BiFC)分析技术,是由Hu等在2002年最先报道的一种直观、快速地判断目标蛋白在活细胞中的定位和相互作用的新技术.该技术巧妙地将荧光蛋白分子的两个互补片段分别与目标蛋白融合表达,如果荧光蛋白活性恢复则表明两目标蛋白发生了相互作用.其后发展出的多色荧光互补技术(multicolorBiFC),不仅能同时检测到多种蛋白质复合体的形成,还能够对不同蛋白质间产生相互作用的强弱进行比较.目前,该技术已用于转录因子,G蛋白βγ亚基的二聚体形式,不同蛋白质间产生相互作用强弱的比较以及蛋白质泛素化等方面的研究工作上. 展开更多
关键词 双分子荧光互补(BiFC) 蛋白质相互作用 亚细胞定位
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蛋白质的亚细胞定位预测研究进展 被引量:10
7
作者 李立奇 万瑛 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期602-604,共3页
蛋白质处于特定的亚细胞位置上才能行使其功能,故研究亚细胞定位对了解蛋白质功能非常重要。随着后基因组时代的来临,蛋白质序列信息增长迅速,而利用实验手段分析蛋白亚细胞定位的不易大规模进行。近年来,通过提取蛋白质的各种特征信息... 蛋白质处于特定的亚细胞位置上才能行使其功能,故研究亚细胞定位对了解蛋白质功能非常重要。随着后基因组时代的来临,蛋白质序列信息增长迅速,而利用实验手段分析蛋白亚细胞定位的不易大规模进行。近年来,通过提取蛋白质的各种特征信息,自动预测蛋白质的亚细胞定位的算法得到了较快的发展,本文拟从蛋白质特征信息的提取、预测算法和预测效果检验等方面,介绍蛋白质亚细胞定位预测领域中研究进展。 展开更多
关键词 蛋白质 亚细胞定位 预测 算法
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The chemosensory protein of Chinese honeybee, Apis cerana cerana: Molecular cloning of cDNA, immunocytochemical localization and expression 被引量:11
8
作者 LI HongLiang LOU BingGan +1 位作者 CHENG Jia'An GAO QiKang 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2007年第10期1355-1364,共10页
Chemosensory proteins (CSPs) are ubiquitous soluble small proteins isolated from sensory organs thought to be involved in chemical communication. Here we report the first cDNA of CSPs, called Ac-ASP3, cloned and chara... Chemosensory proteins (CSPs) are ubiquitous soluble small proteins isolated from sensory organs thought to be involved in chemical communication. Here we report the first cDNA of CSPs, called Ac-ASP3, cloned and characterized from antennas of adult worker bees in Chinese honeybee, Apis cerana cerana. The Ac-ASP3 cDNA comprises 2 exons, with an ORF of 393-bp encoding 130 aa. Protein signature analyses show that the protein consists of four conserved cysteines and a signal peptide with 19 aa in the N-terminal sequence. The deduced protein sequence shares high homology with Am-ASP3 of Apis mellifera and low similarity with other species of insects. Immunocytochemical localization shows that Ac-ASP3 is only specifically expressed on the antenna contact chemosensilla such as sensilla trichodea B and sensilla basiconica, whereas Ac-ASP3 is scarcely expressed on olfactory chemosensilla such as sensilla placodea. Real-time PCR of Ac-ASP3 transcripts shows that Ac-ASP3 is highly expressed on wings and legs, but expression is lower on antenna. Temporal expression patterns suggest that Ac-ASP3 is expressed during the period of pupa and adults from 1-d to 6-d stages when bees act as house bees, cleaning the comb and taking care of the queen and larvae in comb. The above evidence suggests that Ac-ASP3 is unique in species and is generally not involved in olfaction during searching for honey and pollen. Rather, the protein seems to function in recognition of chemosensory substances on bees' cuticle and mechanical movement of antenna. 展开更多
关键词 中国蜜蜂 化学感应蛋白 CDNA 分子克隆 表达 免疫组化定位
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Cellular localization and biochemical characterization of a novel calciumdependent protein kinase from tobacco 被引量:9
9
作者 Yun WANG Mei ZHANG Ke KE Ying Tang LU 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2005年第8期604-612,共9页
By screening tobacco cDNA library with MCK1 as a probe, we isolated a cDNA clone NtCPK5 (accession number AY971376), which encodes a typical calcium-dependent protein kinase. Sequence analyses indicated that NtCPK5 ... By screening tobacco cDNA library with MCK1 as a probe, we isolated a cDNA clone NtCPK5 (accession number AY971376), which encodes a typical calcium-dependent protein kinase. Sequence analyses indicated that NtCPK5 is related to both CPKs and CRKs superfamilies and has all of the three conserved domains of CPKs. The biochemical activity of NtCPK5 was calcium-dependent. NtCPK5 had Vmax and Km of 526nmol/min/mg and 210μg/ml respectively with calf thymus histone (fraction Ⅲ, abbreviated to histone Ⅲs) as substrate. For substrate syntide-2, NtCPK5 showed a higher Vmax of 2008 nmol/min/mg and a lower Km of 30μM. The K0.5 of calcium activation was 0.04μM or 0.06μM for histone Ⅲs or syntide-2 respectively. The putative myristoylation and palmitoylation consensus sequence of NtCPK5 suggests that it could be a membrane-anchoring protein. Indeed, our transient expression experiments with wild type and mutant forms of NtCPK5/GFP fusion proteins showed that NtCPK5 was localized to the plasma membrane of onion epidermal cells and that the localization required the N-terminal acylation sites of NtCPK5/GFP. Taking together, our data have demonstrated the biochemical characteristics of a novel protein NtCPK5 and its subcellular localization as a membrane-anchoring protein. 展开更多
关键词 calcium-dependent protein kinase PHOSPHORYLATION GFP subcellular localization.
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猪瘟病毒衣壳蛋白的细胞核定位研究 被引量:9
10
作者 刘宁 时洪艳 +3 位作者 陈建飞 冯力 张鑫 胡桂学 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期71-72,80,共3页
为了解猪瘟病毒(CSFV)衣壳(C)蛋白在ST细胞中的定位情况,本研究将CSFV C蛋白基因克隆于真核表达载体pEGFP-C2中,构建重组质粒pEGFP-CSFV-C。将该重组质粒转染ST细胞,转染2 h、4 h和6 h后利用激光共聚焦显微镜分析C表达蛋白在细胞中的定... 为了解猪瘟病毒(CSFV)衣壳(C)蛋白在ST细胞中的定位情况,本研究将CSFV C蛋白基因克隆于真核表达载体pEGFP-C2中,构建重组质粒pEGFP-CSFV-C。将该重组质粒转染ST细胞,转染2 h、4 h和6 h后利用激光共聚焦显微镜分析C表达蛋白在细胞中的定位情况。结果表明,CSFV表达蛋白在ST细胞中主要定位于细胞质和核仁。本研究为进一步分析CSFV的复制机理提供依据。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 衣壳蛋白 ST细胞 核仁定位
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绵羊肺腺瘤病毒pEGFP-C1/exJSRV-env构建及引起NIH3T3细胞恶性转化的研究 被引量:9
11
作者 张宇飞 刘月 +2 位作者 王专家 孙晓林 刘淑英 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期268-277,共10页
为了构建绵羊肺腺瘤病毒囊膜基因真核表达质粒并观察绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白在293T细胞中的定位情况以及探讨是否可诱导NIH3T3细胞发生恶性转化,本研究采用RT-PCR技术从自然感染绵羊肺腺瘤病的病羊肺组织中克隆完整的外源性绵羊肺腺瘤... 为了构建绵羊肺腺瘤病毒囊膜基因真核表达质粒并观察绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白在293T细胞中的定位情况以及探讨是否可诱导NIH3T3细胞发生恶性转化,本研究采用RT-PCR技术从自然感染绵羊肺腺瘤病的病羊肺组织中克隆完整的外源性绵羊肺腺瘤病毒囊膜基因(exJSRV-env),并将其亚克隆到真核表达载体pEGFP-C1中。构建好真核表达质粒经PCR、酶切和测序鉴定。同时对exJSRV-env基因进行生物信息学分析。采用脂质体法将该重组质粒转染293T细胞,观察其在真核细胞中的表达及定位情况。将该重组质粒转染NIH3T3细胞,观察细胞是否发生恶性转化。用软琼脂集落实验检查转染重组质粒的NIH3T3细胞的生长状态。结果显示真核表达质粒构建成功并命名为pEGFP-C1/exJSRV-env。exJSRV囊膜蛋白的氨基酸序列与参考株比对发现该囊膜基因的跨膜区(TM区)的胞质尾区具有外源性病毒特有的YXXM基序。系统进化树也表明我们克隆的exJSRV-env基因属于致病性的外源性病毒。运用生物信息学技术分析env基因编码的蛋白质的基本性质,并预测其可能的结构。亚细胞定位表明exJSRV囊膜蛋白主要分布于细胞膜。转染pEGFP-C1/exJSRV-env质粒的NIH3T3细胞接触抑制性消失,可在软琼脂中形成集落。说明绵羊肺腺瘤病毒的囊膜蛋白可引起NIH3T3细胞发生恶性转化。研究结果为进一步探讨exJSRV囊膜蛋白的结构和功能及其致病机理提供了实验基础。 展开更多
关键词 外源性绵羊肺腺瘤病毒囊膜基因 囊膜蛋白 亚细胞定位 细胞转化
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Increasing Accumulation Level of Foreign Protein in Transgenic Plants Through Protein Targeting 被引量:7
12
作者 邓朝阳 宋贵生 +1 位作者 徐军望 朱祯 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第9期1084-1089,共6页
Targeting of the synthesized polypeptide in the cells is an important research field in modern cell biology. Cowpea trypsin inhibitor (cpti) gene has been modified and a fusion protein gene (sck) was produced by fusin... Targeting of the synthesized polypeptide in the cells is an important research field in modern cell biology. Cowpea trypsin inhibitor (cpti) gene has been modified and a fusion protein gene (sck) was produced by fusing a signal peptide sequence at cpti 5' end and an endoplasm reticulum (ER) retention signal peptide at cpti3' end respectively. The signal peptide can direct the newly synthesized polypeptide into ER, while ER retention signal can make the protein retained in the ER and its derivative protein body. ELISA test indicated that the accumulation level of foreign CpTI protein in sck transgenic tobacco (Nicotiana tabacum L.) was two times higher than cpti transgenic tobaccos and some individuals were four times higher. At the same time, sck transgenic tobacco has a high resistance to Lepidoptera pest due to the increased accumulation level of foreign CpTI protein. The strategy of foreign protein targeting can be used to increase the accumulation level of foreign protein in transgenic plants and can be widely applied to other related research field in plant genetic engineering. 展开更多
关键词 targeting protein ER localization modified gene Cowpea trypsin inhibitor transgenic tobacco pest resistance analysis
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小麦胁迫相关基因TaLEAL3的克隆及分子特性分析 被引量:9
13
作者 闵东红 赵月 +6 位作者 陈阳 徐兆师 霍冬英 胡笛 陈明 李连城 马有志 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1847-1855,共9页
第3组LEA蛋白(late embryogenesis abundant protein)介导干旱、高温、高盐等非生物胁迫响应,关于普通小麦LEA基因的研究鲜有报道。利用噬菌体原位杂交技术,从小麦苗期干旱胁迫条件构建的cDNA文库中筛选出LEA蛋白基因TaLEAL3,其全长750... 第3组LEA蛋白(late embryogenesis abundant protein)介导干旱、高温、高盐等非生物胁迫响应,关于普通小麦LEA基因的研究鲜有报道。利用噬菌体原位杂交技术,从小麦苗期干旱胁迫条件构建的cDNA文库中筛选出LEA蛋白基因TaLEAL3,其全长750bp,编码区长501bp,编码166个氨基酸,含有一个明显的核定位信号区。氨基酸同源性分析发现,TaLEAL3属于第3组LEA蛋白,序列中含有由11个氨基酸组成的3个不完全重复的基序和α-螺旋的LEA结构。电子定位结果显示,TaLEAL3基因位于4BL、4DL和5AL染色体上,主要在茎中表达,而在根中几乎无表达。实时荧光定量PCR分析表明,在干旱、低温和ABA诱导下,TaLEAL3基因表达量明显增加。在该基因上游1.7kb序列处,预测具有启动子的核心序列和增强子序列,及与干旱和低温等多种逆境胁迫相关的调控序列。本研究为深入分析小麦LEA蛋白基因的功能,初步解析LEA蛋白的作用机制提供了数据。 展开更多
关键词 小麦 LEA蛋白 REAL-TIMEPCR 亚细胞定位 启动子克隆
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人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在Caski宫颈癌细胞的表达和定位 被引量:8
14
作者 孙美涛 张成桂 +4 位作者 梅雯 杨勇琴 杨泽芳 张晓娟 熊伟 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期783-788,共6页
目的构建人线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因真核表达载体,并在人Caski宫颈癌细胞中过表达,观察其编码蛋白质在Caski细胞中的定位。方法从Caski细胞中提取总RNA,采用反转录PCR扩增人MTERF2基因可读框序列,将其重组于p3×FLAG-CMV-1... 目的构建人线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因真核表达载体,并在人Caski宫颈癌细胞中过表达,观察其编码蛋白质在Caski细胞中的定位。方法从Caski细胞中提取总RNA,采用反转录PCR扩增人MTERF2基因可读框序列,将其重组于p3×FLAG-CMV-14载体中,利用PCR和DNA测序鉴定重组子正确性;并用脂质体法转染至Caski细胞,转染24、32、48 h,采用Western blot法检测MTERF2蛋白水平,通过免疫荧光细胞化学染色观察其亚细胞定位情况。结果经过PCR和DNA测序鉴定,人MTERF2基因可读框正确地插入到真核表达质粒中,大小为1158 bp,表达的蛋白相对分子质量(Mr)为44 000,与预计大小相符。转染p3×FLAG-MTERF2质粒的Caski细胞培养24 h,可检测到目的蛋白表达,该蛋白主要定位于线粒体中。结论在Caski细胞成功表达了MTERF2蛋白并证实其定位于线粒体。 展开更多
关键词 线粒体转录终止因子2(MTERF2) Caski宫颈癌细胞 真核表达 蛋白定位
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GPX5在成年绵羊附睾中的表达与蛋白定位 被引量:8
15
作者 栗瑞兰 张通 +4 位作者 范晓梅 欧阳效晴 张春强 曹俊伟 张家新 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第24期4989-4995,共7页
【目的】研究谷胱甘肽过氧化物酶-5(glutathione peroxidase type-5,GPX5)在成年绵羊附睾的表达特征以及GPX5蛋白在附睾中的定位,为绵羊精子在附睾中抗氧化机制的研究提供理论依据。【方法】采取年龄相近的成年蒙古绵羊的附睾、睾丸和... 【目的】研究谷胱甘肽过氧化物酶-5(glutathione peroxidase type-5,GPX5)在成年绵羊附睾的表达特征以及GPX5蛋白在附睾中的定位,为绵羊精子在附睾中抗氧化机制的研究提供理论依据。【方法】采取年龄相近的成年蒙古绵羊的附睾、睾丸和输精管。每一只公羊的附睾分别按照附睾头、附睾体和附睾尾进行分割。样品保存于-80℃冰箱,采用实时荧光定量PCR和Western blotting的方法,对成年绵羊的附睾、睾丸和输精管的GPX5表达量进行分析。将新鲜的组织样品各部分切取适合大小浸泡于4%多聚甲醛溶液中24h,按照石蜡切片的方法制作组织切片。用GPX5特异性抗体孵育组织切片,利用DAB显色试剂盒对阳性信号进行标记。【结果】实时荧光定量PCR结果显示,成年绵羊附睾头GPX5基因的表达量极显著高于附睾体和附睾尾(P<0.01),而在输精管和睾丸几乎不表达。Western blotting的结果显示,GPX5蛋白在成年绵羊附睾头高表达,在附睾体和附睾尾有微量蛋白存在,睾丸和输精管中未发现GPX5蛋白。这表明GPX5主要在成年绵羊附睾头表达;经过免疫组化染色分析,GPX5蛋白主要位于附睾头上皮细胞质以及静纤毛,附睾体和附睾尾中的GPX5蛋白主要集中在静纤毛。在附睾头、附睾体和附睾尾中的精子上以及附睾腔都可以观察到GPX5蛋白,表明GPX5蛋白从附睾上皮分泌到附睾腔中,随着精子在附睾中的运输与精子结合。【结论】在成年绵羊附睾中,GPX5主要由附睾头上皮细胞合成和分泌,在附睾管腔中与精子结合,为精子功能的正常发挥提供保护。 展开更多
关键词 绵羊 附睾 GPX5 基因表达 蛋白定位
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分子生物学综合性实验的设计与探索 被引量:8
16
作者 肖靓 唐朝晖 +2 位作者 李奇志 罗天明 潘少涛 《实验科学与技术》 2011年第2期141-143,共3页
对分子生物学综合性实验《GFP和HSF4的融合蛋白在HeLa细胞中的定位观察》进行了研究和探讨,通过实验方案的设计、实施以及实验结果分析这个完整的实验过程,培养了学生的科研兴趣,学生的动手能力、创新思维,团队合作和创新实践方面逐步... 对分子生物学综合性实验《GFP和HSF4的融合蛋白在HeLa细胞中的定位观察》进行了研究和探讨,通过实验方案的设计、实施以及实验结果分析这个完整的实验过程,培养了学生的科研兴趣,学生的动手能力、创新思维,团队合作和创新实践方面逐步得到加强和提高,收到了良好的教学效果。 展开更多
关键词 分子生物学 综合性实验 教学改革 创新思维 融合蛋白 定位
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基于特征图网络和多种生物信息预测关键蛋白质的深度学习框架 被引量:1
17
作者 刘桂霞 曹心恬 赵贺 《吉林大学学报(理学版)》 CAS 北大核心 2024年第3期593-605,共13页
针对生物实验识别关键蛋白质费时费力,使用计算方法预测关键蛋白质无法有效整合生物信息的问题,提出一个深度学习框架.首先利用网络拓扑结构、基因表达数据和GO(gene ontology)注释数据构建加权蛋白质相互作用网络;然后分别使用特征图... 针对生物实验识别关键蛋白质费时费力,使用计算方法预测关键蛋白质无法有效整合生物信息的问题,提出一个深度学习框架.首先利用网络拓扑结构、基因表达数据和GO(gene ontology)注释数据构建加权蛋白质相互作用网络;然后分别使用特征图网络和双向长短期记忆细胞从亚细胞定位数据、蛋白质复合物数据和基因表达数据中提取特征向量;最后将这些特征向量输入到任务学习层预测关键蛋白质.实验结果表明,相比于现有的计算方法,该方法预测性能更好. 展开更多
关键词 关键蛋白质 特征图网络 亚细胞定位 基因表达 GO注释 蛋白质复合物
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蛋白激酶Wee1B在小鼠1-细胞期受精卵中的表达及其定位 被引量:6
18
作者 刘超 肖建英 +3 位作者 任丽莉 刘洋 马浚仁 于秉治 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期863-867,I0001,共6页
目的:检测小鼠1-细胞期受精卵各个细胞周期中蛋白激酶Wee1B的表达水平及其定位水平,初步阐明Wee1B对哺乳动物受精卵早期发育调控的机制。方法:超排卵获得小鼠1-细胞期受精卵,收集卵细胞后用RT-PCR和Western blotting方法检测Wee1B的mRN... 目的:检测小鼠1-细胞期受精卵各个细胞周期中蛋白激酶Wee1B的表达水平及其定位水平,初步阐明Wee1B对哺乳动物受精卵早期发育调控的机制。方法:超排卵获得小鼠1-细胞期受精卵,收集卵细胞后用RT-PCR和Western blotting方法检测Wee1B的mRNA和蛋白表达水平;放射自显影测定Wee1B活性;间接免疫荧光观察Wee1B在各个细胞时期的定位。结果:小鼠1-细胞期受精卵G1、S、G2和M期Wee1BmRNA相对表达量比较差异均无统计学意义(P>0.05);S、G2和M期Wee1B蛋白表达量与G1期比较差异有统计学意义(P<0.01);与G1期比较,S、G2期Wee1B活性逐渐增高(P>0.05,P<0.01),M期Wee1B活性迅速下降(P<0.01)。G1期和S期细胞Wee1B蛋白偶联的红色荧光信号主要集中分布于细胞核,但在G2期细胞红色荧光信号弥散分布于细胞浆,在M末期和2-细胞期可见红色荧光信号又重新分布于细胞核,细胞浆内荧光减弱。结论:蛋白激酶Wee1B在小鼠1-细胞期受精卵各个细胞周期动态表达,Wee1B蛋白存在核浆转位,Wee1B的定位变化可能调控小鼠受精卵有丝分裂。 展开更多
关键词 Wee1B Wee1蛋白 小鼠 合子 蛋白表达 蛋白定位
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NOD蛋白与免疫应答 被引量:7
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作者 沈雪莹 方传雷 刘志华 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期801-810,共10页
NOD蛋白包括NOD1和NOD2,两者识别细菌肽聚糖的片段,诱导促炎和抗菌反应。在本篇综述中,我们介绍近年来NOD蛋白的研究进展,包括激活的方式,信号途径的调节,在细胞中的定位以及在免疫防御过程中发挥的作用。洞悉NOD蛋白诱导的信号通路有... NOD蛋白包括NOD1和NOD2,两者识别细菌肽聚糖的片段,诱导促炎和抗菌反应。在本篇综述中,我们介绍近年来NOD蛋白的研究进展,包括激活的方式,信号途径的调节,在细胞中的定位以及在免疫防御过程中发挥的作用。洞悉NOD蛋白诱导的信号通路有助于了解相关疾病的致病机理,为疾病的治疗提供新的视角。 展开更多
关键词 NOD蛋白 胞内定位 生理功能
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中华蜜蜂嗅觉受体AcerOrco的表达及定位分析 被引量:6
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作者 张中印 杨珊珊 +2 位作者 孟娇 赵慧婷 姜玉锁 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期185-191,共7页
【目的】通过对中华蜜蜂Apis cerana cerana嗅觉受体AcerOrco的表达及蛋白定位分析,阐明AcerOrco的表达特性,以期为进一步探索其功能提供理论依据。【方法】分别通过qRT-PCR技术和Western blot技术对中华蜜蜂气味受体AcerOrco mRNA及蛋... 【目的】通过对中华蜜蜂Apis cerana cerana嗅觉受体AcerOrco的表达及蛋白定位分析,阐明AcerOrco的表达特性,以期为进一步探索其功能提供理论依据。【方法】分别通过qRT-PCR技术和Western blot技术对中华蜜蜂气味受体AcerOrco mRNA及蛋白在内勤蜂和采集蜂5个组织部位(触角、头、胸、腹和足)中的相对表达量进行分析,采用免疫组化技术对AcerOrco蛋白的表达进行定位分析。【结果】定量结果显示,AcerOrco转录本在内勤蜂和采集蜂各组织中均有表达,其中触角中的表达量最高;该基因在采集蜂各组织中的表达量普遍高于内勤蜂。AcerOrco受体蛋白在内勤蜂和采集蜂各组织中也均有表达,在触角和头部的表达量明显高于其他组织。定位结果显示,在内勤蜂触角中,AcerOrco主要在毛形感器中表达,板形感器中表达不明显;在采集蜂触角的板形感器和毛形感器中均有表达,但毛形感器中的表达更多一些。【结论】获得了AcerOrco mRNA及其蛋白在内勤蜂和采集蜂各组织中的表达特性,并将这一蛋白表达定位于工蜂触角的毛形感器和板形感器中。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 嗅觉受体 MRNA表达 蛋白表达 蛋白定位
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