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猪NLRC5基因启动子克隆及生物信息学分析
1
作者
刘翔
尹灵丹
+6 位作者
薛美
李亮
赵立媛
蒋成凡
王文哲
冯力
刘平黄
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第13期1-5,143,共6页
为了构建猪NLR家族含CARD结构域5(NOD-like receptor family caspase recruitment domain family domain-containing 5,NLRC5)基因启动子双荧光素酶报告质粒,确认其活性,进而探索其转录调控机制,试验采用PCR方法从猪睾丸细胞(swine test...
为了构建猪NLR家族含CARD结构域5(NOD-like receptor family caspase recruitment domain family domain-containing 5,NLRC5)基因启动子双荧光素酶报告质粒,确认其活性,进而探索其转录调控机制,试验采用PCR方法从猪睾丸细胞(swine testicular cell,ST细胞)中扩增出猪NLRC5基因启动子,将其与pGL3-Basic载体连接,测序正确后将猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒转染至ST细胞中,通过双荧光素酶报告检测试剂盒检测荧光素酶的表达活性,并使用生物信息学软件预测该基因启动子区域的CpG岛、调控元件及转录因子结合位点。结果表明:试验成功构建猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒,该质粒的相对荧光素酶活性极显著高于pGL3-Basic载体(P<0.01)。NLRC5基因启动子区域中存在2个CpG岛,TATA box、CCAAT box和GC box等多种调控元件,以及IRF1、IRF3、STAT1、STAT3、STAT4和NF-κB转录因子结合位点。说明猪NLRC5基因的表达可能受甲基化的影响,同时也可能受顺式作用元件以及干扰素和NF-κB相关转录因子的调控。
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关键词
启动子质粒
双荧光素酶
NLR家族含CARD结构域5(NLRC5)基因
启动子调控元件
转录因子结合位点
生物信息学
原文传递
病原物诱导型植物启动子的研究方法
2
作者
马睿
陈华民
+2 位作者
吴茂森
吴祖建
何晨阳
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期32-37,共6页
植物启动子是控制基因转录的DNA序列之一,按其表达方法可分为组成型(或非特异性)表达和诱导型(或特异性)表达启动子两种类型。当受到病原物侵染时,植物通常通过诱导型启动子中的W-box、RAV1 AAT和WRKY等元件/位点、调控下游基因的表达,...
植物启动子是控制基因转录的DNA序列之一,按其表达方法可分为组成型(或非特异性)表达和诱导型(或特异性)表达启动子两种类型。当受到病原物侵染时,植物通常通过诱导型启动子中的W-box、RAV1 AAT和WRKY等元件/位点、调控下游基因的表达,作出相应的应答反应。近年来,通过计算机预测与试验测定方法的有效结合,发掘和鉴定出了一些病原物诱导型启动子,并进行了调控功能的解析。此外,在通过转基因方法改良植物抗病性的途径中,利用病原物诱导型启动子可以实现对抗病功能相关基因表达的精准控制,避免由组成型启动子持续驱动基因表达、对植株本身带来的负效应。结合本室对水稻启动子OsBTF3-p的研究结果,重点对近年来国内外有关病原物诱导型启动子及其调控元件/位点的研究方法和应用进展作一综述。
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关键词
诱导型启动子
调控元件
转基因途径
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职称材料
根特异性启动子的种类和功能
被引量:
3
3
作者
王春燕
王孝坤
+2 位作者
李巧玲
谢成建
杨星勇
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期15-21,共7页
植物依靠根系来固定和支撑,并依赖根系吸收和运输土壤中的水分及养分、合成和贮藏营养物质。因此,根在植物生长发育中起着重要的作用。了解根特异性表达基因,特别是其启动子对作物改良具有重要的价值,尤其在植物抗病虫害、耐盐碱,以及...
植物依靠根系来固定和支撑,并依赖根系吸收和运输土壤中的水分及养分、合成和贮藏营养物质。因此,根在植物生长发育中起着重要的作用。了解根特异性表达基因,特别是其启动子对作物改良具有重要的价值,尤其在植物抗病虫害、耐盐碱,以及提高和改善食根性植物产量、营养成分等方面有突出的应用价值。综述植物根特异性表达基因,并重点介绍这些特异性表达基因的启动子种类及其功能,以期为根特异性启动子在植物基因工程的研究奠定理论基础。
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关键词
根特异表达基因
启动子
调控元件
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职称材料
利用补丁甲基化技术构建特殊报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子的调控活性
被引量:
2
4
作者
梁云生
赵明
+2 位作者
梁功平
尹恒
陆前进
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期120-124,共5页
目的:构建一种特殊的荧光素报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子调控序列的调控活性。方法:用补丁甲基化技术构建特殊的含完全甲基化和模拟甲基化的FCER1G启动子调控序列的PGL-3荧光素报告载体;通过比较完全甲基化与模拟甲基化荧...
目的:构建一种特殊的荧光素报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子调控序列的调控活性。方法:用补丁甲基化技术构建特殊的含完全甲基化和模拟甲基化的FCER1G启动子调控序列的PGL-3荧光素报告载体;通过比较完全甲基化与模拟甲基化荧光素报告载体活性来检测DNA甲基化对FCERG基因启动子调控序列的调控活性。结果:成功构建特殊的完全甲基化与模拟甲基化FCER1G启动子调控序列荧光素报告载体;并检测出完全甲基化与模拟甲基化荧光素报告载体活性比为(0.36±0.07):1(P<0.001)。结论:FCER1G启动子调控序列是甲基化敏感位点,FCER1G启动子受DNA甲基化调控。
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关键词
补丁甲基化
FCER1G基因
启动子调控序列
DNA甲基化
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职称材料
题名
猪NLRC5基因启动子克隆及生物信息学分析
1
作者
刘翔
尹灵丹
薛美
李亮
赵立媛
蒋成凡
王文哲
冯力
刘平黄
机构
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
中国农业大学动物医学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第13期1-5,143,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31802198)。
文摘
为了构建猪NLR家族含CARD结构域5(NOD-like receptor family caspase recruitment domain family domain-containing 5,NLRC5)基因启动子双荧光素酶报告质粒,确认其活性,进而探索其转录调控机制,试验采用PCR方法从猪睾丸细胞(swine testicular cell,ST细胞)中扩增出猪NLRC5基因启动子,将其与pGL3-Basic载体连接,测序正确后将猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒转染至ST细胞中,通过双荧光素酶报告检测试剂盒检测荧光素酶的表达活性,并使用生物信息学软件预测该基因启动子区域的CpG岛、调控元件及转录因子结合位点。结果表明:试验成功构建猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒,该质粒的相对荧光素酶活性极显著高于pGL3-Basic载体(P<0.01)。NLRC5基因启动子区域中存在2个CpG岛,TATA box、CCAAT box和GC box等多种调控元件,以及IRF1、IRF3、STAT1、STAT3、STAT4和NF-κB转录因子结合位点。说明猪NLRC5基因的表达可能受甲基化的影响,同时也可能受顺式作用元件以及干扰素和NF-κB相关转录因子的调控。
关键词
启动子质粒
双荧光素酶
NLR家族含CARD结构域5(NLRC5)基因
启动子调控元件
转录因子结合位点
生物信息学
Keywords
promoter
plasmid
dual
luciferase
reporter
system
NOD-like
receptor
family
caspase
recruitment
domain
family
domain-containing
5(NLRC5)gene
promoter
regulatory
elements
transcription
factor
binding
sites
bioinformatics
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
Q78 [农业科学—畜牧兽医]
原文传递
题名
病原物诱导型植物启动子的研究方法
2
作者
马睿
陈华民
吴茂森
吴祖建
何晨阳
机构
福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期32-37,共6页
基金
国家转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08009-044B
2009ZX08012-016B)
文摘
植物启动子是控制基因转录的DNA序列之一,按其表达方法可分为组成型(或非特异性)表达和诱导型(或特异性)表达启动子两种类型。当受到病原物侵染时,植物通常通过诱导型启动子中的W-box、RAV1 AAT和WRKY等元件/位点、调控下游基因的表达,作出相应的应答反应。近年来,通过计算机预测与试验测定方法的有效结合,发掘和鉴定出了一些病原物诱导型启动子,并进行了调控功能的解析。此外,在通过转基因方法改良植物抗病性的途径中,利用病原物诱导型启动子可以实现对抗病功能相关基因表达的精准控制,避免由组成型启动子持续驱动基因表达、对植株本身带来的负效应。结合本室对水稻启动子OsBTF3-p的研究结果,重点对近年来国内外有关病原物诱导型启动子及其调控元件/位点的研究方法和应用进展作一综述。
关键词
诱导型启动子
调控元件
转基因途径
Keywords
Pathogen-inducible
plant
promoter
regulatory
elements
Transgenic
approaches
分类号
S432 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
根特异性启动子的种类和功能
被引量:
3
3
作者
王春燕
王孝坤
李巧玲
谢成建
杨星勇
机构
重庆师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期15-21,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30771388)
重庆市自然科学基金项目(cstc2012jjA80021)
+2 种基金
重庆市教委项目(KJ120604)
重庆师范大学重点项目(2011XLZ09)
重庆师范大学博士启动金项目(12XLB002)
文摘
植物依靠根系来固定和支撑,并依赖根系吸收和运输土壤中的水分及养分、合成和贮藏营养物质。因此,根在植物生长发育中起着重要的作用。了解根特异性表达基因,特别是其启动子对作物改良具有重要的价值,尤其在植物抗病虫害、耐盐碱,以及提高和改善食根性植物产量、营养成分等方面有突出的应用价值。综述植物根特异性表达基因,并重点介绍这些特异性表达基因的启动子种类及其功能,以期为根特异性启动子在植物基因工程的研究奠定理论基础。
关键词
根特异表达基因
启动子
调控元件
Keywords
Root-specific
genes
promoter
s
regulatory
elements
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
利用补丁甲基化技术构建特殊报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子的调控活性
被引量:
2
4
作者
梁云生
赵明
梁功平
尹恒
陆前进
机构
中南大学湘雅二医院皮肤科
出处
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期120-124,共5页
基金
国家自然科学基金青年项目(30800993/H1103)
国家重点基础研究计划(973计划)(2009CB825605)~~
文摘
目的:构建一种特殊的荧光素报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子调控序列的调控活性。方法:用补丁甲基化技术构建特殊的含完全甲基化和模拟甲基化的FCER1G启动子调控序列的PGL-3荧光素报告载体;通过比较完全甲基化与模拟甲基化荧光素报告载体活性来检测DNA甲基化对FCERG基因启动子调控序列的调控活性。结果:成功构建特殊的完全甲基化与模拟甲基化FCER1G启动子调控序列荧光素报告载体;并检测出完全甲基化与模拟甲基化荧光素报告载体活性比为(0.36±0.07):1(P<0.001)。结论:FCER1G启动子调控序列是甲基化敏感位点,FCER1G启动子受DNA甲基化调控。
关键词
补丁甲基化
FCER1G基因
启动子调控序列
DNA甲基化
Keywords
patch
methylation
FCER1G
promoter
regulatory
element
DNA
methylation
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪NLRC5基因启动子克隆及生物信息学分析
刘翔
尹灵丹
薛美
李亮
赵立媛
蒋成凡
王文哲
冯力
刘平黄
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021
0
原文传递
2
病原物诱导型植物启动子的研究方法
马睿
陈华民
吴茂森
吴祖建
何晨阳
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
下载PDF
职称材料
3
根特异性启动子的种类和功能
王春燕
王孝坤
李巧玲
谢成建
杨星勇
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
下载PDF
职称材料
4
利用补丁甲基化技术构建特殊报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子的调控活性
梁云生
赵明
梁功平
尹恒
陆前进
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
下载PDF
职称材料
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