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基于CRISPR/Cas系统的基因编辑工具及其改进策略 被引量:2
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作者 辛圆 田开仁 +1 位作者 乔建军 财音青格乐 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期72-85,共14页
CRISPR/Cas系统自发现以来持续推动着生命科学领域的进步。与此同时,CRISPR/Cas介导的基因编辑技术也在不断发展壮大。基于DSBs修复的CRISPR/Cas基因编辑技术、碱基编辑器和先导编辑器等新型基因编辑工具的开发为生物学基础研究铺平了... CRISPR/Cas系统自发现以来持续推动着生命科学领域的进步。与此同时,CRISPR/Cas介导的基因编辑技术也在不断发展壮大。基于DSBs修复的CRISPR/Cas基因编辑技术、碱基编辑器和先导编辑器等新型基因编辑工具的开发为生物学基础研究铺平了道路。虽然这些工具为生物技术带来了革命性变化,但基因编辑效率偏低、产物纯度不高、脱靶效应频繁等问题也随之而来。不断开发精确、高效和安全的CRISPR/Cas基因编辑工具仍是当前和未来的生命科学研究热点。概述了CRISPR/Cas基因编辑工具的发展、构成及原理,总结了CRISPR/Cas基因编辑系统提升编辑效率、扩展编辑范围和降低脱靶效应的通用策略及不同CRISPR/Cas基因编辑工具的改进方法,并就CRISPR/Cas基因编辑工具未来的研究方向进行展望。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 基因编辑效率 DSBs 碱基编辑器 先导编辑器
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基于CRISPR/Cas系统的DNA碱基编辑技术及其在生物医学和农业中的应用 被引量:4
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作者 余传照 莫健新 +2 位作者 赵鑫 李国玲 张献伟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期3071-3087,共17页
近年来,基于成簇的规律间隔短回文重复序列及其相关系统(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas)的基因编辑技术飞速发展,该系统可以利用同源定向重组(Homology directed re... 近年来,基于成簇的规律间隔短回文重复序列及其相关系统(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas)的基因编辑技术飞速发展,该系统可以利用同源定向重组(Homology directed repair,HDR)来完成其介导的精准编辑,但效率极低,限制了其在农业和生物医学等领域上的推广应用。基于CRISPR/Cas系统的DNA碱基编辑技术作为一种新兴的基因组编辑技术,能在不产生双链断裂的情况下实现碱基的定向突变,相对于CRISPR/Cas介导的HDR编辑具有更高的编辑效率和特异性。目前,已开发出了可将C碱基突变为T碱基的胞嘧啶碱基编辑器(Cytidine base editors,CBE),将A碱基突变为G碱基的腺嘌呤碱基编辑器(Adenine base editors,ABE),以及可实现碱基任意变换和小片段精准插入和缺失的Prime编辑器(Prime editors,PE)。另外,能实现C到G颠换的糖基化酶碱基编辑器(Glycosylase base editors,GBE)以及能同时编辑A和C两种底物的双碱基编辑器也已被开发出来。文中主要综述了几种DNA碱基编辑器的开发历程、研究进展及各自优点和局限性;介绍了DNA碱基编辑技术在生物医学以及农业中的成功应用案例,以期为DNA碱基编辑器的进一步优化和选择应用提供借鉴。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 碱基编辑 胞嘧啶碱基编辑器 腺嘌呤碱基编辑器 prime编辑器
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基于CRISPR/Cas系统的多重基因编辑与调控技术 被引量:1
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作者 樊祥瑞 王俊燕 +1 位作者 梁丽亚 刘嵘明 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期2449-2464,共16页
规律成簇的间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关Cas蛋白所构建的CRISPR/Cas系统是古细菌或细菌中特有的一种获得性免疫系统。研究人员将其开发成基因编辑工具之后,凭借其高... 规律成簇的间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关Cas蛋白所构建的CRISPR/Cas系统是古细菌或细菌中特有的一种获得性免疫系统。研究人员将其开发成基因编辑工具之后,凭借其高效、精准和通用性强等优点迅速成为合成生物学领域的热门研究方向,在生命科学、生物工程技术、食品科学及农作物育种等多个领域引发了革命性的影响。目前基于CRISPR/Cas系统单基因编辑与调控技术日益完善,但在多重基因编辑和调控方面仍存在挑战。本文聚焦基于CRISPR/Cas系统的多重基因编辑与调控技术开发及应用,针对单个细胞内实现多位点基因编辑或调控和细胞群体内实现多位点基因编辑或调控技术,依据作用原理对其进行了系统总结和阐述,包括基于CRISPR/Cas系统的双链断裂、单链断裂以及多重基因调控技术等。这些工作丰富了多重基因编辑与调控的工具,为CRISPR/Cas系统在多领域的应用作出了贡献。 展开更多
关键词 规律成簇的间隔短回文重复序列及其相关Cas蛋白 可追踪基因编辑技术 碱基编辑器 先导编辑器 基因激活 基因抑制
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CRISPR/Cas及其衍生编辑技术在基因治疗中的应用进展 被引量:3
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作者 权春菊 郑忠亮 《生物技术进展》 2021年第4期518-525,共8页
基因治疗是指利用基因编辑技术对细胞基因进行"修饰"而达到治疗的目的。CRISPR/Cas的出现为基因编辑提供了简单、高效和多功能的平台,同时,为克服DNA双链断裂产生的不良影响,基于CRISPR/Cas的新型技术,如碱基编辑器(base edit... 基因治疗是指利用基因编辑技术对细胞基因进行"修饰"而达到治疗的目的。CRISPR/Cas的出现为基因编辑提供了简单、高效和多功能的平台,同时,为克服DNA双链断裂产生的不良影响,基于CRISPR/Cas的新型技术,如碱基编辑器(base editors,BE)、Prime Editors(PE)和Cas13效应器,被相继开发出来。目前,CRISPR/Cas及其衍生编辑技术已被广泛应用于动物细胞模型构建、药物靶点筛查和基因功能研究等领域,在基因治疗领域也展现出广阔的应用前景。基于此,简要介绍了CRISPR/Cas及其衍生编辑技术,综述了其在单基因遗传病、肿瘤和其他疾病的基因治疗中的应用进展,并分析了其当下面临的挑战,以期为基因编辑在单基因遗传病、肿瘤和其他疾病治疗领域提供理论参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 碱基编辑器 prime editors Cas13效应器 基因治疗
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单碱基编辑技术在动物中的应用 被引量:1
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作者 陈力 王静 +3 位作者 吴平先 张廷焕 郭宗义 王金勇 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第23期21-25,31,130-132,共9页
近年发展起来的人工核酸酶技术可引起特定位点的DNA双链断裂,断裂后通过同源重组修复机制使精准单碱基编辑成为可能。基于CRISPR/Cas9将Cas9n与胞嘧啶脱氨酶或腺苷脱氨酶融合而开发出的单碱基编辑系统可进一步提高单碱基编辑的效率和精... 近年发展起来的人工核酸酶技术可引起特定位点的DNA双链断裂,断裂后通过同源重组修复机制使精准单碱基编辑成为可能。基于CRISPR/Cas9将Cas9n与胞嘧啶脱氨酶或腺苷脱氨酶融合而开发出的单碱基编辑系统可进一步提高单碱基编辑的效率和精确度,在不造成DNA双链断裂的情况下实现精准单碱基编辑。对动物进行单碱基编辑不仅有望提高其生产性能,而且能为人类疾病研究作出重要贡献。文章回顾了单碱基编辑系统的发展历程,重点介绍了单碱基编辑系统在动物中的应用,并对单碱基编辑系统在动物中的应用前景进行了展望,以期为动物基因编辑技术的研发和应用提供理论依据和应用案例。 展开更多
关键词 同源重组 单碱基编辑系统 胞嘧啶碱基编辑器 腺嘌呤碱基编辑器 糖基化酶碱基编辑器 引导编辑器
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基于CRISPR/Cas9的精准基因编辑技术研究进展 被引量:7
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作者 薛珊 王淑雅 +3 位作者 刘丽 钟巧芳 程在全 肖素勤 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2566-2578,共13页
基因编辑技术是一种可以在基因组水平上对DNA序列进行改造的遗传操作技术。基于CRISPR/Cas9系统的精准编辑技术是一个操作方便、应用广泛的基因编辑技术,与传统的CRISPR/Cas9不同,精准基因编辑技术可以在不需要DNA模板的情况下对基因进... 基因编辑技术是一种可以在基因组水平上对DNA序列进行改造的遗传操作技术。基于CRISPR/Cas9系统的精准编辑技术是一个操作方便、应用广泛的基因编辑技术,与传统的CRISPR/Cas9不同,精准基因编辑技术可以在不需要DNA模板的情况下对基因进行定点突变。本文重点介绍了近年来基于CRISPR/Cas9介导的精准基因编辑技术的发展,并深入分析了基因精准编辑技术面临的挑战和机遇。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 单碱基编辑系统 引导编辑系统 双碱基编辑系统 转座子编辑系统
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引导编辑:突破碱基编辑类型的新技术 被引量:5
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作者 刘尧 周先辉 +1 位作者 黄舒泓 王小龙 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期993-1008,共16页
引导编辑技术(prime editing)是一种基于CRISPR/Cas系统的新型基因编辑技术。引导编辑器(prime editor,PE)的效应蛋白是逆转录酶与具有单链切割活性的nCas9(H840A)的融合蛋白,被称为PE2;其向导RNA是通过在sgRNA的3′末端增加逆转录模板... 引导编辑技术(prime editing)是一种基于CRISPR/Cas系统的新型基因编辑技术。引导编辑器(prime editor,PE)的效应蛋白是逆转录酶与具有单链切割活性的nCas9(H840A)的融合蛋白,被称为PE2;其向导RNA是通过在sgRNA的3′末端增加逆转录模板和引物结合位点序列构成,被称为pegRNA。PE系统可以实现所有12种类型的碱基突变,还可以实现短的插入删除编辑,及多种编辑类型的组合。自2019年被开发以来,因其编辑类型多样化及高特异性等优势,PE已经被成功地应用在多种动植物及细菌中,同时在基因治疗和农业育种等领域也展现出良好的应用前景。本文对PE系统的开发过程、特点、优化、应用、安全风险等方面进行了系统介绍,并对其发展前景进行了展望,以期有助于相关领域研究人员对PE系统的了解与应用。 展开更多
关键词 引导编辑器 CRISPR/Cas9 优化 应用
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CRISPR/Cas基因组编辑技术及其在农作物品种改良中的应用 被引量:4
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作者 赖郑诗雨 黄赞唐 +5 位作者 孙洁婷 敬雪皎 向垒 赵海明 莫测辉 侯学文 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第17期1923-1937,共15页
CRISPR/Cas是存在于细菌及古细菌中成簇的、规律间隔的短回文重复序列及其核酸酶系统,是细菌和古细菌中破坏噬菌体与外源DNA的免疫防护机制.科学家将该免疫防护机制改造成了简便高效的基因组编辑工具,并在微生物、动物及植物的基因功能... CRISPR/Cas是存在于细菌及古细菌中成簇的、规律间隔的短回文重复序列及其核酸酶系统,是细菌和古细菌中破坏噬菌体与外源DNA的免疫防护机制.科学家将该免疫防护机制改造成了简便高效的基因组编辑工具,并在微生物、动物及植物的基因功能解析及改良方面取得了巨大的进展.本文先对基于CRISPR/Cas开发的植物基因组编辑工具,如CRISPR/Cas9、CRISPR/Cas介导的同源重组、胞嘧啶碱基编辑器、腺嘌呤碱基编辑器、双碱基编辑器和引导编辑器等进行介绍,接着详细阐述了在作物分子育种中越来越重要的DNA-free CRISPR/Cas植物基因组编辑技术,然后探讨了CRISPR/Cas基因组编辑技术在提高作物产量和品质、提高作物对生物及非生物逆境抗性、从头驯化及定向改良等方面的应用,分析了CRISPR/Cas植物基因组编辑技术的发展趋势、促进该技术应用的国家政策导向及社会环境,以便更好地促进CRISPR/Cas基因组编辑技术在农作物品种改良中的应用,助推我国种业振兴和藏粮于技战略的实现. 展开更多
关键词 成簇的、规律间隔的短回文重复序列 基因组编辑 碱基编辑器 引导编辑器 作物改良 DNA-free
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