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猪流行性腹泻病毒河南流行株S基因的克隆与遗传进化分析 被引量：14
1
作者 乔涵 李辉 +6 位作者 赵丽 张宇 杨兴武 徐朋丽 韩昊莹 杨明凡 陈红英 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期781-786,共6页
近年来,我国大多省市暴发新生仔猪严重流行性腹泻,给养猪业造成巨大经济损失。为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)在河南省的流行和遗传变异情况,本研究对2014—2015年收集的30份临床腹泻样品,进行RT-PCR检测,对检测为阳性的PEDV样品进行S基... 近年来,我国大多省市暴发新生仔猪严重流行性腹泻,给养猪业造成巨大经济损失。为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)在河南省的流行和遗传变异情况,本研究对2014—2015年收集的30份临床腹泻样品,进行RT-PCR检测,对检测为阳性的PEDV样品进行S基因的克隆与序列分析。结果表明,30份临床腹泻样品中,RT-PCR检测出22个PEDV阳性样品,克隆的22条PEDV S序列与GenBank中发表的29条PEDVS基因序列核苷酸同源性为93.1%~99.2%。与经典毒株相比,22株河南流行株在S1区域存在碱基的插入、缺失现象;S基因遗传进化树表明,PEDV分为2群,河南流行株均属于PEDVП群,与近年国内分离株和韩国野毒株有较近亲缘关系,而与欧洲株以及中国目前使用的疫苗株亲缘关系较远,基因差异较大。 展开更多
关键词 流行性腹泻病毒 S基因 遗传进化分析
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鉴别猪流行性腹泻病毒野毒株和疫苗株RT-PCR方法的建立 被引量：1
2
作者 韩昊莹 郑慧华 +4 位作者 赵宇 张鸿鑫 侯华琳 贾会斌 陈红英 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期84-88,共5页
为临床上能鉴别猪流行性腹泻病毒(PEDV)野毒株和疫苗株,根据GenBank中已发表的PEDV疫苗株ORF3基因序列,在245~293位缺失区域两侧设计合成1对特异性引物,建立了快速鉴别和诊断PEDV野毒株和疫苗株的RT-PCR方法,即PEDV野毒株、疫苗株基因... 为临床上能鉴别猪流行性腹泻病毒(PEDV)野毒株和疫苗株,根据GenBank中已发表的PEDV疫苗株ORF3基因序列,在245~293位缺失区域两侧设计合成1对特异性引物,建立了快速鉴别和诊断PEDV野毒株和疫苗株的RT-PCR方法,即PEDV野毒株、疫苗株基因组中分别可扩增出长度为282和233bp的特异性片段,而对猪传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒、猪细小病毒、猪圆环病毒2型、猪博卡病毒、猪伪狂犬病毒核酸扩增均为阴性;对PEDV野毒株与疫苗株的最低检测下限分别为455拷贝/μL和396拷贝/μL。该方法不仅能够有效区分PEDV野毒株和疫苗株,而且能够鉴别发病猪的感染情况,为该病的防控提供了有效地技术保障。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 野毒株与疫苗株 ORF3基因 RT-PCR 诊断与鉴别
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2011年猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析 被引量：94
3
作者 刘孝珍 陈建飞 +4 位作者 时洪艳 张鑫 石达 刘胜旺 冯力 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期180-183,共4页
为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定;并将其进行比对和遗传演化分析。结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病... 为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定;并将其进行比对和遗传演化分析。结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病毒株S1基因核苷酸序列同源性为90.54%～99.96%,与经典病毒株CV777相比,其中有6个S1基因在453 bp～454 bp处存在3个核苷酸的缺失;一个在453 bp～454 bp处缺失6个核苷酸;其它10个S1基因在173 bp～186 bp之间存在12个核苷酸的插入,413 bp～417 bp之间有3个核苷酸的插入,467 bp～468 bp处缺失6个核苷酸,插入和缺失位点与韩国病毒株KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801相似。S1基因系统进化树分析表明,PEDV S1基因分为3群,其中7个S1基因属于PEDVⅠ群,另外10个属于PEDVⅢ群。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 遗传变异 S1基因
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2010～2012年华中地区猪流行性腹泻病毒分子特征和遗传进化分析 被引量：80
4
作者 郑逢梅 霍金耀 +4 位作者 赵军 常洪涛 王晓梦 陈陆 王川庆 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期197-205,共9页
2010年底开始,猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)在中国境内出现严重暴发。为探讨该病突然再次暴发的原因,对2010年10月至2012年6月于华中地区11个地市收集的12株猪流行性腹泻病毒(Porcineepidemic diarrhea virus,PEDV)S、M... 2010年底开始,猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)在中国境内出现严重暴发。为探讨该病突然再次暴发的原因,对2010年10月至2012年6月于华中地区11个地市收集的12株猪流行性腹泻病毒(Porcineepidemic diarrhea virus,PEDV)S、M和ORF3基因进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化关系、抗原位点、糖基化位点和多肽极性进行分析。结果显示,12株PEDV流行毒株S、M和ORF3基因部分核苷酸及氨基酸的改变使其关键序列明显不同于以往毒株,其中有11株流行毒株的S基因比现用疫苗毒株CV777多9个核苷酸,而且在其S1区N′端存在大量的氨基酸突变。遗传进化分析显示,12株PEDV华中地区毒株与2007～2009年韩国毒株、2007～2008年泰国毒株、2009～2010年越南毒株、2011年日本毒株及2010～2012年中国其它地区流行毒株亲缘关系均较密切,而与欧洲株(CV 777、Br1/87)、中国现用疫苗株(CV777)及2003～2007年中国分离株(LJB/03、JS-2004-2、DX、QH、LZC)亲缘关系均较远。与现用疫苗株(CV777)相比,流行毒株S蛋白的抗原位点、糖基化位点和跨膜螺旋均有明显改变,提示PEDV在近年呈现快速变异和进化的趋势,因而可能需要选择更有效的疫苗株来控制PEDV的暴发。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 分子特征 系统进化分析 S基因 ORF3基因 M基因 病毒变异
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猪流行性腹泻病毒分子生物学研究进展 被引量：51
5
作者 孙东波 冯力 +1 位作者 时洪艳 陈建飞 《动物医学进展》 CSCD 2006年第10期11-14,共4页
猪流行性腹泻病毒在Vero细胞上培养成功后,病毒全基因组的序列和分子结构特征,结构蛋白和非结构蛋白的生物学特性和功能,病原学、血清学和分子生物学的诊断技术,体液免疫、细胞免疫和局部黏膜免疫的机理,疫苗和病毒的细胞受体等方面得... 猪流行性腹泻病毒在Vero细胞上培养成功后,病毒全基因组的序列和分子结构特征,结构蛋白和非结构蛋白的生物学特性和功能,病原学、血清学和分子生物学的诊断技术,体液免疫、细胞免疫和局部黏膜免疫的机理,疫苗和病毒的细胞受体等方面得到了广泛的研究。但是,与其他冠状病毒相比,猪流行腹泻病毒的研究还比较滞后,许多研究还没有开展或不够深入,为了能加快对猪流行性腹泻病毒研究进程,对其最近的分子生物学研究进展做了综述,为猪流行性腹泻病毒的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 分子生物学 分子结构特征 病原学 血清学 诊断技术 体液免疫
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2014年部分地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查 被引量：39
6
作者 常铁城 陈建飞 +1 位作者 冯力 倪宏波 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期335-338,共4页
为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,本研究利用RT-PCR方法对2014年来自全国11个省市42个猪场的165份病料样品进行了检测。结果显示,在检测的42个猪场中,共有36个猪场显示PEDV阳性,猪场阳性率为85.71%。其中单独感染PEDV的猪场有25... 为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,本研究利用RT-PCR方法对2014年来自全国11个省市42个猪场的165份病料样品进行了检测。结果显示,在检测的42个猪场中,共有36个猪场显示PEDV阳性,猪场阳性率为85.71%。其中单独感染PEDV的猪场有25个,占总数的59.52%;混合感染PEDV和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的猪场有2个,占总数的4.76%,PEDV和猪轮状病毒(Po RV)混合感染猪场有7个,占总数的16.67%;3种病毒均混合感染的猪场有2个,占总数的4.76%。结果表明PEDV在我国的猪腹泻病病原中仍占主导地位。对2014年分离的21株PEDV ORF3基因进行测序分析,并与Gen Bank中登录的12株国内外PEDV参考株相关序列进行遗传变异分析。这33个PEDV株的ORF3基因系统发育树显示,目前我国的PEDV现地病毒株分布在Ⅰ群中的Ⅰ-Ⅰ亚群和Ⅰ-Ⅲ亚群。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 流行病学调查 ORF3基因 序列分析
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2015～2016年我国东北地区猪病毒性腹泻流行病学调查 被引量：37
7
作者 朱子健 闫丽辉 +3 位作者 鞠妍 唐志芬 杨金雨 朱庆虎 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期356-360,共5页
为了解东北地区(黑龙江省、吉林省和辽宁省)的猪病毒性腹泻发病情况和流行特点,本研究对2015年~2016年间东北地区的88个疑似病毒性腹泻猪场进行临床症状、发病猪日龄、发病时间、发病率、病死率等基本情况调查,并采用RT-PCR和抗原快速... 为了解东北地区(黑龙江省、吉林省和辽宁省)的猪病毒性腹泻发病情况和流行特点,本研究对2015年~2016年间东北地区的88个疑似病毒性腹泻猪场进行临床症状、发病猪日龄、发病时间、发病率、病死率等基本情况调查,并采用RT-PCR和抗原快速检测试剂盒对送检疑似病毒性腹泻仔猪粪便或肠道内容物264份样品进行病原检测。调查结果显示,疫情多发生在冬春寒冷季节。发病初期,后备猪、母猪或育肥猪呈一过性腹泻,发病率一般在1%以下,腹泻主要发生于哺乳仔猪,发病率高达87.97%,病死率高达89.90%。3个省份的7日龄以内仔猪发病率分别为62.52%、79.73%和75.00%,病死率为84.91%、80.87%和80.25%。随着日龄的增加,仔猪的发病率和死亡率呈明显递减趋势。病原学检测结果显示,传染性胃肠炎病病毒(TGEV)的阳性率为6.06%(16/264),猪流行性腹泻病毒(PEDV)的阳性率为74.62%(197/264),猪轮状病病毒(PoRV)的阳性率为25.76%。其中,单一病原感染以PEDV最高,感染率为48.86%,Po RV感染率为1.52%,TGEV感染率为0.38%。存在TGEV/PEDV、TGEV/PoRV、PEDV/PoRV混合感染和PEDV/TGEV/PoRV的3重感染,以PEDV/Po RV的双重感染为主。结果表明,东北三省份的猪病毒性腹泻发病率和死亡率均较高,主要病原以PEDV为主。该调查结果为东北地区养殖场猪病毒性腹泻的综合防控提供流行病学数据。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 猪流行性腹泻病毒 猪轮状病毒 猪病毒性腹泻 流行病学调查
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3种致猪腹泻病毒的多重RT-PCR检测 被引量：34
8
作者 田小艳 孙华 +3 位作者 邓雨修 苏润环 王东东 宋延华 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第9期54-57,共4页
试验建立了用于检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)与猪轮状病毒(PRV)的三重RT-PCR方法,以调查猪群中腹泻病毒感染情况。通过该方法对采自广东省规模化猪场的95份临床疑似病毒性腹泻病料进行了检测,结果表明,猪流行... 试验建立了用于检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)与猪轮状病毒(PRV)的三重RT-PCR方法,以调查猪群中腹泻病毒感染情况。通过该方法对采自广东省规模化猪场的95份临床疑似病毒性腹泻病料进行了检测,结果表明,猪流行性性腹泻病毒阳性率为33.7%,猪传染性胃肠炎病毒阳性率为4.2%,猪轮状病毒阳性率为20%;猪流行性性腹泻病毒和猪轮状病毒混合感染率为8.4%,猪流行性腹泻病毒和猪传染性胃肠炎病毒混合感染率为2.1%。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 猪轮状病毒 猪传染性胃肠炎病毒 多重RT-PCR
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山东省部分地区仔猪病毒性腹泻流行病学调查 被引量：35
9
作者 薛瑞雪 田野 +5 位作者 田夫林 张月 孙振 陈超 姜世金 陈书民 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期254-257,共4页
为了解山东省仔猪病毒性腹泻的流行状况,本研究根据Gen Bank中登录的猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）及猪轮状病毒（PRo V）序列,分别设计扩增引物,采用RT-PCR方法对2013年10月～2014年10月采集的226份腹泻样品... 为了解山东省仔猪病毒性腹泻的流行状况,本研究根据Gen Bank中登录的猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）及猪轮状病毒（PRo V）序列,分别设计扩增引物,采用RT-PCR方法对2013年10月～2014年10月采集的226份腹泻样品进行检测。结果显示226份病料样品中,PEDV、TGEV及PRo V的阳性率分别为34.96%、2.21%及28.76%,并且不同季节PEDV和PRo V均有感染,表明PEDV和PRo V是引起山东省仔猪腹泻的主要病原,并且山东省PRo V的感染率明显高于全国。规模化猪场与散养户相比,PEDV、TGEV及PRo V 3种病原的检出率明显降低,而且相对于未免疫腹泻二联苗的母猪,免疫母猪生产的仔猪发生腹泻后,该病原的检出率有所降低,表明合理的饲养环境和免疫对该病具有有效的防控作用。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 猪轮状病毒 流行病学调查
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猪流行性腹泻病毒CH/S株N蛋白基因的遗传变异及其原核表达 被引量：32
10
作者 陈建飞 冯力 +3 位作者 时洪艳 孙东波 白兴华 佟有恩 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期856-860,895,共6页
应用RT-PCR和nested-PCR方法扩增得到含猪流行性腹泻病毒CH/S株N蛋白基因的目的片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析。CH/S株N蛋白基因含有一个长1326bp的ORF,编码由441个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失。CH/S与CV777... 应用RT-PCR和nested-PCR方法扩增得到含猪流行性腹泻病毒CH/S株N蛋白基因的目的片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析。CH/S株N蛋白基因含有一个长1326bp的ORF,编码由441个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失。CH/S与CV777、Chinju99、JS-2004-2和LJB/03N蛋白基因ORF的序列同源性分别为97.1%、96.8%、96.7%和96.5%;推导的氨基酸序列的同源性分别为97.7%、97.1%、97.1%和96.8%。以阳性质粒为模板,用分别含有BamHⅠ和XhoⅠ酶切位点的上、下游引物扩增得到ORF,其PCR产物经BamHⅠ和XhoⅠ双酶切后定向克隆到pET-30a载体,构建的重组质粒命名为pET-30a-PN;将pET-30a-PN转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,在IPTG诱导下进行表达;SDS-PAGE结果表明表达出与预期大小相符的约54.4Ku的重组蛋白,重组蛋白以包涵体形式存在;薄层扫描结果表明表达产物占菌体总蛋白的30.5%;Western blot分析表明表达的重组蛋白能与抗PEDV高免血清反应,说明该重组蛋白具有免疫学活性。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 N蛋白基因 序列同源性 重组蛋白 免疫学活性
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猪流行性腹泻病毒的研究进展 被引量：34
11
作者 高君恺 刘浩飞 杨倩 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期1-5,共5页
猪流行性腹泻是一种急性、接触性、高度传染性消化道疾病,近年来给我国养猪业带来巨大经济损失。本文就近年来国内外对猪流行性腹泻病毒的研究进展(包括猪流行性腹泻病毒的结构蛋白和非结构蛋白、病毒的细胞培养特点、病毒感染的宿主受... 猪流行性腹泻是一种急性、接触性、高度传染性消化道疾病,近年来给我国养猪业带来巨大经济损失。本文就近年来国内外对猪流行性腹泻病毒的研究进展(包括猪流行性腹泻病毒的结构蛋白和非结构蛋白、病毒的细胞培养特点、病毒感染的宿主受体、遗传变异和疫苗的开发等)进行综述,以期为猪流行性腹泻的预防和控制提供帮助。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 结构蛋白 细胞培养特性 猪氨基肽酶N受体 疫苗开发
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猪流行性腹泻病毒研究进展 被引量：34
12
作者 刘政龙 王金良 沈志强 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第9期2506-2511,共6页
猪流行性腹泻病毒是引起猪腹泻的重要病原体之一,广泛流行于世界各地,造成了重大的经济损失。文章阐述了猪流行性腹泻病毒的分子生物学特点,概括了病毒的检测方法,并对近年来流行病学及疫苗的研发情况进行了综述,以期对猪流行性腹泻病... 猪流行性腹泻病毒是引起猪腹泻的重要病原体之一,广泛流行于世界各地,造成了重大的经济损失。文章阐述了猪流行性腹泻病毒的分子生物学特点,概括了病毒的检测方法,并对近年来流行病学及疫苗的研发情况进行了综述,以期对猪流行性腹泻病毒研究提供帮助。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 分子生物学 流行病学 检测方法 疫苗
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猪Delta冠状病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪流行性腹泻病毒多重RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量：29
13
作者 韦学雷 梁青青 +4 位作者 曹贝贝 张君涛 韩丽 兰培英 胡慧 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期11-16,共6页
猪Delta冠状病毒（PDcoV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）和猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）均是能引起仔猪腹泻的冠状病毒，通过临床症状和剖检很难鉴别诊断，建立同时检测且能够鉴别诊断这3种疾病的快速检测方法对于临床诊断具有重要的意义... 猪Delta冠状病毒（PDcoV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）和猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）均是能引起仔猪腹泻的冠状病毒，通过临床症状和剖检很难鉴别诊断，建立同时检测且能够鉴别诊断这3种疾病的快速检测方法对于临床诊断具有重要的意义。参照GenBank中登录的PDCoV，NPEDVM和TGEVN基因的基因序列，利用Primer5．0设计合成3对能扩增特异性目的片段的引物，构建重组质粒，并对RT-PCR反应条件进行优化，建立了检测PDCoV，PEDV和TGEV的多重RT—PCR诊断方法，并对所建立的方法进行敏感性、特异性和重复性分析。利用该方法对河南176份临床样品进行检测，并与普通RT-PCR检测方法对该检测方法进行比较分析。结果表明，所建立的三重RT-PCR方法对PDCoV的最低检测量是3．14×10 3拷贝／uL；PEDV的最低检测量是3．88×10 4拷贝／uL和TGEV的最低检测量是3．68×10 4拷贝／uL。所建立的方法具有较好的特异性，对猪博卡病毒（PboV）、猪伪狂犬病病毒（PRV）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、猪瘟（CSFV）和猪圆环病毒（PCV）等猪常见病毒的扩增结果均为阴性。应用所建立的三重RT-PCR方法对176份临床收集的仔猪腹泻样品进行PEDV，PDCoV和TGEV检测，并将检测结果和单重RT-PCR检测方法比较，结果显示，多重RT—PCR检测结果与常规单一RT～PCR的结果符合率均为100％。综上，本试验建立了能同时检测PDCoV，PEDV和TGEV的三重RT—PCR方法，为临床上这3种疫病的快速检测和流行病学调查奠定了基础。 展开更多
关键词 猪Delta冠状病毒 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 多重RT—PCR方法
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猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析 被引量：30
14
作者 王隆柏 林裕胜 +4 位作者 车勇良 吴学敏 陈如敬 邵良平 周伦江 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2014年第11期1830-1836,共7页
为探明2012—2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒（PEDV）结构蛋白的遗传变异情况,对7株PEDV流行毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析。结果表明:7株PEDV S基因之间的核苷酸相似性为98.6%<sup>9</sup>9.4%,与attenua... 为探明2012—2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒（PEDV）结构蛋白的遗传变异情况,对7株PEDV流行毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析。结果表明:7株PEDV S基因之间的核苷酸相似性为98.6%<sup>9</sup>9.4%,与attenuated DR13弱毒株和CV777标准株的相似性分别为93.7%<sup>9</sup>4.1%和93.8%<sup>9</sup>4.1%;同CV777标准株比较,存在64个氨基酸突变,其中有3个氨基酸较以往国内外流行毒株的变异不一样,为新变异氨基酸,氨基酸的插入和缺失与2008年泰国NPPED2008<sub>2</sub>株相似;7株PEDV毒株的N基因和ORF3基因之间核苷酸的相似性分别为96.5%<sup>9</sup>9.7%和99.7%<sup>1</sup>00%,与CV777标准株的相似性分别为96.6%<sup>9</sup>8.0%和96.6%<sup>9</sup>6.9%。遗传进化树表明:7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因与泰国流行毒株的亲缘关系较近,N基因与CV777标准株亲缘关系较近。7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因变异程度较大,可能源于泰国及韩国的变异株。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 N基因 ORF3基因 变异分析
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猪流行性腹泻病毒FJ-11A株的分离与ORF3基因序列分析 被引量：27
15
作者 陈如敬 吴学敏 +5 位作者 车勇良 王隆柏 魏宏 庄向生 严山 周伦江 《福建农业学报》 CAS 2011年第6期947-951,共5页
从福建省某疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集腹泻粪便样品和小肠组织,利用Vero细胞连续传代后,分离到猪流行性腹泻病毒福建株(FJ-11A株)。根据GenBank中登录的猪流行性腹泻病毒ORF3基因特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法对猪流行性腹... 从福建省某疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集腹泻粪便样品和小肠组织,利用Vero细胞连续传代后,分离到猪流行性腹泻病毒福建株(FJ-11A株)。根据GenBank中登录的猪流行性腹泻病毒ORF3基因特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒福建株ORF3基因进行扩增,将扩增目的片段经胶回收后进行克隆测序。结果表明,所扩增的目的片段基因编码有完整的ORF3开放阅读框,全长为675bp,编码有224个氨基酸。运用DNAStar软件,将获得的ORF3基因序列和GenBan中登录的猪流行性腹泻病毒株ORF3基因序列进行分析比较和遗传进化分析,猪流行性腹泻病毒福建株ORF3基因和韩国分离株CPF1074和PFF513该基因核苷酸同源性最高,均为99.3%,与疫苗株CV777核苷酸同源性为97.8%。从遗传进化上看,我国PEDV分离株ORF3基因处在同一个分支,而弱毒株则处在相对独立的分支。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 ORF3基因 序列分析
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2011—2017年浙江省猪病毒性腹泻病的流行病学调查 被引量：25
16
作者 徐丽华 李军星 +4 位作者 苏菲 余斌 王赛 田瑞雨 袁秀芳 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期625-630,共6页
为了解浙江省不同地区猪群中猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪轮状病毒（Po RV）和猪Delta冠状病毒（PDCo V）导致猪病毒性腹泻的感染情况,本研究应用RT-PCR方法对2011—2017年收集的浙江省不同地区猪腹泻样... 为了解浙江省不同地区猪群中猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪轮状病毒（Po RV）和猪Delta冠状病毒（PDCo V）导致猪病毒性腹泻的感染情况,本研究应用RT-PCR方法对2011—2017年收集的浙江省不同地区猪腹泻样品进行4种病毒的检测与分析。结果显示,2011年至今,PEDV阳性率为71.25%,TGEV阳性率为3.05%,Po RV阳性率为17.67%,PDCo V阳性率为8.75%;单独感染中PEDV阳性率为51.89%,TGEV阳性率为0.94%,Po RV阳性率为5.19%,PDCo V阳性率为4.25%;混合感染中PEDV/TGEV阳性率为2.4%,PEDV/Po RV阳性率为15.1%,PEDV/PDCo V阳性率为2.8%,Po RV/PDCo V阳性率为0.5%,PEDV/TGEV/PDCo V阳性率为0.5%。结果表明,浙江省不同地区存在这4种病毒所导致的猪病毒性腹泻病,其中在单独感染中以PEDV感染为主,混合感染中以PEDV/Po RV二重混合感染为主。不同年份中以PEDV感染最为严重,阳性率均在50%以上;Po RV感染在2015年上半年阳性率高达60.9%,其余年份均稳定在20%左右;TGEV每年均有零星发病;PDCo V在2016年感染最为严重,阳性率为22.9%。该结果为浙江省猪病毒性腹泻病的诊断和防控积累了资料。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 猪轮状病毒 猪Delta冠状病毒 RT-PCR 流行病学调查
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猪流行性腹泻的诊断与预防 被引量：24
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作者 王靓靓 李训良 +1 位作者 李鹏冲 任晓峰 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期33-38,共6页
猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的一种严重的病毒性传染病.该病的特征是可以导致哺乳仔猪发生严重的腹泻、呕吐、脱水,并且致死率极高.本文在简述PEDV的... 猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的一种严重的病毒性传染病.该病的特征是可以导致哺乳仔猪发生严重的腹泻、呕吐、脱水,并且致死率极高.本文在简述PEDV的流行病学、基因组特性和临床症状的基础上,对实验室诊断和疫苗防治等方面进行综述,为猪流行性腹泻病的防控提供参考. 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 猪流行性腹泻病毒
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猪流行性腹泻病毒CH/JL毒株S基因的克隆、序列分析及线性抗原表位区的鉴定 被引量：21
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作者 孙东波 冯力 +4 位作者 陈建飞 时洪艳 佟有恩 刘胜旺 陈洪岩 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期224-229,共6页
以猪流行性腹泻病毒CH/JL毒株的RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得的3个相互重叠的cDNA克隆覆盖了S基因,序列比对结果表明：PEDV CH/JL株S基因与CV777、Brl/87、JS、KPEDV和Chinju99毒株S基因核苷酸序列的同源性分别为96.97%、96.87%、96.41... 以猪流行性腹泻病毒CH/JL毒株的RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得的3个相互重叠的cDNA克隆覆盖了S基因,序列比对结果表明：PEDV CH/JL株S基因与CV777、Brl/87、JS、KPEDV和Chinju99毒株S基因核苷酸序列的同源性分别为96.97%、96.87%、96.41%、94.02%和93.93%,氨基酸序列的同源性分别为96.17%、95.88%、96.10%、92.36%和92.05%;分子进化树分析结果显示,PEDV CH/JL株S基因与JS毒株S基因亲缘关系最近,处于同一群。利用DNAstar Protean程序预测了PEDV CH/JL株S蛋白一个抗原表位区（83-276aa）,将其克隆到原核表达载体pGEX-6p-1后转化E.coliBL21（DE3）感受态细胞,在终浓度1.0mmol/L的IPTG诱导下获得了表达,Western blot结果显示,预测的抗原表位区GST融合蛋白能与猪流行性腹泻病毒多克隆抗血清反应,提示该抗原表位区含有线性抗原表位。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 序列分析 线性抗原表位区
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猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪A型轮状病毒多重RT-PCR方法的建立及其应用 被引量：23
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作者 李丽敏 朱卫霞 +4 位作者 王晓波 魏艳秋 张鹤 张义明 宋勤叶 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期216-220,227,共6页
为了建立一种能够同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪A群轮状病毒(RVA)的敏感、特异的多重RT-PCR(mRT-PCR)方法,本试验分别针对PEDV和TGEV的N基因、RVA的VP7基因设计了4对引物(其中针对PEDV N基因的引物为... 为了建立一种能够同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪A群轮状病毒(RVA)的敏感、特异的多重RT-PCR(mRT-PCR)方法,本试验分别针对PEDV和TGEV的N基因、RVA的VP7基因设计了4对引物(其中针对PEDV N基因的引物为内、外2对),结合mRT-PCR和PEDV的套式RT-PCR(nRTPCR),建立了检测PEDV、TGEV和RVA的mRT-PCR方法。mRT-PCR能够同时扩增出针对3种病毒的预期大小的目的核苷酸片段,与猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、伪狂犬病毒及猪圆环病毒2型等病毒无交叉反应;可以检测到PEDV、TGEV和RVA的最低核酸浓度分别为16.07、803.9和321.5μg/L。应用mRT-PCR检测了31份腹泻仔猪的血清、肛拭子或小肠组织,其中PEDV、TGEV与RVA的阳性率分别为61.29%、6.45%和25.81%,并检测到了PEDV与RVA或TGEV双重感染及PEDV、TGEV和RVA三重感染的样品。在检测临床样品时,mRT-PCR和单项RT-PCR检出PEDV、TGEV和RVA的符合率分别为96.77%、93.54%和93.54%。上述结果表明,mRTPCR能够快速鉴别检测PEDV、TGEV和RVA 3种病毒,PEDV是引起当前仔猪腹泻的主要病原。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 猪A群轮状病毒 多重RT—PCR
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2011年河南省猪流行性腹泻病毒流行株的遗传进化分析 被引量：24
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作者 沈永恕 陈陆 +2 位作者 皇甫和平 张华 张磊 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期672-674,共3页
2011年前后,猪流行性腹泻(PED)在河南省爆发流行。为探明该病再次流行的原因,本研究对2011年收集的7份来自河南省不同地区PED病毒(PEDV)流行病毒株M基因进行RT-PCR扩增、克隆、测序及分析。序列分析显示,7株PEDV河南流行株M基因部分核... 2011年前后,猪流行性腹泻(PED)在河南省爆发流行。为探明该病再次流行的原因,本研究对2011年收集的7份来自河南省不同地区PED病毒(PEDV)流行病毒株M基因进行RT-PCR扩增、克隆、测序及分析。序列分析显示,7株PEDV河南流行株M基因部分核苷酸及氨基酸发生变异,不同于以往参考病毒株。基于M基因的遗传进化分析显示,PEDV河南流行株和参考株可以分为3个群(G1、G2、G3),7株PEDV河南流行株均属于第3群,与2010年中国BJ2010株、2007年韩国PFF188株及2008年泰国08RB03株亲缘关系密切,而与欧洲病毒株(CV777、Br1/87)、1995年和2004年泰国株(M_NIAH1795_04、M_NIAH2013_95)及2006年中国LZC株亲缘关系较远。结果表明,2011年在中国河南省及其它地区流行的PEDV是一个新的基因型,可能起源于韩国和泰国。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 遗传进化分析 M基因
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