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题名猪T细胞受体β链基因的克隆及生物信息学分析
被引量：9
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作者
李玩生
刘磊
冯海燕
房永祥
景志忠
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机构
甘肃农业大学动物医学院
中国农业科学院兰州兽医研究所
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出处
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期1-6,13,共7页
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基金
国家高新技术"863"项目(2006AA10A203)
国家支撑计划项目(2007BAD40B03)
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文摘
以GenBank上登载的猪的T细胞受体β(pTCR-β)基因为参考序列,用RT-PCR法从猪的外周血淋巴细胞中克隆了TCR-β链基因,并进行生物信息学分析.结果表明:pTCR-β基因含有一个完整的开放阅读框架(ORF),大小为849bp,编码283个氨基酸,且含有一段27个氨基酸的信号肽序列,与参考序列相比,在核苷酸序列上的同源性为80.4%,在氨基酸序列上的同源性为70.3%;生物信息学结构预测发现2个结构域,一个为IG结构域,由第32-138位共107个氨基酸残基组成;另一个为IG-LIKE结构域,由第164-211位共48个氨基酸残基组成.
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关键词
猪TCR-β链基因
基因克隆
生物信息学
结构预测
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Keywords
porcine t cell receptor beta chain gene
gene cloning
bioinformatics
structure prediction
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分类号
S828
[农业科学—畜牧学]
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