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猪博卡病毒的基因分型 被引量：6
1
作者 周宇 唐连飞 +7 位作者 朱事康 朱中武 佟铁铸 禹思宇 林志雄 刘星 陈燕忠 罗卓军 《中国动物检疫》 CAS 2015年第2期63-68,共6页
为了解猪博卡病毒(PBoV)的遗传进化规律,研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用Gen Bank中登录的29条PBoV和2条本实验室测得的全基因组序列信息,采用生物信息学软件进行基因组序列分析。结果显示,分别以NS1基因、NP1基因和VP1基因编码... 为了解猪博卡病毒(PBoV)的遗传进化规律,研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用Gen Bank中登录的29条PBoV和2条本实验室测得的全基因组序列信息,采用生物信息学软件进行基因组序列分析。结果显示,分别以NS1基因、NP1基因和VP1基因编码氨基酸构建的系统进化树,PBoV均被划分为3个基因群,但三种氨基酸序列绘制的进化树存在差异;基因群内各病毒株的氨基酸序列同源性较高,而各基因群之间病毒株的氨基酸序列同源性非常低,基因组结构差异较大。 展开更多
关键词 猪博卡病毒 遗传进化分析 基因分型
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猪博卡病毒NP1基因特异性的PCR方法建立及应用 被引量：3
2
作者 叶星宇 聂奎 聂福平 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期18-22,共5页
该研究根据Genbank公布的猪博卡病毒Porcine bocavirus,PBoV的核苷酸序列,在其NP1保守区域设计一对特异性引物,建立一种能扩增多种猪博卡病毒亚型的PCR检测方法,并进行特异性试验,敏感性试验,重复性试验及可靠性检测.结果显示:所建立的... 该研究根据Genbank公布的猪博卡病毒Porcine bocavirus,PBoV的核苷酸序列,在其NP1保守区域设计一对特异性引物,建立一种能扩增多种猪博卡病毒亚型的PCR检测方法,并进行特异性试验,敏感性试验,重复性试验及可靠性检测.结果显示:所建立的PCR检测方法对猪瘟病毒、猪细小病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒2型无交叉反应;敏感度可以检测到58pg/μL;经3次重复检测,结果一致,重复性好;对阳性产物测序,与Genbank公布的猪博卡病毒NP1序列同源性在97.3%以上,可靠性强.用建立的PCR方法对2011年重庆部分地区猪场的266份育肥猪血清样本进行检测,结果45份为猪博卡病毒阳性,证明了在重庆地区育肥猪中存在PBoV感染的情况. 展开更多
关键词 猪博卡病毒 NP1基因 PCR检测方法
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四川5个规模化养猪场仔猪腹泻的病原学研究
3
作者 彭俊杰 陈炜 +4 位作者 高继业 林文婷 徐琳 郭西平 郑强 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期172-176,共5页
为了弄清2015年10月份四川5个规模化养猪场仔猪腹泻的病因,试验采用RT-PCR、PCR和常规细菌学的方法,参考Gen Bank登录序列合成8对PCR引物,分别用于扩增猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的S基因、猪流行性腹泻病毒(PEDV)的M基因、猪轮状病毒(PRV... 为了弄清2015年10月份四川5个规模化养猪场仔猪腹泻的病因,试验采用RT-PCR、PCR和常规细菌学的方法,参考Gen Bank登录序列合成8对PCR引物,分别用于扩增猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的S基因、猪流行性腹泻病毒(PEDV)的M基因、猪轮状病毒(PRV)的VP4基因、博卡病毒(PBo V)的VP1/VP2基因、猪库布病毒(PKo V)的3D基因,以及肠致病性大肠杆菌(EPEC)K88的fae G基因、K99的fan C基因、987P的fas G基因,其目标DNA片段大小分别为1 062 bp、467 bp、750 bp、496 bp、323 bp、792 bp、500 bp和551 bp。结果表明:SC1猪场病例样本扩增出PKo V 3D基因,大小为300 bp;SC2、SC3、SC4和SC5猪场病例样本均扩增出PBo V VP1/VP2基因,大小为500 bp;其他病原的检测结果均为阴性。经测序和遗传多样性分析表明,PKo V 3D基因、PBo V VP1/VP2基因与Gen Bank登录序列同源性分别在96%和98%以上。说明此次调查的5个猪场存在PBo V和PKo V的感染,但其感染来源和途径还不清楚。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV) 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 猪轮状病毒(PRV) 猪博卡病毒 (pbov) 猪库布病毒(PKoV) 肠致病性大肠杆菌(EPEC)
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猪博卡病毒的研究概况 被引量：1
4
作者 蔡扩军 陈发喜 +4 位作者 李爱巧 杨启元 韩涌 李建玲 范玉娟 《中国动物检疫》 CAS 2015年第2期42-46,共5页
博卡病毒是近几年被发现的一种人、猪、牛、犬、猩猩等多种哺乳动物共患的新型DNA病毒,本文概述了博卡病毒的生物学特性,从流行病学的角度介绍了猪博卡病在国内外流行情况及对猪博卡病毒的检测方法,为猪博卡病毒的深入研究、防控及做好... 博卡病毒是近几年被发现的一种人、猪、牛、犬、猩猩等多种哺乳动物共患的新型DNA病毒,本文概述了博卡病毒的生物学特性,从流行病学的角度介绍了猪博卡病在国内外流行情况及对猪博卡病毒的检测方法,为猪博卡病毒的深入研究、防控及做好公共卫生安全提供参考。 展开更多
关键词 猪 博卡病毒 研究概况 公共卫生 流行病学
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猪博卡病毒5型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量：5
5
作者 陈鹏强 胡崇伟 +2 位作者 陈秋勇 林群群 修金生 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期150-155,共6页
根据猪博卡病毒5型NS1基因序列设计引物,建立了基于SYBR GreenⅠ的用以检测猪博卡病毒5型的实时荧光定量PCR。用该方法检测猪博卡病毒5型NS1基因,在3.64×102~3.64×107 copies/μL范围内有很好的线性关系。扩增产物的熔解曲线... 根据猪博卡病毒5型NS1基因序列设计引物,建立了基于SYBR GreenⅠ的用以检测猪博卡病毒5型的实时荧光定量PCR。用该方法检测猪博卡病毒5型NS1基因,在3.64×102~3.64×107 copies/μL范围内有很好的线性关系。扩增产物的熔解曲线仅出现单一特异峰,无引物二聚体,Tm值为(83.12±0.12)℃,对猪圆环病毒(PCV1和PCV2)、猪细小病毒(PPV)、猪输血传播病毒(TTV1和TTV2)的核酸均无阳性信号扩增,可重复性好,组内变异系数为0.35%~1.24%,组间变异系数为0.43%~1.46%。此方法的建立为定量分析猪博卡病毒5型感染猪的感染程度和靶器官提供了精确检测手段。 展开更多
关键词 猪博卡病毒5型 NS1基因 SYBR GreenⅠ 实时荧光定量PCR
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