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题名翻译组研究技术进展
被引量：5
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作者
魏康宁
崔俊霞
王梦蕾
王丽
李用芳
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机构
河南师范大学生命科学学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期222-229,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31771703,31601241)
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文摘
基于高通量测序的RNA-Seq广泛被用于检测组织和细胞中基因的表达和调控机理研究,然而已有的文献表明mRNA水平并不能反映蛋白质的丰度,而研究正在翻译的mRNA的翻译组则比转录组更能反映蛋白组的实际水平,因此翻译组研究比转录组研究更具有理论和实践意义。对翻译组研究最为经典的多聚核糖体图谱技术到最近发展起来的核糖体图谱技术、核糖体亲和纯化技术以及翻译谱分析技术进行了综述比较,并介绍了翻译组研究前景,以便为翻译组研究提供参考。
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关键词
翻译组
多聚核糖体图谱
核糖体亲和纯化技术
核糖体图谱
翻译谱分析技术
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Keywords
translatome
polysome profiling
ribosome affinity-purification
ribosomal profiling
RNC-mRNA-Seq
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分类号
H31
[语言文字—英语]
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题名人胚胎肾细胞系HEK293中的翻译调控
被引量：1
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作者
柳满
任悦
高玉风
王芳
余佳
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机构
中国医学科学院基础医学研究所
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出处
《基础医学与临床》
2021年第5期630-635,共6页
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基金
国家自然科学基金(81970103)。
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文摘
目的探讨人胚胎肾细胞系HEK293中的翻译调控。方法通过Polysome profiling结合Western blot实验检测并验证HEK293细胞中mRNA的翻译活性;通过针对RPL10A和RPS17两种核糖体蛋白的RNA免疫共沉淀、建库测序(RIP-seq)及生物信息学分析,获得参与HEK293细胞蛋白质合成调控的相关分子。结果在两种核糖体蛋白的RNA免疫共沉淀实验富集的分子中共有129种基因,其中93.8%为蛋白质编码基因;且功能与RNA剪接、分解代谢、MAPK信号通路、染色体定位、RNA转运等相关。结论通过针对核糖体蛋白的RNA免疫共沉淀可以获得HEK293细胞中活跃翻译的mRNA。
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关键词
人胚胎肾细胞系293
polysome
profiling
RNA结合蛋白
免疫共沉淀
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Keywords
human embryonic kidney 293 cell line
polysome profiling
RNA binding protein
immunoprecipitation
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分类号
Q522
[生物学—生物化学]
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