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基于DNA荧光探针的T4多聚核苷酸激酶免标记荧光检测
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作者 马昌杯 郑立阳 +1 位作者 赵涵 颜颖 《包装学报》 2021年第1期1-7,共7页
开发一种新型的基于DNA荧光探针的T4多聚核苷酸激酶(T4 PNK)活性检测方法。先设计了可以形成发卡结构的DNA探针(PNK-Tb),再通过引入T4 PNK、ATP和λ核酸外切水解酶(λ exo),打开发卡结构,释放发卡结构3’末端富含G的碱基序列,随后与Tb~(... 开发一种新型的基于DNA荧光探针的T4多聚核苷酸激酶(T4 PNK)活性检测方法。先设计了可以形成发卡结构的DNA探针(PNK-Tb),再通过引入T4 PNK、ATP和λ核酸外切水解酶(λ exo),打开发卡结构,释放发卡结构3’末端富含G的碱基序列,随后与Tb~(3+)结合形成G-四链体产生显著的荧光信号。通过反应前后荧光信号的变化实现T4 PNK的高灵敏检测。实验结果表明:成功制备了新的免标记DNA荧光探针,创新性地将Tb~(3+)应用到T4 PNK活性的检测中;本荧光法定量检测的线性范围为0~100 U/mL,检测下限为2 U/mL;该策略具有良好的特异性并且可用于评估ADP对T4 PNK活性的抑制作用。基于免淬灭标记DNA荧光探针构建的T4 PNK活性检测新策略反应快速 (不超过60 min)、成本低廉、灵敏度高,在药物开发以及生物化学研究中具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 荧光探针 多聚核苷酸激酶 抑制剂
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多核苷酸激酶定量检测方法的研究进展
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作者 代丽雁 刘增臣 +1 位作者 姚帅 朱文平 《周口师范学院学报》 CAS 2020年第5期40-44,135,共6页
多核苷酸激酶(PNK)在许多重要的生物进程的调节中起着关键作用,一些严重的疾病与PNK活性密切相关,发展高灵敏的PNK活性检测方法具有重要的意义.以T4 PNK为例,对近年来发展的PNK定量检测方法进行综述,主要介绍了荧光分析法和电化学法,并... 多核苷酸激酶(PNK)在许多重要的生物进程的调节中起着关键作用,一些严重的疾病与PNK活性密切相关,发展高灵敏的PNK活性检测方法具有重要的意义.以T4 PNK为例,对近年来发展的PNK定量检测方法进行综述,主要介绍了荧光分析法和电化学法,并对PNK检测方法未来的发展前景进行了展望. 展开更多
关键词 多核苷酸激酶 荧光分析法 电化学法 定量检测 DNA磷酸化
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基于“分段”-“完整”转化的G-四链体脱氧核糖核酸酶传感器用于多聚核苷酸激酶的检测 被引量:5
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作者 周璐 程慧 +1 位作者 王金娥 裴仁军 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第1期13-18,共6页
采用"分段"转化为"完整"G-四链体脱氧核糖核酸酶的策略,构建了检测多聚核苷激酶(T4 PNK)的传感器。将形成G-四链体的富G序列PS5.M序列拆分成5'和3'端均为羟基的两条链:链S_1OH和链S_2OH即分别具有12个碱基... 采用"分段"转化为"完整"G-四链体脱氧核糖核酸酶的策略,构建了检测多聚核苷激酶(T4 PNK)的传感器。将形成G-四链体的富G序列PS5.M序列拆分成5'和3'端均为羟基的两条链:链S_1OH和链S_2OH即分别具有12个碱基的"分段"的PS5.M。在ATP存在下,T4 PNK酶可以将链S_2OH的5'端的羟基磷酸化,转化为S_2P;在S_1OH、S_2P以及Helper链S-H存在下,T4 DNA连接酶(T4 DNA Ligase)将链S_1OH和链S_2P连接成"完整"的PS5.M序列。在体系中再加入核酸外切酶Ⅲ(ExoⅢ),从S-H的3'端剪切S-H,释放出PS5.M。在K^+存在下,PS5.M与氯化血红素(Henfin)作用,形成具有类过氧化物酶活性的复合物,催化H_2O_2氧化2 2'-联氮-二(3-乙基-苯并噻唑-6-磺酸)二铵盐(ABTS)的反应,通过检测氧化产物在418 nm处的吸收值变化,实现对T4 PNK活性的定量检测。线性检测范围为0.02~3.0 U/mL舱出限为0.014 U/mL(S/N=3)。对Hela细胞和HEK293细胞实际样本的T4 PNK活性进行了检测,平均回收率为95.6%~105.7%。 展开更多
关键词 多聚核苷酸激酶 脱氧核糖核酸酶 G-四链体 生物传感器
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Screen for Coronary Artery Disease Specific Genetic Expression by Representational Differential Analysis
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作者 周钢 余细勇 +4 位作者 陈纪言 符永恒 谭虹虹 黄素玉 林曙光 《South China Journal of Cardiology》 CAS 2001年第1期42-48,共7页
Objective To screen coronaryartery disease (CAD) specific expressions and clone their genes. Method Blood samples were collected from CAD and non - CAD patients at the end of coronary angiography. mRNA from samples wa... Objective To screen coronaryartery disease (CAD) specific expressions and clone their genes. Method Blood samples were collected from CAD and non - CAD patients at the end of coronary angiography. mRNA from samples was isolated and converted into cDNA. After ligated with specific linkers, the cDNA was amplified with complementary primers. PCR products from CAD samples were named as tester; the ones from non - CAD samples were named as driver. With different ratio of tester to driver (1 : 100,1: 1, 000, and 1: 10, 000), they were mixed, denatured, and renatured. Single strand cD-NA was eliminated by Mung bean nuclease. Double strand cDNA presented only in tester was amplified, ligated in vector pUC19 and pUC53, and transformed into E. coll DH5a. Strains with inserted cDNA fragments were picked up based on blue and white selection. Insertions were screened by endonuclease digestion and DNA sequencing. Results were compared with DNA sequences of GeneBank. Results: After the selection with representational differential analysis, CAD specific cDNA fragments with different sizes (about 1kb, 0. 75kb, and 0. 6kb) were cloned. Among them, two fragments from unknown genes were identified. One presented a 43. 3 % similarity with part of the rattus norvegicus lipocortin gene. Another presented a 45. 4 % similarity with part of the human polynucleotide kinase 3' - phosphatase gene. Conclusion There are at least two CAD specific - ex- pressions from unknown genes that were partially similar to lipocortin and polynucleotide kinase 3'- phos-phatase genes, respectively. Expression of these genes might affect the formation and progression of plaque within coronary artery. 展开更多
关键词 Coronary artery disease Representational differential analysis Lipocortin polynucleotide kinase 3'- phosphatase
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PNKP沉默对骨肉瘤放疗的增敏作用 被引量:1
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作者 周斌 李宏维 +2 位作者 史继德 王颢 张海鸿 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期390-395,共6页
目的研究多聚核苷酸激酶/磷酸酶(polynucleotide kinase/phosphatase,PNKP)在放疗诱导的细胞DNA损伤、细胞凋亡、细胞增殖和细胞周期中的调节作用。方法将U2OS细胞系分为3组:骨肉瘤细胞对照组、阴性si RNA转染组(si C)和PNKP si RNA转染... 目的研究多聚核苷酸激酶/磷酸酶(polynucleotide kinase/phosphatase,PNKP)在放疗诱导的细胞DNA损伤、细胞凋亡、细胞增殖和细胞周期中的调节作用。方法将U2OS细胞系分为3组:骨肉瘤细胞对照组、阴性si RNA转染组(si C)和PNKP si RNA转染组(si PNKP)。Western blot检测0、1、2、4、6、8 Gy 6个剂量水平γ-射线照射后U2OS细胞中PNKP的变化,CCK-8分析不同剂量γ-射线照射后细胞的存活率,彗星实验检测辐射后骨肉瘤细胞DNA的损伤,MTT法检测辐射后细胞增殖情况,流式细胞仪分析辐射后细胞凋亡、线粒体膜电位和细胞周期的变化。结果 4 Gy剂量的γ-射线可以显著降低骨肉瘤细胞U2OS中PNKP的表达(55.17%,P<0.01)和细胞的存活能力(与对照组相比下降50.16%,P<0.01)。与单独辐射组(si C+IR)对比,PNKP沉默可以抑制辐照后细胞的生长(抑制率增加到129.61%,P<0.01),增加DNA的损伤(DNA迁移量增加58.94%,P<0.01),使细胞周期停滞在S期,促进细胞凋亡以及降低线粒体膜电位水平。结论 PNKP沉默可以增加骨肉瘤细胞放射治疗的敏感性。 展开更多
关键词 多聚核苷酸激酶/磷酸酶 骨肉瘤 放疗敏感性
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基于外切酶驱动策略构建荧光减弱式T4 PNK免标记传感器
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作者 刘业玲 袁珲 +4 位作者 刘炳鑫 黄圣荣 周冰倩 李霞 薛庆旺 《聊城大学学报(自然科学版)》 2022年第2期82-88,共7页
T4多核苷酸激酶(T4 polynucleotide kinase,T4 PNK)是5′-激酶家族的主要成员,可以将三磷酸腺苷(ATP)的γ位点磷酸基团转移到单链或双链DNA/RNA、寡核苷酸或具有3′-磷酸基团的单核苷酸的5′-羟基进行催化。核酸中5′-羟基末端的磷酸化... T4多核苷酸激酶(T4 polynucleotide kinase,T4 PNK)是5′-激酶家族的主要成员,可以将三磷酸腺苷(ATP)的γ位点磷酸基团转移到单链或双链DNA/RNA、寡核苷酸或具有3′-磷酸基团的单核苷酸的5′-羟基进行催化。核酸中5′-羟基末端的磷酸化在DNA重组、复制和损伤中起着重要作用,与恶性疾病的生成发展密切相关。因此构建一种灵敏的T4 PNK的检测方法对于许多疾病早期治疗具有重要意义。本文提出基于λ核酸外切酶驱动荧光减弱式检测T4 PNK活性的策略,拟利用T4 PNK可将DNA的5′端由羟基化变为磷酸化的特点,磷酸化DNA能被λ核酸外切酶(λ-exonuclease)特异性识别和切割的特点降解底物双链DNA,导致与荧光染料SGΙ键合位点急剧减少,荧光信号输出由“on”模式切换到“off”模式,荧光强度大大减少。因此,可利用荧光减弱的程度来实现对T4 PNK的免标记荧光定量检测。 展开更多
关键词 T4多核苷酸激酶 外切酶驱动 免标记荧光
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基于G-三链体分子信标的多聚核苷酸激酶荧光检测新方法
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作者 朱文平 刘硕硕 李志怡 《周口师范学院学报》 CAS 2022年第5期52-56,共5页
G-三链体(G3)由三段连续G碱基的富G序列组成的,因其潜在的生物学功能和特殊的结构受到越来越多的关注。G3序列能结合硫磺素T(ThT)发出强荧光,以此作信号报告分子,本文提出了一种基于G3分子信标(MB)的T4多聚核苷酸激酶(PNK)荧光检测新方... G-三链体(G3)由三段连续G碱基的富G序列组成的,因其潜在的生物学功能和特殊的结构受到越来越多的关注。G3序列能结合硫磺素T(ThT)发出强荧光,以此作信号报告分子,本文提出了一种基于G3分子信标(MB)的T4多聚核苷酸激酶(PNK)荧光检测新方法。有T4 PNK时,P1的5'末端被磷酸化,P1/G3MB双链结构中的P1被外切酶酶切,封闭在G3MB中的G3序列不能结合ThT,得到弱荧光信号。无T4 PNK时,P1/G3MB双链结构能阻止外切酶酶切,G3MB被打开,释放G3序列结合ThT荧光增强。该方法对T4 PNK检测的线性范围为0.0002~0.01 U/μL,检测限为0.0002 U/μL。该方法具有操作简便、成本低和选择性高等优点,并可用于T4 PNK酶活性抑制剂的评估。 展开更多
关键词 T4多聚核苷酸激酶 硫磺素T G-三链体 分子信标
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碱基上的氨臂对T_4多核苷酸激酶催化的影响
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作者 张晓岚 陆长德 祁国荣 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1995年第6期534-536,共3页
寡聚核苷酸内部和5′末端含有的氨臂修饰胸苷酸,能够明显地影响T_4多核苷酸激酶催化的[γ- ̄(32)P]ATP的转移反应.其转移效率为未修饰寡聚核苷酸的50%和2%.这种修饰的寡聚核苷酸对T_4RNA连接酶催化的反应... 寡聚核苷酸内部和5′末端含有的氨臂修饰胸苷酸,能够明显地影响T_4多核苷酸激酶催化的[γ- ̄(32)P]ATP的转移反应.其转移效率为未修饰寡聚核苷酸的50%和2%.这种修饰的寡聚核苷酸对T_4RNA连接酶催化的反应没有影响. 展开更多
关键词 T4多核苷酸激酶 氨臂 催化作用
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T4多聚核苷酸激酶的原核表达、纯化及初步应用
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作者 左锐 林峻 蔡伟文 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期63-68,共6页
原核表达、纯化T4多聚核苷酸激酶,并尝试将纯化的T4 PNK用于短探针序列的连接。本研究以合成的pseT基因为模板,PCR扩增出带有NdeⅠ和Bam HⅠ位点的目的片段,构建pseT-pET-15b原核表达载体,并转入E. coli ER2566中诱导表达。Ni-Agarose... 原核表达、纯化T4多聚核苷酸激酶,并尝试将纯化的T4 PNK用于短探针序列的连接。本研究以合成的pseT基因为模板,PCR扩增出带有NdeⅠ和Bam HⅠ位点的目的片段,构建pseT-pET-15b原核表达载体,并转入E. coli ER2566中诱导表达。Ni-Agarose亲和层析柱纯化重组蛋白后,再进行Western blot鉴定。用纯化后再浓缩的T4 PNK参与探针连接反应,并设置商品T4 PNK和阴性对照。PCR扩增成功获得大于900 bp的目的基因片段,原核表达载体pseT-pET-15b构建成功,经诱导表达的重组蛋白分子量大小约为35 kD,Western blotting确认蛋白表达正确,浓缩后的蛋白浓度达到826μg/m L。电泳结果显示,重组T4 PNK在探针连接中效果较好。本研究成功表达并纯化了可溶性的T4多聚核苷酸激酶,且具有较好的活性,该蛋白可进一步用于后续大批量探针连接反应或其他相关研究,具有一定实际应用价值。 展开更多
关键词 T4多聚核苷酸激酶 pseT基因 原核表达 探针连接
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一种基于核苷酸激酶的ATP非标荧光检测新方法
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作者 朱文平 池芳莹 +1 位作者 杨伟杰 刘增臣 《周口师范学院学报》 CAS 2020年第5期35-39,共5页
提出了一种检测三磷酸腺苷(ATP)的非标记荧光新方法,该方法基于T4多聚核苷酸激酶调控Lambda核酸外切酶活性的原理,利用DNA荧光染料SYBR Green I作信号报告基团.有ATP时,双链DNA底物能在T4 PNK作用下发生5'端磷酸化,进而被核酸外切... 提出了一种检测三磷酸腺苷(ATP)的非标记荧光新方法,该方法基于T4多聚核苷酸激酶调控Lambda核酸外切酶活性的原理,利用DNA荧光染料SYBR Green I作信号报告基团.有ATP时,双链DNA底物能在T4 PNK作用下发生5'端磷酸化,进而被核酸外切酶降解成DNA碎片,得到较弱的荧光信号,信号强度与ATP浓度成反比.该方法对ATP检测的线性范围为0.04~4 mmol/L,检测限为20 nmol/L.实验结果表明本方法具有快速、成本低、灵敏度高和简单易操作等优点,可进一步应用于复杂生物样品的分析. 展开更多
关键词 ATP T4多聚核苷酸激酶 核酸外切酶 磷酸化 SYBR Green I
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基于PDANPs和T4 PNK、λexo生物传感技术建立
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作者 涂海健 赵成飞 +3 位作者 姜玉才 林堃 俞柳敏 黄亚雨 《莆田学院学报》 2020年第2期23-28,共6页
为找到一种快速灵敏检测miRNA-199的方法,分析纳米材料PDANPs表征,构建基于聚多巴胺纳米粒子(PDANPs)和T4多聚核苷酸激酶(T4 PNK)、λ核酸外切酶(λexo)的新型纳米生物传感技术检测miRNA-199平台,对影响生物传感技术主要因素进行优化,... 为找到一种快速灵敏检测miRNA-199的方法,分析纳米材料PDANPs表征,构建基于聚多巴胺纳米粒子(PDANPs)和T4多聚核苷酸激酶(T4 PNK)、λ核酸外切酶(λexo)的新型纳米生物传感技术检测miRNA-199平台,对影响生物传感技术主要因素进行优化,分析其线性范围和检测限;与茎环引物设计荧光定量PCR方法进行比对。结果显示:合成PDANPs直径300.0±31.7 nm,表面含有丰富的π电子;反应体系荧光强度与miRNA-199浓度的对数成线性关系,F=65.183 lg C+157.3、R 2=0.973;线性范围为10 pmol/mL^100 nmol/mL;检出限值为4.62 pmol/mL;与荧光定量PCR法比对结果偏倚为-0.22105 pmol/mL。结果表明,基于PDANPs和T4 PNK、λexo新型纳米生物传感技术可用于miRNA-199检测。 展开更多
关键词 聚多巴胺纳米粒子 miRNA-199 T4多聚核苷酸激酶 λ核酸外切酶
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