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分子动力学模拟聚赖氨酸在晶格界面上的吸附 被引量:4
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作者 韩振为 廖川 周薇 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期703-708,共6页
分子模拟为从微观角度理解生物大分子提供了有利的工具。本文采用分子动力学方法研究在Pt(100)、Pt(110)及Pt (111)三种晶格界面上聚十赖氨酸分子的吸附,以从分子水平上研究蛋白质吸附的动态过程和机理。界面的作用使部分聚十赖氨酸分... 分子模拟为从微观角度理解生物大分子提供了有利的工具。本文采用分子动力学方法研究在Pt(100)、Pt(110)及Pt (111)三种晶格界面上聚十赖氨酸分子的吸附,以从分子水平上研究蛋白质吸附的动态过程和机理。界面的作用使部分聚十赖氨酸分子出现了较明显的二面角变化,说明吸附过程中界面的特性对聚赖氨酸的分子结构有影响;在Pt(100)与Pt(111)界面上,聚十赖氨酸分子构象变化较大,Pt(110)变化较小。聚十赖氨酸分子在吸附中,能量变化与分子构象变化的结果一致,构象变化较大的Pt(100)和Pt(111)界面上聚十赖氨酸分子能量的平均值高于Pt(110)。聚十赖氨酸分子在Pt(100)与Pt(111)界面上先远离界面运动,然后在某位置稳定波动;在Pt(110)界面上先靠近界面运动一段时间后又远离界面。 展开更多
关键词 聚十赖氨酸 晶格界面 吸附 分子动力学(MD)
原文传递
分子模拟蛋白质在氧化锌界面上的吸附 被引量:3
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作者 韩振为 周薇 《天津大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期366-370,共5页
采用分子力学、分子动力学方法模拟了周期性水环境下聚十赖氨酸在氧化锌界面上的吸附过程.模拟初始对水溶液进行了能量优化,对聚十赖氨酸和水整体进行了100 ps的分子动力学模拟.结果表明,聚十赖氨酸在氧化锌界面的吸附作用下构象发生... 采用分子力学、分子动力学方法模拟了周期性水环境下聚十赖氨酸在氧化锌界面上的吸附过程.模拟初始对水溶液进行了能量优化,对聚十赖氨酸和水整体进行了100 ps的分子动力学模拟.结果表明,聚十赖氨酸在氧化锌界面的吸附作用下构象发生变化,部分α螺旋结构消失.水溶液在界面与聚十赖氨酸分子作用过程中起到非常重要的媒介传递作用.界面作用、分子内部的作用和水溶液的共同作用使聚十赖氨酸侧链呈部分规律性变化. 展开更多
关键词 聚十赖氨酸 氧化锌 吸附 分子动力学模拟
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