植物MicroRNA功能的研究进展 被引量：14

1

作者 郭韬 李广林 +1 位作者 魏强 梁永宏 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2347-2354,共8页

MicroRNA(miRNA)是真核生物基因表达的一类负调控因子,植物miRNA主要在转录水平上通过介导靶基因的甲基化、在转录后水平介导靶mRNA的切割或降低靶mRNA的翻译来调节基因的表达,从而调控植物器官的形态建成、生长发育、激素分泌与信号转... MicroRNA(miRNA)是真核生物基因表达的一类负调控因子,植物miRNA主要在转录水平上通过介导靶基因的甲基化、在转录后水平介导靶mRNA的切割或降低靶mRNA的翻译来调节基因的表达,从而调控植物器官的形态建成、生长发育、激素分泌与信号转导以及植物对逆境胁迫因素的应答能力。该文主要综述了近年来植物miRNA在植物生长发育、激素调节与信号转导以及逆境胁迫应答中的重要作用,并针对miRNA的网络调控特征提出了今后miRNA功能研究的方向。 展开更多

关键词 植物mirna 生长发育 激素信号转导 胁迫应答 网络调控

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植物MicroRNA 被引量：12

2

作者 金龙国 王川 刘进元 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期609-614,共6页

MicroRNA(miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的内源单链非编码RNA,在结构上相当保守,因而可以借助生物信息学方法进行预测.从2002年证实miRNA在植物中的存在以来,关于植物miRNA的研究进展异常迅速,短短几年内就已发现200多种.植物miRNA主... MicroRNA(miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的内源单链非编码RNA,在结构上相当保守,因而可以借助生物信息学方法进行预测.从2002年证实miRNA在植物中的存在以来,关于植物miRNA的研究进展异常迅速,短短几年内就已发现200多种.植物miRNA主要通过切割靶mRNA,或抑制靶mRNA翻译,来调控植物个体生长发育并影响其生理过程,是一种新的基因调控方式.本文将就植物miRNA的形成、特征、作用机制、生物功能及其与siRNA的关系进行综述. 展开更多

关键词 植物mirna DICER酶 RISC 基因表达调控 SIRNA

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植物microRNA的生物信息学预测与分析 被引量：5

3

作者 蔡蕊 未晓巍 +3 位作者 武慧 王婷婷 周晓馥 徐洪伟 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期565-570,共6页

microRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中调控基因转录后表达的非编码小分子RNA。大量研究表明,miRNA在调节多种生物途径中起着重要的作用,采用生物信息学方法预测与分析miRNA是当前发现和鉴定植物miRNA的重要策略之一。本文总结了... microRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中调控基因转录后表达的非编码小分子RNA。大量研究表明,miRNA在调节多种生物途径中起着重要的作用,采用生物信息学方法预测与分析miRNA是当前发现和鉴定植物miRNA的重要策略之一。本文总结了生物信息学预测植物miRNA及其靶基因的方法策略,阐述了生物信息学在植物miRNA研究中的重要作用,为今后的研究奠定了基础。 展开更多

关键词 植物mirna 生物信息学 靶基因 数据库 预测

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植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响

4

作者 王奕 孙瑞萍 +4 位作者 彭永佳 姜涵晨 马飞 张瑾 黎梦 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期2184-2195,共12页

本试验旨在探究植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响。选取初始体重为(5.82±0.13)kg的35日五指山龄断奶仔猪12头,随机分为2组,每组6个重复,每个重复1头。对照组饲喂无意义单链核酸,试验组饲喂合成的植物源mi... 本试验旨在探究植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响。选取初始体重为(5.82±0.13)kg的35日五指山龄断奶仔猪12头,随机分为2组,每组6个重复,每个重复1头。对照组饲喂无意义单链核酸,试验组饲喂合成的植物源miR156a-5p(每天600 pmol/kg)。试验期7 d。结果表明:与对照组相比,1)试验组的终末体重和平均日增重均无显著差异(P>0.05),肺脏指数显著增加(P<0.05);2)试验组的血清白蛋白和高密度脂蛋白胆固醇含量显著或极显著提高(P<0.05);3)试验组十二指肠Chao1指数和Observed_otus指数显著提高(P<0.05),空肠Simpson指数显著降低(P<0.05),盲肠Shanon指数和Simpson指数显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01),结肠Simpson指数显著提高(P<0.05);4)试验组十二指肠拟杆菌目(Bacteroidales)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和拟杆菌属(Bacteroides)的富集显著增加(P<0.05),十二指肠纤毛菌属(Leptotrichia)、颤螺旋菌属(Oscillibacter)、UCG-010、螺杆菌属(Helicobacter)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、Clostridia_vadinBB60_group、副萨特氏菌属(Parasutterella)和理研菌属(Rikenella)等的富集显著增加(P<0.05);5)试验组十二指肠pH和隐窝深度极显著提高(P<0.01);6)试验组十二指肠载脂蛋白A1(APOA1)和尾型同源盒转录因子2(CDX2)mRNA相对表达量极显著上调(P<0.01),十二指肠黏糖蛋白2(MUC2)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和β防御素1(DEFB1)mRNA相对表达量显著上调(P<0.05)。综上所述,植物源miR156a-5p可调节断奶五指山仔猪十二指肠、空肠、盲肠和结肠菌群α多样性,增加十二指肠pH及拟杆菌纲、目和属水平的富集,改善十二指肠上皮分化、化学屏障和黏膜免疫屏障功能。 展开更多

关键词 植物源mirna 断奶仔猪 肠道菌群 肠道屏障

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植物microRNA跨界调控哺乳动物基因表达研究进展 被引量：3

5

作者 彭朦媛 王颖芳 《广东药科大学学报》 CAS 2019年第5期714-718,共5页

微小RNA(miRNA)是一类约22个核苷酸(nt)的单链非编码RNA,能有效调节动植物的靶基因表达。最近研究表明,植物miRNA可以通过胃肠道进入哺乳动物体内,到达靶器官发挥治疗作用。本文主要对植物miRNA分子进行跨物种调控哺乳动物基因表达的研... 微小RNA(miRNA)是一类约22个核苷酸(nt)的单链非编码RNA,能有效调节动植物的靶基因表达。最近研究表明,植物miRNA可以通过胃肠道进入哺乳动物体内,到达靶器官发挥治疗作用。本文主要对植物miRNA分子进行跨物种调控哺乳动物基因表达的研究现状进行综述。揭示植物来源的miRNA可作为一类新的生物活性成分在哺乳动物体内产生疗效,为人类疾病治疗、药用植物物质基础研究提供新思路。 展开更多

关键词 mirna 植物mirna 跨界调控 靶基因

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植物pri-miRNA转录及加工过程中的重要因子 被引量：2

6

作者 宋家会 蔡强 莫蓓莘 《生命科学》 CSCD 2017年第4期406-413,共8页

MicroRNA(miRNA)是真核生物内源的一类长度为20~24 nt的非编码小RNA,它们通过切割靶标基因mRNA或阻止其翻译在转录后水平调控基因的表达。miRNA广泛参与植物的生长发育、代谢及各类胁迫反应过程,在植物基因表达调控网络中发挥重要作用... MicroRNA(miRNA)是真核生物内源的一类长度为20~24 nt的非编码小RNA,它们通过切割靶标基因mRNA或阻止其翻译在转录后水平调控基因的表达。miRNA广泛参与植物的生长发育、代谢及各类胁迫反应过程,在植物基因表达调控网络中发挥重要作用。编码miRNA的MIR基因首先经过DNA依赖的RNA聚合酶Pol II复合体转录形成pri-miRNA,之后pri-miRNA再经过DCL1加工复合体的一系列加工形成成熟的miRNA。现介绍参与植物pri-miRNA转录和加工过程的重要蛋白及其作用方式,并阐述植物miRNA在转录及转录后水平复杂且精密的调控机制。 展开更多

关键词 植物mirna MIR基因转录 pri-mirna加工 蛋白因子

原文传递

植物microRNA及其在植物生长发育中作用的研究进展 被引量：3

7

作者 张停停 刘长洲 +1 位作者 赵娟 李小平 《安徽农业科学》 CAS 2013年第13期5667-5669,5673,共4页

microRNA(miRNA)是一类由内源基因编码的长度约21～25 nt的非编码小分子RNA。miRNA广泛分布于植物中,在植物生长发育的整个生活史中都有着重要的作用。文中主要介绍了植物miRNA的特点、生物合成、作用机制及其在植物发育中的作用。

关键词 植物mirna 生物合成 植物生长发育

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植物microRNA靶基因的预测与验证技术研究进展 被引量：3

8

作者 崔俊霞 魏康宁 +2 位作者 谢伊源 王丽 李用芳 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第7期1-7,共7页

MicroRNA(miRNA)是真核生物中具有重要调控功能的一类小分子RNA。植物miRNA通过碱基互补配对方式引导RNA沉默复合体识别靶基因并介导靶基因mRNA被剪切或蛋白质翻译被抑制,所以对植物miRNA靶基因的分析和验证是研究miRNA功能必不可少的... MicroRNA(miRNA)是真核生物中具有重要调控功能的一类小分子RNA。植物miRNA通过碱基互补配对方式引导RNA沉默复合体识别靶基因并介导靶基因mRNA被剪切或蛋白质翻译被抑制,所以对植物miRNA靶基因的分析和验证是研究miRNA功能必不可少的一部分。植物miRNA靶基因可通过生物信息学方法预测,主要根据miRNA与mRNA的互补程度进行,然而理论上预测的靶基因尚有待于进一步的试验验证。简要介绍了植物miRNA产生过程的最新研究进展以及靶基因的预测方法,重点综述了植物miRNA靶基因的验证方法,包括RLM-5'RACE、降解组测序、瞬时共表达和转基因系统,为更深入地研究植物miRNA介导的调控机制提供参考。 展开更多

关键词 植物mirna 靶基因 剪切 预测 验证

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植物miRNA靶基因验证研究进展 被引量：3

9

作者 何炫程 吕鹤书 +2 位作者 黄捷飞 马兰青 杨明峰 《生物技术进展》 2017年第2期102-105,共4页

植物microRNA(miRNA)可以利用碱基互补配对原则对靶基因进行识别并介导靶基因(mRNA)的切割或翻译抑制,以此机制来调控靶基因的表达。主要从作用方式及实验体系两大方面入手,综述了植物miRNA与其靶基因的作用机制,以及植物miRNA靶基因验... 植物microRNA(miRNA)可以利用碱基互补配对原则对靶基因进行识别并介导靶基因(mRNA)的切割或翻译抑制,以此机制来调控靶基因的表达。主要从作用方式及实验体系两大方面入手,综述了植物miRNA与其靶基因的作用机制,以及植物miRNA靶基因验证方法的研究进展,旨在更深入的探究miRNA与其靶基因的作用关系。 展开更多

关键词 植物mirna 靶基因 验证

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植物源miRNA跨界调控动物机体健康研究进展 被引量：1

10

作者 黎梦 彭涵 +1 位作者 彭永佳 张瑾 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期2732-2740,共9页

食物中的营养素普遍被认为是有关动物营养调控基因表达的重要物质,近年来发现,食物中植物源miRNA作为一类单链非编码小RNA可能是一种新的食物功能性成分在动物机体发挥调控作用。过去10年出现的证据表明,植物源miRNAs可以通过采食进入... 食物中的营养素普遍被认为是有关动物营养调控基因表达的重要物质,近年来发现,食物中植物源miRNA作为一类单链非编码小RNA可能是一种新的食物功能性成分在动物机体发挥调控作用。过去10年出现的证据表明,植物源miRNAs可以通过采食进入动物机体参与基因的表达调控,在动物生理过程和疾病发生发展中产生影响。目前,对食物中植物源miRNA如何进入动物机体并在机体内转运发挥调节功能的一系列活动仍未有系统全面总结。因此,本文从植物源miRNA跨物种的稳定性、转运方式、吸收规律、作用机制和代谢等方面的进展进行总结分析,为探究食物中植物源miRNA与动物健康和生长的关系提供新的视角,并对植物源miRNA跨界调控动物健康和在畜牧生产中的应用前景进行展望,为植物源miRNA的开发利用提供参考。 展开更多

关键词 植物源mirna 跨界调控 免疫 肠道 畜牧生产

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基于MiRfilter系统的毛果杨miRNA预测

11

作者 赵洁苑 龚云路 王翼飞 《上海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期397-403,435,共8页

从参数训练、参数范围训练、候选成熟体打分等方面改进miRNA预测系统MiRfilter,使其适应拥有更长前体的植物miRNA的预测.预测毛果杨基因组上的miRNA,并对系统进行精度检验.利用MiRfilter系统共预测出3 860条候选miRNA;在110个正样本中,... 从参数训练、参数范围训练、候选成熟体打分等方面改进miRNA预测系统MiRfilter,使其适应拥有更长前体的植物miRNA的预测.预测毛果杨基因组上的miRNA,并对系统进行精度检验.利用MiRfilter系统共预测出3 860条候选miRNA;在110个正样本中,正确识别91条前体和80条成熟体,前体预测精度为82.73%,成熟体预测精度为72.73%;在毛果杨第4号染色体(LG_Ⅳ)上得到的1 968个负样本中,有12个数据可认为是miRNA,假阳性率为0.61%. 展开更多

关键词 植物mirna MiRfilter 毛果杨基因组 一类分类法 K-最近邻分类器(KNN)

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植物miRNA抗胁迫机理研究进展 被引量：9

12

作者 徐涛 张富春 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第5期5-9,共5页

植物microRNA(miRNA)是一类约有21个核苷酸组成的小RNA分子,属于非编码单链RNA家族。miRNA与靶mRNA互补配对结合,以抑制基因表达或切割mRNA的方式,实现基因的负调控。miRNA对植物基因表达、生长发育和抵抗胁迫等有十分重要的影响。综述... 植物microRNA(miRNA)是一类约有21个核苷酸组成的小RNA分子,属于非编码单链RNA家族。miRNA与靶mRNA互补配对结合,以抑制基因表达或切割mRNA的方式,实现基因的负调控。miRNA对植物基因表达、生长发育和抵抗胁迫等有十分重要的影响。综述了植物miRNA特点以及miRNA抗胁迫机理的最新研究进展。 展开更多

关键词 植物mirna 生物胁迫 环境胁迫

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两种提取人参水煎液miRNA方法的比较 被引量：3

13

作者 王文娟 何枝华 +6 位作者 陈艳琳 曹晶晶 杨泽民 龚梦鹃 尹永芹 韩彬 王颖芳 《广东药科大学学报》 CAS 2017年第5期595-599,共5页

目的筛选获取新鲜人参水煎液中高质量miRNA的提取方法。方法选择改良Trizol法和通用植物miRNA提取试剂盒法提取新鲜人参水煎液miRNA,所得miRNA经DNaseⅠ处理后进行琼脂糖凝胶电泳和Agilent 2100生物分析仪检测,比较两种方法所得miRNA的... 目的筛选获取新鲜人参水煎液中高质量miRNA的提取方法。方法选择改良Trizol法和通用植物miRNA提取试剂盒法提取新鲜人参水煎液miRNA,所得miRNA经DNaseⅠ处理后进行琼脂糖凝胶电泳和Agilent 2100生物分析仪检测,比较两种方法所得miRNA的纯度和质量。结果改良Trizol法步骤简单、快捷省时、成功率较高但纯度较低;通用植物miRNA提取试剂盒法步骤较多耗时较长,但miRNA纯度高质量好。结论通用植物miRNA提取试剂盒法更适用于提取人参水煎液中miRNA,提取的miRNA完整性好、纯度高,可以满足荧光定量PCR、建库测序等后续研究的需要。 展开更多

关键词 人参 水煎液 mirna 改良Trizol法 通用植物mirna提取试剂盒法

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基于高通量数据的人体外源性植物miRNA跨界调控建模

14

作者 张浩 占萌苹 +5 位作者 郭刘香 李誌 刘元宁 张春鹤 常浩武 王志强 《吉林大学学报（工学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第4期1206-1213,共8页

以基于人体血清的高通量测序数据为研究对象,采用生物计算方法对数据进行分析,以目前已知的人类和植物的RNA数据作为参照集,从中筛选出可能的人体外源植物miRNA;基于miRNA的调控机制原理,获得可能的植物miRNA干扰人类mRNA的靶基因;构建... 以基于人体血清的高通量测序数据为研究对象,采用生物计算方法对数据进行分析,以目前已知的人类和植物的RNA数据作为参照集,从中筛选出可能的人体外源植物miRNA;基于miRNA的调控机制原理,获得可能的植物miRNA干扰人类mRNA的靶基因;构建植物miRNA-人类mRNA调控网络模型,分析可能的跨界调控作用。本文通过构建植物-人体跨界调控模型,共挖掘出9个核心模块。研究结果表明,外源性植物miRNA参与调控人体胺代谢、酒精代谢以及脂肪酸代谢等生物过程。 展开更多

关键词 人工智能 高通量数据 外源性植物mirna 跨界调控

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转基因植物转录后基因沉默机制及克服策略 被引量：4

15

作者 王豫颖 付畅 +1 位作者 孙成 黄永芬 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2004年第6期43-47,共5页

转录后基因沉默 (post transcriptionalgenesilencing,PTGS)表现为基因具有转录活性 ,能转录出mRNA ,但由于细胞启动了RNA特异降解机制 ,使mRNA特异水解或翻译有受抑制的现象。它常常诱发于外源基因的侵入和特定内源基因的表达 ,随后产... 转录后基因沉默 (post transcriptionalgenesilencing,PTGS)表现为基因具有转录活性 ,能转录出mRNA ,但由于细胞启动了RNA特异降解机制 ,使mRNA特异水解或翻译有受抑制的现象。它常常诱发于外源基因的侵入和特定内源基因的表达 ,随后产生的siRNA和miRNA ,在多种酶类作用下 ,以 5′至 3′的方向降解相应RNA。PTGS沉默信号还能够以级联放大的形式扩散至整个植物体。在转基因植物中 ,利用已有的对沉默机制的认识去克服基因沉默 ,人们已提出一系列应对策略。就转基因植物转录后基因沉默在PTGS的诱发、mRNA降解或抑制、PTGS信号传导等方面机制的研究进展作一综述 ;并在克服基因沉默的诸多对策中 ,着重介绍在转基因DNA或转化载体的设计中可加入或删除的一些特殊序列。 展开更多

关键词 转基因植物 转录 基因沉默 机制 SIRNA mirna 基因表达

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血液循环和植物来源miRNA的研究进展 被引量：3

16

作者 杨中保 彭军 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期271-274,共4页

miRNA是一类19～25个核苷酸大小的非编码RNA,参与了基因的转录与翻译的调节,广泛参与了哺乳动物体内肿瘤和心脑血管疾病等的发生、发展过程。最近研究表明,外周血液中存在miRNA,具有良好的稳定性。循环中某些miRNA水平变化与某些疾病的... miRNA是一类19～25个核苷酸大小的非编码RNA,参与了基因的转录与翻译的调节,广泛参与了哺乳动物体内肿瘤和心脑血管疾病等的发生、发展过程。最近研究表明,外周血液中存在miRNA,具有良好的稳定性。循环中某些miRNA水平变化与某些疾病的发生、发展和预后密切相关,可能是一种新的疾病生物标记物。植物来源的miRNA可以稳定地存在于动物的血液,并参与了机体多种靶蛋白的调控。检测血液中植物源性miRNA水平的变化,对于评估中药的疗效和阐明其作用机制具有重要意义。 展开更多

关键词 循环mirna 植物来源mirna 疾病标记物 中药机制

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