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镇江地区儿童群体博卡病毒感染情况及基因组遗传特征
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作者 于魁魁 谢凯 +2 位作者 张潇丹 章震花 朱桂芳 《现代检验医学杂志》 CAS 2015年第6期67-71,共5页
目的了解镇江地区呼吸道和胃肠道疾病患儿博卡病毒（HBoV）流行状况，并通过对代表毒株的全基因组测序了解博卡病毒遗传特征。方法收集2010年1月-2011年12月期间镇江地区156份呼吸道疾病患儿鼻咽分泌物样品和310份急性胃肠炎患儿粪便样... 目的了解镇江地区呼吸道和胃肠道疾病患儿博卡病毒（HBoV）流行状况，并通过对代表毒株的全基因组测序了解博卡病毒遗传特征。方法收集2010年1月-2011年12月期间镇江地区156份呼吸道疾病患儿鼻咽分泌物样品和310份急性胃肠炎患儿粪便样品，采用PCR方法检测HBoV基因；选取3株镇江地区HBoV代表毒株，测序获取全基因组序列，采用CLUSTAL和MEGA4．0等软件进行序列同源性及系统发育分析。结果HBoV在鼻咽分泌物样品中的检出率为2．56％，在粪便样品检出率为3．55％；HBoV基因序列均与GenBank中提交的HBoV-1型毒株高度同源（〉95％），且与上海地区的7株HBoV-1和重庆地区的3株HBoV-1同源性最高；系统进化分析结果显示，3株HBov-1代表株聚类在三个不同的类群中，其中ZJ92与来自中国香港的HBoV毒株HK24及上海的HBoV毒株SH8遗传关系最近，ZJ42与来自泰国的毒株CU25遗传关系最近，而ZJ68与来自上海的R3080522001和SH1亲缘关系最近。结论HBoV-1为镇江地区HBoV主要流行基因型；系统进化分析显示镇江地区的HBoV-1毒株与重庆和上海的毒株有共同的分子起源。 展开更多
关键词 人博卡病毒 分子流行病学 系统进化分析 基因型
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