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云南芝麻丛枝和花变叶植原体16S rRNA和rp基因序列分析 被引量:2
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作者 苏帆 杨子祥 +4 位作者 王柱华 万琼莲 何孟兰 毛清源 蔡红 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期888-897,共10页
本研究通过对表现出丛枝和花变叶症状的芝麻感病植株总DNA进行植原体16S rRNA和rp基因的PCR扩增、克隆、测序及序列分析,明确了两种病株的病原均为植原体,并将其命名为云南元谋芝麻丛枝植原体(SEWB-YNym)和云南元谋芝麻花变叶植原体(SEP... 本研究通过对表现出丛枝和花变叶症状的芝麻感病植株总DNA进行植原体16S rRNA和rp基因的PCR扩增、克隆、测序及序列分析,明确了两种病株的病原均为植原体,并将其命名为云南元谋芝麻丛枝植原体(SEWB-YNym)和云南元谋芝麻花变叶植原体(SEP-YNym)。两个株系的16S rRNA基因片段长度均为1248 bp,并且碱基序列完全一致。通过与其他地区报道的芝麻植原体株系16S rRNA基因序列比对后发现这两个株系与来自缅甸的株系不存在位点差异,而与泰国、中国台湾、印度的株系分别存在3~6个位点差异。同时,还从两个株系中获得了长度均为1171 bp并且碱基序列也完全一致的SEWB-YNym和SEP-YNym的rp基因序列。此rp基因序列包括全部rpl22基因(nt90-476)和部分rps3基因(nt550-1170),分别编码128和206个氨基酸。通过对16S rRNA和rp基因的序列进行同源性比对、构建系统进化树等分析,表明两个株系与候选种‘Candidatus Phytoplasma aurantifolia’相关,为16SrII-A亚组成员,并归属于植原体rp-iii亚进化支。 展开更多
关键词 芝麻 丛枝 花变叶 植原体 16S rRNA基因 rp基因
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赛葵花变叶植原体的鉴定及其16S rDNA序列特征分析
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作者 杨海中 杨毅 陈剑山 《中国植保导刊》 北大核心 2018年第11期21-24,共4页
在海南的赛葵上发现了类似植原体感染的病症,症状表现为花变叶和叶片变小。本研究通过植原体16S r DNA通用引物P1/P7对表现症状的赛葵植株进行了PCR检测,并对检测到的植原体病原16S r DNA进行了克隆测序、序列比对、虚拟RFLP分析和系统... 在海南的赛葵上发现了类似植原体感染的病症,症状表现为花变叶和叶片变小。本研究通过植原体16S r DNA通用引物P1/P7对表现症状的赛葵植株进行了PCR检测,并对检测到的植原体病原16S r DNA进行了克隆测序、序列比对、虚拟RFLP分析和系统进化树构建分析。结果表明,该植原体为翠菊黄化植原体候选种相关株系,属于翠菊黄化植原体组(16SrI)的B亚组(相似系数为1.00)。 展开更多
关键词 赛葵 花变叶病 植原体 检测鉴定 16S RDNA
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小麦蓝矮病植原体转运蛋白secY基因片段序列分析 被引量:3
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作者 张荣 崔晓艳 +1 位作者 孙广宇 康振生 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期446-448,共3页
Wheat blue dwarf(WBD)is a disease caused by phytoplasma and only reported from China.A fragment about 1.3 kb in protein translocation gene,secY was amplified by PCR from the total DNA of di-seased wheat sample with pr... Wheat blue dwarf(WBD)is a disease caused by phytoplasma and only reported from China.A fragment about 1.3 kb in protein translocation gene,secY was amplified by PCR from the total DNA of di-seased wheat sample with primer pair secYF/secYR,which was designed based on secY gene sequence of known 16SrI group members.Nucleotide acid sequence analysis of amplified fragment indicated that the length was 1 240 bp.A phylogenetic tree based on secY gene sequences was constructed and showed that wheat blue dwarf phytoplasma was clustered into the Candidatus Phytoplasma asteris,subgroup 16SrI-C.Wheat blue dwarf phytoplasma showed high homology with clover phyllody phytoplasma strains based on sequence comparison and phylogenetic analysis. 展开更多
关键词 小麦 蓝矮病 植原体 转运蛋白secY基因片段 序列分析
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中国樱桃花变叶病相关植原体的分子检测及鉴定 被引量:5
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作者 高瑞 杨淑珂 +4 位作者 王洁 路兴波 孙玉刚 田延平 汪卫星 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1249-1256,共8页
从重庆市采集到表现花变叶症状的中国樱桃枝条样品,利用透射电镜在感病樱桃枝条韧皮部筛管细胞内观察到直径为200~500nm的圆形或者近圆形的植原体粒子。提取感病和健康花瓣的总DNA,利用植原体16S rRNA基因及延伸因子rp基因通用引物进行... 从重庆市采集到表现花变叶症状的中国樱桃枝条样品,利用透射电镜在感病樱桃枝条韧皮部筛管细胞内观察到直径为200~500nm的圆形或者近圆形的植原体粒子。提取感病和健康花瓣的总DNA,利用植原体16S rRNA基因及延伸因子rp基因通用引物进行PCR扩增,从感病植株中扩增得到了长度分别为1.4kb的16SrRNA基因和1.2kb的rp基因。序列一致率分析表明,樱桃花变叶植原体16SrRNA基因和rp基因均与四川甜樱桃花变绿植原体相应基因的核苷酸一致率最高,分别为100%和99.8%;16SrRNA基因相似系数分析表明,樱桃花变叶植原体与四川甜樱桃花变绿植原体、枣疯植原体的相似系数均为1.00;基于16SrRNA基因和rp基因构建系统进化树时发现,樱桃花变叶植原体均与16SrV-B亚组成员聚为一簇,该植原体属于16SrV组的B亚组。 展开更多
关键词 中国樱桃 樱桃花变叶病 植原体 枣疯病植原体
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海南长春花变叶病病原物的分子鉴定 被引量:3
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作者 车海彦 郑文虎 +2 位作者 温衍生 符瑞益 罗大全 《热带作物学报》 CSCD 2011年第3期485-489,共5页
本研究分别利用植原体16S rDNA和核糖体蛋白(ribosomal protein,rp)基因的通用引物对自然表现变叶症状的海南长春花样品总DNA进行PCR扩增,获得16S rDNA基因片段长为1 432 bp,rp基因片段长为1 211 bp。BLAST程序比较、系统进化树构建及iP... 本研究分别利用植原体16S rDNA和核糖体蛋白(ribosomal protein,rp)基因的通用引物对自然表现变叶症状的海南长春花样品总DNA进行PCR扩增,获得16S rDNA基因片段长为1 432 bp,rp基因片段长为1 211 bp。BLAST程序比较、系统进化树构建及iPhyClassifier分析表明:海南长春花变叶病是由植原体引起的,该植原体株系属于16S rⅠ-B亚组,与候选种Ca.Phytoplasma asteris相关,将其暂命名为长春花变叶病植原体海南株系(Periwinkle phyllody strain Hainan,PP-Hn)。 展开更多
关键词 长春花变叶病 植原体 16S RDNA rp分子鉴定
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云南芒果变叶病植原体的分子鉴定 被引量:1
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作者 尹跃艳 汪开化 +3 位作者 徐忠志 卢训 方琦 丁铭 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期332-336,共5页
植原体(phytoplasma)是一类没有细胞壁,不能离体培养的原核生物,对四环素敏感,主要存在于植物筛管细胞中。植原体主要通过叶蝉、飞虱等取食植物韧皮部的昆虫传播,也可通过菟丝子寄生和嫁接等方式传播。目前,全世界已发现1 000多... 植原体(phytoplasma)是一类没有细胞壁,不能离体培养的原核生物,对四环素敏感,主要存在于植物筛管细胞中。植原体主要通过叶蝉、飞虱等取食植物韧皮部的昆虫传播,也可通过菟丝子寄生和嫁接等方式传播。目前,全世界已发现1 000多种由植原体引起的植物病害,我国大陆已报道100余种与之相关的病害。由植原体引起的病害症状主要表现为植株花器病态、小叶、丛枝、黄化等,从而导致植物产量和品质明显下降。 展开更多
关键词 植原体 分子鉴定 叶病 芒果 云南 取食植物 植物病害 原核生物
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野茼蒿变叶病病原物的分子鉴定
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作者 车海彦 郑文虎 +2 位作者 符瑞益 温衍生 罗大全 《热带作物学报》 CSCD 2011年第2期289-292,共4页
利用植原体16S rDNA通用引物R16mF2/R16mR1对海南表现变叶症状的野茼蒿样品总DNA进行PCR扩增,获得约1.4 kb的特异片段,并对扩增产物进行核苷酸序列测定。通过BLAST程序比较、系统进化树构建及iPhy Classifier分析表明,海南发生的野茼蒿... 利用植原体16S rDNA通用引物R16mF2/R16mR1对海南表现变叶症状的野茼蒿样品总DNA进行PCR扩增,获得约1.4 kb的特异片段,并对扩增产物进行核苷酸序列测定。通过BLAST程序比较、系统进化树构建及iPhy Classifier分析表明,海南发生的野茼蒿变叶植原体在分类上属于花生丛枝植原体组中的A亚组,即16Sr II-A亚组。这是我国首次在野茼蒿上发现植原体病害。 展开更多
关键词 野茼蒿变叶病 植原体 16S RDNA 分子鉴定
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